EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSGAFG00000017239 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ago4
Alias: Ago4|eif2c4|fd14f04|wu:fd14f04
Full Name: argonaute RISC catalytic component 4
Gene Type: protein_coding
Species: Gambusia_affinis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 18834 bases
Position: chrNHOQ01000459.1:14610-33443
Accession: ZDB-GENE-030131-5357
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGAFP00000025529	PAZ	PF02170.22	7.1e-28	1	1
ENSGAFP00000025529	Piwi	PF02171.17	1.1e-105	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGAFT00000025795	-	5059	-	ENSGAFP00000025529	874 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSGAFG00000017239	ago4	99	81.286	ENSGAFG00000009775	ago1	99	81.286
ENSGAFG00000017239	ago4	99	78.481	ENSGAFG00000018026	ago2	97	78.481
ENSGAFG00000017239	ago4	100	79.096	ENSGAFG00000009808	ago3a	100	79.096
ENSGAFG00000017239	ago4	99	78.385	ENSGAFG00000015911	-	99	78.385

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGAFG00000017239	ago4	100	96.224	ENSG00000134698	AGO4	100	96.224	Homo_sapiens
ENSGAFG00000017239	ago4	96	99.642	ENSAPOG00000023867	ago4	99	99.642	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAFG00000017239	ago4	99	95.757	ENSAMEG00000000573	AGO4	100	95.757	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGAFG00000017239	ago4	92	98.385	ENSACIG00000014548	ago4	100	98.385	Amphilophus_citrinellus
ENSGAFG00000017239	ago4	92	93.913	ENSAPEG00000022426	ago4	100	93.913	Amphiprion_percula
ENSGAFG00000017239	ago4	100	99.657	ENSATEG00000006717	ago4	100	99.752	Anabas_testudineus
ENSGAFG00000017239	ago4	98	96.387	ENSAPLG00000010882	AGO4	100	96.387	Anas_platyrhynchos
ENSGAFG00000017239	ago4	99	95.183	ENSACAG00000017275	AGO4	99	95.183	Anolis_carolinensis
ENSGAFG00000017239	ago4	100	96.110	ENSANAG00000031428	AGO4	100	96.110	Aotus_nancymaae
ENSGAFG00000017239	ago4	100	99.771	ENSACLG00000005181	ago4	100	99.771	Astatotilapia_calliptera
ENSGAFG00000017239	ago4	100	99.657	ENSAMXG00000010318	ago4	100	99.657	Astyanax_mexicanus
ENSGAFG00000017239	ago4	99	95.293	ENSBTAG00000015220	AGO4	99	95.293	Bos_taurus
ENSGAFG00000017239	ago4	100	96.224	ENSCJAG00000001610	AGO4	100	96.224	Callithrix_jacchus
ENSGAFG00000017239	ago4	92	96.398	ENSCAFG00000024306	AGO4	100	96.398	Canis_familiaris
ENSGAFG00000017239	ago4	100	96.110	ENSCHIG00000026564	AGO4	100	96.110	Capra_hircus
ENSGAFG00000017239	ago4	99	96.412	ENSTSYG00000014007	AGO4	99	96.412	Carlito_syrichta
ENSGAFG00000017239	ago4	94	91.087	ENSCAPG00000009369	AGO4	100	91.087	Cavia_aperea
ENSGAFG00000017239	ago4	99	93.814	ENSCPOG00000011557	AGO4	99	93.814	Cavia_porcellus
ENSGAFG00000017239	ago4	100	96.224	ENSCCAG00000001397	AGO4	100	96.224	Cebus_capucinus
ENSGAFG00000017239	ago4	100	96.224	ENSCATG00000043421	AGO4	100	97.674	Cercocebus_atys
ENSGAFG00000017239	ago4	99	96.181	ENSCLAG00000012097	AGO4	99	96.181	Chinchilla_lanigera
ENSGAFG00000017239	ago4	100	96.224	ENSCSAG00000001090	AGO4	100	96.224	Chlorocebus_sabaeus
ENSGAFG00000017239	ago4	80	97.640	ENSCHOG00000006867	AGO4	81	97.640	Choloepus_hoffmanni
ENSGAFG00000017239	ago4	99	96.198	ENSCPBG00000018602	AGO4	98	96.198	Chrysemys_picta_bellii
ENSGAFG00000017239	ago4	99	96.198	ENSCANG00000016914	AGO4	100	96.198	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGAFG00000017239	ago4	100	95.652	ENSCGRG00001002701	Ago4	100	95.652	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGAFG00000017239	ago4	99	95.833	ENSCGRG00000013335	Ago4	99	95.833	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGAFG00000017239	ago4	92	92.317	ENSCSEG00000010696	ago4	100	92.317	Cynoglossus_semilaevis
ENSGAFG00000017239	ago4	100	98.398	ENSDARG00000100854	ago4	100	98.398	Danio_rerio
ENSGAFG00000017239	ago4	100	96.110	ENSDNOG00000015674	AGO4	100	96.110	Dasypus_novemcinctus
ENSGAFG00000017239	ago4	100	96.224	ENSDORG00000008933	Ago4	100	96.224	Dipodomys_ordii
ENSGAFG00000017239	ago4	59	97.044	ENSETEG00000018390	AGO4	83	97.044	Echinops_telfairi
ENSGAFG00000017239	ago4	100	96.224	ENSEASG00005012079	AGO4	100	96.224	Equus_asinus_asinus
ENSGAFG00000017239	ago4	100	96.224	ENSECAG00000024686	AGO4	100	96.224	Equus_caballus
ENSGAFG00000017239	ago4	78	93.684	ENSEEUG00000000745	AGO4	79	93.684	Erinaceus_europaeus
ENSGAFG00000017239	ago4	100	98.975	ENSELUG00000023873	ago4	100	98.975	Esox_lucius
ENSGAFG00000017239	ago4	100	96.110	ENSFCAG00000006218	AGO4	100	96.110	Felis_catus
ENSGAFG00000017239	ago4	99	96.412	ENSFDAG00000021483	AGO4	99	96.412	Fukomys_damarensis
ENSGAFG00000017239	ago4	97	89.256	ENSFHEG00000019658	ago4	100	89.256	Fundulus_heteroclitus
ENSGAFG00000017239	ago4	99	97.701	ENSGMOG00000009544	ago4	99	97.701	Gadus_morhua
ENSGAFG00000017239	ago4	100	96.224	ENSGALG00000039713	AGO4	100	96.398	Gallus_gallus
ENSGAFG00000017239	ago4	99	98.048	ENSGACG00000002683	ago4	99	98.048	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAFG00000017239	ago4	92	96.398	ENSGAGG00000012897	AGO4	100	96.398	Gopherus_agassizii
ENSGAFG00000017239	ago4	99	93.039	ENSGGOG00000036532	AGO4	100	93.039	Gorilla_gorilla
ENSGAFG00000017239	ago4	100	99.771	ENSHBUG00000001525	ago4	100	99.771	Haplochromis_burtoni
ENSGAFG00000017239	ago4	100	96.224	ENSHGLG00000010241	AGO4	100	96.224	Heterocephalus_glaber_female
ENSGAFG00000017239	ago4	99	96.400	ENSHGLG00100005233	AGO4	99	96.400	Heterocephalus_glaber_male
ENSGAFG00000017239	ago4	100	99.428	ENSHCOG00000003725	ago4	100	99.428	Hippocampus_comes
ENSGAFG00000017239	ago4	100	99.657	ENSIPUG00000015600	ago4	100	99.657	Ictalurus_punctatus
ENSGAFG00000017239	ago4	99	96.220	ENSSTOG00000004725	AGO4	100	96.220	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGAFG00000017239	ago4	100	99.886	ENSKMAG00000018602	ago4	100	99.886	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAFG00000017239	ago4	100	98.864	ENSLBEG00000010670	ago4	100	98.864	Labrus_bergylta
ENSGAFG00000017239	ago4	100	96.110	ENSLACG00000016888	AGO4	100	96.110	Latimeria_chalumnae
ENSGAFG00000017239	ago4	100	99.199	ENSLOCG00000000584	ago4	100	99.199	Lepisosteus_oculatus
ENSGAFG00000017239	ago4	93	95.813	ENSLAFG00000010394	AGO4	100	95.813	Loxodonta_africana
ENSGAFG00000017239	ago4	100	96.224	ENSMFAG00000035543	AGO4	100	96.224	Macaca_fascicularis
ENSGAFG00000017239	ago4	99	95.982	ENSMMUG00000003343	AGO4	100	96.825	Macaca_mulatta
ENSGAFG00000017239	ago4	100	96.224	ENSMNEG00000037723	AGO4	100	96.825	Macaca_nemestrina
ENSGAFG00000017239	ago4	99	96.296	ENSMLEG00000039490	AGO4	99	96.296	Mandrillus_leucophaeus
ENSGAFG00000017239	ago4	100	99.542	ENSMAMG00000003874	ago4	100	99.595	Mastacembelus_armatus
ENSGAFG00000017239	ago4	100	99.771	ENSMZEG00005026346	ago4	100	99.771	Maylandia_zebra
ENSGAFG00000017239	ago4	99	95.853	ENSMGAG00000003851	AGO4	99	95.853	Meleagris_gallopavo
ENSGAFG00000017239	ago4	83	97.122	ENSMAUG00000021743	Ago4	98	94.812	Mesocricetus_auratus
ENSGAFG00000017239	ago4	99	96.069	ENSMICG00000033507	AGO4	99	96.069	Microcebus_murinus
ENSGAFG00000017239	ago4	100	95.767	ENSMOCG00000005772	Ago4	100	95.767	Microtus_ochrogaster
ENSGAFG00000017239	ago4	92	96.894	ENSMMOG00000013473	ago4	100	96.894	Mola_mola
ENSGAFG00000017239	ago4	100	96.339	ENSMODG00000017888	AGO4	100	96.339	Monodelphis_domestica
ENSGAFG00000017239	ago4	99	96.313	ENSMALG00000011797	ago4	99	96.313	Monopterus_albus
ENSGAFG00000017239	ago4	100	95.423	MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	95.423	Mus_caroli
ENSGAFG00000017239	ago4	100	95.195	ENSMUSG00000042500	Ago4	100	95.195	Mus_musculus
ENSGAFG00000017239	ago4	100	94.737	MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	94.737	Mus_pahari
ENSGAFG00000017239	ago4	100	95.195	MGP_SPRETEiJ_G0027458	Ago4	100	95.195	Mus_spretus
ENSGAFG00000017239	ago4	92	96.398	ENSMPUG00000014876	AGO4	100	96.398	Mustela_putorius_furo
ENSGAFG00000017239	ago4	99	95.742	ENSMLUG00000017102	AGO4	98	95.742	Myotis_lucifugus
ENSGAFG00000017239	ago4	99	96.412	ENSNGAG00000020544	Ago4	99	96.412	Nannospalax_galili
ENSGAFG00000017239	ago4	100	99.771	ENSNBRG00000013492	ago4	100	99.771	Neolamprologus_brichardi
ENSGAFG00000017239	ago4	99	96.296	ENSNLEG00000011125	AGO4	99	96.296	Nomascus_leucogenys
ENSGAFG00000017239	ago4	88	96.296	ENSMEUG00000001023	AGO4	90	96.296	Notamacropus_eugenii
ENSGAFG00000017239	ago4	99	89.236	ENSOPRG00000012309	AGO4	99	89.236	Ochotona_princeps
ENSGAFG00000017239	ago4	93	96.292	ENSODEG00000006355	AGO4	97	96.292	Octodon_degus
ENSGAFG00000017239	ago4	100	99.771	ENSONIG00000013603	ago4	100	99.771	Oreochromis_niloticus
ENSGAFG00000017239	ago4	92	96.522	ENSOANG00000002082	AGO4	100	96.522	Ornithorhynchus_anatinus
ENSGAFG00000017239	ago4	100	96.110	ENSOCUG00000004076	AGO4	100	96.110	Oryctolagus_cuniculus
ENSGAFG00000017239	ago4	100	99.657	ENSORLG00000009865	ago4	92	99.657	Oryzias_latipes
ENSGAFG00000017239	ago4	100	99.657	ENSORLG00020016978	ago4	92	99.657	Oryzias_latipes_hni
ENSGAFG00000017239	ago4	100	99.657	ENSORLG00015008800	ago4	92	99.657	Oryzias_latipes_hsok
ENSGAFG00000017239	ago4	100	99.657	ENSOMEG00000006399	ago4	100	99.657	Oryzias_melastigma
ENSGAFG00000017239	ago4	100	87.757	ENSOGAG00000027107	-	100	87.757	Otolemur_garnettii
ENSGAFG00000017239	ago4	93	95.432	ENSOGAG00000004233	-	100	95.432	Otolemur_garnettii
ENSGAFG00000017239	ago4	99	95.298	ENSOARG00000019568	AGO4	98	95.298	Ovis_aries
ENSGAFG00000017239	ago4	99	96.296	ENSPPAG00000031752	AGO4	99	96.296	Pan_paniscus
ENSGAFG00000017239	ago4	100	96.110	ENSPPRG00000006520	AGO4	100	96.110	Panthera_pardus
ENSGAFG00000017239	ago4	99	96.296	ENSPTIG00000020262	AGO4	99	96.296	Panthera_tigris_altaica
ENSGAFG00000017239	ago4	100	96.224	ENSPTRG00000000527	AGO4	100	96.224	Pan_troglodytes
ENSGAFG00000017239	ago4	92	96.398	ENSPANG00000007232	AGO4	100	96.398	Papio_anubis
ENSGAFG00000017239	ago4	100	99.199	ENSPKIG00000022598	ago4	100	99.199	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGAFG00000017239	ago4	99	96.198	ENSPSIG00000013832	AGO4	99	96.198	Pelodiscus_sinensis
ENSGAFG00000017239	ago4	92	98.261	ENSPMGG00000023325	ago4	100	98.261	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGAFG00000017239	ago4	89	97.143	ENSPEMG00000022651	-	97	97.143	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGAFG00000017239	ago4	100	96.339	ENSPCIG00000000092	AGO4	100	96.339	Phascolarctos_cinereus
ENSGAFG00000017239	ago4	100	99.886	ENSPFOG00000001935	ago4	100	99.886	Poecilia_formosa
ENSGAFG00000017239	ago4	100	98.627	ENSPLAG00000011534	ago4	100	98.627	Poecilia_latipinna
ENSGAFG00000017239	ago4	100	99.886	ENSPMEG00000005049	ago4	100	99.886	Poecilia_mexicana
ENSGAFG00000017239	ago4	100	99.886	ENSPREG00000010315	ago4	100	99.886	Poecilia_reticulata
ENSGAFG00000017239	ago4	99	96.296	ENSPPYG00000001552	AGO4	99	96.296	Pongo_abelii
ENSGAFG00000017239	ago4	99	96.185	ENSPCOG00000015935	AGO4	99	96.185	Propithecus_coquereli
ENSGAFG00000017239	ago4	87	96.970	ENSPVAG00000005079	AGO4	88	96.970	Pteropus_vampyrus
ENSGAFG00000017239	ago4	100	99.771	ENSPNYG00000002089	ago4	100	99.771	Pundamilia_nyererei
ENSGAFG00000017239	ago4	100	97.826	ENSPNAG00000005191	ago4	100	97.826	Pygocentrus_nattereri
ENSGAFG00000017239	ago4	70	95.066	ENSRNOG00000025596	Ago4	100	95.066	Rattus_norvegicus
ENSGAFG00000017239	ago4	99	95.244	ENSRBIG00000040185	AGO4	100	96.825	Rhinopithecus_bieti
ENSGAFG00000017239	ago4	92	96.398	ENSRROG00000035783	AGO4	100	96.398	Rhinopithecus_roxellana
ENSGAFG00000017239	ago4	99	92.317	ENSSBOG00000026529	AGO4	100	96.094	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSGAFG00000017239	ago4	99	95.652	ENSSHAG00000017320	AGO4	99	95.652	Sarcophilus_harrisii
ENSGAFG00000017239	ago4	100	99.314	ENSSFOG00015022028	ago4	100	99.503	Scleropages_formosus
ENSGAFG00000017239	ago4	100	96.983	ENSSMAG00000000808	ago4	93	98.814	Scophthalmus_maximus
ENSGAFG00000017239	ago4	100	98.641	ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.764	Seriola_dumerili
ENSGAFG00000017239	ago4	92	98.385	ENSSLDG00000021841	ago4	100	98.385	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSGAFG00000017239	ago4	77	97.257	ENSSARG00000011504	AGO4	79	97.257	Sorex_araneus
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ENSGAFG00000017239	ago4	99	91.405	ENSTGUG00000001631	AGO4	99	90.815	Taeniopygia_guttata
ENSGAFG00000017239	ago4	100	99.314	ENSTRUG00000008052	ago4	100	99.314	Takifugu_rubripes
ENSGAFG00000017239	ago4	99	98.157	ENSTNIG00000006331	ago4	99	98.157	Tetraodon_nigroviridis
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ENSGAFG00000017239	ago4	99	92.708	ENSTTRG00000015086	AGO4	99	92.708	Tursiops_truncatus
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ENSGAFG00000017239	ago4	92	96.398	ENSVVUG00000000465	-	100	96.398	Vulpes_vulpes
ENSGAFG00000017239	ago4	100	82.554	ENSXETG00000009664	ago4	100	82.554	Xenopus_tropicalis
ENSGAFG00000017239	ago4	100	99.886	ENSXMAG00000016657	ago4	100	99.886	Xiphophorus_maculatus