EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSGAFG00000009775 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ago1
Alias: Ago1|eif2c1|si:ch211-119n15.3
Full Name: argonaute RISC catalytic component 1
Gene Type: protein_coding
Species: Gambusia_affinis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 19513 bases
Position: chrNHOQ01001935.1:3755785-3775297
Accession: ZDB-GENE-110606-3
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGAFP00000014465	PAZ	PF02170.22	7.2e-29	1	1
ENSGAFP00000014465	Piwi	PF02171.17	1.5e-110	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGAFT00000014612	-	5046	-	ENSGAFP00000014465	858 (aa)	-	UPI0003B4A598

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSGAFG00000009775	ago1	100	83.506	ENSGAFG00000009808	ago3a	100	83.506
ENSGAFG00000009775	ago1	99	81.235	ENSGAFG00000018026	ago2	99	81.235
ENSGAFG00000009775	ago1	100	80.778	ENSGAFG00000015911	-	100	80.778
ENSGAFG00000009775	ago1	99	81.286	ENSGAFG00000017239	ago4	99	81.286

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGAFG00000009775	ago1	98	96.916	ENSG00000092847	AGO1	100	97.187	Homo_sapiens
ENSGAFG00000009775	ago1	100	99.767	ENSAPOG00000024299	ago1	100	99.767	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAFG00000009775	ago1	98	96.916	ENSAMEG00000000504	AGO1	100	96.270	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGAFG00000009775	ago1	82	93.162	ENSACIG00000005298	ago1	98	93.162	Amphilophus_citrinellus
ENSGAFG00000009775	ago1	100	99.767	ENSAOCG00000017727	ago1	100	99.767	Amphiprion_ocellaris
ENSGAFG00000009775	ago1	100	99.767	ENSAPEG00000004458	ago1	100	99.767	Amphiprion_percula
ENSGAFG00000009775	ago1	100	99.767	ENSATEG00000008523	ago1	100	99.767	Anabas_testudineus
ENSGAFG00000009775	ago1	99	89.675	ENSAPLG00000010440	AGO1	99	89.675	Anas_platyrhynchos
ENSGAFG00000009775	ago1	91	97.059	ENSACAG00000029174	AGO1	100	97.059	Anolis_carolinensis
ENSGAFG00000009775	ago1	99	96.145	ENSANAG00000037711	AGO1	100	96.270	Aotus_nancymaae
ENSGAFG00000009775	ago1	100	99.534	ENSACLG00000000890	ago1	100	99.534	Astatotilapia_calliptera
ENSGAFG00000009775	ago1	80	99.854	ENSAMXG00000001917	ago1	98	99.854	Astyanax_mexicanus
ENSGAFG00000009775	ago1	98	96.686	ENSBTAG00000012253	AGO1	100	96.270	Bos_taurus
ENSGAFG00000009775	ago1	99	96.694	ENSCJAG00000032023	AGO1	100	96.270	Callithrix_jacchus
ENSGAFG00000009775	ago1	98	96.916	ENSCAFG00000003443	AGO1	100	96.270	Canis_familiaris
ENSGAFG00000009775	ago1	99	95.887	ENSCAFG00020009251	AGO1	99	98.095	Canis_lupus_dingo
ENSGAFG00000009775	ago1	99	96.340	ENSCHIG00000011848	-	100	95.481	Capra_hircus
ENSGAFG00000009775	ago1	100	75.758	ENSTSYG00000032426	-	99	78.143	Carlito_syrichta
ENSGAFG00000009775	ago1	99	96.694	ENSTSYG00000009767	-	100	96.270	Carlito_syrichta
ENSGAFG00000009775	ago1	89	92.531	ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.858	Cavia_aperea
ENSGAFG00000009775	ago1	99	96.694	ENSCPOG00000011568	AGO1	100	96.270	Cavia_porcellus
ENSGAFG00000009775	ago1	98	96.916	ENSCCAG00000011823	AGO1	100	96.270	Cebus_capucinus
ENSGAFG00000009775	ago1	100	95.921	ENSCATG00000031521	AGO1	100	97.187	Cercocebus_atys
ENSGAFG00000009775	ago1	99	96.694	ENSCLAG00000011507	AGO1	100	96.270	Chinchilla_lanigera
ENSGAFG00000009775	ago1	98	96.916	ENSCSAG00000001091	AGO1	100	96.270	Chlorocebus_sabaeus
ENSGAFG00000009775	ago1	85	91.473	ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	Choloepus_hoffmanni
ENSGAFG00000009775	ago1	100	96.037	ENSCPBG00000018594	AGO1	100	96.037	Chrysemys_picta_bellii
ENSGAFG00000009775	ago1	98	96.916	ENSCANG00000039798	AGO1	100	96.270	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGAFG00000009775	ago1	99	96.353	ENSCGRG00001022708	Ago1	100	96.270	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGAFG00000009775	ago1	99	96.694	ENSCGRG00000010386	Ago1	99	96.694	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGAFG00000009775	ago1	99	97.683	ENSCSEG00000001051	ago1	100	97.683	Cynoglossus_semilaevis
ENSGAFG00000009775	ago1	100	99.650	ENSCVAG00000018173	ago1	100	99.650	Cyprinodon_variegatus
ENSGAFG00000009775	ago1	100	98.951	ENSDARG00000092644	ago1	100	98.951	Danio_rerio
ENSGAFG00000009775	ago1	91	97.187	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	97.187	Dasypus_novemcinctus
ENSGAFG00000009775	ago1	91	97.087	ENSDORG00000008494	Ago1	100	97.087	Dipodomys_ordii
ENSGAFG00000009775	ago1	82	89.958	ENSETEG00000007626	AGO1	100	89.335	Echinops_telfairi
ENSGAFG00000009775	ago1	99	96.694	ENSEASG00005012086	AGO1	100	96.270	Equus_asinus_asinus
ENSGAFG00000009775	ago1	98	96.916	ENSECAG00000024353	AGO1	100	96.270	Equus_caballus
ENSGAFG00000009775	ago1	92	88.818	ENSEEUG00000005349	AGO1	92	88.818	Erinaceus_europaeus
ENSGAFG00000009775	ago1	91	99.744	ENSELUG00000016803	ago1	100	99.744	Esox_lucius
ENSGAFG00000009775	ago1	98	96.916	ENSFCAG00000000746	AGO1	100	96.270	Felis_catus
ENSGAFG00000009775	ago1	91	90.816	ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.816	Ficedula_albicollis
ENSGAFG00000009775	ago1	100	96.154	ENSFDAG00000017210	AGO1	100	96.154	Fukomys_damarensis
ENSGAFG00000009775	ago1	99	95.755	ENSFHEG00000017927	ago1	100	95.755	Fundulus_heteroclitus
ENSGAFG00000009775	ago1	87	86.649	ENSGMOG00000019413	ago1	100	86.649	Gadus_morhua
ENSGAFG00000009775	ago1	98	96.797	ENSGALG00000002249	AGO1	100	96.154	Gallus_gallus
ENSGAFG00000009775	ago1	87	99.334	ENSGACG00000012443	ago1	100	99.334	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAFG00000009775	ago1	91	97.059	ENSGAGG00000012893	-	100	97.059	Gopherus_agassizii
ENSGAFG00000009775	ago1	100	95.804	ENSGGOG00000003316	AGO1	100	96.270	Gorilla_gorilla
ENSGAFG00000009775	ago1	100	99.534	ENSHBUG00000010459	ago1	100	99.534	Haplochromis_burtoni
ENSGAFG00000009775	ago1	99	96.694	ENSHGLG00000011540	AGO1	100	96.270	Heterocephalus_glaber_female
ENSGAFG00000009775	ago1	99	96.694	ENSHGLG00100005568	AGO1	100	96.270	Heterocephalus_glaber_male
ENSGAFG00000009775	ago1	99	99.764	ENSHCOG00000005708	ago1	100	99.764	Hippocampus_comes
ENSGAFG00000009775	ago1	100	99.301	ENSIPUG00000023216	ago1	100	99.301	Ictalurus_punctatus
ENSGAFG00000009775	ago1	99	96.019	ENSSTOG00000010857	AGO1	100	96.270	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGAFG00000009775	ago1	100	96.154	ENSJJAG00000019449	Ago1	100	96.154	Jaculus_jaculus
ENSGAFG00000009775	ago1	100	99.883	ENSKMAG00000019464	ago1	100	99.883	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAFG00000009775	ago1	100	99.883	ENSLBEG00000007694	ago1	100	99.883	Labrus_bergylta
ENSGAFG00000009775	ago1	99	90.824	ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.824	Latimeria_chalumnae
ENSGAFG00000009775	ago1	100	94.755	ENSLOCG00000000504	AGO1	100	94.755	Lepisosteus_oculatus
ENSGAFG00000009775	ago1	99	96.353	ENSLAFG00000010835	AGO1	100	96.353	Loxodonta_africana
ENSGAFG00000009775	ago1	98	96.916	ENSMFAG00000002846	AGO1	100	96.270	Macaca_fascicularis
ENSGAFG00000009775	ago1	99	92.090	ENSMMUG00000006251	AGO1	100	92.171	Macaca_mulatta
ENSGAFG00000009775	ago1	100	92.424	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	97.187	Macaca_nemestrina
ENSGAFG00000009775	ago1	98	96.916	ENSMLEG00000038388	AGO1	100	96.270	Mandrillus_leucophaeus
ENSGAFG00000009775	ago1	100	99.767	ENSMAMG00000008381	ago1	100	99.767	Mastacembelus_armatus
ENSGAFG00000009775	ago1	100	99.534	ENSMZEG00005007996	ago1	100	99.534	Maylandia_zebra
ENSGAFG00000009775	ago1	99	90.719	ENSMGAG00000003822	AGO1	99	90.719	Meleagris_gallopavo
ENSGAFG00000009775	ago1	98	96.916	ENSMAUG00000015189	Ago1	100	96.270	Mesocricetus_auratus
ENSGAFG00000009775	ago1	99	96.145	ENSMICG00000016147	AGO1	100	96.270	Microcebus_murinus
ENSGAFG00000009775	ago1	99	95.804	ENSMOCG00000000537	Ago1	100	96.154	Microtus_ochrogaster
ENSGAFG00000009775	ago1	78	99.701	ENSMMOG00000018459	ago1	93	99.701	Mola_mola
ENSGAFG00000009775	ago1	100	95.921	ENSMODG00000023335	AGO1	100	95.921	Monodelphis_domestica
ENSGAFG00000009775	ago1	99	99.646	ENSMALG00000011057	ago1	100	99.646	Monopterus_albus
ENSGAFG00000009775	ago1	98	96.916	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	98.011	Mus_caroli
ENSGAFG00000009775	ago1	98	96.916	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	98.011	Mus_musculus
ENSGAFG00000009775	ago1	98	96.916	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	98.011	Mus_pahari
ENSGAFG00000009775	ago1	98	96.916	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	98.011	Mus_spretus
ENSGAFG00000009775	ago1	84	97.772	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	97.772	Mustela_putorius_furo
ENSGAFG00000009775	ago1	61	94.837	ENSMLUG00000009628	AGO1	99	94.837	Myotis_lucifugus
ENSGAFG00000009775	ago1	100	96.037	ENSNGAG00000017448	Ago1	100	96.037	Nannospalax_galili
ENSGAFG00000009775	ago1	91	99.872	ENSNBRG00000010867	ago1	100	99.872	Neolamprologus_brichardi
ENSGAFG00000009775	ago1	100	96.270	ENSNLEG00000011181	AGO1	100	96.270	Nomascus_leucogenys
ENSGAFG00000009775	ago1	84	91.429	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	91.429	Notamacropus_eugenii
ENSGAFG00000009775	ago1	93	98.480	ENSOPRG00000012325	AGO1	93	98.480	Ochotona_princeps
ENSGAFG00000009775	ago1	100	95.035	ENSODEG00000005321	AGO1	100	96.270	Octodon_degus
ENSGAFG00000009775	ago1	99	99.529	ENSONIG00000016345	ago1	100	99.529	Oreochromis_niloticus
ENSGAFG00000009775	ago1	100	88.269	ENSOANG00000002080	AGO1	100	88.269	Ornithorhynchus_anatinus
ENSGAFG00000009775	ago1	98	96.797	ENSOCUG00000023116	AGO1	100	96.154	Oryctolagus_cuniculus
ENSGAFG00000009775	ago1	100	99.883	ENSORLG00000014965	ago1	100	99.883	Oryzias_latipes
ENSGAFG00000009775	ago1	100	99.883	ENSORLG00020018253	ago1	100	99.883	Oryzias_latipes_hni
ENSGAFG00000009775	ago1	100	99.883	ENSORLG00015003287	ago1	100	99.883	Oryzias_latipes_hsok
ENSGAFG00000009775	ago1	100	99.883	ENSOMEG00000020528	ago1	100	99.883	Oryzias_melastigma
ENSGAFG00000009775	ago1	99	96.136	ENSOGAG00000010279	AGO1	99	96.136	Otolemur_garnettii
ENSGAFG00000009775	ago1	98	96.686	ENSOARG00000019591	AGO1	100	96.270	Ovis_aries
ENSGAFG00000009775	ago1	100	95.804	ENSPPAG00000034838	AGO1	100	96.270	Pan_paniscus
ENSGAFG00000009775	ago1	98	96.916	ENSPPRG00000006475	AGO1	100	96.270	Panthera_pardus
ENSGAFG00000009775	ago1	98	96.679	ENSPTIG00000020991	AGO1	100	96.037	Panthera_tigris_altaica
ENSGAFG00000009775	ago1	100	95.804	ENSPTRG00000000528	AGO1	100	96.270	Pan_troglodytes
ENSGAFG00000009775	ago1	98	96.916	ENSPANG00000009060	AGO1	100	96.270	Papio_anubis
ENSGAFG00000009775	ago1	98	95.962	ENSPSIG00000017482	AGO1	100	95.962	Pelodiscus_sinensis
ENSGAFG00000009775	ago1	80	98.547	ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.547	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGAFG00000009775	ago1	99	96.023	ENSPEMG00000023313	Ago1	100	96.270	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGAFG00000009775	ago1	100	95.921	ENSPCIG00000000172	AGO1	100	95.921	Phascolarctos_cinereus
ENSGAFG00000009775	ago1	100	100.000	ENSPFOG00000005867	ago1	100	100.000	Poecilia_formosa
ENSGAFG00000009775	ago1	100	100.000	ENSPLAG00000002824	ago1	100	100.000	Poecilia_latipinna
ENSGAFG00000009775	ago1	100	100.000	ENSPMEG00000001787	ago1	100	100.000	Poecilia_mexicana
ENSGAFG00000009775	ago1	100	100.000	ENSPREG00000006534	ago1	100	100.000	Poecilia_reticulata
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