EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGAFG00000012593 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: srprb
Alias: wu:fk57h10|zgc:111820|zgc:92746
Full Name: SRP receptor subunit beta
Gene Type: protein_coding
Species: Gambusia_affinis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3379 bases
Position: chrNHOQ01001971.1:12030559-12033937
Accession: ZDB-GENE-040718-311
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGAFP00000018623	MMR_HSR1	PF01926.23	1e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGAFT00000018801	-	1619	-	ENSGAFP00000018623	265 (aa)	-	UPI000DD1AED2

Gene Model

Click here to download ENSGAFG00000012593's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSGAFG00000012593's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSGAFG00000012593	srprb	60	30.000	ENSGAFG00000010799	arf2b	83	30.000

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGAFG00000012593	srprb	99	87.452	ENSAPOG00000021219	srprb	95	87.452	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAFG00000012593	srprb	99	85.985	ENSACIG00000014621	srprb	99	85.985	Amphilophus_citrinellus
ENSGAFG00000012593	srprb	99	86.312	ENSAOCG00000017265	srprb	95	86.312	Amphiprion_ocellaris
ENSGAFG00000012593	srprb	99	86.312	ENSAPEG00000024541	srprb	84	86.312	Amphiprion_percula
ENSGAFG00000012593	srprb	99	85.606	ENSATEG00000014016	srprb	96	85.606	Anabas_testudineus
ENSGAFG00000012593	srprb	99	86.792	ENSACLG00000016748	srprb	96	86.792	Astatotilapia_calliptera
ENSGAFG00000012593	srprb	99	69.318	ENSAMXG00000044118	srprb	99	69.318	Astyanax_mexicanus
ENSGAFG00000012593	srprb	99	82.576	ENSCSEG00000017194	srprb	96	82.576	Cynoglossus_semilaevis
ENSGAFG00000012593	srprb	99	90.909	ENSCVAG00000004221	srprb	99	90.909	Cyprinodon_variegatus
ENSGAFG00000012593	srprb	99	67.424	ENSDARG00000030949	srprb	99	67.424	Danio_rerio
ENSGAFG00000012593	srprb	99	78.707	ENSELUG00000009740	srprb	97	78.707	Esox_lucius
ENSGAFG00000012593	srprb	99	92.045	ENSFHEG00000006004	srprb	99	92.045	Fundulus_heteroclitus
ENSGAFG00000012593	srprb	99	82.197	ENSGMOG00000002081	srprb	97	82.197	Gadus_morhua
ENSGAFG00000012593	srprb	99	85.227	ENSGACG00000009891	srprb	97	85.227	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAFG00000012593	srprb	99	86.792	ENSHBUG00000002145	srprb	96	86.792	Haplochromis_burtoni
ENSGAFG00000012593	srprb	99	81.818	ENSHCOG00000007732	srprb	98	81.818	Hippocampus_comes
ENSGAFG00000012593	srprb	95	67.063	ENSIPUG00000004177	srprb	94	67.063	Ictalurus_punctatus
ENSGAFG00000012593	srprb	99	85.227	ENSKMAG00000020736	srprb	99	85.227	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAFG00000012593	srprb	99	86.742	ENSLBEG00000021483	srprb	96	86.742	Labrus_bergylta
ENSGAFG00000012593	srprb	98	70.000	ENSLOCG00000009740	srprb	87	68.462	Lepisosteus_oculatus
ENSGAFG00000012593	srprb	99	87.452	ENSMAMG00000011876	srprb	96	87.452	Mastacembelus_armatus
ENSGAFG00000012593	srprb	97	86.486	ENSMZEG00005016621	srprb	100	86.486	Maylandia_zebra
ENSGAFG00000012593	srprb	99	85.985	ENSMMOG00000012550	srprb	97	85.985	Mola_mola
ENSGAFG00000012593	srprb	99	85.171	ENSMALG00000012595	srprb	96	85.171	Monopterus_albus
ENSGAFG00000012593	srprb	74	86.667	ENSNBRG00000004699	srprb	91	80.465	Neolamprologus_brichardi
ENSGAFG00000012593	srprb	99	86.742	ENSONIG00000003788	srprb	79	86.742	Oreochromis_niloticus
ENSGAFG00000012593	srprb	99	81.369	ENSORLG00000006430	srprb	96	81.369	Oryzias_latipes
ENSGAFG00000012593	srprb	99	81.749	ENSORLG00020003413	srprb	96	81.749	Oryzias_latipes_hni
ENSGAFG00000012593	srprb	99	81.749	ENSORLG00015000166	srprb	96	81.749	Oryzias_latipes_hsok
ENSGAFG00000012593	srprb	99	83.270	ENSOMEG00000012735	srprb	96	83.270	Oryzias_melastigma
ENSGAFG00000012593	srprb	94	70.120	ENSPKIG00000013147	srprb	95	70.120	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGAFG00000012593	srprb	99	79.924	ENSPMGG00000014061	srprb	96	79.924	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGAFG00000012593	srprb	100	96.981	ENSPFOG00000011347	srprb	96	96.981	Poecilia_formosa
ENSGAFG00000012593	srprb	97	98.062	ENSPLAG00000001156	srprb	100	98.062	Poecilia_latipinna
ENSGAFG00000012593	srprb	97	96.899	ENSPMEG00000012169	srprb	100	96.899	Poecilia_mexicana
ENSGAFG00000012593	srprb	97	96.124	ENSPREG00000001449	srprb	100	96.124	Poecilia_reticulata
ENSGAFG00000012593	srprb	99	86.792	ENSPNYG00000005911	srprb	96	86.792	Pundamilia_nyererei
ENSGAFG00000012593	srprb	99	69.697	ENSPNAG00000009983	srprb	99	69.697	Pygocentrus_nattereri
ENSGAFG00000012593	srprb	95	74.016	ENSSFOG00015019355	srprb	95	74.016	Scleropages_formosus
ENSGAFG00000012593	srprb	99	85.171	ENSSMAG00000013202	srprb	96	85.171	Scophthalmus_maximus
ENSGAFG00000012593	srprb	99	85.985	ENSSDUG00000018746	srprb	90	85.985	Seriola_dumerili
ENSGAFG00000012593	srprb	99	86.364	ENSSLDG00000020560	srprb	96	86.364	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSGAFG00000012593	srprb	99	86.692	ENSSPAG00000008898	srprb	95	86.692	Stegastes_partitus
ENSGAFG00000012593	srprb	99	85.227	ENSTRUG00000022463	srprb	96	85.227	Takifugu_rubripes
ENSGAFG00000012593	srprb	99	81.298	ENSTNIG00000007725	srprb	100	81.298	Tetraodon_nigroviridis
ENSGAFG00000012593	srprb	97	97.674	ENSXCOG00000012585	srprb	100	97.674	Xiphophorus_couchianus
ENSGAFG00000012593	srprb	97	98.062	ENSXMAG00000028725	srprb	100	98.062	Xiphophorus_maculatus