EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGAFG00000006609 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: si:dkey-86e18.1
Alias: im:6912651
Full Name: si:dkey-86e18.1
Gene Type: protein_coding
Species: Gambusia_affinis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6872 bases
Position: chrNHOQ01001926.1:7225983-7232854
Accession: ZDB-GENE-041014-18
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGAFP00000009693	Isy1	PF06246.12	3.3e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGAFT00000009797	-	1031	-	ENSGAFP00000009693	296 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSGAFG00000006609's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSGAFG00000006609's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	70.763	ENSAPOG00000002792	si:dkey-86e18.1	75	70.763	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	66.525	ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	82	66.525	Amphilophus_citrinellus
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	65.532	ENSAOCG00000014440	si:dkey-86e18.1	83	65.532	Amphiprion_ocellaris
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	68.085	ENSAPEG00000011831	si:dkey-86e18.1	76	68.085	Amphiprion_percula
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	65.966	ENSATEG00000018061	si:dkey-86e18.1	77	65.966	Anabas_testudineus
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	66.949	ENSACLG00000012308	si:dkey-86e18.1	75	66.949	Astatotilapia_calliptera
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	55.983	ENSAMXG00000038638	si:dkey-86e18.1	82	55.983	Astyanax_mexicanus
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	61.207	ENSCSEG00000007482	-	73	61.207	Cynoglossus_semilaevis
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	76.271	ENSCVAG00000020099	si:dkey-86e18.1	77	76.271	Cyprinodon_variegatus
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	53.617	ENSDARG00000043536	si:dkey-86e18.1	83	53.617	Danio_rerio
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	80	54.150	ENSELUG00000007229	si:dkey-86e18.1	83	54.150	Esox_lucius
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	81.780	ENSFHEG00000023250	si:dkey-86e18.1	77	81.780	Fundulus_heteroclitus
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	66.949	ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	75	66.949	Haplochromis_burtoni
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	55.319	ENSIPUG00000012213	si:dkey-86e18.1	82	55.319	Ictalurus_punctatus
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	72.996	ENSKMAG00000008387	si:dkey-86e18.1	77	72.996	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	59.402	ENSLBEG00000008055	si:dkey-86e18.1	81	59.402	Labrus_bergylta
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	82	40.562	ENSLACG00000003926	si:dkey-86e18.1	89	40.562	Latimeria_chalumnae
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	51.515	ENSLOCG00000008902	si:dkey-86e18.1	81	51.948	Lepisosteus_oculatus
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	91	60.806	ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	86	60.806	Mastacembelus_armatus
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	66.949	ENSMZEG00005019446	si:dkey-86e18.1	75	66.949	Maylandia_zebra
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	66.810	ENSMMOG00000002257	si:dkey-86e18.1	85	66.810	Mola_mola
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	80	62.705	ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	83	58.824	Monopterus_albus
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	63.043	ENSNBRG00000023611	si:dkey-86e18.1	77	63.043	Neolamprologus_brichardi
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	66.949	ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	82	66.949	Oreochromis_niloticus
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	80	66.116	ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	77	66.390	Oryzias_latipes
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	80	65.145	ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	76	65.145	Oryzias_latipes_hni
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	80	66.390	ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	77	66.390	Oryzias_latipes_hsok
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	64.407	ENSOMEG00000001778	si:dkey-86e18.1	76	64.979	Oryzias_melastigma
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	48.052	ENSPKIG00000009550	si:dkey-86e18.1	81	48.052	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	57.143	ENSPMGG00000008481	si:dkey-86e18.1	82	57.143	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	91.810	ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	76	91.810	Poecilia_formosa
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	92.241	ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	76	92.241	Poecilia_latipinna
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	91.379	ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	76	91.379	Poecilia_mexicana
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	100	79.811	ENSPREG00000002081	si:dkey-86e18.1	100	79.811	Poecilia_reticulata
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	67.373	ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	75	67.373	Pundamilia_nyererei
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	57.447	ENSPNAG00000008048	si:dkey-86e18.1	83	57.447	Pygocentrus_nattereri
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	51.073	ENSSFOG00015002284	si:dkey-86e18.1	82	51.073	Scleropages_formosus
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	80	63.934	ENSSMAG00000017672	si:dkey-86e18.1	78	63.934	Scophthalmus_maximus
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	67.647	ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	75	67.647	Seriola_dumerili
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	66.807	ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	75	66.807	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	72.458	ENSSPAG00000014712	si:dkey-86e18.1	77	72.458	Stegastes_partitus
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	62.338	ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	78	60.494	Takifugu_rubripes
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	77.155	ENSXCOG00000008851	si:dkey-86e18.1	86	77.155	Xiphophorus_couchianus
ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	95.259	ENSXMAG00000011403	si:dkey-86e18.1	76	95.259	Xiphophorus_maculatus