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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGAFG00000003960 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: sbno1
Alias: -
Full Name: strawberry notch homolog 1 (Drosophila)
Gene Type: protein_coding
Species: Gambusia_affinis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 18910 bases
Position: chrNHOQ01001156.1:16855764-16874673
Accession: ZDB-GENE-080522-2
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGAFP00000005976	ResIII	PF04851.15	1.7e-07	1	1
ENSGAFP00000005933	ResIII	PF04851.15	1.8e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGAFT00000006043	-	4080	-	ENSGAFP00000005976	1359 (aa)	-	-
ENSGAFT00000006000	-	5077	-	ENSGAFP00000005933	1403 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSGAFG00000003960	sbno1	73	64.399	ENSGAFG00000004860	si:ch73-63e15.2	77	64.399

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGAFG00000003960	sbno1	99	75.840	ENSG00000139697	SBNO1	99	75.828	Homo_sapiens
ENSGAFG00000003960	sbno1	84	93.984	ENSAPOG00000003196	sbno1	98	93.913	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAFG00000003960	sbno1	99	75.821	ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	75.738	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGAFG00000003960	sbno1	99	88.929	ENSACIG00000008088	sbno1	99	89.075	Amphilophus_citrinellus
ENSGAFG00000003960	sbno1	100	90.541	ENSAOCG00000014859	sbno1	99	90.896	Amphiprion_ocellaris
ENSGAFG00000003960	sbno1	100	90.469	ENSAPEG00000006069	sbno1	99	90.825	Amphiprion_percula
ENSGAFG00000003960	sbno1	100	91.827	ENSATEG00000006667	sbno1	100	91.898	Anabas_testudineus
ENSGAFG00000003960	sbno1	98	76.509	ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	76.396	Anas_platyrhynchos
ENSGAFG00000003960	sbno1	97	76.635	ENSACAG00000015441	SBNO1	88	76.432	Anolis_carolinensis
ENSGAFG00000003960	sbno1	95	84.029	ENSANAG00000029958	-	99	83.513	Aotus_nancymaae
ENSGAFG00000003960	sbno1	99	87.509	ENSACLG00000024913	sbno1	100	87.731	Astatotilapia_calliptera
ENSGAFG00000003960	sbno1	100	81.702	ENSAMXG00000019473	sbno1	100	82.057	Astyanax_mexicanus
ENSGAFG00000003960	sbno1	100	76.067	ENSBTAG00000020505	SBNO1	99	77.299	Bos_taurus
ENSGAFG00000003960	sbno1	99	76.144	ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	75.899	Callithrix_jacchus
ENSGAFG00000003960	sbno1	99	75.944	ENSCAFG00000007503	SBNO1	99	78.810	Canis_familiaris
ENSGAFG00000003960	sbno1	95	81.149	ENSCAFG00020015363	SBNO1	99	81.329	Canis_lupus_dingo
ENSGAFG00000003960	sbno1	95	83.513	ENSCHIG00000008382	SBNO1	99	83.513	Capra_hircus
ENSGAFG00000003960	sbno1	99	76.867	ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	77.477	Carlito_syrichta
ENSGAFG00000003960	sbno1	92	83.393	ENSCAPG00000000384	SBNO1	99	83.662	Cavia_aperea
ENSGAFG00000003960	sbno1	95	83.662	ENSCPOG00000008109	SBNO1	99	83.662	Cavia_porcellus
ENSGAFG00000003960	sbno1	99	72.615	ENSCCAG00000035316	SBNO1	99	73.514	Cebus_capucinus
ENSGAFG00000003960	sbno1	93	83.393	ENSCATG00000008239	SBNO1	99	83.842	Cercocebus_atys
ENSGAFG00000003960	sbno1	95	83.662	ENSCLAG00000008995	SBNO1	99	83.662	Chinchilla_lanigera
ENSGAFG00000003960	sbno1	85	81.935	ENSCSAG00000002064	SBNO1	99	82.084	Chlorocebus_sabaeus
ENSGAFG00000003960	sbno1	96	73.228	ENSCHOG00000008814	SBNO1	96	73.189	Choloepus_hoffmanni
ENSGAFG00000003960	sbno1	97	77.778	ENSCPBG00000025968	SBNO1	98	77.273	Chrysemys_picta_bellii
ENSGAFG00000003960	sbno1	99	72.211	ENSCANG00000042688	-	99	72.163	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGAFG00000003960	sbno1	95	82.437	ENSCGRG00001017470	Sbno1	99	82.437	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGAFG00000003960	sbno1	95	82.437	ENSCGRG00000004756	Sbno1	99	82.437	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGAFG00000003960	sbno1	100	87.838	ENSCSEG00000011919	sbno1	100	87.909	Cynoglossus_semilaevis
ENSGAFG00000003960	sbno1	100	95.085	ENSCVAG00000007038	sbno1	100	95.085	Cyprinodon_variegatus
ENSGAFG00000003960	sbno1	99	82.064	ENSDARG00000099080	sbno1	99	82.290	Danio_rerio
ENSGAFG00000003960	sbno1	99	78.707	ENSDNOG00000017147	SBNO1	96	78.707	Dasypus_novemcinctus
ENSGAFG00000003960	sbno1	99	71.298	ENSDORG00000015261	Sbno1	99	80.811	Dipodomys_ordii
ENSGAFG00000003960	sbno1	93	72.642	ENSETEG00000005620	SBNO1	93	72.642	Echinops_telfairi
ENSGAFG00000003960	sbno1	74	64.922	ENSEBUG00000013823	sbno1	93	63.828	Eptatretus_burgeri
ENSGAFG00000003960	sbno1	50	76.754	ENSEASG00005012595	-	92	76.833	Equus_asinus_asinus
ENSGAFG00000003960	sbno1	99	76.050	ENSECAG00000006127	SBNO1	99	76.727	Equus_caballus
ENSGAFG00000003960	sbno1	81	77.049	ENSEEUG00000003793	SBNO1	82	77.049	Erinaceus_europaeus
ENSGAFG00000003960	sbno1	100	82.991	ENSELUG00000002886	sbno1	99	82.849	Esox_lucius
ENSGAFG00000003960	sbno1	99	76.050	ENSFCAG00000015331	SBNO1	99	75.899	Felis_catus
ENSGAFG00000003960	sbno1	98	76.652	ENSFALG00000009273	SBNO1	99	76.466	Ficedula_albicollis
ENSGAFG00000003960	sbno1	95	81.159	ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	74.191	Fukomys_damarensis
ENSGAFG00000003960	sbno1	100	95.513	ENSFHEG00000007360	sbno1	100	95.513	Fundulus_heteroclitus
ENSGAFG00000003960	sbno1	96	84.966	ENSGMOG00000018229	sbno1	99	85.053	Gadus_morhua
ENSGAFG00000003960	sbno1	88	76.653	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	76.518	Gallus_gallus
ENSGAFG00000003960	sbno1	96	88.636	ENSGACG00000015633	sbno1	99	88.805	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAFG00000003960	sbno1	96	84.074	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	83.216	Gopherus_agassizii
ENSGAFG00000003960	sbno1	95	83.662	ENSGGOG00000015000	SBNO1	99	83.662	Gorilla_gorilla
ENSGAFG00000003960	sbno1	99	81.268	ENSHBUG00000011910	sbno1	100	81.370	Haplochromis_burtoni
ENSGAFG00000003960	sbno1	95	84.392	ENSHGLG00000014165	-	99	75.847	Heterocephalus_glaber_female
ENSGAFG00000003960	sbno1	92	92.277	ENSHCOG00000003246	sbno1	95	92.277	Hippocampus_comes
ENSGAFG00000003960	sbno1	100	81.812	ENSIPUG00000015830	Sbno1	98	82.549	Ictalurus_punctatus
ENSGAFG00000003960	sbno1	95	83.662	ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	83.662	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGAFG00000003960	sbno1	95	80.251	ENSJJAG00000001741	Sbno1	99	80.251	Jaculus_jaculus
ENSGAFG00000003960	sbno1	99	92.791	ENSKMAG00000009696	sbno1	99	93.005	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAFG00000003960	sbno1	100	88.936	ENSLBEG00000007623	sbno1	100	89.149	Labrus_bergylta
ENSGAFG00000003960	sbno1	100	72.836	ENSLACG00000017227	SBNO1	99	75.239	Latimeria_chalumnae
ENSGAFG00000003960	sbno1	100	81.127	ENSLOCG00000005725	sbno1	97	80.986	Lepisosteus_oculatus
ENSGAFG00000003960	sbno1	99	75.332	ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	75.476	Loxodonta_africana
ENSGAFG00000003960	sbno1	95	80.639	ENSMFAG00000031429	SBNO1	99	80.639	Macaca_fascicularis
ENSGAFG00000003960	sbno1	95	80.639	ENSMMUG00000011496	SBNO1	99	80.639	Macaca_mulatta
ENSGAFG00000003960	sbno1	95	83.662	ENSMLEG00000033260	SBNO1	99	83.662	Mandrillus_leucophaeus
ENSGAFG00000003960	sbno1	100	91.518	ENSMAMG00000005473	sbno1	100	91.518	Mastacembelus_armatus
ENSGAFG00000003960	sbno1	98	76.906	ENSMGAG00000003274	SBNO1	99	76.575	Meleagris_gallopavo
ENSGAFG00000003960	sbno1	50	73.684	ENSMAUG00000004834	-	98	78.030	Mesocricetus_auratus
ENSGAFG00000003960	sbno1	95	81.125	ENSMICG00000006573	-	99	80.645	Microcebus_murinus
ENSGAFG00000003960	sbno1	95	83.154	ENSMOCG00000009390	Sbno1	99	83.154	Microtus_ochrogaster
ENSGAFG00000003960	sbno1	100	85.641	ENSMMOG00000008691	sbno1	99	86.091	Mola_mola
ENSGAFG00000003960	sbno1	99	75.545	ENSMODG00000012470	SBNO1	98	75.760	Monodelphis_domestica
ENSGAFG00000003960	sbno1	100	90.121	ENSMALG00000001056	sbno1	100	90.263	Monopterus_albus
ENSGAFG00000003960	sbno1	99	75.473	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	95	91.228	Mus_caroli
ENSGAFG00000003960	sbno1	99	75.490	ENSMUSG00000038095	Sbno1	94	91.228	Mus_musculus
ENSGAFG00000003960	sbno1	99	76.342	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	95	91.228	Mus_pahari
ENSGAFG00000003960	sbno1	99	75.420	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	95	91.228	Mus_spretus
ENSGAFG00000003960	sbno1	99	76.104	ENSMPUG00000001658	SBNO1	99	75.952	Mustela_putorius_furo
ENSGAFG00000003960	sbno1	99	75.862	ENSMLUG00000017159	SBNO1	99	75.617	Myotis_lucifugus
ENSGAFG00000003960	sbno1	92	84.570	ENSNGAG00000012620	Sbno1	98	84.570	Nannospalax_galili
ENSGAFG00000003960	sbno1	99	88.274	ENSNBRG00000019189	sbno1	100	88.422	Neolamprologus_brichardi
ENSGAFG00000003960	sbno1	99	73.913	ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	75.763	Nomascus_leucogenys
ENSGAFG00000003960	sbno1	62	72.152	ENSMEUG00000008768	-	93	73.418	Notamacropus_eugenii
ENSGAFG00000003960	sbno1	99	75.335	ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	75.405	Ochotona_princeps
ENSGAFG00000003960	sbno1	95	83.842	ENSODEG00000009997	SBNO1	99	83.842	Octodon_degus
ENSGAFG00000003960	sbno1	100	89.979	ENSONIG00000015348	sbno1	100	90.334	Oreochromis_niloticus
ENSGAFG00000003960	sbno1	98	75.071	ENSOCUG00000002441	SBNO1	95	74.982	Oryctolagus_cuniculus
ENSGAFG00000003960	sbno1	100	89.268	ENSORLG00000001593	sbno1	100	89.481	Oryzias_latipes
ENSGAFG00000003960	sbno1	100	89.687	ENSORLG00020015216	sbno1	100	89.758	Oryzias_latipes_hni
ENSGAFG00000003960	sbno1	100	89.545	ENSORLG00015002726	sbno1	100	89.616	Oryzias_latipes_hsok
ENSGAFG00000003960	sbno1	100	89.110	ENSOMEG00000019313	sbno1	100	89.110	Oryzias_melastigma
ENSGAFG00000003960	sbno1	50	72.521	ENSOGAG00000010781	-	98	76.364	Otolemur_garnettii
ENSGAFG00000003960	sbno1	100	75.386	ENSOARG00000004404	SBNO1	99	75.758	Ovis_aries
ENSGAFG00000003960	sbno1	95	83.662	ENSPPAG00000024635	SBNO1	99	83.662	Pan_paniscus
ENSGAFG00000003960	sbno1	99	76.050	ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	75.899	Panthera_pardus
ENSGAFG00000003960	sbno1	99	76.070	ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	75.918	Panthera_tigris_altaica
ENSGAFG00000003960	sbno1	95	83.662	ENSPTRG00000005597	SBNO1	99	83.662	Pan_troglodytes
ENSGAFG00000003960	sbno1	95	83.662	ENSPANG00000011640	SBNO1	99	83.662	Papio_anubis
ENSGAFG00000003960	sbno1	100	81.767	ENSPKIG00000001441	sbno1	100	81.555	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGAFG00000003960	sbno1	92	73.018	ENSPSIG00000009256	-	99	73.089	Pelodiscus_sinensis
ENSGAFG00000003960	sbno1	97	77.595	ENSPSIG00000009572	-	99	77.199	Pelodiscus_sinensis
ENSGAFG00000003960	sbno1	95	82.975	ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	82.975	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGAFG00000003960	sbno1	99	77.080	ENSPCIG00000010985	SBNO1	99	77.210	Phascolarctos_cinereus
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ENSGAFG00000003960	sbno1	99	77.197	ENSPCOG00000024277	SBNO1	99	83.971	Propithecus_coquereli
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