EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGAFG00000007093 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: mtrf1
Alias: zgc:113104
Full Name: mitochondrial translational release factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Gambusia_affinis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4214 bases
Position: chrNHOQ01000204.1:44635-48848
Accession: ZDB-GENE-050220-8
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGAFP00000010471	RF-1	PF00472.20	9e-39	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGAFT00000010578	-	2289	-	ENSGAFP00000010471	441 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSGAFG00000007093	mtrf1	85	43.158	ENSGAFG00000012295	mtrf1l	86	43.158

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	55.789	ENSG00000120662	MTRF1	85	55.789	Homo_sapiens
ENSGAFG00000007093	mtrf1	88	77.238	ENSAPOG00000010181	mtrf1	95	77.238	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	56.168	ENSAMEG00000008696	MTRF1	85	56.168	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGAFG00000007093	mtrf1	53	86.383	ENSACIG00000001495	mtrf1	94	86.383	Amphilophus_citrinellus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	97	77.389	ENSAOCG00000002832	mtrf1	96	77.389	Amphiprion_ocellaris
ENSGAFG00000007093	mtrf1	97	76.923	ENSAPEG00000014844	mtrf1	96	76.923	Amphiprion_percula
ENSGAFG00000007093	mtrf1	91	75.062	ENSATEG00000017403	mtrf1	97	75.062	Anabas_testudineus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	55.145	ENSAPLG00000009317	MTRF1	88	55.145	Anas_platyrhynchos
ENSGAFG00000007093	mtrf1	90	53.333	ENSACAG00000000897	MTRF1	91	53.333	Anolis_carolinensis
ENSGAFG00000007093	mtrf1	81	55.153	ENSANAG00000025310	-	92	57.612	Aotus_nancymaae
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	52.493	ENSANAG00000023063	-	84	52.493	Aotus_nancymaae
ENSGAFG00000007093	mtrf1	98	75.571	ENSACLG00000023945	mtrf1	97	75.571	Astatotilapia_calliptera
ENSGAFG00000007093	mtrf1	53	75.000	ENSAMXG00000031859	mtrf1	96	75.000	Astyanax_mexicanus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	55.789	ENSBTAG00000012260	MTRF1	84	57.224	Bos_taurus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	55.526	ENSCJAG00000017739	MTRF1	96	64.671	Callithrix_jacchus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	56.283	ENSCAFG00000004795	MTRF1	86	56.283	Canis_familiaris
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	56.283	ENSCAFG00020018178	MTRF1	86	56.283	Canis_lupus_dingo
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	55.789	ENSCHIG00000011810	MTRF1	85	55.789	Capra_hircus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	56.842	ENSTSYG00000006976	MTRF1	85	56.842	Carlito_syrichta
ENSGAFG00000007093	mtrf1	87	54.805	ENSCAPG00000013163	MTRF1	89	54.805	Cavia_aperea
ENSGAFG00000007093	mtrf1	87	54.545	ENSCPOG00000005264	MTRF1	86	54.545	Cavia_porcellus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	56.316	ENSCCAG00000035116	MTRF1	85	56.316	Cebus_capucinus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	56.168	ENSCATG00000009909	MTRF1	86	56.168	Cercocebus_atys
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	54.474	ENSCLAG00000000582	MTRF1	85	54.474	Chinchilla_lanigera
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	55.906	ENSCSAG00000017835	MTRF1	86	55.906	Chlorocebus_sabaeus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	85	51.194	ENSCHOG00000011915	-	90	51.194	Choloepus_hoffmanni
ENSGAFG00000007093	mtrf1	85	54.521	ENSCPBG00000007969	MTRF1	84	54.521	Chrysemys_picta_bellii
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	55.789	ENSCANG00000040353	MTRF1	85	55.789	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	98	51.972	ENSCGRG00001003065	Mtrf1	96	51.972	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGAFG00000007093	mtrf1	98	51.972	ENSCGRG00000002570	Mtrf1	96	51.972	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGAFG00000007093	mtrf1	98	67.882	ENSCSEG00000005667	mtrf1	96	67.882	Cynoglossus_semilaevis
ENSGAFG00000007093	mtrf1	100	80.045	ENSCVAG00000021729	mtrf1	100	80.045	Cyprinodon_variegatus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	53	64.681	ENSDARG00000033579	mtrf1	100	64.681	Danio_rerio
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	53.665	ENSDNOG00000034196	MTRF1	96	61.409	Dasypus_novemcinctus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	56.579	ENSDORG00000016429	Mtrf1	85	56.579	Dipodomys_ordii
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	56.168	ENSETEG00000014811	MTRF1	85	56.168	Echinops_telfairi
ENSGAFG00000007093	mtrf1	54	53.942	ENSEBUG00000000778	mtrf1	99	53.942	Eptatretus_burgeri
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	55.526	ENSEASG00005015715	MTRF1	85	55.526	Equus_asinus_asinus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	55.263	ENSECAG00000014389	MTRF1	83	55.263	Equus_caballus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	92	42.579	ENSEEUG00000004450	-	92	42.195	Erinaceus_europaeus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	99	63.883	ENSELUG00000006544	mtrf1	99	63.883	Esox_lucius
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	56.430	ENSFCAG00000031635	MTRF1	85	56.430	Felis_catus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	88	53.351	ENSFALG00000008036	MTRF1	96	53.351	Ficedula_albicollis
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	55.789	ENSFDAG00000017881	MTRF1	85	55.789	Fukomys_damarensis
ENSGAFG00000007093	mtrf1	99	80.505	ENSFHEG00000019043	mtrf1	100	80.505	Fundulus_heteroclitus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	85	66.667	ENSGMOG00000008608	mtrf1	99	66.667	Gadus_morhua
ENSGAFG00000007093	mtrf1	88	54.780	ENSGALG00000016951	MTRF1	85	54.780	Gallus_gallus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	85	76.658	ENSGACG00000013728	mtrf1	98	76.658	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	71	57.325	ENSGAGG00000025696	MTRF1	99	57.325	Gopherus_agassizii
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	56.053	ENSGGOG00000002529	MTRF1	85	56.053	Gorilla_gorilla
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	54.474	ENSHGLG00000003210	MTRF1	85	54.474	Heterocephalus_glaber_female
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	54.474	ENSHGLG00100011843	MTRF1	85	54.474	Heterocephalus_glaber_male
ENSGAFG00000007093	mtrf1	96	67.536	ENSHCOG00000009449	mtrf1	95	67.536	Hippocampus_comes
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	55.263	ENSSTOG00000021682	MTRF1	86	55.263	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	56.464	ENSJJAG00000017590	Mtrf1	85	56.464	Jaculus_jaculus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	99	72.506	ENSKMAG00000003231	mtrf1	99	72.506	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	53	85.532	ENSLBEG00000023151	mtrf1	94	85.532	Labrus_bergylta
ENSGAFG00000007093	mtrf1	53	85.532	ENSLBEG00000027169	-	94	85.532	Labrus_bergylta
ENSGAFG00000007093	mtrf1	85	60.582	ENSLACG00000010582	MTRF1	85	60.582	Latimeria_chalumnae
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	61.155	ENSLOCG00000005937	MTRF1	85	61.155	Lepisosteus_oculatus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	43.045	ENSLAFG00000030499	-	84	43.045	Loxodonta_africana
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	55.263	ENSLAFG00000022177	-	85	55.263	Loxodonta_africana
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	56.168	ENSMFAG00000037972	MTRF1	86	56.168	Macaca_fascicularis
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	56.168	ENSMNEG00000035487	MTRF1	86	56.168	Macaca_nemestrina
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	56.168	ENSMLEG00000033582	MTRF1	86	56.168	Mandrillus_leucophaeus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	98	75.172	ENSMAMG00000022048	mtrf1	97	75.172	Mastacembelus_armatus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	98	75.571	ENSMZEG00005017922	mtrf1	97	75.571	Maylandia_zebra
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	55.673	ENSMGAG00000014971	MTRF1	91	55.673	Meleagris_gallopavo
ENSGAFG00000007093	mtrf1	98	51.276	ENSMAUG00000011661	Mtrf1	95	51.276	Mesocricetus_auratus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	56.842	ENSMICG00000033131	MTRF1	85	56.842	Microcebus_murinus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	87	55.759	ENSMOCG00000011945	Mtrf1	86	55.759	Microtus_ochrogaster
ENSGAFG00000007093	mtrf1	53	68.936	ENSMMOG00000013394	mtrf1	96	68.936	Mola_mola
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	54.474	ENSMODG00000014772	MTRF1	86	54.474	Monodelphis_domestica
ENSGAFG00000007093	mtrf1	98	76.765	ENSMALG00000013274	mtrf1	99	76.765	Monopterus_albus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	98	50.930	MGP_CAROLIEiJ_G0019539	Mtrf1	94	50.930	Mus_caroli
ENSGAFG00000007093	mtrf1	98	51.628	ENSMUSG00000022022	Mtrf1	95	51.628	Mus_musculus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	87	55.236	MGP_PahariEiJ_G0030557	Mtrf1	86	55.236	Mus_pahari
ENSGAFG00000007093	mtrf1	96	51.773	MGP_SPRETEiJ_G0020435	Mtrf1	93	51.773	Mus_spretus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	56.430	ENSMPUG00000001874	MTRF1	86	56.430	Mustela_putorius_furo
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	56.316	ENSMLUG00000017237	MTRF1	85	56.316	Myotis_lucifugus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	97	52.103	ENSNGAG00000014460	Mtrf1	94	52.103	Nannospalax_galili
ENSGAFG00000007093	mtrf1	53	87.234	ENSNBRG00000004634	mtrf1	99	87.234	Neolamprologus_brichardi
ENSGAFG00000007093	mtrf1	96	50.922	ENSNLEG00000001236	MTRF1	98	50.922	Nomascus_leucogenys
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	53.421	ENSMEUG00000001846	MTRF1	86	53.421	Notamacropus_eugenii
ENSGAFG00000007093	mtrf1	62	33.824	ENSOPRG00000006450	-	83	33.824	Ochotona_princeps
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	55.000	ENSODEG00000005782	MTRF1	85	55.000	Octodon_degus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	87	81.299	ENSONIG00000012476	mtrf1	99	81.299	Oreochromis_niloticus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	67	59.667	ENSOANG00000003383	-	95	59.667	Ornithorhynchus_anatinus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	56.842	ENSOCUG00000025207	MTRF1	85	56.842	Oryctolagus_cuniculus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	100	71.269	ENSORLG00000003225	mtrf1	100	71.269	Oryzias_latipes
ENSGAFG00000007093	mtrf1	100	70.732	ENSORLG00020021048	mtrf1	100	70.732	Oryzias_latipes_hni
ENSGAFG00000007093	mtrf1	100	70.824	ENSORLG00015020957	mtrf1	100	70.824	Oryzias_latipes_hsok
ENSGAFG00000007093	mtrf1	100	70.917	ENSOMEG00000002022	mtrf1	100	70.917	Oryzias_melastigma
ENSGAFG00000007093	mtrf1	79	58.571	ENSOGAG00000009719	-	78	58.571	Otolemur_garnettii
ENSGAFG00000007093	mtrf1	73	50.464	ENSOGAG00000026411	-	99	50.464	Otolemur_garnettii
ENSGAFG00000007093	mtrf1	94	51.253	ENSOARG00000006994	MTRF1	98	51.253	Ovis_aries
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	55.789	ENSPPAG00000000050	MTRF1	85	55.789	Pan_paniscus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	56.430	ENSPPRG00000009511	MTRF1	85	56.430	Panthera_pardus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	90	55.164	ENSPTIG00000006673	MTRF1	88	55.164	Panthera_tigris_altaica
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	55.789	ENSPTRG00000005815	MTRF1	85	55.789	Pan_troglodytes
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	56.168	ENSPANG00000010809	MTRF1	86	56.168	Papio_anubis
ENSGAFG00000007093	mtrf1	84	59.786	ENSPKIG00000015711	mtrf1	87	59.786	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGAFG00000007093	mtrf1	98	50.225	ENSPSIG00000004773	MTRF1	98	50.225	Pelodiscus_sinensis
ENSGAFG00000007093	mtrf1	53	82.479	ENSPMGG00000006724	mtrf1	95	82.479	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	98	52.791	ENSPEMG00000020982	Mtrf1	95	52.791	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGAFG00000007093	mtrf1	76	50.437	ENSPMAG00000009849	mtrf1	98	50.729	Petromyzon_marinus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	85	55.438	ENSPCIG00000012940	MTRF1	86	55.145	Phascolarctos_cinereus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	100	92.971	ENSPFOG00000000254	mtrf1	100	92.971	Poecilia_formosa
ENSGAFG00000007093	mtrf1	100	93.424	ENSPLAG00000014280	mtrf1	100	93.424	Poecilia_latipinna
ENSGAFG00000007093	mtrf1	100	92.744	ENSPMEG00000023245	mtrf1	100	92.744	Poecilia_mexicana
ENSGAFG00000007093	mtrf1	55	85.537	ENSPREG00000018619	mtrf1	99	85.537	Poecilia_reticulata
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	55.263	ENSPPYG00000005313	MTRF1	85	55.263	Pongo_abelii
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	56.316	ENSPCOG00000018133	MTRF1	85	56.316	Propithecus_coquereli
ENSGAFG00000007093	mtrf1	92	51.597	ENSPVAG00000008573	MTRF1	90	51.597	Pteropus_vampyrus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	53	87.660	ENSPNYG00000004357	mtrf1	95	87.660	Pundamilia_nyererei
ENSGAFG00000007093	mtrf1	85	64.721	ENSPNAG00000010682	mtrf1	86	64.721	Pygocentrus_nattereri
ENSGAFG00000007093	mtrf1	84	55.645	ENSRNOG00000047106	Mtrf1	93	69.912	Rattus_norvegicus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	55.263	ENSRBIG00000007069	MTRF1	85	55.263	Rhinopithecus_bieti
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	55.263	ENSRROG00000035345	MTRF1	85	55.263	Rhinopithecus_roxellana
ENSGAFG00000007093	mtrf1	84	57.027	ENSSBOG00000004572	MTRF1	98	57.027	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSGAFG00000007093	mtrf1	79	55.966	ENSSHAG00000018109	MTRF1	86	55.966	Sarcophilus_harrisii
ENSGAFG00000007093	mtrf1	97	56.164	ENSSFOG00015006191	mtrf1	98	56.164	Scleropages_formosus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	99	71.106	ENSSMAG00000015740	mtrf1	99	71.106	Scophthalmus_maximus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	99	75.000	ENSSDUG00000022608	mtrf1	87	75.000	Seriola_dumerili
ENSGAFG00000007093	mtrf1	99	75.000	ENSSLDG00000013584	mtrf1	87	75.000	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSGAFG00000007093	mtrf1	92	51.843	ENSSARG00000002306	MTRF1	90	51.843	Sorex_araneus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	53	66.810	ENSSPUG00000007354	MTRF1	96	66.810	Sphenodon_punctatus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	99	72.336	ENSSPAG00000000881	mtrf1	98	72.336	Stegastes_partitus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	56.316	ENSSSCG00000009436	MTRF1	85	56.316	Sus_scrofa
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	53.826	ENSTGUG00000012422	MTRF1	92	53.826	Taeniopygia_guttata
ENSGAFG00000007093	mtrf1	100	71.749	ENSTRUG00000000396	mtrf1	99	71.749	Takifugu_rubripes
ENSGAFG00000007093	mtrf1	84	73.243	ENSTNIG00000017149	-	99	73.177	Tetraodon_nigroviridis
ENSGAFG00000007093	mtrf1	54	57.322	ENSTBEG00000004696	-	100	57.322	Tupaia_belangeri
ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	56.053	ENSTTRG00000010370	MTRF1	85	56.053	Tursiops_truncatus
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ENSGAFG00000007093	mtrf1	85	56.499	ENSXETG00000018904	mtrf1	97	56.499	Xenopus_tropicalis
ENSGAFG00000007093	mtrf1	51	94.643	ENSXCOG00000020386	mtrf1	96	94.643	Xiphophorus_couchianus
ENSGAFG00000007093	mtrf1	100	92.744	ENSXMAG00000009853	mtrf1	100	92.744	Xiphophorus_maculatus