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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGAFG00000004408 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: xpo1a
Alias: im:7151655
Full Name: exportin 1 (CRM1 homolog%2C yeast) a
Gene Type: protein_coding
Species: Gambusia_affinis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11770 bases
Position: chrNHOQ01000621.1:425113-436882
Accession: ZDB-GENE-050309-201
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGAFP00000006519	CRM1_C	PF08767.11	1.2e-130	1	1
ENSGAFP00000006519	Xpo1	PF08389.12	1.9e-39	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGAFT00000006590	-	2808	-	ENSGAFP00000006519	935 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	93.936	ENSGAFG00000003355	-	95	93.936

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	91.915	ENSG00000082898	XPO1	88	91.915	Homo_sapiens
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	96.043	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	96.043	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	94.043	ENSAPOG00000004984	-	93	94.043	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.766	ENSAMEG00000003460	XPO1	88	92.766	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	93.936	ENSACIG00000010818	-	100	93.936	Amphilophus_citrinellus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	97.968	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	97.968	Amphilophus_citrinellus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	93.936	ENSAOCG00000010121	-	100	91.684	Amphiprion_ocellaris
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	98.289	ENSAOCG00000018914	xpo1a	88	98.289	Amphiprion_ocellaris
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	98.289	ENSAPEG00000006583	xpo1a	96	98.289	Amphiprion_percula
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	93.936	ENSAPEG00000007038	-	99	91.791	Amphiprion_percula
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	93.936	ENSATEG00000008816	-	93	93.936	Anabas_testudineus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	98.182	ENSATEG00000020750	xpo1a	98	98.122	Anabas_testudineus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.979	ENSAPLG00000004008	XPO1	88	92.979	Anas_platyrhynchos
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.979	ENSACAG00000002501	XPO1	88	92.979	Anolis_carolinensis
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	91.915	ENSANAG00000020802	XPO1	88	91.915	Aotus_nancymaae
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	93.936	ENSACLG00000015192	-	93	93.936	Astatotilapia_calliptera
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	98.289	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	98.289	Astatotilapia_calliptera
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	93.936	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	91.923	Astyanax_mexicanus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	93.432	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	93.432	Astyanax_mexicanus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.766	ENSBTAG00000013254	XPO1	88	92.766	Bos_taurus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	99	52.898	WBGene00002078	xpo-1	91	51.316	Caenorhabditis_elegans
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	91.915	ENSCJAG00000008877	XPO1	88	91.915	Callithrix_jacchus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.766	ENSCAFG00000003050	XPO1	88	92.766	Canis_familiaris
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.766	ENSCAFG00020026910	XPO1	94	92.766	Canis_lupus_dingo
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.766	ENSCHIG00000018132	XPO1	88	92.766	Capra_hircus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.766	ENSTSYG00000004330	XPO1	88	92.766	Carlito_syrichta
ENSGAFG00000004408	xpo1a	60	88.298	ENSCAPG00000006454	-	100	88.298	Cavia_aperea
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	91.277	ENSCPOG00000034053	XPO1	88	91.277	Cavia_porcellus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	72.334	ENSCCAG00000037445	XPO1	86	72.545	Cebus_capucinus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	91.915	ENSCATG00000032674	XPO1	100	91.915	Cercocebus_atys
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.553	ENSCLAG00000012953	XPO1	88	92.553	Chinchilla_lanigera
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	91.915	ENSCSAG00000014606	XPO1	88	91.915	Chlorocebus_sabaeus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	80	94.844	ENSCHOG00000012088	XPO1	71	94.844	Choloepus_hoffmanni
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.979	ENSCPBG00000026239	XPO1	94	92.979	Chrysemys_picta_bellii
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	81.277	ENSCING00000024562	-	88	81.277	Ciona_intestinalis
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	79.557	ENSCSAVG00000005965	-	88	79.557	Ciona_savignyi
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	87.553	ENSCANG00000028883	XPO1	100	91.489	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	91.809	ENSCGRG00001000263	Xpo1	88	91.809	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	91.809	ENSCGRG00000001520	Xpo1	88	91.809	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.872	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	92.872	Cynoglossus_semilaevis
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	98.610	ENSCVAG00000016558	xpo1a	88	98.610	Cyprinodon_variegatus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	93.830	ENSCVAG00000016788	-	88	93.830	Cyprinodon_variegatus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	94.149	ENSDARG00000063229	xpo1b	88	94.149	Danio_rerio
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	94.149	ENSDARG00000078041	xpo1a	88	94.149	Danio_rerio
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.872	ENSDNOG00000005805	XPO1	88	92.872	Dasypus_novemcinctus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	90	89.633	ENSDORG00000013050	Xpo1	86	89.633	Dipodomys_ordii
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	69.370	FBgn0020497	emb	88	69.370	Drosophila_melanogaster
ENSGAFG00000004408	xpo1a	93	92.944	ENSETEG00000018045	XPO1	82	92.944	Echinops_telfairi
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	78.852	ENSEBUG00000012580	-	100	86.340	Eptatretus_burgeri
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.766	ENSEASG00005007223	XPO1	88	92.766	Equus_asinus_asinus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.766	ENSECAG00000024920	XPO1	94	92.766	Equus_caballus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	91	93.750	ENSEEUG00000009479	XPO1	80	93.750	Erinaceus_europaeus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	99	90.471	ENSELUG00000014306	-	99	90.471	Esox_lucius
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	95.106	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	95.106	Esox_lucius
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.766	ENSFCAG00000002702	XPO1	88	92.766	Felis_catus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.766	ENSFALG00000010989	XPO1	88	92.766	Ficedula_albicollis
ENSGAFG00000004408	xpo1a	99	92.316	ENSFDAG00000014716	XPO1	89	92.316	Fukomys_damarensis
ENSGAFG00000004408	xpo1a	56	95.103	ENSFHEG00000018974	-	100	95.103	Fundulus_heteroclitus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	98.717	ENSFHEG00000002412	xpo1a	88	98.717	Fundulus_heteroclitus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	94.759	ENSGMOG00000004441	xpo1a	88	94.759	Gadus_morhua
ENSGAFG00000004408	xpo1a	93	93.249	ENSGMOG00000019063	-	82	93.249	Gadus_morhua
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.979	ENSGALG00000029476	XPO1	88	92.979	Gallus_gallus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	94.043	ENSGACG00000002743	-	88	94.043	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	97.433	ENSGACG00000019736	xpo1a	88	97.433	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.872	ENSGAGG00000017558	XPO1	88	92.872	Gopherus_agassizii
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	91.915	ENSGGOG00000034878	XPO1	88	91.915	Gorilla_gorilla
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	98.289	ENSHBUG00000007128	xpo1a	88	98.289	Haplochromis_burtoni
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	94.043	ENSHBUG00000020037	-	93	94.043	Haplochromis_burtoni
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.447	ENSHGLG00000003115	XPO1	88	92.447	Heterocephalus_glaber_female
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.447	ENSHGLG00100012227	XPO1	88	92.447	Heterocephalus_glaber_male
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.660	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	92.660	Hippocampus_comes
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ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	94.681	ENSIPUG00000024394	XPO1	88	94.681	Ictalurus_punctatus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.553	ENSSTOG00000016122	XPO1	88	92.553	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.553	ENSJJAG00000020468	Xpo1	88	92.553	Jaculus_jaculus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	93.723	ENSKMAG00000016218	-	95	93.723	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	99.358	ENSKMAG00000004830	xpo1a	88	99.358	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	93.936	ENSLBEG00000005740	-	89	93.810	Labrus_bergylta
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	95.421	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	95.421	Labrus_bergylta
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	69.811	ENSLACG00000018213	XPO1	88	69.811	Latimeria_chalumnae
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	94.043	ENSLOCG00000016095	xpo1b	87	94.043	Lepisosteus_oculatus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.660	ENSLAFG00000014553	XPO1	88	92.660	Loxodonta_africana
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	91.915	ENSMFAG00000038679	XPO1	88	91.915	Macaca_fascicularis
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	91.915	ENSMMUG00000006941	XPO1	88	91.915	Macaca_mulatta
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	91.915	ENSMNEG00000030909	XPO1	88	91.915	Macaca_nemestrina
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	89.936	ENSMLEG00000032004	XPO1	88	89.936	Mandrillus_leucophaeus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	93.936	ENSMAMG00000010568	-	99	93.717	Mastacembelus_armatus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	97.754	ENSMAMG00000023037	xpo1a	93	97.754	Mastacembelus_armatus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	98.289	ENSMZEG00005005105	xpo1a	88	98.289	Maylandia_zebra
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	93.936	ENSMZEG00005018158	-	95	93.936	Maylandia_zebra
ENSGAFG00000004408	xpo1a	77	92.149	ENSMGAG00000001496	-	100	92.149	Meleagris_gallopavo
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	91.809	ENSMAUG00000006769	Xpo1	92	91.809	Mesocricetus_auratus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.766	ENSMICG00000027770	XPO1	88	92.766	Microcebus_murinus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	91.809	ENSMOCG00000012169	Xpo1	88	91.809	Microtus_ochrogaster
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	98.396	ENSMMOG00000018767	xpo1a	100	98.396	Mola_mola
ENSGAFG00000004408	xpo1a	99	93.917	ENSMMOG00000008001	-	99	93.917	Mola_mola
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	91.702	ENSMODG00000002831	XPO1	88	91.702	Monodelphis_domestica
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ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	93.830	ENSMALG00000007085	-	96	93.703	Monopterus_albus
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ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.766	ENSMPUG00000005560	XPO1	88	92.766	Mustela_putorius_furo
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ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.660	ENSNGAG00000022158	Xpo1	88	92.660	Nannospalax_galili
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	94.043	ENSNBRG00000012229	-	100	94.043	Neolamprologus_brichardi
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	98.289	ENSNBRG00000003776	xpo1a	88	98.289	Neolamprologus_brichardi
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	87.810	ENSNLEG00000009680	XPO1	88	87.810	Nomascus_leucogenys
ENSGAFG00000004408	xpo1a	58	95.556	ENSMEUG00000013277	-	52	95.556	Notamacropus_eugenii
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.553	ENSOPRG00000012615	XPO1	88	92.553	Ochotona_princeps
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ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	91.915	ENSPEMG00000010103	Xpo1	88	91.915	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	99.679	ENSPMEG00000003659	xpo1a	88	99.679	Poecilia_mexicana
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ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	93.830	ENSSLDG00000019530	-	99	93.797	Seriola_lalandi_dorsalis
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ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	93.830	ENSTRUG00000005571	-	99	93.696	Takifugu_rubripes
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	95.722	ENSTNIG00000003360	xpo1a	88	95.722	Tetraodon_nigroviridis
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ENSGAFG00000004408	xpo1a	95	81.839	ENSTTRG00000013369	XPO1	87	81.839	Tursiops_truncatus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.766	ENSUAMG00000026512	XPO1	88	92.766	Ursus_americanus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.766	ENSUMAG00000019859	XPO1	88	92.766	Ursus_maritimus
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ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.766	ENSVVUG00000012009	XPO1	88	92.766	Vulpes_vulpes
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.234	ENSXETG00000002224	xpo1	88	92.234	Xenopus_tropicalis
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	99.893	ENSXCOG00000011889	XPO1	100	99.893	Xiphophorus_couchianus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	89	94.885	ENSXCOG00000006625	-	97	94.885	Xiphophorus_couchianus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	93.830	ENSXMAG00000007353	-	93	93.830	Xiphophorus_maculatus
ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	99.786	ENSXMAG00000005790	xpo1a	88	99.786	Xiphophorus_maculatus