EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGAFG00000004044 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: xpo6
Alias: Ranbp20|fi24f12|wu:fi24f12
Full Name: exportin 6
Gene Type: protein_coding
Species: Gambusia_affinis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 19521 bases
Position: chrNHOQ01000074.1:60160-79680
Accession: ZDB-GENE-030131-5912
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGAFP00000006054	Xpo1	PF08389.12	1.8e-20	1	1
ENSGAFP00000006092	Xpo1	PF08389.12	1.9e-20	1	1
ENSGAFP00000006054	IBN_N	PF03810.19	2e-07	1	1
ENSGAFP00000006092	IBN_N	PF03810.19	2.4e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGAFT00000006160	-	3471	-	ENSGAFP00000006092	1156 (aa)	-	-
ENSGAFT00000006121	-	4926	-	ENSGAFP00000006054	1148 (aa)	-	-

Gene Model

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	75.000	ENSG00000169180	XPO6	100	94.118	Homo_sapiens
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	92.708	ENSAPOG00000012873	xpo6	100	92.795	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAFG00000004044	xpo6	99	74.717	ENSAMEG00000011014	XPO6	100	74.823	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGAFG00000004044	xpo6	99	91.171	ENSACIG00000008055	xpo6	99	91.346	Amphilophus_citrinellus
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	93.056	ENSAOCG00000001326	xpo6	100	93.142	Amphiprion_ocellaris
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	92.969	ENSAPEG00000016304	xpo6	100	93.056	Amphiprion_percula
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	91.406	ENSATEG00000002273	xpo6	100	91.493	Anabas_testudineus
ENSGAFG00000004044	xpo6	99	75.937	ENSAPLG00000007480	XPO6	100	75.908	Anas_platyrhynchos
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	66.956	ENSACAG00000016883	XPO6	100	66.956	Anolis_carolinensis
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	74.739	ENSANAG00000031761	XPO6	100	74.739	Aotus_nancymaae
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	91.840	ENSACLG00000007048	xpo6	100	91.927	Astatotilapia_calliptera
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	76.690	ENSAMXG00000032539	xpo6	100	76.690	Astyanax_mexicanus
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	74.390	ENSBTAG00000010309	XPO6	100	74.390	Bos_taurus
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	74.826	ENSCJAG00000006014	XPO6	100	74.826	Callithrix_jacchus
ENSGAFG00000004044	xpo6	99	74.891	ENSCAFG00000017356	XPO6	100	75.000	Canis_familiaris
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	74.913	ENSCAFG00020011808	XPO6	100	74.913	Canis_lupus_dingo
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	74.739	ENSCHIG00000022341	XPO6	100	74.739	Capra_hircus
ENSGAFG00000004044	xpo6	99	72.203	ENSTSYG00000012249	XPO6	100	72.203	Carlito_syrichta
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	74.739	ENSCPOG00000012824	XPO6	100	74.739	Cavia_porcellus
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	74.739	ENSCCAG00000036360	XPO6	100	74.739	Cebus_capucinus
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	75.087	ENSCATG00000034030	XPO6	100	75.087	Cercocebus_atys
ENSGAFG00000004044	xpo6	99	74.804	ENSCLAG00000012270	XPO6	100	74.911	Chinchilla_lanigera
ENSGAFG00000004044	xpo6	91	73.623	ENSCHOG00000004369	XPO6	91	75.270	Choloepus_hoffmanni
ENSGAFG00000004044	xpo6	82	82.353	ENSCPBG00000024660	XPO6	99	82.353	Chrysemys_picta_bellii
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	44.919	ENSCING00000006884	-	100	44.919	Ciona_intestinalis
ENSGAFG00000004044	xpo6	99	44.397	ENSCSAVG00000000850	-	100	43.900	Ciona_savignyi
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	75.000	ENSCANG00000041578	XPO6	100	75.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	74.913	ENSCGRG00001013173	Xpo6	100	74.913	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	90.799	ENSCSEG00000013622	xpo6	100	90.885	Cynoglossus_semilaevis
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	95.383	ENSCVAG00000017399	xpo6	100	95.383	Cyprinodon_variegatus
ENSGAFG00000004044	xpo6	97	76.450	ENSDARG00000041217	xpo6	99	76.450	Danio_rerio
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	74.913	ENSDNOG00000012449	XPO6	100	74.913	Dasypus_novemcinctus
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	75.000	ENSDORG00000000919	Xpo6	100	75.000	Dipodomys_ordii
ENSGAFG00000004044	xpo6	83	74.903	ENSETEG00000018768	XPO6	85	74.903	Echinops_telfairi
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	59.150	ENSEBUG00000015560	xpo6	99	59.894	Eptatretus_burgeri
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	75.174	ENSEASG00005017296	XPO6	100	75.174	Equus_asinus_asinus
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	75.087	ENSECAG00000008601	XPO6	100	75.087	Equus_caballus
ENSGAFG00000004044	xpo6	97	69.300	ENSEEUG00000014587	XPO6	100	69.315	Erinaceus_europaeus
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	84.930	ENSELUG00000009159	xpo6	100	84.930	Esox_lucius
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	75.000	ENSFCAG00000010309	XPO6	100	75.000	Felis_catus
ENSGAFG00000004044	xpo6	99	75.850	ENSFALG00000004441	XPO6	98	76.112	Ficedula_albicollis
ENSGAFG00000004044	xpo6	99	74.804	ENSFDAG00000012689	XPO6	100	74.911	Fukomys_damarensis
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	95.557	ENSFHEG00000021190	xpo6	100	95.557	Fundulus_heteroclitus
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	75.871	ENSGALG00000035360	XPO6	100	75.871	Gallus_gallus
ENSGAFG00000004044	xpo6	95	75.298	ENSGAGG00000022738	XPO6	100	75.298	Gopherus_agassizii
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	74.913	ENSGGOG00000005609	XPO6	100	74.913	Gorilla_gorilla
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	91.927	ENSHBUG00000019504	xpo6	100	92.014	Haplochromis_burtoni
ENSGAFG00000004044	xpo6	94	61.164	ENSHGLG00000003865	-	99	61.164	Heterocephalus_glaber_female
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	75.174	ENSHGLG00000009679	-	100	75.174	Heterocephalus_glaber_female
ENSGAFG00000004044	xpo6	94	63.150	ENSHGLG00100001081	-	99	63.150	Heterocephalus_glaber_male
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	75.087	ENSHGLG00100003673	-	99	75.087	Heterocephalus_glaber_male
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	89.835	ENSHCOG00000004987	xpo6	100	89.835	Hippocampus_comes
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	75.652	ENSIPUG00000006516	xpo6	100	76.348	Ictalurus_punctatus
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	74.652	ENSSTOG00000012161	XPO6	100	74.652	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	74.303	ENSJJAG00000019392	Xpo6	100	74.303	Jaculus_jaculus
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	94.164	ENSKMAG00000010403	xpo6	100	94.164	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	91.493	ENSLBEG00000023039	xpo6	100	91.580	Labrus_bergylta
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	74.826	ENSLACG00000017930	XPO6	100	74.826	Latimeria_chalumnae
ENSGAFG00000004044	xpo6	94	80.851	ENSLOCG00000003304	xpo6	100	80.851	Lepisosteus_oculatus
ENSGAFG00000004044	xpo6	99	74.281	ENSLAFG00000011960	XPO6	98	77.198	Loxodonta_africana
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	75.087	ENSMFAG00000045067	XPO6	100	75.087	Macaca_fascicularis
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	75.087	ENSMMUG00000018623	XPO6	100	75.087	Macaca_mulatta
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	75.087	ENSMNEG00000028587	XPO6	100	75.087	Macaca_nemestrina
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	75.087	ENSMLEG00000029685	XPO6	100	75.087	Mandrillus_leucophaeus
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	91.667	ENSMAMG00000001351	xpo6	100	91.753	Mastacembelus_armatus
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	91.927	ENSMZEG00005010620	xpo6	100	92.014	Maylandia_zebra
ENSGAFG00000004044	xpo6	97	75.000	ENSMGAG00000009566	XPO6	100	75.000	Meleagris_gallopavo
ENSGAFG00000004044	xpo6	99	66.201	ENSMAUG00000012539	Xpo6	100	65.939	Mesocricetus_auratus
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	74.913	ENSMICG00000001923	XPO6	100	74.913	Microcebus_murinus
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	74.826	ENSMOCG00000008015	Xpo6	100	74.826	Microtus_ochrogaster
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	89.547	ENSMMOG00000011992	xpo6	100	89.547	Mola_mola
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	75.523	ENSMODG00000015516	XPO6	100	75.523	Monodelphis_domestica
ENSGAFG00000004044	xpo6	99	81.763	ENSMALG00000020612	xpo6	99	82.024	Monopterus_albus
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	74.826	MGP_CAROLIEiJ_G0030439	Xpo6	99	77.198	Mus_caroli
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	74.652	ENSMUSG00000000131	Xpo6	100	74.652	Mus_musculus
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	74.652	MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	74.652	Mus_pahari
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	74.477	MGP_SPRETEiJ_G0031553	Xpo6	100	74.477	Mus_spretus
ENSGAFG00000004044	xpo6	99	74.368	ENSMPUG00000012920	XPO6	98	74.425	Mustela_putorius_furo
ENSGAFG00000004044	xpo6	99	74.455	ENSMLUG00000012970	XPO6	100	74.557	Myotis_lucifugus
ENSGAFG00000004044	xpo6	99	74.804	ENSNGAG00000012740	Xpo6	99	74.911	Nannospalax_galili
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	92.014	ENSNBRG00000007275	xpo6	100	92.101	Neolamprologus_brichardi
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	75.000	ENSNLEG00000011518	XPO6	100	75.000	Nomascus_leucogenys
ENSGAFG00000004044	xpo6	84	78.295	ENSOPRG00000009278	XPO6	87	78.295	Ochotona_princeps
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	74.913	ENSODEG00000012917	XPO6	100	74.913	Octodon_degus
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	92.101	ENSONIG00000019366	xpo6	100	92.188	Oreochromis_niloticus
ENSGAFG00000004044	xpo6	99	75.065	ENSOCUG00000002727	XPO6	100	75.177	Oryctolagus_cuniculus
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	90.696	ENSORLG00000011231	xpo6	100	90.696	Oryzias_latipes
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	91.043	ENSORLG00020000386	xpo6	100	91.043	Oryzias_latipes_hni
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	90.783	ENSORLG00015003636	xpo6	100	90.783	Oryzias_latipes_hsok
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	91.478	ENSOMEG00000016505	xpo6	100	91.478	Oryzias_melastigma
ENSGAFG00000004044	xpo6	99	75.065	ENSOGAG00000012844	XPO6	100	75.177	Otolemur_garnettii
ENSGAFG00000004044	xpo6	99	74.629	ENSOARG00000000960	XPO6	100	75.000	Ovis_aries
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	75.000	ENSPPAG00000033668	XPO6	100	75.000	Pan_paniscus
ENSGAFG00000004044	xpo6	99	74.780	ENSPPRG00000001454	XPO6	100	74.888	Panthera_pardus
ENSGAFG00000004044	xpo6	97	74.031	ENSPTIG00000016663	XPO6	99	74.128	Panthera_tigris_altaica
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	75.000	ENSPTRG00000007919	XPO6	100	75.000	Pan_troglodytes
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	75.087	ENSPANG00000017103	XPO6	100	75.087	Papio_anubis
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	79.861	ENSPKIG00000022550	xpo6	100	79.913	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGAFG00000004044	xpo6	99	74.449	ENSPSIG00000018225	XPO6	100	74.449	Pelodiscus_sinensis
ENSGAFG00000004044	xpo6	99	90.123	ENSPMGG00000014436	xpo6	100	90.123	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	74.739	ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	74.739	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGAFG00000004044	xpo6	99	67.798	ENSPMAG00000003127	xpo6	99	67.798	Petromyzon_marinus
ENSGAFG00000004044	xpo6	97	74.978	ENSPCIG00000003863	XPO6	100	74.724	Phascolarctos_cinereus
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	98.085	ENSPFOG00000008763	xpo6	100	98.085	Poecilia_formosa
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	98.084	ENSPLAG00000014054	xpo6	100	98.084	Poecilia_latipinna
ENSGAFG00000004044	xpo6	100	98.171	ENSPMEG00000018994	xpo6	100	98.171	Poecilia_mexicana
ENSGAFG00000004044	xpo6	97	98.120	ENSPREG00000016421	xpo6	96	98.120	Poecilia_reticulata
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