EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGAFG00000011896 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ctif
Alias: zmp:0000001000
Full Name: CBP80/20-dependent translation initiation factor
Gene Type: protein_coding
Species: Gambusia_affinis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 46761 bases
Position: chrNHOQ01001156.1:10572960-10619720
Accession: ZDB-GENE-130530-1003
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGAFP00000017596	MIF4G	PF02854.19	2.3e-27	1	1
ENSGAFP00000017582	MIF4G	PF02854.19	3.5e-27	1	1
ENSGAFP00000017576	MIF4G	PF02854.19	3.5e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGAFT00000017746	-	5994	-	ENSGAFP00000017576	704 (aa)	-	-
ENSGAFT00000017766	-	1764	-	ENSGAFP00000017596	587 (aa)	-	-
ENSGAFT00000017753	-	5713	-	ENSGAFP00000017582	701 (aa)	-	-

Gene Model

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGAFG00000011896	ctif	99	56.894	ENSG00000134030	CTIF	100	60.577	Homo_sapiens
ENSGAFG00000011896	ctif	100	70.915	ENSAPOG00000020192	ctif	100	80.355	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAFG00000011896	ctif	87	56.343	ENSAMEG00000006759	CTIF	79	56.900	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGAFG00000011896	ctif	99	90.385	ENSACIG00000017099	ctif	89	90.385	Amphilophus_citrinellus
ENSGAFG00000011896	ctif	100	74.574	ENSAOCG00000014275	ctif	100	74.858	Amphiprion_ocellaris
ENSGAFG00000011896	ctif	100	80.114	ENSAPEG00000016975	ctif	100	81.093	Amphiprion_percula
ENSGAFG00000011896	ctif	100	88.136	ENSATEG00000016752	ctif	92	88.136	Anabas_testudineus
ENSGAFG00000011896	ctif	99	66.667	ENSACAG00000018006	CTIF	91	66.667	Anolis_carolinensis
ENSGAFG00000011896	ctif	99	56.735	ENSANAG00000024925	CTIF	99	57.212	Aotus_nancymaae
ENSGAFG00000011896	ctif	100	84.746	ENSACLG00000005956	ctif	100	80.059	Astatotilapia_calliptera
ENSGAFG00000011896	ctif	70	87.500	ENSAMXG00000015964	ctif	100	61.421	Astyanax_mexicanus
ENSGAFG00000011896	ctif	99	58.528	ENSBTAG00000018901	CTIF	99	57.886	Bos_taurus
ENSGAFG00000011896	ctif	99	56.550	ENSCJAG00000004729	CTIF	99	57.027	Callithrix_jacchus
ENSGAFG00000011896	ctif	97	56.331	ENSCAFG00000019076	CTIF	99	57.212	Canis_familiaris
ENSGAFG00000011896	ctif	97	56.331	ENSCAFG00020026482	CTIF	99	57.212	Canis_lupus_dingo
ENSGAFG00000011896	ctif	99	55.803	ENSCHIG00000014455	CTIF	99	55.183	Capra_hircus
ENSGAFG00000011896	ctif	90	54.645	ENSTSYG00000030461	CTIF	97	55.102	Carlito_syrichta
ENSGAFG00000011896	ctif	99	52.524	ENSCAPG00000011865	CTIF	99	52.607	Cavia_aperea
ENSGAFG00000011896	ctif	99	56.037	ENSCPOG00000001049	CTIF	99	55.538	Cavia_porcellus
ENSGAFG00000011896	ctif	99	56.101	ENSCCAG00000022758	CTIF	99	56.866	Cebus_capucinus
ENSGAFG00000011896	ctif	99	56.894	ENSCATG00000038134	CTIF	98	66.250	Cercocebus_atys
ENSGAFG00000011896	ctif	99	57.278	ENSCLAG00000008174	CTIF	99	57.372	Chinchilla_lanigera
ENSGAFG00000011896	ctif	99	55.487	ENSCSAG00000018021	CTIF	99	55.573	Chlorocebus_sabaeus
ENSGAFG00000011896	ctif	98	88.000	ENSCPBG00000025654	CTIF	98	88.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSGAFG00000011896	ctif	99	56.714	ENSCANG00000030916	CTIF	99	57.428	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGAFG00000011896	ctif	99	58.796	ENSCGRG00001020158	Ctif	99	59.390	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGAFG00000011896	ctif	99	54.071	ENSCGRG00000000052	Ctif	99	54.432	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGAFG00000011896	ctif	95	89.831	ENSCSEG00000019857	ctif	100	76.578	Cynoglossus_semilaevis
ENSGAFG00000011896	ctif	100	94.915	ENSCVAG00000017158	ctif	100	86.506	Cyprinodon_variegatus
ENSGAFG00000011896	ctif	99	65.488	ENSDARG00000090617	ctif	100	65.064	Danio_rerio
ENSGAFG00000011896	ctif	75	56.645	ENSDNOG00000037310	CTIF	99	57.301	Dasypus_novemcinctus
ENSGAFG00000011896	ctif	99	57.120	ENSDORG00000003221	Ctif	99	57.767	Dipodomys_ordii
ENSGAFG00000011896	ctif	99	56.447	ENSEASG00005016094	CTIF	81	86.000	Equus_asinus_asinus
ENSGAFG00000011896	ctif	99	56.447	ENSECAG00000020473	CTIF	100	56.825	Equus_caballus
ENSGAFG00000011896	ctif	85	57.225	ENSEEUG00000012451	CTIF	91	56.852	Erinaceus_europaeus
ENSGAFG00000011896	ctif	99	86.792	ENSELUG00000008733	ctif	90	86.792	Esox_lucius
ENSGAFG00000011896	ctif	99	58.292	ENSFCAG00000000664	CTIF	98	86.000	Felis_catus
ENSGAFG00000011896	ctif	96	56.616	ENSFALG00000008943	CTIF	98	56.856	Ficedula_albicollis
ENSGAFG00000011896	ctif	99	56.162	ENSFDAG00000017379	CTIF	99	56.398	Fukomys_damarensis
ENSGAFG00000011896	ctif	97	93.220	ENSFHEG00000004334	ctif	100	93.220	Fundulus_heteroclitus
ENSGAFG00000011896	ctif	98	88.000	ENSGALG00000035912	-	88	88.000	Gallus_gallus
ENSGAFG00000011896	ctif	69	55.854	ENSGAGG00000020663	CTIF	89	58.667	Gopherus_agassizii
ENSGAFG00000011896	ctif	99	56.556	ENSGGOG00000015204	CTIF	99	57.029	Gorilla_gorilla
ENSGAFG00000011896	ctif	100	84.746	ENSHBUG00000018092	ctif	100	80.207	Haplochromis_burtoni
ENSGAFG00000011896	ctif	99	57.234	ENSHGLG00000005663	CTIF	99	57.488	Heterocephalus_glaber_female
ENSGAFG00000011896	ctif	99	57.234	ENSHGLG00100006976	CTIF	99	57.488	Heterocephalus_glaber_male
ENSGAFG00000011896	ctif	99	62.193	ENSHCOG00000011784	ctif	98	68.261	Hippocampus_comes
ENSGAFG00000011896	ctif	97	95.122	ENSIPUG00000014050	ctif	89	76.667	Ictalurus_punctatus
ENSGAFG00000011896	ctif	99	56.894	ENSSTOG00000001967	CTIF	99	57.372	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGAFG00000011896	ctif	99	55.994	ENSJJAG00000013706	Ctif	99	56.550	Jaculus_jaculus
ENSGAFG00000011896	ctif	100	86.441	ENSKMAG00000014651	ctif	100	76.686	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAFG00000011896	ctif	99	73.413	ENSLBEG00000018277	ctif	99	88.136	Labrus_bergylta
ENSGAFG00000011896	ctif	98	91.667	ENSLOCG00000011697	ctif	90	78.333	Lepisosteus_oculatus
ENSGAFG00000011896	ctif	99	49.544	ENSLAFG00000016335	CTIF	99	75.758	Loxodonta_africana
ENSGAFG00000011896	ctif	99	56.894	ENSMFAG00000037903	CTIF	98	66.250	Macaca_fascicularis
ENSGAFG00000011896	ctif	99	56.894	ENSMMUG00000020898	CTIF	98	66.250	Macaca_mulatta
ENSGAFG00000011896	ctif	99	56.894	ENSMNEG00000039395	CTIF	98	66.250	Macaca_nemestrina
ENSGAFG00000011896	ctif	99	56.714	ENSMLEG00000041132	CTIF	98	66.250	Mandrillus_leucophaeus
ENSGAFG00000011896	ctif	100	89.831	ENSMAMG00000014741	ctif	100	78.279	Mastacembelus_armatus
ENSGAFG00000011896	ctif	88	84.746	ENSMZEG00005019767	ctif	90	77.851	Maylandia_zebra
ENSGAFG00000011896	ctif	88	40.255	ENSMGAG00000001378	CTIF	62	88.000	Meleagris_gallopavo
ENSGAFG00000011896	ctif	99	57.820	ENSMAUG00000000656	Ctif	99	58.013	Mesocricetus_auratus
ENSGAFG00000011896	ctif	99	57.188	ENSMICG00000010167	CTIF	99	57.437	Microcebus_murinus
ENSGAFG00000011896	ctif	99	58.228	ENSMOCG00000020507	Ctif	99	58.814	Microtus_ochrogaster
ENSGAFG00000011896	ctif	98	97.727	ENSMMOG00000000831	ctif	100	74.366	Mola_mola
ENSGAFG00000011896	ctif	99	53.090	ENSMODG00000003464	CTIF	99	53.387	Monodelphis_domestica
ENSGAFG00000011896	ctif	88	69.038	ENSMALG00000020553	ctif	99	84.615	Monopterus_albus
ENSGAFG00000011896	ctif	99	56.269	MGP_CAROLIEiJ_G0022408	Ctif	99	56.811	Mus_caroli
ENSGAFG00000011896	ctif	99	55.878	ENSMUSG00000052928	Ctif	99	56.260	Mus_musculus
ENSGAFG00000011896	ctif	99	58.003	MGP_PahariEiJ_G0019137	Ctif	99	58.587	Mus_pahari
ENSGAFG00000011896	ctif	99	56.146	MGP_SPRETEiJ_G0023321	Ctif	91	75.817	Mus_spretus
ENSGAFG00000011896	ctif	99	56.735	ENSMPUG00000000844	CTIF	99	57.212	Mustela_putorius_furo
ENSGAFG00000011896	ctif	99	56.894	ENSMLUG00000003025	CTIF	100	57.327	Myotis_lucifugus
ENSGAFG00000011896	ctif	99	57.504	ENSNGAG00000011452	Ctif	99	58.080	Nannospalax_galili
ENSGAFG00000011896	ctif	100	84.746	ENSNBRG00000008679	ctif	100	80.207	Neolamprologus_brichardi
ENSGAFG00000011896	ctif	99	56.714	ENSNLEG00000011503	CTIF	99	57.188	Nomascus_leucogenys
ENSGAFG00000011896	ctif	99	51.840	ENSMEUG00000000218	CTIF	84	86.000	Notamacropus_eugenii
ENSGAFG00000011896	ctif	99	56.735	ENSOPRG00000003558	CTIF	100	56.418	Ochotona_princeps
ENSGAFG00000011896	ctif	99	55.046	ENSODEG00000018390	CTIF	99	55.418	Octodon_degus
ENSGAFG00000011896	ctif	99	72.578	ENSONIG00000007750	ctif	100	72.444	Oreochromis_niloticus
ENSGAFG00000011896	ctif	88	46.859	ENSOANG00000001337	CTIF	99	47.342	Ornithorhynchus_anatinus
ENSGAFG00000011896	ctif	99	56.731	ENSOCUG00000024842	CTIF	100	57.120	Oryctolagus_cuniculus
ENSGAFG00000011896	ctif	100	84.746	ENSORLG00000005786	ctif	92	84.746	Oryzias_latipes
ENSGAFG00000011896	ctif	100	83.051	ENSORLG00020005385	ctif	92	83.051	Oryzias_latipes_hni
ENSGAFG00000011896	ctif	100	84.746	ENSORLG00015011872	ctif	92	84.746	Oryzias_latipes_hsok
ENSGAFG00000011896	ctif	100	84.746	ENSOMEG00000007917	ctif	92	84.746	Oryzias_melastigma
ENSGAFG00000011896	ctif	99	56.825	ENSOGAG00000013927	CTIF	99	57.303	Otolemur_garnettii
ENSGAFG00000011896	ctif	99	56.529	ENSOARG00000003754	CTIF	99	55.911	Ovis_aries
ENSGAFG00000011896	ctif	99	56.714	ENSPPAG00000023554	CTIF	98	66.250	Pan_paniscus
ENSGAFG00000011896	ctif	99	56.714	ENSPPRG00000002265	CTIF	99	57.440	Panthera_pardus
ENSGAFG00000011896	ctif	99	56.850	ENSPTIG00000013761	CTIF	99	57.325	Panthera_tigris_altaica
ENSGAFG00000011896	ctif	99	56.714	ENSPTRG00000010009	CTIF	98	66.250	Pan_troglodytes
ENSGAFG00000011896	ctif	99	56.714	ENSPANG00000017087	CTIF	98	66.250	Papio_anubis
ENSGAFG00000011896	ctif	88	60.659	ENSPKIG00000011234	ctif	99	60.271	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGAFG00000011896	ctif	99	59.333	ENSPSIG00000006508	CTIF	98	86.000	Pelodiscus_sinensis
ENSGAFG00000011896	ctif	99	87.273	ENSPMGG00000022958	ctif	100	70.297	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGAFG00000011896	ctif	99	57.325	ENSPEMG00000022746	Ctif	99	57.903	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGAFG00000011896	ctif	78	54.772	ENSPCIG00000026247	CTIF	99	58.892	Phascolarctos_cinereus
ENSGAFG00000011896	ctif	100	98.305	ENSPFOG00000009243	ctif	100	94.499	Poecilia_formosa
ENSGAFG00000011896	ctif	100	98.305	ENSPLAG00000019171	ctif	100	95.015	Poecilia_latipinna
ENSGAFG00000011896	ctif	100	98.305	ENSPMEG00000020089	ctif	100	94.575	Poecilia_mexicana
ENSGAFG00000011896	ctif	96	98.305	ENSPREG00000017326	ctif	100	91.255	Poecilia_reticulata
ENSGAFG00000011896	ctif	88	56.159	ENSPPYG00000009147	CTIF	99	56.697	Pongo_abelii
ENSGAFG00000011896	ctif	99	54.803	ENSPCOG00000013391	CTIF	99	55.255	Propithecus_coquereli
ENSGAFG00000011896	ctif	99	56.121	ENSPVAG00000001965	CTIF	99	56.361	Pteropus_vampyrus
ENSGAFG00000011896	ctif	100	84.746	ENSPNYG00000007879	ctif	100	80.207	Pundamilia_nyererei
ENSGAFG00000011896	ctif	98	84.615	ENSPNAG00000029174	ctif	100	65.537	Pygocentrus_nattereri
ENSGAFG00000011896	ctif	99	57.528	ENSRNOG00000018342	Ctif	99	58.106	Rattus_norvegicus
ENSGAFG00000011896	ctif	99	56.714	ENSRBIG00000043937	CTIF	99	56.960	Rhinopithecus_bieti
ENSGAFG00000011896	ctif	99	56.556	ENSRROG00000006039	CTIF	99	56.800	Rhinopithecus_roxellana
ENSGAFG00000011896	ctif	99	58.500	ENSSBOG00000028468	CTIF	99	59.022	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSGAFG00000011896	ctif	99	53.185	ENSSHAG00000016321	CTIF	99	53.647	Sarcophilus_harrisii
ENSGAFG00000011896	ctif	99	78.333	ENSSFOG00015022594	ctif	99	64.774	Scleropages_formosus
ENSGAFG00000011896	ctif	100	89.831	ENSSMAG00000005707	ctif	91	89.831	Scophthalmus_maximus
ENSGAFG00000011896	ctif	100	89.831	ENSSDUG00000016033	ctif	92	89.831	Seriola_dumerili
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ENSGAFG00000011896	ctif	99	50.614	ENSTGUG00000000030	CTIF	99	54.844	Taeniopygia_guttata
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ENSGAFG00000011896	ctif	70	93.932	ENSXCOG00000002477	ctif	98	91.051	Xiphophorus_couchianus
ENSGAFG00000011896	ctif	100	98.305	ENSXMAG00000004236	ctif	100	94.868	Xiphophorus_maculatus