EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGAFG00000012342 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ipo11
Alias: zgc:91897
Full Name: importin 11
Gene Type: protein_coding
Species: Gambusia_affinis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 103531 bases
Position: chrNHOQ01002573.1:1000761-1104291
Accession: ZDB-GENE-040711-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGAFP00000018277	IBN_N	PF03810.19	1.1e-19	1	1
ENSGAFP00000018260	IBN_N	PF03810.19	1.4e-19	1	1
ENSGAFP00000018273	IBN_N	PF03810.19	1.4e-19	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGAFT00000018434	-	6536	-	ENSGAFP00000018260	975 (aa)	-	-
ENSGAFT00000018447	-	2877	-	ENSGAFP00000018273	958 (aa)	-	-
ENSGAFT00000018451	-	3061	-	ENSGAFP00000018277	921 (aa)	-	-

Gene Model

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.822	ENSG00000086200	IPO11	100	90.741	Homo_sapiens
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	95.657	ENSAPOG00000009256	ipo11	100	95.590	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.532	ENSAMEG00000004080	IPO11	99	83.009	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGAFG00000012342	ipo11	92	94.264	ENSACIG00000003345	ipo11	98	94.293	Amphilophus_citrinellus
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	91.761	ENSAOCG00000000164	ipo11	100	91.761	Amphiprion_ocellaris
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	91.864	ENSAPEG00000005496	ipo11	100	91.864	Amphiprion_percula
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	95.548	ENSATEG00000016853	ipo11	99	95.548	Anabas_testudineus
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	78.863	ENSAPLG00000009338	IPO11	100	78.398	Anas_platyrhynchos
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.062	ENSACAG00000008472	IPO11	99	82.667	Anolis_carolinensis
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.496	ENSANAG00000027877	IPO11	99	82.974	Aotus_nancymaae
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	89.264	ENSACLG00000014997	ipo11	100	89.264	Astatotilapia_calliptera
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.160	ENSAMXG00000005993	ipo11	100	83.368	Astyanax_mexicanus
ENSGAFG00000012342	ipo11	93	83.275	ENSBTAG00000018616	IPO11	99	83.275	Bos_taurus
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.713	ENSCJAG00000015559	IPO11	99	83.179	Callithrix_jacchus
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	84.039	ENSCAFG00000007240	IPO11	100	83.487	Canis_familiaris
ENSGAFG00000012342	ipo11	76	83.073	ENSCAFG00020022776	-	99	83.073	Canis_lupus_dingo
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.388	ENSCHIG00000013218	IPO11	100	82.974	Capra_hircus
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	81.868	ENSCPOG00000009412	IPO11	100	81.436	Cavia_porcellus
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.713	ENSCCAG00000024860	IPO11	99	83.179	Cebus_capucinus
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.822	ENSCATG00000040159	IPO11	100	83.385	Cercocebus_atys
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.822	ENSCLAG00000003889	IPO11	100	83.385	Chinchilla_lanigera
ENSGAFG00000012342	ipo11	59	82.689	ENSCSAG00000016001	IPO11	96	82.689	Chlorocebus_sabaeus
ENSGAFG00000012342	ipo11	76	80.674	ENSCHOG00000002780	IPO11	77	81.015	Choloepus_hoffmanni
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	84.799	ENSCPBG00000026824	IPO11	100	90.116	Chrysemys_picta_bellii
ENSGAFG00000012342	ipo11	99	34.681	ENSCING00000006626	-	99	34.615	Ciona_intestinalis
ENSGAFG00000012342	ipo11	99	34.038	ENSCSAVG00000003664	-	99	34.038	Ciona_savignyi
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	77.982	ENSCANG00000042405	IPO11	99	82.558	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.170	ENSCGRG00001012206	Ipo11	100	82.769	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.170	ENSCGRG00000003026	-	100	82.769	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	93.538	ENSCSEG00000017257	ipo11	100	93.538	Cynoglossus_semilaevis
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	97.846	ENSCVAG00000011995	ipo11	100	97.846	Cyprinodon_variegatus
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	90.879	ENSDARG00000054224	ipo11	100	90.462	Danio_rerio
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	80.347	ENSDORG00000002721	Ipo11	100	80.103	Dipodomys_ordii
ENSGAFG00000012342	ipo11	99	36.275	FBgn0284254	Impbeta11	95	35.749	Drosophila_melanogaster
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	61.346	ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.802	Eptatretus_burgeri
ENSGAFG00000012342	ipo11	58	78.113	ENSEASG00005006951	-	98	79.079	Equus_asinus_asinus
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.931	ENSECAG00000014185	IPO11	98	83.385	Equus_caballus
ENSGAFG00000012342	ipo11	92	84.655	ENSEEUG00000000271	IPO11	92	83.371	Erinaceus_europaeus
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	92.074	ENSELUG00000002842	ipo11	100	91.897	Esox_lucius
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	84.039	ENSFCAG00000003236	IPO11	100	83.487	Felis_catus
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.931	ENSFALG00000011086	IPO11	100	83.385	Ficedula_albicollis
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.170	ENSFDAG00000016117	IPO11	100	82.667	Fukomys_damarensis
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.910	ENSFHEG00000017985	ipo11	100	83.910	Fundulus_heteroclitus
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	90.359	ENSGMOG00000007727	ipo11	100	90.359	Gadus_morhua
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	82.953	ENSGALG00000014740	IPO11	100	82.564	Gallus_gallus
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	93.538	ENSGACG00000006939	ipo11	100	93.538	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAFG00000012342	ipo11	89	88.953	ENSGAGG00000008880	IPO11	97	88.953	Gopherus_agassizii
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.931	ENSGGOG00000003240	IPO11	100	83.487	Gorilla_gorilla
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	95.548	ENSHBUG00000004364	ipo11	100	95.385	Haplochromis_burtoni
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.605	ENSHGLG00000002375	IPO11	100	83.179	Heterocephalus_glaber_female
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.605	ENSHGLG00100011662	IPO11	100	83.179	Heterocephalus_glaber_male
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	89.116	ENSHCOG00000013529	ipo11	100	88.900	Hippocampus_comes
ENSGAFG00000012342	ipo11	99	72.485	ENSIPUG00000019077	clc4f	100	72.485	Ictalurus_punctatus
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.822	ENSSTOG00000006070	IPO11	100	83.282	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.170	ENSJJAG00000007223	Ipo11	100	82.667	Jaculus_jaculus
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	94.245	ENSKMAG00000013674	ipo11	100	94.239	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	95.005	ENSLBEG00000003126	ipo11	100	94.667	Labrus_bergylta
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	89.902	ENSLOCG00000007848	ipo11	100	89.902	Lepisosteus_oculatus
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.388	ENSLAFG00000003115	IPO11	100	83.295	Loxodonta_africana
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.822	ENSMFAG00000035631	IPO11	98	83.385	Macaca_fascicularis
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.822	ENSMMUG00000001233	IPO11	100	90.741	Macaca_mulatta
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.931	ENSMNEG00000032061	IPO11	98	83.487	Macaca_nemestrina
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.713	ENSMLEG00000014468	IPO11	100	83.282	Mandrillus_leucophaeus
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	94.680	ENSMAMG00000020889	ipo11	100	94.667	Mastacembelus_armatus
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	95.657	ENSMZEG00005006586	ipo11	100	95.487	Maylandia_zebra
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	72.727	ENSMGAG00000004204	IPO11	100	72.319	Meleagris_gallopavo
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	70.889	ENSMAUG00000020293	Ipo11	100	70.889	Mesocricetus_auratus
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	81.976	ENSMICG00000036842	-	100	81.641	Microcebus_murinus
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.822	ENSMICG00000016463	-	100	83.385	Microcebus_murinus
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	82.302	ENSMOCG00000000236	Ipo11	100	81.846	Microtus_ochrogaster
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	91.853	ENSMMOG00000001391	ipo11	100	91.853	Mola_mola
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.279	ENSMODG00000019612	IPO11	100	82.872	Monodelphis_domestica
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	94.788	ENSMALG00000017198	ipo11	100	94.462	Monopterus_albus
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	82.628	MGP_CAROLIEiJ_G0018871	Ipo11	100	82.154	Mus_caroli
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	82.845	ENSMUSG00000042590	Ipo11	100	82.359	Mus_musculus
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	81.650	MGP_PahariEiJ_G0015943	Ipo11	100	81.231	Mus_pahari
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	82.845	MGP_SPRETEiJ_G0019750	Ipo11	100	82.359	Mus_spretus
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	80.673	ENSMPUG00000007026	IPO11	100	80.308	Mustela_putorius_furo
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.605	ENSMLUG00000011760	IPO11	99	83.179	Myotis_lucifugus
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	82.845	ENSNGAG00000007024	Ipo11	100	82.359	Nannospalax_galili
ENSGAFG00000012342	ipo11	95	88.720	ENSNBRG00000013831	ipo11	99	88.938	Neolamprologus_brichardi
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.822	ENSNLEG00000003072	IPO11	100	83.282	Nomascus_leucogenys
ENSGAFG00000012342	ipo11	74	83.333	ENSMEUG00000003783	-	74	83.333	Notamacropus_eugenii
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.713	ENSODEG00000017269	IPO11	100	83.282	Octodon_degus
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	95.657	ENSONIG00000015147	ipo11	100	95.487	Oreochromis_niloticus
ENSGAFG00000012342	ipo11	89	82.742	ENSOANG00000012524	IPO11	91	82.742	Ornithorhynchus_anatinus
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	93.485	ENSORLG00000004267	ipo11	100	93.231	Oryzias_latipes
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	93.702	ENSORLG00020002280	ipo11	100	93.436	Oryzias_latipes_hni
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	93.594	ENSORLG00015010565	ipo11	100	93.333	Oryzias_latipes_hsok
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	94.028	ENSOMEG00000021765	ipo11	100	93.744	Oryzias_melastigma
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.931	ENSOGAG00000000533	IPO11	99	83.385	Otolemur_garnettii
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.388	ENSOARG00000006763	IPO11	99	82.974	Ovis_aries
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.822	ENSPPAG00000042249	IPO11	100	83.385	Pan_paniscus
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	84.039	ENSPPRG00000000856	IPO11	99	83.487	Panthera_pardus
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	84.039	ENSPTIG00000015280	IPO11	100	83.487	Panthera_tigris_altaica
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.931	ENSPTRG00000016915	IPO11	100	83.487	Pan_troglodytes
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.822	ENSPANG00000013348	IPO11	100	83.385	Papio_anubis
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	91.097	ENSPKIG00000016964	ipo11	100	90.256	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	84.273	ENSPSIG00000002959	IPO11	100	83.811	Pelodiscus_sinensis
ENSGAFG00000012342	ipo11	95	87.100	ENSPMGG00000013232	ipo11	95	87.600	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	82.628	ENSPEMG00000018393	Ipo11	100	82.154	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGAFG00000012342	ipo11	100	82.736	ENSPCIG00000023292	IPO11	100	82.792	Phascolarctos_cinereus
ENSGAFG00000012342	ipo11	81	100.000	ENSPFOG00000019348	ipo11	98	98.917	Poecilia_formosa
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ENSGAFG00000012342	ipo11	100	98.697	ENSPREG00000016551	ipo11	98	98.564	Poecilia_reticulata
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