EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGAFG00000003571 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: pop4
Alias: zgc:110597
Full Name: POP4 homolog%2C ribonuclease P/MRP subunit
Gene Type: protein_coding
Species: Gambusia_affinis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3882 bases
Position: chrNHOQ01000132.1:730316-734197
Accession: ZDB-GENE-050522-505
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGAFP00000005236	UPF0086	PF01868.16	3.2e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGAFT00000005296	-	969	-	ENSGAFP00000005236	181 (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGAFG00000003571	pop4	96	51.724	ENSG00000105171	POP4	93	51.429	Homo_sapiens
ENSGAFG00000003571	pop4	96	48.851	ENSAMEG00000018329	-	78	48.851	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGAFG00000003571	pop4	91	46.386	ENSAMEG00000003172	-	75	46.386	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGAFG00000003571	pop4	98	69.492	ENSACIG00000008358	pop4	79	69.492	Amphilophus_citrinellus
ENSGAFG00000003571	pop4	87	74.051	ENSAOCG00000010116	pop4	76	74.051	Amphiprion_ocellaris
ENSGAFG00000003571	pop4	98	70.056	ENSAPEG00000002829	pop4	74	70.056	Amphiprion_percula
ENSGAFG00000003571	pop4	98	73.446	ENSATEG00000013028	pop4	79	73.446	Anabas_testudineus
ENSGAFG00000003571	pop4	88	50.000	ENSAPLG00000014051	POP4	76	51.250	Anas_platyrhynchos
ENSGAFG00000003571	pop4	98	50.847	ENSANAG00000020295	POP4	79	51.685	Aotus_nancymaae
ENSGAFG00000003571	pop4	99	69.274	ENSACLG00000000526	pop4	80	69.274	Astatotilapia_calliptera
ENSGAFG00000003571	pop4	99	60.556	ENSAMXG00000002899	pop4	80	60.556	Astyanax_mexicanus
ENSGAFG00000003571	pop4	96	50.000	ENSBTAG00000002223	POP4	78	50.000	Bos_taurus
ENSGAFG00000003571	pop4	98	50.282	ENSCJAG00000046750	POP4	70	63.566	Callithrix_jacchus
ENSGAFG00000003571	pop4	56	68.317	ENSCAFG00000007630	POP4	69	61.719	Canis_familiaris
ENSGAFG00000003571	pop4	91	52.727	ENSCHIG00000016743	POP4	74	52.727	Capra_hircus
ENSGAFG00000003571	pop4	96	49.425	ENSTSYG00000003488	POP4	78	49.425	Carlito_syrichta
ENSGAFG00000003571	pop4	96	49.425	ENSCPOG00000002992	POP4	78	49.425	Cavia_porcellus
ENSGAFG00000003571	pop4	98	49.718	ENSCCAG00000020285	-	79	49.718	Cebus_capucinus
ENSGAFG00000003571	pop4	96	52.571	ENSCATG00000036022	POP4	78	53.143	Cercocebus_atys
ENSGAFG00000003571	pop4	96	50.575	ENSCLAG00000013162	POP4	78	50.575	Chinchilla_lanigera
ENSGAFG00000003571	pop4	96	51.724	ENSCSAG00000004868	POP4	78	52.571	Chlorocebus_sabaeus
ENSGAFG00000003571	pop4	98	49.153	ENSCPBG00000016132	POP4	79	49.718	Chrysemys_picta_bellii
ENSGAFG00000003571	pop4	88	54.375	ENSCANG00000005924	POP4	78	55.280	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGAFG00000003571	pop4	98	51.412	ENSCGRG00001017185	Pop4	79	51.667	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGAFG00000003571	pop4	98	51.412	ENSCGRG00000008155	Pop4	79	51.667	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGAFG00000003571	pop4	95	63.372	ENSCSEG00000002946	pop4	77	63.953	Cynoglossus_semilaevis
ENSGAFG00000003571	pop4	98	52.542	ENSCVAG00000018602	POP4	73	52.542	Cyprinodon_variegatus
ENSGAFG00000003571	pop4	98	54.237	ENSDARG00000101472	pop4	79	54.802	Danio_rerio
ENSGAFG00000003571	pop4	98	49.718	ENSDNOG00000047663	POP4	69	50.000	Dasypus_novemcinctus
ENSGAFG00000003571	pop4	96	48.851	ENSDORG00000008577	Pop4	99	49.432	Dipodomys_ordii
ENSGAFG00000003571	pop4	96	39.080	ENSETEG00000003607	POP4	79	39.080	Echinops_telfairi
ENSGAFG00000003571	pop4	93	32.961	ENSEBUG00000004305	pop4	77	34.078	Eptatretus_burgeri
ENSGAFG00000003571	pop4	97	33.333	ENSEBUG00000008575	pop4	77	33.333	Eptatretus_burgeri
ENSGAFG00000003571	pop4	57	52.885	ENSEBUG00000010447	pop4	65	40.120	Eptatretus_burgeri
ENSGAFG00000003571	pop4	96	50.000	ENSECAG00000020206	POP4	59	50.000	Equus_caballus
ENSGAFG00000003571	pop4	87	34.177	ENSEEUG00000013109	POP4	78	34.177	Erinaceus_europaeus
ENSGAFG00000003571	pop4	98	53.672	ENSELUG00000019812	pop4	79	54.237	Esox_lucius
ENSGAFG00000003571	pop4	96	50.575	ENSFCAG00000001619	POP4	78	50.575	Felis_catus
ENSGAFG00000003571	pop4	97	50.857	ENSFALG00000000206	POP4	77	52.571	Ficedula_albicollis
ENSGAFG00000003571	pop4	96	51.149	ENSFDAG00000017859	POP4	78	51.149	Fukomys_damarensis
ENSGAFG00000003571	pop4	84	69.935	ENSFHEG00000012745	pop4	68	69.935	Fundulus_heteroclitus
ENSGAFG00000003571	pop4	87	56.707	ENSGMOG00000000335	pop4	77	56.707	Gadus_morhua
ENSGAFG00000003571	pop4	98	49.718	ENSGALG00000041972	POP4	73	50.282	Gallus_gallus
ENSGAFG00000003571	pop4	99	68.715	ENSGACG00000014510	pop4	76	74.286	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAFG00000003571	pop4	98	50.282	ENSGAGG00000024544	POP4	63	50.847	Gopherus_agassizii
ENSGAFG00000003571	pop4	96	51.724	ENSGGOG00000038346	POP4	78	52.571	Gorilla_gorilla
ENSGAFG00000003571	pop4	99	69.274	ENSHBUG00000021821	pop4	80	69.274	Haplochromis_burtoni
ENSGAFG00000003571	pop4	96	50.575	ENSHGLG00000015798	POP4	78	50.575	Heterocephalus_glaber_female
ENSGAFG00000003571	pop4	96	50.575	ENSHGLG00100009737	POP4	78	50.575	Heterocephalus_glaber_male
ENSGAFG00000003571	pop4	99	65.363	ENSHCOG00000020937	pop4	80	65.363	Hippocampus_comes
ENSGAFG00000003571	pop4	98	55.367	ENSIPUG00000013652	pop4	79	55.367	Ictalurus_punctatus
ENSGAFG00000003571	pop4	96	51.724	ENSSTOG00000011016	POP4	78	51.724	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGAFG00000003571	pop4	96	51.149	ENSJJAG00000013376	Pop4	78	51.149	Jaculus_jaculus
ENSGAFG00000003571	pop4	99	75.978	ENSKMAG00000012250	pop4	80	75.978	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAFG00000003571	pop4	100	67.956	ENSLBEG00000018846	-	84	68.508	Labrus_bergylta
ENSGAFG00000003571	pop4	99	68.715	ENSLBEG00000014139	pop4	80	69.274	Labrus_bergylta
ENSGAFG00000003571	pop4	96	46.552	ENSLACG00000008581	POP4	77	47.126	Latimeria_chalumnae
ENSGAFG00000003571	pop4	98	53.107	ENSLOCG00000005597	pop4	79	53.107	Lepisosteus_oculatus
ENSGAFG00000003571	pop4	96	51.149	ENSLAFG00000000084	POP4	78	51.149	Loxodonta_africana
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ENSGAFG00000003571	pop4	96	51.724	ENSMMUG00000017424	POP4	78	52.571	Macaca_mulatta
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ENSGAFG00000003571	pop4	98	72.881	ENSMAMG00000011716	pop4	79	72.881	Mastacembelus_armatus
ENSGAFG00000003571	pop4	99	69.274	ENSMZEG00005002360	pop4	80	69.274	Maylandia_zebra
ENSGAFG00000003571	pop4	96	50.575	ENSMGAG00000005337	POP4	76	51.149	Meleagris_gallopavo
ENSGAFG00000003571	pop4	98	50.562	ENSMAUG00000020110	Pop4	79	50.556	Mesocricetus_auratus
ENSGAFG00000003571	pop4	96	52.299	ENSMICG00000035730	POP4	77	54.857	Microcebus_murinus
ENSGAFG00000003571	pop4	98	66.102	ENSMMOG00000015321	pop4	78	66.667	Mola_mola
ENSGAFG00000003571	pop4	98	49.718	ENSMODG00000029406	POP4	75	51.412	Monodelphis_domestica
ENSGAFG00000003571	pop4	99	69.274	ENSMALG00000012571	pop4	80	69.832	Monopterus_albus
ENSGAFG00000003571	pop4	98	54.237	MGP_CAROLIEiJ_G0029600	Pop4	79	54.237	Mus_caroli
ENSGAFG00000003571	pop4	98	54.237	ENSMUSG00000030423	Pop4	79	54.237	Mus_musculus
ENSGAFG00000003571	pop4	98	53.107	MGP_SPRETEiJ_G0030699	Pop4	79	54.494	Mus_spretus
ENSGAFG00000003571	pop4	96	51.149	ENSMPUG00000008041	-	78	51.149	Mustela_putorius_furo
ENSGAFG00000003571	pop4	96	44.253	ENSMPUG00000008063	-	77	44.253	Mustela_putorius_furo
ENSGAFG00000003571	pop4	87	40.506	ENSMLUG00000010774	POP4	70	41.139	Myotis_lucifugus
ENSGAFG00000003571	pop4	90	53.988	ENSOPRG00000004736	POP4	78	55.152	Ochotona_princeps
ENSGAFG00000003571	pop4	96	50.000	ENSODEG00000013025	POP4	76	51.515	Octodon_degus
ENSGAFG00000003571	pop4	98	68.927	ENSONIG00000003458	pop4	77	68.927	Oreochromis_niloticus
ENSGAFG00000003571	pop4	91	53.939	ENSOCUG00000015974	POP4	71	54.167	Oryctolagus_cuniculus
ENSGAFG00000003571	pop4	98	65.537	ENSORLG00000020317	pop4	79	65.537	Oryzias_latipes
ENSGAFG00000003571	pop4	99	65.922	ENSORLG00015011624	pop4	80	65.922	Oryzias_latipes_hsok
ENSGAFG00000003571	pop4	99	67.598	ENSOMEG00000002538	pop4	80	67.598	Oryzias_melastigma
ENSGAFG00000003571	pop4	96	53.448	ENSOGAG00000011168	POP4	78	56.000	Otolemur_garnettii
ENSGAFG00000003571	pop4	91	53.614	ENSOARG00000004041	POP4	74	53.614	Ovis_aries
ENSGAFG00000003571	pop4	96	51.724	ENSPPAG00000040372	POP4	78	52.571	Pan_paniscus
ENSGAFG00000003571	pop4	96	50.575	ENSPPRG00000010502	POP4	78	50.575	Panthera_pardus
ENSGAFG00000003571	pop4	96	50.575	ENSPTIG00000016598	POP4	78	50.575	Panthera_tigris_altaica
ENSGAFG00000003571	pop4	96	51.724	ENSPTRG00000010779	POP4	78	52.571	Pan_troglodytes
ENSGAFG00000003571	pop4	96	51.724	ENSPANG00000008546	POP4	78	52.571	Papio_anubis
ENSGAFG00000003571	pop4	84	59.211	ENSPKIG00000004468	pop4	66	59.211	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGAFG00000003571	pop4	96	51.149	ENSPSIG00000015690	POP4	78	54.375	Pelodiscus_sinensis
ENSGAFG00000003571	pop4	87	58.750	ENSPMGG00000008608	pop4	77	60.000	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGAFG00000003571	pop4	97	52.273	ENSPEMG00000014034	-	76	52.514	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGAFG00000003571	pop4	97	44.318	ENSPEMG00000019982	-	76	44.693	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGAFG00000003571	pop4	55	62.000	ENSPMAG00000006265	pop4	51	62.000	Petromyzon_marinus
ENSGAFG00000003571	pop4	98	50.282	ENSPCIG00000024738	POP4	75	50.282	Phascolarctos_cinereus
ENSGAFG00000003571	pop4	99	89.944	ENSPFOG00000000925	pop4	80	89.944	Poecilia_formosa
ENSGAFG00000003571	pop4	99	89.385	ENSPLAG00000003161	pop4	80	89.385	Poecilia_latipinna
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ENSGAFG00000003571	pop4	98	50.847	ENSPCAG00000007737	POP4	79	51.412	Procavia_capensis
ENSGAFG00000003571	pop4	96	50.575	ENSPCOG00000018055	POP4	78	50.575	Propithecus_coquereli
ENSGAFG00000003571	pop4	98	50.838	ENSPVAG00000006069	POP4	79	50.838	Pteropus_vampyrus
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ENSGAFG00000003571	pop4	98	60.674	ENSPNAG00000005591	pop4	79	60.674	Pygocentrus_nattereri
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