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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGAFG00000006361 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ipo13
Alias: -
Full Name: importin 13
Gene Type: protein_coding
Species: Gambusia_affinis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 32180 bases
Position: chrNHOQ01001926.1:6934589-6966768
Accession: ZDB-GENE-070706-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGAFP00000009354	Xpo1	PF08389.12	2.9e-23	1	1
ENSGAFP00000009354	IBN_N	PF03810.19	2.4e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGAFT00000009451	-	5296	-	ENSGAFP00000009354	961 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	67.355	ENSGAFG00000011643	si:ch73-182a11.2	99	67.355

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	82.173	ENSG00000117408	IPO13	99	81.582	Homo_sapiens
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	69.938	ENSAPOG00000022358	si:ch73-182a11.2	99	69.835	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAFG00000006361	ipo13	100	98.231	ENSAPOG00000003308	ipo13	100	98.231	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	82.278	ENSAMEG00000001123	IPO13	99	81.686	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGAFG00000006361	ipo13	97	70.074	ENSACIG00000011776	si:ch73-182a11.2	98	70.116	Amphilophus_citrinellus
ENSGAFG00000006361	ipo13	96	92.935	ENSACIG00000008146	ipo13	100	92.717	Amphilophus_citrinellus
ENSGAFG00000006361	ipo13	100	97.711	ENSAOCG00000004943	ipo13	100	97.711	Amphiprion_ocellaris
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	68.802	ENSAOCG00000024622	si:ch73-182a11.2	99	68.698	Amphiprion_ocellaris
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	68.905	ENSAPEG00000001137	si:ch73-182a11.2	99	68.802	Amphiprion_percula
ENSGAFG00000006361	ipo13	100	97.607	ENSAPEG00000011282	ipo13	100	97.607	Amphiprion_percula
ENSGAFG00000006361	ipo13	97	68.783	ENSATEG00000001251	si:ch73-182a11.2	99	68.638	Anabas_testudineus
ENSGAFG00000006361	ipo13	100	97.190	ENSATEG00000018367	ipo13	100	97.190	Anabas_testudineus
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	82.173	ENSAPLG00000001349	IPO13	98	82.173	Anas_platyrhynchos
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	82.911	ENSACAG00000014300	IPO13	99	82.911	Anolis_carolinensis
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	82.173	ENSANAG00000034183	IPO13	99	81.866	Aotus_nancymaae
ENSGAFG00000006361	ipo13	96	97.614	ENSACLG00000011458	ipo13	100	97.614	Astatotilapia_calliptera
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	69.588	ENSACLG00000013726	si:ch73-182a11.2	99	69.421	Astatotilapia_calliptera
ENSGAFG00000006361	ipo13	100	91.268	ENSAMXG00000005200	ipo13	100	91.268	Astyanax_mexicanus
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	64.211	ENSAMXG00000006313	si:ch73-182a11.2	99	64.211	Astyanax_mexicanus
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	81.646	ENSBTAG00000018887	IPO13	99	81.061	Bos_taurus
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	82.278	ENSCJAG00000007453	IPO13	99	81.971	Callithrix_jacchus
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	82.068	ENSCAFG00000004875	IPO13	99	81.478	Canis_familiaris
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	82.068	ENSCAFG00020017359	IPO13	99	81.478	Canis_lupus_dingo
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	81.751	ENSCHIG00000008341	IPO13	99	81.165	Capra_hircus
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	82.173	ENSTSYG00000035980	IPO13	99	81.582	Carlito_syrichta
ENSGAFG00000006361	ipo13	87	81.377	ENSCAPG00000001972	IPO13	97	81.377	Cavia_aperea
ENSGAFG00000006361	ipo13	98	81.770	ENSCPOG00000012445	IPO13	98	81.462	Cavia_porcellus
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	82.278	ENSCCAG00000022035	IPO13	99	81.971	Cebus_capucinus
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	82.173	ENSCATG00000041276	IPO13	99	81.582	Cercocebus_atys
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	81.857	ENSCLAG00000002914	IPO13	99	81.270	Chinchilla_lanigera
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	82.173	ENSCSAG00000001190	IPO13	99	81.582	Chlorocebus_sabaeus
ENSGAFG00000006361	ipo13	95	82.770	ENSCPBG00000003471	IPO13	100	82.770	Chrysemys_picta_bellii
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	38.438	ENSCING00000001863	-	100	38.358	Ciona_intestinalis
ENSGAFG00000006361	ipo13	98	36.991	ENSCSAVG00000001368	-	99	36.886	Ciona_savignyi
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	82.173	ENSCANG00000009091	IPO13	99	81.582	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	80.907	ENSCGRG00001021177	Ipo13	99	80.608	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	80.907	ENSCGRG00000012411	Ipo13	99	80.608	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	63.098	ENSCSEG00000016612	si:ch73-182a11.2	99	63.098	Cynoglossus_semilaevis
ENSGAFG00000006361	ipo13	100	93.965	ENSCSEG00000007713	ipo13	100	93.965	Cynoglossus_semilaevis
ENSGAFG00000006361	ipo13	100	98.543	ENSCVAG00000013039	ipo13	100	98.543	Cyprinodon_variegatus
ENSGAFG00000006361	ipo13	97	66.277	ENSCVAG00000007910	si:ch73-182a11.2	100	66.277	Cyprinodon_variegatus
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	91.043	ENSDARG00000060618	ipo13	99	91.043	Danio_rerio
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	65.964	ENSDARG00000076996	si:ch73-182a11.2	99	65.964	Danio_rerio
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	81.857	ENSDNOG00000016583	IPO13	99	81.270	Dasypus_novemcinctus
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	82.068	ENSDORG00000005471	Ipo13	99	81.478	Dipodomys_ordii
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	68.607	ENSEBUG00000006281	ipo13	100	68.035	Eptatretus_burgeri
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	82.068	ENSEASG00005001738	IPO13	99	81.478	Equus_asinus_asinus
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	82.068	ENSECAG00000015508	IPO13	99	81.478	Equus_caballus
ENSGAFG00000006361	ipo13	68	86.243	ENSEEUG00000011681	IPO13	82	86.243	Erinaceus_europaeus
ENSGAFG00000006361	ipo13	100	66.599	ENSELUG00000003341	si:ch73-182a11.2	99	66.497	Esox_lucius
ENSGAFG00000006361	ipo13	100	93.548	ENSELUG00000001498	ipo13	100	93.548	Esox_lucius
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	82.173	ENSFCAG00000006488	IPO13	99	81.582	Felis_catus
ENSGAFG00000006361	ipo13	95	82.443	ENSFALG00000005368	IPO13	100	82.443	Ficedula_albicollis
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	81.751	ENSFDAG00000015599	IPO13	99	81.165	Fukomys_damarensis
ENSGAFG00000006361	ipo13	100	98.439	ENSFHEG00000023271	ipo13	100	98.439	Fundulus_heteroclitus
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	67.665	ENSFHEG00000015719	si:ch73-182a11.2	99	67.662	Fundulus_heteroclitus
ENSGAFG00000006361	ipo13	100	95.530	ENSGMOG00000015856	ipo13	99	95.530	Gadus_morhua
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	59.629	ENSGMOG00000016863	si:ch73-182a11.2	99	60.104	Gadus_morhua
ENSGAFG00000006361	ipo13	100	81.998	ENSGALG00000010087	IPO13	100	81.998	Gallus_gallus
ENSGAFG00000006361	ipo13	100	95.218	ENSGACG00000014562	ipo13	99	95.218	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	68.841	ENSGACG00000016242	si:ch73-182a11.2	99	68.841	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAFG00000006361	ipo13	98	82.872	ENSGAGG00000008331	IPO13	98	82.872	Gopherus_agassizii
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	82.173	ENSGGOG00000016375	IPO13	99	81.582	Gorilla_gorilla
ENSGAFG00000006361	ipo13	100	97.503	ENSHBUG00000018605	ipo13	100	97.503	Haplochromis_burtoni
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	68.660	ENSHBUG00000015271	si:ch73-182a11.2	99	68.492	Haplochromis_burtoni
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	81.540	ENSHGLG00000001822	IPO13	99	81.237	Heterocephalus_glaber_female
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	81.540	ENSHGLG00100015830	IPO13	99	81.237	Heterocephalus_glaber_male
ENSGAFG00000006361	ipo13	100	92.404	ENSHCOG00000018408	ipo13	98	94.937	Hippocampus_comes
ENSGAFG00000006361	ipo13	97	64.111	ENSHCOG00000005273	si:ch73-182a11.2	99	64.111	Hippocampus_comes
ENSGAFG00000006361	ipo13	100	90.010	ENSIPUG00000011283	IPO13	99	90.010	Ictalurus_punctatus
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	59.603	ENSIPUG00000010787	si:ch73-182a11.2	100	59.603	Ictalurus_punctatus
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	82.068	ENSSTOG00000003611	IPO13	99	81.478	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	81.857	ENSJJAG00000018591	Ipo13	99	81.551	Jaculus_jaculus
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	69.112	ENSKMAG00000006041	si:ch73-182a11.2	99	69.175	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	97.482	ENSKMAG00000007869	ipo13	99	97.482	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAFG00000006361	ipo13	100	95.734	ENSLBEG00000007442	ipo13	99	95.734	Labrus_bergylta
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	67.739	ENSLBEG00000011390	si:ch73-182a11.2	100	67.739	Labrus_bergylta
ENSGAFG00000006361	ipo13	98	77.542	ENSLACG00000016657	IPO13	98	77.542	Latimeria_chalumnae
ENSGAFG00000006361	ipo13	85	31.868	ENSLACG00000002351	TNPO3	96	32.031	Latimeria_chalumnae
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	85.104	ENSLOCG00000010620	ipo13	99	85.104	Lepisosteus_oculatus
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	80.336	ENSLAFG00000017144	IPO13	99	79.772	Loxodonta_africana
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	82.173	ENSMFAG00000032846	IPO13	99	81.582	Macaca_fascicularis
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	82.173	ENSMMUG00000015142	IPO13	99	81.582	Macaca_mulatta
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	82.173	ENSMNEG00000041971	IPO13	99	81.582	Macaca_nemestrina
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	82.173	ENSMLEG00000044330	IPO13	99	81.582	Mandrillus_leucophaeus
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	69.525	ENSMAMG00000000328	si:ch73-182a11.2	99	69.381	Mastacembelus_armatus
ENSGAFG00000006361	ipo13	100	97.086	ENSMAMG00000017290	ipo13	100	97.086	Mastacembelus_armatus
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	69.485	ENSMZEG00005009283	si:ch73-182a11.2	99	69.318	Maylandia_zebra
ENSGAFG00000006361	ipo13	100	97.503	ENSMZEG00005019335	ipo13	100	97.503	Maylandia_zebra
ENSGAFG00000006361	ipo13	98	81.044	ENSMGAG00000009898	IPO13	100	81.044	Meleagris_gallopavo
ENSGAFG00000006361	ipo13	82	83.036	ENSMAUG00000013018	Ipo13	98	82.658	Mesocricetus_auratus
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	77.954	ENSMICG00000011003	IPO13	99	77.419	Microcebus_murinus
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	81.435	ENSMOCG00000008881	Ipo13	99	81.132	Microtus_ochrogaster
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	67.083	ENSMMOG00000018046	si:ch73-182a11.2	99	66.667	Mola_mola
ENSGAFG00000006361	ipo13	98	94.456	ENSMMOG00000001954	ipo13	99	94.456	Mola_mola
ENSGAFG00000006361	ipo13	95	81.461	ENSMODG00000003017	IPO13	100	81.461	Monodelphis_domestica
ENSGAFG00000006361	ipo13	96	94.788	ENSMALG00000010805	ipo13	100	94.788	Monopterus_albus
ENSGAFG00000006361	ipo13	81	68.892	ENSMALG00000006451	si:ch73-182a11.2	99	68.892	Monopterus_albus
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ENSGAFG00000006361	ipo13	99	76.488	ENSMPUG00000013635	IPO13	99	76.004	Mustela_putorius_furo
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	81.962	ENSMLUG00000006360	IPO13	99	81.374	Myotis_lucifugus
ENSGAFG00000006361	ipo13	99	81.981	ENSNGAG00000013019	Ipo13	99	81.656	Nannospalax_galili
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