EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGAFG00000019350 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: pelo
Alias: wu:fa12c12|wu:fb97f07|zgc:56550
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Gambusia_affinis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10551 bases
Position: chrNHOQ01002480.1:560979-571529
Accession: ZDB-GENE-040426-1074
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGAFP00000028632	eRF1_2	PF03464.15	5.1e-34	1	1
ENSGAFP00000028633	eRF1_2	PF03464.15	5.3e-32	1	1
ENSGAFP00000028633	eRF1_3	PF03465.15	3.9e-25	1	1
ENSGAFP00000028632	eRF1_3	PF03465.15	4.2e-25	1	1
ENSGAFP00000028633	eRF1_1	PF03463.15	4.2e-53	1	1
ENSGAFP00000028632	eRF1_1	PF03463.15	4.4e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGAFT00000028929	-	3941	-	ENSGAFP00000028632	385 (aa)	-	-
ENSGAFT00000028930	-	1131	-	ENSGAFP00000028633	376 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSGAFG00000019350's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSGAFG00000019350's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGAFG00000019350	pelo	100	80.519	ENSG00000152684	PELO	100	80.519	Homo_sapiens
ENSGAFG00000019350	pelo	66	92.308	ENSAPOG00000000616	pelo	90	92.308	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	91.169	ENSAPOG00000023072	pelo	100	91.169	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAFG00000019350	pelo	66	92.308	ENSAPOG00000023700	-	90	92.308	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	80.779	ENSAMEG00000007734	PELO	100	80.779	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGAFG00000019350	pelo	97	90.934	ENSACIG00000014386	pelo	97	93.787	Amphilophus_citrinellus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	91.429	ENSAOCG00000023717	pelo	100	91.429	Amphiprion_ocellaris
ENSGAFG00000019350	pelo	100	91.429	ENSAPEG00000011235	pelo	100	91.429	Amphiprion_percula
ENSGAFG00000019350	pelo	100	92.727	ENSATEG00000019550	pelo	100	92.727	Anabas_testudineus
ENSGAFG00000019350	pelo	77	72.148	ENSAPLG00000013265	PELO	100	72.148	Anas_platyrhynchos
ENSGAFG00000019350	pelo	97	80.000	ENSACAG00000004352	PELO	100	79.221	Anolis_carolinensis
ENSGAFG00000019350	pelo	100	80.779	ENSANAG00000014096	PELO	100	80.779	Aotus_nancymaae
ENSGAFG00000019350	pelo	100	89.870	ENSACLG00000010305	pelo	100	89.870	Astatotilapia_calliptera
ENSGAFG00000019350	pelo	97	91.689	ENSAMXG00000020299	pelo	99	90.130	Astyanax_mexicanus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	80.519	ENSBTAG00000003268	PELO	99	80.519	Bos_taurus
ENSGAFG00000019350	pelo	98	61.478	WBGene00011280	pelo-1	99	61.478	Caenorhabditis_elegans
ENSGAFG00000019350	pelo	100	80.519	ENSCJAG00000035190	PELO	100	80.519	Callithrix_jacchus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	81.039	ENSCAFG00020023234	PELO	100	81.039	Canis_lupus_dingo
ENSGAFG00000019350	pelo	100	80.260	ENSCHIG00000016410	PELO	99	80.260	Capra_hircus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	81.299	ENSTSYG00000005203	PELO	100	81.299	Carlito_syrichta
ENSGAFG00000019350	pelo	100	81.299	ENSCPOG00000027406	PELO	100	81.299	Cavia_porcellus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	80.519	ENSCCAG00000035600	PELO	100	80.519	Cebus_capucinus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	80.779	ENSCATG00000011829	PELO	100	80.779	Cercocebus_atys
ENSGAFG00000019350	pelo	100	80.779	ENSCLAG00000005043	PELO	100	80.779	Chinchilla_lanigera
ENSGAFG00000019350	pelo	100	80.779	ENSCSAG00000016692	PELO	100	80.779	Chlorocebus_sabaeus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	81.299	ENSCHOG00000000523	PELO	100	81.299	Choloepus_hoffmanni
ENSGAFG00000019350	pelo	97	81.067	ENSCPBG00000007544	PELO	100	80.260	Chrysemys_picta_bellii
ENSGAFG00000019350	pelo	97	64.611	ENSCING00000001979	-	100	64.675	Ciona_intestinalis
ENSGAFG00000019350	pelo	99	66.316	ENSCSAVG00000006158	-	99	66.316	Ciona_savignyi
ENSGAFG00000019350	pelo	100	80.779	ENSCANG00000023382	PELO	100	80.779	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGAFG00000019350	pelo	97	81.769	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	81.558	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGAFG00000019350	pelo	97	82.574	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	82.338	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGAFG00000019350	pelo	100	91.688	ENSCSEG00000008807	pelo	100	91.688	Cynoglossus_semilaevis
ENSGAFG00000019350	pelo	100	98.182	ENSCVAG00000016082	pelo	100	98.182	Cyprinodon_variegatus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	87.792	ENSDARG00000055477	pelo	100	87.792	Danio_rerio
ENSGAFG00000019350	pelo	100	77.720	ENSDNOG00000036721	PELO	100	77.720	Dasypus_novemcinctus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	82.597	ENSDORG00000016689	Pelo	100	82.597	Dipodomys_ordii
ENSGAFG00000019350	pelo	96	67.838	FBgn0011207	pelo	96	67.282	Drosophila_melanogaster
ENSGAFG00000019350	pelo	77	80.117	ENSEBUG00000004955	pelo	99	80.117	Eptatretus_burgeri
ENSGAFG00000019350	pelo	100	81.039	ENSEASG00005013348	PELO	100	81.039	Equus_asinus_asinus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	89.610	ENSELUG00000023229	pelo	100	89.610	Esox_lucius
ENSGAFG00000019350	pelo	100	81.039	ENSFCAG00000032341	PELO	100	81.039	Felis_catus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	81.299	ENSFALG00000004559	PELO	100	81.299	Ficedula_albicollis
ENSGAFG00000019350	pelo	74	83.099	ENSFDAG00000002076	PELO	88	83.099	Fukomys_damarensis
ENSGAFG00000019350	pelo	100	96.104	ENSFHEG00000009769	pelo	100	96.104	Fundulus_heteroclitus
ENSGAFG00000019350	pelo	98	88.329	ENSGMOG00000005849	pelo	100	87.792	Gadus_morhua
ENSGAFG00000019350	pelo	100	90.390	ENSGACG00000007245	pelo	97	93.407	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAFG00000019350	pelo	97	81.067	ENSGAGG00000004018	PELO	100	80.260	Gopherus_agassizii
ENSGAFG00000019350	pelo	100	80.779	ENSGGOG00000012635	PELO	100	80.779	Gorilla_gorilla
ENSGAFG00000019350	pelo	100	89.870	ENSHBUG00000005866	pelo	100	89.870	Haplochromis_burtoni
ENSGAFG00000019350	pelo	100	81.558	ENSHGLG00000005932	PELO	100	81.558	Heterocephalus_glaber_female
ENSGAFG00000019350	pelo	100	79.481	ENSHGLG00100017627	PELO	100	79.481	Heterocephalus_glaber_male
ENSGAFG00000019350	pelo	100	88.312	ENSHCOG00000016782	pelo	100	88.312	Hippocampus_comes
ENSGAFG00000019350	pelo	100	88.312	ENSIPUG00000020627	pelo	100	88.312	Ictalurus_punctatus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	81.039	ENSSTOG00000027378	PELO	100	81.039	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	79.740	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	79.740	Jaculus_jaculus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	92.987	ENSKMAG00000021305	pelo	100	92.987	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	90.909	ENSLBEG00000022399	pelo	100	90.909	Labrus_bergylta
ENSGAFG00000019350	pelo	100	81.299	ENSLAFG00000020551	PELO	100	81.299	Loxodonta_africana
ENSGAFG00000019350	pelo	100	80.779	ENSMFAG00000000651	PELO	100	80.779	Macaca_fascicularis
ENSGAFG00000019350	pelo	100	80.779	ENSMMUG00000039101	PELO	100	80.779	Macaca_mulatta
ENSGAFG00000019350	pelo	100	80.779	ENSMNEG00000035538	PELO	100	80.779	Macaca_nemestrina
ENSGAFG00000019350	pelo	100	80.779	ENSMLEG00000039113	PELO	100	80.779	Mandrillus_leucophaeus
ENSGAFG00000019350	pelo	97	94.102	ENSMAMG00000013260	pelo	100	93.247	Mastacembelus_armatus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	89.870	ENSMZEG00005014258	pelo	100	89.870	Maylandia_zebra
ENSGAFG00000019350	pelo	100	82.078	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	82.078	Mesocricetus_auratus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	81.039	ENSMICG00000044040	PELO	100	81.039	Microcebus_murinus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	81.818	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	81.818	Microtus_ochrogaster
ENSGAFG00000019350	pelo	100	90.130	ENSMMOG00000001324	pelo	100	90.130	Mola_mola
ENSGAFG00000019350	pelo	100	90.909	ENSMALG00000008194	pelo	100	90.909	Monopterus_albus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	82.078	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	82.078	Mus_caroli
ENSGAFG00000019350	pelo	100	82.078	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	82.078	Mus_musculus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	82.338	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	82.338	Mus_pahari
ENSGAFG00000019350	pelo	100	82.078	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	82.078	Mus_spretus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	80.519	ENSMLUG00000024132	PELO	100	80.519	Myotis_lucifugus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	81.818	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	81.818	Nannospalax_galili
ENSGAFG00000019350	pelo	100	89.870	ENSNBRG00000011799	pelo	100	89.870	Neolamprologus_brichardi
ENSGAFG00000019350	pelo	100	80.779	ENSNLEG00000035970	PELO	100	80.779	Nomascus_leucogenys
ENSGAFG00000019350	pelo	100	79.221	ENSMEUG00000005468	PELO	100	79.221	Notamacropus_eugenii
ENSGAFG00000019350	pelo	98	80.739	ENSOPRG00000018793	PELO	100	80.739	Ochotona_princeps
ENSGAFG00000019350	pelo	100	82.078	ENSODEG00000017579	PELO	100	82.078	Octodon_degus
ENSGAFG00000019350	pelo	96	90.836	ENSONIG00000011511	pelo	100	90.649	Oreochromis_niloticus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	81.039	ENSOCUG00000023902	PELO	100	81.039	Oryctolagus_cuniculus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	90.130	ENSORLG00000005827	pelo	100	90.130	Oryzias_latipes
ENSGAFG00000019350	pelo	100	90.390	ENSORLG00020016456	pelo	100	90.390	Oryzias_latipes_hni
ENSGAFG00000019350	pelo	100	90.390	ENSORLG00015014447	pelo	100	90.390	Oryzias_latipes_hsok
ENSGAFG00000019350	pelo	100	92.208	ENSOMEG00000021567	pelo	100	92.208	Oryzias_melastigma
ENSGAFG00000019350	pelo	100	80.779	ENSOGAG00000027940	PELO	100	80.779	Otolemur_garnettii
ENSGAFG00000019350	pelo	100	80.519	ENSOARG00000008324	PELO	99	80.519	Ovis_aries
ENSGAFG00000019350	pelo	100	80.779	ENSPPAG00000038951	PELO	100	80.779	Pan_paniscus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	81.039	ENSPPRG00000018800	PELO	100	81.039	Panthera_pardus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	81.039	ENSPTIG00000019988	PELO	100	81.039	Panthera_tigris_altaica
ENSGAFG00000019350	pelo	100	80.519	ENSPTRG00000034409	PELO	100	80.519	Pan_troglodytes
ENSGAFG00000019350	pelo	100	80.779	ENSPANG00000010902	PELO	100	80.779	Papio_anubis
ENSGAFG00000019350	pelo	100	88.052	ENSPKIG00000015190	pelo	100	88.052	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGAFG00000019350	pelo	97	80.800	ENSPSIG00000004971	PELO	100	80.000	Pelodiscus_sinensis
ENSGAFG00000019350	pelo	68	90.157	ENSPMGG00000014561	pelo	94	90.157	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	81.818	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	81.818	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGAFG00000019350	pelo	100	80.519	ENSPCIG00000004880	PELO	100	80.519	Phascolarctos_cinereus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	98.182	ENSPFOG00000007277	pelo	100	98.182	Poecilia_formosa
ENSGAFG00000019350	pelo	100	98.442	ENSPLAG00000020787	pelo	100	98.442	Poecilia_latipinna
ENSGAFG00000019350	pelo	100	98.182	ENSPMEG00000016964	pelo	100	98.182	Poecilia_mexicana
ENSGAFG00000019350	pelo	100	98.442	ENSPREG00000023071	pelo	100	98.442	Poecilia_reticulata
ENSGAFG00000019350	pelo	97	80.965	ENSPPYG00000015451	PELO	96	80.779	Pongo_abelii
ENSGAFG00000019350	pelo	100	81.039	ENSPCOG00000021178	PELO	100	81.039	Propithecus_coquereli
ENSGAFG00000019350	pelo	100	89.870	ENSPNYG00000017325	pelo	100	89.870	Pundamilia_nyererei
ENSGAFG00000019350	pelo	97	91.957	ENSPNAG00000012458	pelo	99	90.390	Pygocentrus_nattereri
ENSGAFG00000019350	pelo	100	82.597	ENSRNOG00000061128	Pelo	100	82.597	Rattus_norvegicus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	80.779	ENSRBIG00000007299	PELO	100	80.779	Rhinopithecus_bieti
ENSGAFG00000019350	pelo	100	80.779	ENSRROG00000035507	PELO	100	80.779	Rhinopithecus_roxellana
ENSGAFG00000019350	pelo	98	32.208	YNL001W	-	98	32.208	Saccharomyces_cerevisiae
ENSGAFG00000019350	pelo	100	80.260	ENSSBOG00000036140	PELO	100	80.260	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSGAFG00000019350	pelo	63	76.230	ENSSHAG00000010770	PELO	100	76.230	Sarcophilus_harrisii
ENSGAFG00000019350	pelo	98	88.859	ENSSFOG00015013399	pelo	100	88.312	Scleropages_formosus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	91.429	ENSSMAG00000017171	pelo	100	91.429	Scophthalmus_maximus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	90.909	ENSSDUG00000022938	pelo	100	90.909	Seriola_dumerili
ENSGAFG00000019350	pelo	100	87.013	ENSSLDG00000017884	pelo	100	87.013	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSGAFG00000019350	pelo	97	80.800	ENSSPUG00000005545	PELO	100	80.000	Sphenodon_punctatus
ENSGAFG00000019350	pelo	98	91.512	ENSSPAG00000008501	pelo	100	90.909	Stegastes_partitus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	79.221	ENSSSCG00000016884	PELO	100	79.221	Sus_scrofa
ENSGAFG00000019350	pelo	100	81.818	ENSTGUG00000002416	PELO	100	81.818	Taeniopygia_guttata
ENSGAFG00000019350	pelo	100	90.130	ENSTRUG00000005809	pelo	100	90.130	Takifugu_rubripes
ENSGAFG00000019350	pelo	100	90.649	ENSTNIG00000018937	pelo	100	90.649	Tetraodon_nigroviridis
ENSGAFG00000019350	pelo	100	80.519	ENSTTRG00000001857	PELO	100	80.519	Tursiops_truncatus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	81.299	ENSUAMG00000002535	PELO	100	81.299	Ursus_americanus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	81.299	ENSUMAG00000005809	PELO	100	81.299	Ursus_maritimus
ENSGAFG00000019350	pelo	100	80.779	ENSVPAG00000001113	PELO	100	80.779	Vicugna_pacos
ENSGAFG00000019350	pelo	100	81.039	ENSVVUG00000025499	PELO	100	81.039	Vulpes_vulpes
ENSGAFG00000019350	pelo	81	76.452	ENSXETG00000018368	pelo	99	76.025	Xenopus_tropicalis
ENSGAFG00000019350	pelo	100	98.182	ENSXMAG00000018474	pelo	100	98.182	Xiphophorus_maculatus