EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGAFG00000005601 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ipo4
Alias: si:ch211-196f5.1
Full Name: importin 4
Gene Type: protein_coding
Species: Gambusia_affinis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 15254 bases
Position: chrNHOQ01001369.1:160829-176082
Accession: ZDB-GENE-041014-307
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGAFP00000008228	IBN_N	PF03810.19	2.1e-14	1	1
ENSGAFP00000008275	IBN_N	PF03810.19	2.1e-14	1	1
ENSGAFP00000008248	IBN_N	PF03810.19	2.2e-14	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGAFT00000008312	-	4459	-	ENSGAFP00000008228	1091 (aa)	-	-
ENSGAFT00000008332	-	4430	-	ENSGAFP00000008248	1102 (aa)	-	-
ENSGAFT00000008359	-	4787	-	ENSGAFP00000008275	1091 (aa)	-	-

Gene Model

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	44.352	ENSG00000196497	IPO4	99	44.363	Homo_sapiens
ENSGAFG00000005601	ipo4	100	78.918	ENSAPOG00000019018	ipo4	100	78.827	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	43.750	ENSAMEG00000016271	IPO4	85	43.434	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGAFG00000005601	ipo4	100	78.552	ENSACIG00000004246	ipo4	100	78.552	Amphilophus_citrinellus
ENSGAFG00000005601	ipo4	100	81.577	ENSAOCG00000004773	ipo4	100	81.577	Amphiprion_ocellaris
ENSGAFG00000005601	ipo4	100	81.668	ENSAPEG00000002112	ipo4	100	81.668	Amphiprion_percula
ENSGAFG00000005601	ipo4	92	84.080	ENSATEG00000017082	ipo4	99	84.080	Anabas_testudineus
ENSGAFG00000005601	ipo4	84	45.425	ENSACAG00000003973	-	97	45.533	Anolis_carolinensis
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	44.167	ENSANAG00000037973	IPO4	99	44.363	Aotus_nancymaae
ENSGAFG00000005601	ipo4	100	77.544	ENSACLG00000019742	ipo4	100	77.544	Astatotilapia_calliptera
ENSGAFG00000005601	ipo4	100	70.394	ENSAMXG00000037878	ipo4	100	70.394	Astyanax_mexicanus
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	44.026	ENSBTAG00000002707	IPO4	99	44.026	Bos_taurus
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	44.352	ENSCJAG00000006937	IPO4	99	44.546	Callithrix_jacchus
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	44.805	ENSCAFG00000012049	IPO4	99	44.628	Canis_familiaris
ENSGAFG00000005601	ipo4	98	44.434	ENSCAFG00020002873	IPO4	99	43.281	Canis_lupus_dingo
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	44.156	ENSCHIG00000009413	IPO4	96	44.210	Capra_hircus
ENSGAFG00000005601	ipo4	98	44.175	ENSTSYG00000002643	IPO4	99	44.004	Carlito_syrichta
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	44.793	ENSCPOG00000014783	IPO4	99	44.751	Cavia_porcellus
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	44.259	ENSCCAG00000037929	IPO4	99	44.363	Cebus_capucinus
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	44.444	ENSCATG00000040395	IPO4	99	44.271	Cercocebus_atys
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	44.577	ENSCLAG00000012817	IPO4	99	44.812	Chinchilla_lanigera
ENSGAFG00000005601	ipo4	91	44.890	ENSCPBG00000025757	IPO4	99	42.332	Chrysemys_picta_bellii
ENSGAFG00000005601	ipo4	92	37.098	ENSCING00000008639	-	99	36.791	Ciona_intestinalis
ENSGAFG00000005601	ipo4	93	36.346	ENSCSAVG00000011482	-	99	36.827	Ciona_savignyi
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	44.259	ENSCANG00000029513	IPO4	99	44.088	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	42.910	ENSCGRG00001001217	Ipo4	99	42.831	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	42.910	ENSCGRG00000014404	Ipo4	99	42.831	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGAFG00000005601	ipo4	100	75.092	ENSCSEG00000009606	ipo4	100	75.183	Cynoglossus_semilaevis
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	81.625	ENSCVAG00000002281	ipo4	100	81.677	Cyprinodon_variegatus
ENSGAFG00000005601	ipo4	100	73.376	ENSDARG00000041493	ipo4	100	73.492	Danio_rerio
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	44.608	ENSDNOG00000000366	IPO4	99	44.383	Dasypus_novemcinctus
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	44.156	ENSDORG00000009274	Ipo4	99	44.353	Dipodomys_ordii
ENSGAFG00000005601	ipo4	98	30.081	FBgn0042178	CG32165	98	30.126	Drosophila_melanogaster
ENSGAFG00000005601	ipo4	97	30.691	FBgn0042177	CG32164	96	30.826	Drosophila_melanogaster
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	43.407	ENSETEG00000018381	IPO4	99	43.275	Echinops_telfairi
ENSGAFG00000005601	ipo4	90	46.263	ENSEASG00005011954	IPO4	96	45.746	Equus_asinus_asinus
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	44.853	ENSECAG00000009909	IPO4	99	44.394	Equus_caballus
ENSGAFG00000005601	ipo4	100	73.213	ENSELUG00000020628	ipo4	100	73.607	Esox_lucius
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	45.404	ENSFCAG00000005587	IPO4	99	44.995	Felis_catus
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	40.880	ENSFDAG00000000725	IPO4	99	40.751	Fukomys_damarensis
ENSGAFG00000005601	ipo4	88	86.775	ENSFHEG00000009351	ipo4	96	87.045	Fundulus_heteroclitus
ENSGAFG00000005601	ipo4	100	74.176	ENSGMOG00000001801	ipo4	99	74.176	Gadus_morhua
ENSGAFG00000005601	ipo4	100	79.670	ENSGACG00000002276	ipo4	99	79.102	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	44.167	ENSGGOG00000016062	IPO4	99	44.180	Gorilla_gorilla
ENSGAFG00000005601	ipo4	100	78.185	ENSHBUG00000023269	ipo4	100	78.185	Haplochromis_burtoni
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	43.934	ENSHGLG00000002923	IPO4	99	43.985	Heterocephalus_glaber_female
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	43.750	ENSHGLG00100003725	IPO4	99	43.802	Heterocephalus_glaber_male
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	75.181	ENSHCOG00000016854	ipo4	99	75.634	Hippocampus_comes
ENSGAFG00000005601	ipo4	100	71.311	ENSIPUG00000001185	ipo4	100	71.494	Ictalurus_punctatus
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	44.761	ENSSTOG00000002288	IPO4	99	44.904	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	44.949	ENSJJAG00000019002	Ipo4	99	44.771	Jaculus_jaculus
ENSGAFG00000005601	ipo4	100	80.293	ENSKMAG00000004627	ipo4	100	80.110	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAFG00000005601	ipo4	100	79.377	ENSLBEG00000024952	ipo4	100	79.377	Labrus_bergylta
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	49.154	ENSLACG00000001428	IPO4	100	49.160	Latimeria_chalumnae
ENSGAFG00000005601	ipo4	79	65.473	ENSLOCG00000001149	ipo4	85	64.031	Lepisosteus_oculatus
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	44.312	ENSLAFG00000015852	IPO4	99	44.485	Loxodonta_africana
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	44.444	ENSMFAG00000000743	IPO4	99	44.271	Macaca_fascicularis
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	44.444	ENSMMUG00000012481	IPO4	99	44.271	Macaca_mulatta
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	44.352	ENSMNEG00000043531	IPO4	99	44.180	Macaca_nemestrina
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	44.444	ENSMLEG00000042067	IPO4	99	44.271	Mandrillus_leucophaeus
ENSGAFG00000005601	ipo4	100	78.827	ENSMAMG00000021976	ipo4	100	78.827	Mastacembelus_armatus
ENSGAFG00000005601	ipo4	100	78.277	ENSMZEG00005017273	ipo4	100	78.277	Maylandia_zebra
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	44.301	ENSMAUG00000017565	Ipo4	99	43.945	Mesocricetus_auratus
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	44.063	ENSMICG00000001719	IPO4	99	44.353	Microcebus_murinus
ENSGAFG00000005601	ipo4	98	44.101	ENSMOCG00000020462	Ipo4	99	43.767	Microtus_ochrogaster
ENSGAFG00000005601	ipo4	100	77.585	ENSMMOG00000005264	ipo4	100	77.493	Mola_mola
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	43.646	ENSMODG00000003337	IPO4	96	43.658	Monodelphis_domestica
ENSGAFG00000005601	ipo4	100	78.277	ENSMALG00000001587	ipo4	100	78.277	Monopterus_albus
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	43.446	MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	98	45.432	Mus_caroli
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	42.910	ENSMUSG00000002319	Ipo4	98	44.823	Mus_musculus
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	43.041	MGP_PahariEiJ_G0030322	Ipo4	98	45.122	Mus_pahari
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	43.186	MGP_SPRETEiJ_G0020194	Ipo4	98	45.067	Mus_spretus
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	45.221	ENSMPUG00000005916	IPO4	99	45.363	Mustela_putorius_furo
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	43.871	ENSMLUG00000025277	IPO4	85	44.107	Myotis_lucifugus
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	44.393	ENSNGAG00000019340	Ipo4	99	44.720	Nannospalax_galili
ENSGAFG00000005601	ipo4	100	81.852	ENSNBRG00000005870	ipo4	100	81.485	Neolamprologus_brichardi
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	45.262	ENSOPRG00000016615	IPO4	99	45.037	Ochotona_princeps
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	44.669	ENSODEG00000002609	IPO4	99	44.628	Octodon_degus
ENSGAFG00000005601	ipo4	100	81.668	ENSONIG00000014574	ipo4	100	81.668	Oreochromis_niloticus
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	43.905	ENSOCUG00000002881	IPO4	99	43.824	Oryctolagus_cuniculus
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	79.686	ENSORLG00000006457	ipo4	99	80.362	Oryzias_latipes
ENSGAFG00000005601	ipo4	100	80.128	ENSORLG00020004286	ipo4	100	79.487	Oryzias_latipes_hni
ENSGAFG00000005601	ipo4	100	80.220	ENSORLG00015021856	ipo4	100	79.579	Oryzias_latipes_hsok
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	78.148	ENSOMEG00000016203	ipo4	100	77.605	Oryzias_melastigma
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	43.692	ENSOGAG00000010642	IPO4	99	43.290	Otolemur_garnettii
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	43.095	ENSOARG00000019188	IPO4	99	43.296	Ovis_aries
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	44.074	ENSPPAG00000035476	IPO4	99	44.037	Pan_paniscus
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	45.588	ENSPPRG00000023607	IPO4	99	45.179	Panthera_pardus
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	45.496	ENSPTIG00000008720	IPO4	99	45.087	Panthera_tigris_altaica
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	44.167	ENSPTRG00000006200	IPO4	99	43.996	Pan_troglodytes
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	44.537	ENSPANG00000026278	IPO4	99	44.363	Papio_anubis
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	67.126	ENSPKIG00000007683	-	99	66.544	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGAFG00000005601	ipo4	100	64.932	ENSPKIG00000007830	ipo4	100	65.269	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	70.734	ENSPMGG00000020871	ipo4	100	70.734	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	43.618	ENSPEMG00000016160	Ipo4	99	43.233	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGAFG00000005601	ipo4	93	46.237	ENSPCIG00000010718	IPO4	96	45.951	Phascolarctos_cinereus
ENSGAFG00000005601	ipo4	100	95.234	ENSPFOG00000009255	ipo4	100	95.234	Poecilia_formosa
ENSGAFG00000005601	ipo4	100	95.325	ENSPLAG00000020556	ipo4	100	95.325	Poecilia_latipinna
ENSGAFG00000005601	ipo4	100	95.417	ENSPMEG00000013102	ipo4	100	95.417	Poecilia_mexicana
ENSGAFG00000005601	ipo4	100	94.959	ENSPREG00000017605	ipo4	100	94.959	Poecilia_reticulata
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	44.167	ENSPPYG00000005688	IPO4	99	44.363	Pongo_abelii
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	45.278	ENSPCAG00000015669	IPO4	99	45.280	Procavia_capensis
ENSGAFG00000005601	ipo4	98	43.523	ENSPCOG00000015319	IPO4	99	43.727	Propithecus_coquereli
ENSGAFG00000005601	ipo4	98	43.989	ENSPVAG00000010755	IPO4	99	44.188	Pteropus_vampyrus
ENSGAFG00000005601	ipo4	100	79.927	ENSPNYG00000021414	ipo4	100	79.927	Pundamilia_nyererei
ENSGAFG00000005601	ipo4	100	73.236	ENSPNAG00000027964	ipo4	100	72.869	Pygocentrus_nattereri
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	43.566	ENSRNOG00000019553	Ipo4	99	43.078	Rattus_norvegicus
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	44.259	ENSRBIG00000027704	IPO4	99	44.088	Rhinopithecus_bieti
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	44.259	ENSRROG00000011492	IPO4	99	44.088	Rhinopithecus_roxellana
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	43.426	ENSSBOG00000020162	IPO4	99	43.538	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSGAFG00000005601	ipo4	99	45.147	ENSSHAG00000002619	IPO4	96	44.973	Sarcophilus_harrisii
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