EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGAFG00000009808 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ago3a
Alias: Ago3a|eif2c3a|sb:eu275|sb:eu416
Full Name: argonaute RISC catalytic component 3a
Gene Type: protein_coding
Species: Gambusia_affinis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 27763 bases
Position: chrNHOQ01001935.1:3777791-3805553
Accession: ZDB-GENE-051107-16
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGAFP00000014514	PAZ	PF02170.22	1.5e-28	1	1
ENSGAFP00000014514	Piwi	PF02171.17	1.1e-113	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGAFT00000014662	-	3455	-	ENSGAFP00000014514	860 (aa)	-	UPI0003B32ED6

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSGAFG00000009808	ago3a	99	80.471	ENSGAFG00000018026	ago2	97	80.471
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	94.118	ENSGAFG00000015911	-	100	94.118
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	79.096	ENSGAFG00000017239	ago4	100	79.096
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	83.506	ENSGAFG00000009775	ago1	100	83.506

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	96.977	ENSG00000126070	AGO3	100	98.403	Homo_sapiens
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	99.767	ENSAPOG00000024260	ago3a	100	99.767	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	96.078	ENSAPOG00000014494	-	100	96.078	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	97.093	ENSAMEG00000000497	AGO3	100	97.093	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGAFG00000009808	ago3a	92	99.874	ENSACIG00000005333	ago3a	100	99.874	Amphilophus_citrinellus
ENSGAFG00000009808	ago3a	92	97.092	ENSACIG00000019272	AGO3	100	97.092	Amphilophus_citrinellus
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	99.767	ENSAOCG00000017642	ago3a	100	99.767	Amphiprion_ocellaris
ENSGAFG00000009808	ago3a	93	89.335	ENSAOCG00000017051	-	100	89.335	Amphiprion_ocellaris
ENSGAFG00000009808	ago3a	54	90.397	ENSAOCG00000022538	-	91	90.397	Amphiprion_ocellaris
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	98.962	ENSAPEG00000004375	ago3a	100	98.962	Amphiprion_percula
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	95.848	ENSAPEG00000020249	-	100	95.848	Amphiprion_percula
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	98.962	ENSATEG00000008458	ago3a	100	98.962	Anabas_testudineus
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	96.078	ENSATEG00000005160	-	100	96.078	Anabas_testudineus
ENSGAFG00000009808	ago3a	99	97.310	ENSAPLG00000009642	AGO3	99	97.310	Anas_platyrhynchos
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	96.860	ENSACAG00000003385	AGO3	100	96.860	Anolis_carolinensis
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	96.977	ENSANAG00000037735	AGO3	100	96.977	Aotus_nancymaae
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	99.535	ENSACLG00000000963	ago3a	100	99.535	Astatotilapia_calliptera
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	95.617	ENSACLG00000001965	-	100	95.617	Astatotilapia_calliptera
ENSGAFG00000009808	ago3a	92	95.575	ENSAMXG00000009571	ago3b	100	95.575	Astyanax_mexicanus
ENSGAFG00000009808	ago3a	92	97.345	ENSAMXG00000002198	ago3a	100	97.345	Astyanax_mexicanus
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	97.093	ENSBTAG00000018324	AGO3	100	97.093	Bos_taurus
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	96.977	ENSCJAG00000031580	AGO3	100	96.977	Callithrix_jacchus
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	96.977	ENSCAFG00000024682	AGO3	100	96.977	Canis_familiaris
ENSGAFG00000009808	ago3a	99	97.083	ENSCAFG00020009051	AGO3	99	97.771	Canis_lupus_dingo
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	97.093	ENSCHIG00000011536	AGO3	100	97.093	Capra_hircus
ENSGAFG00000009808	ago3a	84	96.823	ENSTSYG00000011897	AGO3	100	96.823	Carlito_syrichta
ENSGAFG00000009808	ago3a	93	79.255	ENSCAPG00000011589	AGO3	100	78.723	Cavia_aperea
ENSGAFG00000009808	ago3a	99	93.794	ENSCPOG00000030524	AGO3	99	93.794	Cavia_porcellus
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	96.977	ENSCCAG00000034189	AGO3	100	98.403	Cebus_capucinus
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	96.977	ENSCATG00000029748	AGO3	100	98.403	Cercocebus_atys
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	97.093	ENSCLAG00000013184	AGO3	100	97.093	Chinchilla_lanigera
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	96.977	ENSCSAG00000001092	AGO3	100	96.977	Chlorocebus_sabaeus
ENSGAFG00000009808	ago3a	92	97.143	ENSCHOG00000011621	AGO3	92	97.143	Choloepus_hoffmanni
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	97.209	ENSCPBG00000018583	AGO3	100	97.209	Chrysemys_picta_bellii
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	96.977	ENSCANG00000033258	AGO3	100	98.403	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	96.860	ENSCGRG00001024614	Ago3	100	96.860	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	96.860	ENSCGRG00000010670	Ago3	100	96.860	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGAFG00000009808	ago3a	92	98.989	ENSCSEG00000001040	ago3a	100	98.989	Cynoglossus_semilaevis
ENSGAFG00000009808	ago3a	92	91.136	ENSCSEG00000009788	-	100	91.136	Cynoglossus_semilaevis
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	99.767	ENSCVAG00000018224	ago3a	100	99.767	Cyprinodon_variegatus
ENSGAFG00000009808	ago3a	52	86.404	ENSCVAG00000011229	-	98	86.404	Cyprinodon_variegatus
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	98.385	ENSDARG00000059888	ago3a	100	98.385	Danio_rerio
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	96.977	ENSDARG00000063079	ago3b	100	96.977	Danio_rerio
ENSGAFG00000009808	ago3a	88	96.966	ENSDNOG00000008106	AGO3	100	96.966	Dasypus_novemcinctus
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	96.977	ENSDORG00000009414	Ago3	100	96.977	Dipodomys_ordii
ENSGAFG00000009808	ago3a	85	96.620	ENSETEG00000007639	AGO3	89	96.620	Echinops_telfairi
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	97.093	ENSEASG00005012089	AGO3	100	97.093	Equus_asinus_asinus
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	97.093	ENSECAG00000023972	AGO3	100	97.093	Equus_caballus
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	80.465	ENSEEUG00000007058	AGO3	100	80.465	Erinaceus_europaeus
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	95.216	ENSELUG00000001774	-	100	95.216	Esox_lucius
ENSGAFG00000009808	ago3a	92	95.954	ENSELUG00000016755	ago3a	100	95.954	Esox_lucius
ENSGAFG00000009808	ago3a	73	98.403	ENSFCAG00000000747	-	100	98.403	Felis_catus
ENSGAFG00000009808	ago3a	99	97.193	ENSFALG00000000802	AGO3	99	97.193	Ficedula_albicollis
ENSGAFG00000009808	ago3a	99	97.418	ENSFDAG00000012874	AGO3	99	97.418	Fukomys_damarensis
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	94.233	ENSFHEG00000016205	-	100	94.233	Fundulus_heteroclitus
ENSGAFG00000009808	ago3a	83	80.081	ENSGMOG00000019418	-	89	80.081	Gadus_morhua
ENSGAFG00000009808	ago3a	97	97.964	ENSGMOG00000013069	-	100	97.964	Gadus_morhua
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	97.093	ENSGALG00000043711	AGO3	100	97.093	Gallus_gallus
ENSGAFG00000009808	ago3a	92	98.996	ENSGACG00000012453	ago3a	100	98.996	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAFG00000009808	ago3a	97	96.527	ENSGACG00000002455	AGO3	100	96.527	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	97.093	ENSGAGG00000012887	AGO3	100	97.093	Gopherus_agassizii
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	96.977	ENSGGOG00000036711	AGO3	100	96.977	Gorilla_gorilla
ENSGAFG00000009808	ago3a	89	98.191	ENSHBUG00000010542	ago3a	97	98.191	Haplochromis_burtoni
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	95.617	ENSHBUG00000017794	-	100	95.617	Haplochromis_burtoni
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	97.093	ENSHGLG00000012538	AGO3	100	97.093	Heterocephalus_glaber_female
ENSGAFG00000009808	ago3a	99	97.055	ENSHGLG00100006043	AGO3	99	97.055	Heterocephalus_glaber_male
ENSGAFG00000009808	ago3a	87	97.718	ENSHCOG00000005674	ago3a	97	97.718	Hippocampus_comes
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	94.348	ENSHCOG00000011851	AGO3	100	94.348	Hippocampus_comes
ENSGAFG00000009808	ago3a	99	93.148	ENSIPUG00000023241	ago3a	99	93.148	Ictalurus_punctatus
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	96.770	ENSIPUG00000008548	ago3b	100	96.770	Ictalurus_punctatus
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	92.558	ENSSTOG00000025904	AGO3	100	92.558	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	96.977	ENSJJAG00000017436	Ago3	100	96.977	Jaculus_jaculus
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	98.962	ENSKMAG00000019534	ago3a	100	98.962	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAFG00000009808	ago3a	92	99.621	ENSLBEG00000007592	ago3a	100	99.621	Labrus_bergylta
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	94.875	ENSLBEG00000016073	-	100	94.875	Labrus_bergylta
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	97.093	ENSLAFG00000002744	AGO3	100	97.093	Loxodonta_africana
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	96.977	ENSMFAG00000035610	AGO3	100	98.403	Macaca_fascicularis
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	96.977	ENSMMUG00000006252	AGO3	100	96.977	Macaca_mulatta
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	96.977	ENSMNEG00000039518	AGO3	100	98.403	Macaca_nemestrina
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	96.977	ENSMLEG00000027912	AGO3	100	98.403	Mandrillus_leucophaeus
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	93.860	ENSMAMG00000008440	ago3a	100	98.989	Mastacembelus_armatus
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	95.617	ENSMAMG00000005697	-	100	95.617	Mastacembelus_armatus
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	99.535	ENSMZEG00005007949	ago3a	100	99.535	Maylandia_zebra
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	95.732	ENSMZEG00005026243	-	100	95.732	Maylandia_zebra
ENSGAFG00000009808	ago3a	99	97.313	ENSMGAG00000003773	AGO3	99	97.313	Meleagris_gallopavo
ENSGAFG00000009808	ago3a	93	85.050	ENSMAUG00000010128	Ago3	96	85.176	Mesocricetus_auratus
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	97.093	ENSMICG00000016158	AGO3	100	97.093	Microcebus_murinus
ENSGAFG00000009808	ago3a	99	94.366	ENSMOCG00000020568	Ago3	99	94.366	Microtus_ochrogaster
ENSGAFG00000009808	ago3a	92	94.564	ENSMMOG00000014065	-	100	94.564	Mola_mola
ENSGAFG00000009808	ago3a	92	94.665	ENSMMOG00000018446	ago3a	100	94.665	Mola_mola
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	97.093	ENSMODG00000017869	AGO3	100	97.093	Monodelphis_domestica
ENSGAFG00000009808	ago3a	99	96.462	ENSMALG00000010895	ago3a	99	96.462	Monopterus_albus
ENSGAFG00000009808	ago3a	99	94.111	ENSMALG00000014658	-	99	94.111	Monopterus_albus
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	96.628	MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	96.628	Mus_caroli
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	96.395	ENSMUSG00000028842	Ago3	100	96.395	Mus_musculus
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	96.628	MGP_PahariEiJ_G0028808	Ago3	100	96.628	Mus_pahari
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	96.744	MGP_SPRETEiJ_G0027456	Ago3	100	96.744	Mus_spretus
ENSGAFG00000009808	ago3a	73	98.243	ENSMLUG00000009668	AGO3	100	98.243	Myotis_lucifugus
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	96.977	ENSNGAG00000012607	Ago3	100	96.977	Nannospalax_galili
ENSGAFG00000009808	ago3a	92	90.692	ENSNBRG00000010936	ago3a	100	90.692	Neolamprologus_brichardi
ENSGAFG00000009808	ago3a	92	96.966	ENSNBRG00000015687	AGO3	100	96.966	Neolamprologus_brichardi
ENSGAFG00000009808	ago3a	99	93.067	ENSNLEG00000027092	AGO3	99	93.067	Nomascus_leucogenys
ENSGAFG00000009808	ago3a	87	85.692	ENSMEUG00000009200	AGO3	91	85.692	Notamacropus_eugenii
ENSGAFG00000009808	ago3a	82	97.790	ENSOPRG00000012344	AGO3	82	97.790	Ochotona_princeps
ENSGAFG00000009808	ago3a	99	97.418	ENSODEG00000005161	AGO3	99	97.418	Octodon_degus
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	95.848	ENSONIG00000013760	AGO3	100	95.848	Oreochromis_niloticus
ENSGAFG00000009808	ago3a	100	99.651	ENSONIG00000016349	ago3a	100	99.651	Oreochromis_niloticus
ENSGAFG00000009808	ago3a	98	97.870	ENSOANG00000002078	AGO3	99	97.870	Ornithorhynchus_anatinus
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ENSGAFG00000009808	ago3a	80	99.854	ENSXCOG00000007676	ago3a	100	99.854	Xiphophorus_couchianus
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