EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGAFG00000012362 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: si:dkey-98f17.5
Gene Type: protein_coding
Species: Gambusia_affinis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 15986 bases
Position: chrNHOQ01002094.1:6963718-6979703
Accession: ZDB-GENE-060526-354
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGAFP00000018267	MMR_HSR1	PF01926.23	4.7e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGAFT00000018441	-	3414	-	ENSGAFP00000018267	501 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	59.333	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	99	59.333

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	90.848	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	90.848	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	59.333	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	99	59.333	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	90.848	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	90.848	Amphilophus_citrinellus
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	58.315	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	99	58.315	Amphilophus_citrinellus
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	59.556	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Amphiprion_ocellaris
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	91.295	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	91.295	Amphiprion_ocellaris
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	91.071	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	91.071	Amphiprion_percula
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	59.333	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	99	59.333	Amphiprion_percula
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	59.333	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	99	59.333	Anabas_testudineus
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	88.839	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	100	88.839	Anabas_testudineus
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	57.589	ENSACAG00000028632	-	99	57.589	Anolis_carolinensis
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	91.741	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	91.741	Astatotilapia_calliptera
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	58.850	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	99	58.850	Astatotilapia_calliptera
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	80.401	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	80.401	Astyanax_mexicanus
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	59.471	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	99	59.471	Astyanax_mexicanus
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	71	59.831	ENSCING00000020807	-	94	59.831	Ciona_intestinalis
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	88	54.773	ENSCSAVG00000009987	-	98	55.000	Ciona_savignyi
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	95	84.486	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	98	84.906	Cynoglossus_semilaevis
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	58.889	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	99	59.333	Cynoglossus_semilaevis
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	60.222	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Cyprinodon_variegatus
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	94.420	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	94.420	Cyprinodon_variegatus
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	60.667	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	100	73.980	Danio_rerio
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	88	82.045	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	82.045	Danio_rerio
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	71	55.587	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	96	55.587	Eptatretus_burgeri
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	79.195	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	79.195	Esox_lucius
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	59.202	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	99	59.202	Fundulus_heteroclitus
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	95.312	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	95.312	Fundulus_heteroclitus
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	80	55.362	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	99	55.362	Gadus_morhua
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	51	94.574	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	94.574	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	76	63.089	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	99	61.097	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	91.964	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	91.964	Haplochromis_burtoni
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	59.071	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	99	59.071	Haplochromis_burtoni
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	59.333	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	99	59.333	Hippocampus_comes
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	84.009	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	84.009	Hippocampus_comes
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	72	59.444	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	80	59.444	Ictalurus_punctatus
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	77.060	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	77.060	Ictalurus_punctatus
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	86	59.353	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	99	59.353	Ictalurus_punctatus
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	58.889	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	99	58.889	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	92.188	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	92.188	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	88.616	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	88.616	Labrus_bergylta
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	61.798	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	98	62.022	Latimeria_chalumnae
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	88	69.820	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	69.820	Latimeria_chalumnae
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	61.915	ENSLACG00000004899	-	99	61.915	Latimeria_chalumnae
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	73.154	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	73.154	Lepisosteus_oculatus
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	86	60.046	ENSMAMG00000002536	si:ch211-11k18.4	99	59.908	Mastacembelus_armatus
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	89.955	ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	89.955	Mastacembelus_armatus
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	58.628	ENSMZEG00005008941	si:ch211-11k18.4	99	58.628	Maylandia_zebra
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	91.964	ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	91.964	Maylandia_zebra
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	57.871	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	99	57.871	Mola_mola
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	59.778	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Monopterus_albus
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	88	87.927	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	87.927	Monopterus_albus
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	86	59.584	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	98	59.584	Neolamprologus_brichardi
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	91.295	ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	91.295	Neolamprologus_brichardi
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	58.850	ENSONIG00000019412	si:ch211-11k18.4	99	58.850	Oreochromis_niloticus
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	91.964	ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	91.964	Oreochromis_niloticus
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	85.491	ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	85.491	Oryzias_latipes
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	59.778	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Oryzias_latipes
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	59.556	ENSORLG00020012386	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Oryzias_latipes_hni
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	88.616	ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	88.616	Oryzias_latipes_hni
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	89.062	ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	89.062	Oryzias_latipes_hsok
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	59.778	ENSORLG00015022862	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Oryzias_latipes_hsok
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	90.402	ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	90.402	Oryzias_melastigma
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	60.000	ENSOMEG00000018686	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Oryzias_melastigma
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	57.366	ENSPKIG00000023918	-	98	57.366	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	75.724	ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	75.724	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	59.111	ENSPKIG00000018807	si:ch211-11k18.4	99	59.111	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	84.152	ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	84.152	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	59.513	ENSPMGG00000016507	si:ch211-11k18.4	99	59.513	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	60.667	ENSPFOG00000007976	si:ch211-11k18.4	99	60.667	Poecilia_formosa
ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	97.783	ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	97.783	Poecilia_formosa
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ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	80.624	ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	100	80.624	Pygocentrus_nattereri
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