EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGAFG00000019435 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: syf2
Alias: hm:zeh0031|zeh0031|zgc:113871|zgc:92835
Full Name: SYF2 pre-mRNA-splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Gambusia_affinis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7545 bases
Position: chrNHOQ01002481.1:8615619-8623163
Accession: ZDB-GENE-040801-170
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGAFP00000028779	SYF2	PF08231.12	5.5e-55	1	1
ENSGAFP00000028776	SYF2	PF08231.12	8.5e-55	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGAFT00000029076	-	1235	-	ENSGAFP00000028779	238 (aa)	-	-
ENSGAFT00000029073	-	1619	-	ENSGAFP00000028776	278 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSGAFG00000019435's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSGAFG00000019435's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGAFG00000019435	syf2	91	80.556	ENSG00000117614	SYF2	95	75.424	Homo_sapiens
ENSGAFG00000019435	syf2	100	89.076	ENSAPOG00000001174	syf2	100	89.076	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAFG00000019435	syf2	94	78.475	ENSAMEG00000010115	-	91	78.475	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGAFG00000019435	syf2	81	80.729	ENSAMEG00000010134	-	98	80.729	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGAFG00000019435	syf2	99	87.234	ENSACIG00000023688	syf2	94	87.234	Amphilophus_citrinellus
ENSGAFG00000019435	syf2	100	89.076	ENSAOCG00000022046	syf2	100	88.235	Amphiprion_ocellaris
ENSGAFG00000019435	syf2	93	88.235	ENSAOCG00000010912	syf2	69	88.235	Amphiprion_ocellaris
ENSGAFG00000019435	syf2	100	89.076	ENSAPEG00000018858	syf2	92	89.076	Amphiprion_percula
ENSGAFG00000019435	syf2	100	89.496	ENSATEG00000007745	syf2	100	89.496	Anabas_testudineus
ENSGAFG00000019435	syf2	84	81.910	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	81.910	Anas_platyrhynchos
ENSGAFG00000019435	syf2	86	80.882	ENSACAG00000013653	-	100	80.882	Anolis_carolinensis
ENSGAFG00000019435	syf2	70	67.665	ENSACAG00000026777	-	100	67.665	Anolis_carolinensis
ENSGAFG00000019435	syf2	91	81.019	ENSANAG00000032473	SYF2	100	74.486	Aotus_nancymaae
ENSGAFG00000019435	syf2	100	89.916	ENSACLG00000019916	syf2	100	89.916	Astatotilapia_calliptera
ENSGAFG00000019435	syf2	100	80.672	ENSAMXG00000004051	syf2	100	80.672	Astyanax_mexicanus
ENSGAFG00000019435	syf2	96	77.155	ENSBTAG00000001651	SYF2	98	77.155	Bos_taurus
ENSGAFG00000019435	syf2	87	51.905	WBGene00019402	syf-2	90	51.429	Caenorhabditis_elegans
ENSGAFG00000019435	syf2	91	81.019	ENSCJAG00000046570	SYF2	90	80.275	Callithrix_jacchus
ENSGAFG00000019435	syf2	91	75.000	ENSCAFG00000030331	-	92	75.000	Canis_familiaris
ENSGAFG00000019435	syf2	91	79.630	ENSCAFG00000012895	-	90	78.475	Canis_familiaris
ENSGAFG00000019435	syf2	76	71.429	ENSCAFG00020021094	-	95	71.429	Canis_lupus_dingo
ENSGAFG00000019435	syf2	91	79.630	ENSCAFG00020021091	-	90	78.475	Canis_lupus_dingo
ENSGAFG00000019435	syf2	99	75.000	ENSCHIG00000020874	SYF2	99	75.000	Capra_hircus
ENSGAFG00000019435	syf2	99	75.000	ENSTSYG00000005114	SYF2	99	75.000	Carlito_syrichta
ENSGAFG00000019435	syf2	83	79.798	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	79.798	Cavia_aperea
ENSGAFG00000019435	syf2	97	73.770	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	73.770	Cavia_porcellus
ENSGAFG00000019435	syf2	91	81.019	ENSCCAG00000022459	SYF2	100	74.486	Cebus_capucinus
ENSGAFG00000019435	syf2	99	73.444	ENSCATG00000026917	SYF2	99	74.689	Cercocebus_atys
ENSGAFG00000019435	syf2	93	79.730	ENSCLAG00000008474	SYF2	91	79.730	Chinchilla_lanigera
ENSGAFG00000019435	syf2	100	73.663	ENSCSAG00000000948	SYF2	100	73.663	Chlorocebus_sabaeus
ENSGAFG00000019435	syf2	72	58.382	ENSCHOG00000005273	-	96	58.382	Choloepus_hoffmanni
ENSGAFG00000019435	syf2	94	80.444	ENSCPBG00000025073	SYF2	95	77.872	Chrysemys_picta_bellii
ENSGAFG00000019435	syf2	89	54.673	ENSCING00000003017	-	89	55.140	Ciona_intestinalis
ENSGAFG00000019435	syf2	89	50.467	ENSCSAVG00000006627	-	98	50.467	Ciona_savignyi
ENSGAFG00000019435	syf2	99	64.730	ENSCANG00000037322	SYF2	99	65.975	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGAFG00000019435	syf2	100	75.620	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	75.620	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGAFG00000019435	syf2	82	80.612	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	80.808	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGAFG00000019435	syf2	92	85.780	ENSCSEG00000000117	syf2	99	83.122	Cynoglossus_semilaevis
ENSGAFG00000019435	syf2	100	94.561	ENSCVAG00000019543	syf2	100	94.561	Cyprinodon_variegatus
ENSGAFG00000019435	syf2	100	81.513	ENSDARG00000004706	syf2	100	81.513	Danio_rerio
ENSGAFG00000019435	syf2	96	76.724	ENSDNOG00000047605	SYF2	95	76.724	Dasypus_novemcinctus
ENSGAFG00000019435	syf2	96	78.788	ENSDORG00000001274	Syf2	95	78.788	Dipodomys_ordii
ENSGAFG00000019435	syf2	94	55.310	FBgn0033556	CG12343	99	55.310	Drosophila_melanogaster
ENSGAFG00000019435	syf2	87	65.700	ENSETEG00000015729	SYF2	100	62.882	Echinops_telfairi
ENSGAFG00000019435	syf2	83	57.360	ENSEBUG00000015402	syf2	95	57.360	Eptatretus_burgeri
ENSGAFG00000019435	syf2	100	75.510	ENSEASG00005004224	-	98	76.569	Equus_asinus_asinus
ENSGAFG00000019435	syf2	99	67.083	ENSEASG00005004232	-	99	67.083	Equus_asinus_asinus
ENSGAFG00000019435	syf2	96	77.586	ENSECAG00000012023	-	95	77.586	Equus_caballus
ENSGAFG00000019435	syf2	96	78.017	ENSECAG00000010440	-	97	78.017	Equus_caballus
ENSGAFG00000019435	syf2	70	65.882	ENSEEUG00000015084	SYF2	93	65.882	Erinaceus_europaeus
ENSGAFG00000019435	syf2	100	81.933	ENSELUG00000003465	syf2	99	81.933	Esox_lucius
ENSGAFG00000019435	syf2	100	75.102	ENSFCAG00000010324	-	85	74.694	Felis_catus
ENSGAFG00000019435	syf2	95	78.070	ENSFCAG00000043095	-	93	78.070	Felis_catus
ENSGAFG00000019435	syf2	86	78.431	ENSFALG00000000460	SYF2	92	76.652	Ficedula_albicollis
ENSGAFG00000019435	syf2	97	74.486	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	74.486	Fukomys_damarensis
ENSGAFG00000019435	syf2	99	78.008	ENSFHEG00000007238	syf2	100	80.088	Fundulus_heteroclitus
ENSGAFG00000019435	syf2	90	86.512	ENSGMOG00000019138	syf2	96	86.512	Gadus_morhua
ENSGAFG00000019435	syf2	93	81.081	ENSGALG00000013639	SYF2	88	81.081	Gallus_gallus
ENSGAFG00000019435	syf2	93	89.189	ENSGACG00000007305	syf2	100	86.192	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAFG00000019435	syf2	94	80.889	ENSGAGG00000010670	SYF2	95	78.298	Gopherus_agassizii
ENSGAFG00000019435	syf2	91	80.556	ENSGGOG00000012796	SYF2	95	75.424	Gorilla_gorilla
ENSGAFG00000019435	syf2	100	89.916	ENSHBUG00000020477	syf2	100	89.916	Haplochromis_burtoni
ENSGAFG00000019435	syf2	93	69.820	ENSHGLG00000004304	-	93	70.270	Heterocephalus_glaber_female
ENSGAFG00000019435	syf2	93	79.279	ENSHGLG00000014393	SYF2	91	79.279	Heterocephalus_glaber_female
ENSGAFG00000019435	syf2	93	79.279	ENSHGLG00100014722	SYF2	91	79.279	Heterocephalus_glaber_male
ENSGAFG00000019435	syf2	100	88.235	ENSHCOG00000012904	syf2	78	88.235	Hippocampus_comes
ENSGAFG00000019435	syf2	100	82.845	ENSIPUG00000019859	syf2	100	82.845	Ictalurus_punctatus
ENSGAFG00000019435	syf2	61	73.288	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	73.288	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGAFG00000019435	syf2	84	80.402	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	80.402	Jaculus_jaculus
ENSGAFG00000019435	syf2	100	91.176	ENSKMAG00000013856	syf2	100	91.176	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAFG00000019435	syf2	100	89.916	ENSLBEG00000014425	syf2	100	89.916	Labrus_bergylta
ENSGAFG00000019435	syf2	97	78.355	ENSLACG00000012064	SYF2	97	78.355	Latimeria_chalumnae
ENSGAFG00000019435	syf2	100	82.773	ENSLOCG00000002728	syf2	95	82.773	Lepisosteus_oculatus
ENSGAFG00000019435	syf2	77	52.174	ENSLAFG00000030814	-	100	52.174	Loxodonta_africana
ENSGAFG00000019435	syf2	96	77.922	ENSLAFG00000023150	-	94	77.922	Loxodonta_africana
ENSGAFG00000019435	syf2	99	73.444	ENSMFAG00000041831	SYF2	99	74.689	Macaca_fascicularis
ENSGAFG00000019435	syf2	91	79.630	ENSMMUG00000002968	SYF2	99	73.029	Macaca_mulatta
ENSGAFG00000019435	syf2	99	73.444	ENSMNEG00000030180	SYF2	99	74.689	Macaca_nemestrina
ENSGAFG00000019435	syf2	99	73.444	ENSMLEG00000030248	SYF2	99	74.689	Mandrillus_leucophaeus
ENSGAFG00000019435	syf2	100	89.076	ENSMAMG00000010403	syf2	98	89.076	Mastacembelus_armatus
ENSGAFG00000019435	syf2	100	89.916	ENSMZEG00005006429	syf2	100	89.916	Maylandia_zebra
ENSGAFG00000019435	syf2	84	81.407	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	81.407	Meleagris_gallopavo
ENSGAFG00000019435	syf2	100	76.446	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	76.446	Mesocricetus_auratus
ENSGAFG00000019435	syf2	84	80.402	ENSMICG00000016191	SYF2	100	80.402	Microcebus_murinus
ENSGAFG00000019435	syf2	100	76.033	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	76.033	Microtus_ochrogaster
ENSGAFG00000019435	syf2	97	86.580	ENSMMOG00000002396	syf2	99	85.169	Mola_mola
ENSGAFG00000019435	syf2	93	75.446	ENSMODG00000013951	-	98	75.446	Monodelphis_domestica
ENSGAFG00000019435	syf2	100	86.307	ENSMALG00000010706	syf2	100	86.722	Monopterus_albus
ENSGAFG00000019435	syf2	100	76.446	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	76.446	Mus_caroli
ENSGAFG00000019435	syf2	100	76.446	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	76.446	Mus_musculus
ENSGAFG00000019435	syf2	100	76.446	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	76.446	Mus_pahari
ENSGAFG00000019435	syf2	100	76.446	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	76.446	Mus_spretus
ENSGAFG00000019435	syf2	92	79.091	ENSMPUG00000015801	-	89	79.091	Mustela_putorius_furo
ENSGAFG00000019435	syf2	91	79.630	ENSMPUG00000015802	-	93	76.754	Mustela_putorius_furo
ENSGAFG00000019435	syf2	95	77.293	ENSMLUG00000001885	SYF2	99	75.104	Myotis_lucifugus
ENSGAFG00000019435	syf2	100	73.171	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	73.171	Nannospalax_galili
ENSGAFG00000019435	syf2	100	79.752	ENSNBRG00000010720	syf2	99	79.752	Neolamprologus_brichardi
ENSGAFG00000019435	syf2	91	80.556	ENSNLEG00000035185	SYF2	95	75.424	Nomascus_leucogenys
ENSGAFG00000019435	syf2	100	74.074	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	74.074	Ochotona_princeps
ENSGAFG00000019435	syf2	93	68.468	ENSODEG00000014338	-	92	68.468	Octodon_degus
ENSGAFG00000019435	syf2	100	73.529	ENSODEG00000017664	-	93	77.928	Octodon_degus
ENSGAFG00000019435	syf2	100	89.496	ENSONIG00000008213	syf2	100	89.496	Oreochromis_niloticus
ENSGAFG00000019435	syf2	85	80.198	ENSOANG00000009552	SYF2	100	80.198	Ornithorhynchus_anatinus
ENSGAFG00000019435	syf2	91	81.019	ENSOCUG00000013050	SYF2	91	79.279	Oryctolagus_cuniculus
ENSGAFG00000019435	syf2	97	90.000	ENSORLG00000028820	syf2	99	90.000	Oryzias_latipes
ENSGAFG00000019435	syf2	100	88.655	ENSORLG00020018333	syf2	100	88.655	Oryzias_latipes_hni
ENSGAFG00000019435	syf2	100	89.076	ENSORLG00015014665	syf2	100	89.076	Oryzias_latipes_hsok
ENSGAFG00000019435	syf2	100	87.395	ENSOMEG00000013911	syf2	100	87.395	Oryzias_melastigma
ENSGAFG00000019435	syf2	97	77.682	ENSOGAG00000009962	SYF2	95	77.682	Otolemur_garnettii
ENSGAFG00000019435	syf2	82	53.333	ENSOARG00000006269	-	100	53.333	Ovis_aries
ENSGAFG00000019435	syf2	96	76.068	ENSOARG00000006348	-	95	76.068	Ovis_aries
ENSGAFG00000019435	syf2	91	80.556	ENSPPAG00000036579	SYF2	95	75.424	Pan_paniscus
ENSGAFG00000019435	syf2	93	80.631	ENSPPRG00000001638	-	90	80.631	Panthera_pardus
ENSGAFG00000019435	syf2	95	78.070	ENSPPRG00000001651	-	93	78.070	Panthera_pardus
ENSGAFG00000019435	syf2	91	81.481	ENSPTIG00000005711	-	80	80.734	Panthera_tigris_altaica
ENSGAFG00000019435	syf2	95	78.070	ENSPTIG00000007036	-	93	78.070	Panthera_tigris_altaica
ENSGAFG00000019435	syf2	91	80.556	ENSPTRG00000000352	SYF2	95	75.424	Pan_troglodytes
ENSGAFG00000019435	syf2	99	73.444	ENSPANG00000008139	SYF2	99	74.689	Papio_anubis
ENSGAFG00000019435	syf2	100	79.832	ENSPKIG00000008130	syf2	100	79.832	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGAFG00000019435	syf2	97	77.447	ENSPSIG00000011816	SYF2	91	77.447	Pelodiscus_sinensis
ENSGAFG00000019435	syf2	96	86.842	ENSPMGG00000008755	syf2	93	82.845	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGAFG00000019435	syf2	100	75.620	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	75.620	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGAFG00000019435	syf2	93	80.180	ENSPCIG00000014235	SYF2	92	79.039	Phascolarctos_cinereus
ENSGAFG00000019435	syf2	100	94.561	ENSPFOG00000004116	syf2	99	94.561	Poecilia_formosa
ENSGAFG00000019435	syf2	98	95.708	ENSPLAG00000006691	syf2	99	96.121	Poecilia_latipinna
ENSGAFG00000019435	syf2	100	93.697	ENSPMEG00000011684	syf2	100	93.697	Poecilia_mexicana
ENSGAFG00000019435	syf2	100	96.639	ENSPREG00000003009	syf2	100	96.639	Poecilia_reticulata
ENSGAFG00000019435	syf2	99	73.859	ENSPPYG00000001713	SYF2	99	73.859	Pongo_abelii
ENSGAFG00000019435	syf2	97	53.219	ENSPCOG00000027011	SYF2	94	53.219	Propithecus_coquereli
ENSGAFG00000019435	syf2	97	68.831	ENSPVAG00000005841	SYF2	92	68.831	Pteropus_vampyrus
ENSGAFG00000019435	syf2	100	89.496	ENSPNYG00000004979	syf2	100	89.496	Pundamilia_nyererei
ENSGAFG00000019435	syf2	100	81.513	ENSPNAG00000015570	syf2	100	81.513	Pygocentrus_nattereri
ENSGAFG00000019435	syf2	100	76.446	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	76.446	Rattus_norvegicus
ENSGAFG00000019435	syf2	99	71.369	ENSRBIG00000042970	SYF2	99	72.614	Rhinopithecus_bieti
ENSGAFG00000019435	syf2	99	73.444	ENSRROG00000001347	SYF2	99	74.689	Rhinopithecus_roxellana
ENSGAFG00000019435	syf2	91	80.556	ENSSBOG00000020184	SYF2	100	74.074	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSGAFG00000019435	syf2	86	80.097	ENSSHAG00000007152	-	100	80.097	Sarcophilus_harrisii
ENSGAFG00000019435	syf2	93	78.829	ENSSHAG00000015630	-	89	78.829	Sarcophilus_harrisii
ENSGAFG00000019435	syf2	93	84.163	ENSSFOG00015023647	syf2	93	84.163	Scleropages_formosus
ENSGAFG00000019435	syf2	100	85.714	ENSSMAG00000009867	syf2	100	85.714	Scophthalmus_maximus
ENSGAFG00000019435	syf2	100	87.815	ENSSDUG00000013072	syf2	100	87.815	Seriola_dumerili
ENSGAFG00000019435	syf2	100	87.815	ENSSLDG00000012677	syf2	100	87.815	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSGAFG00000019435	syf2	100	58.607	ENSSARG00000012889	SYF2	100	58.607	Sorex_araneus
ENSGAFG00000019435	syf2	99	78.512	ENSSPUG00000005251	SYF2	96	78.512	Sphenodon_punctatus
ENSGAFG00000019435	syf2	100	88.235	ENSSPAG00000009626	syf2	100	88.235	Stegastes_partitus
ENSGAFG00000019435	syf2	96	76.724	ENSSSCG00000037481	SYF2	95	76.724	Sus_scrofa
ENSGAFG00000019435	syf2	63	50.993	ENSTGUG00000001126	SYF2	86	51.429	Taeniopygia_guttata
ENSGAFG00000019435	syf2	100	83.333	ENSTRUG00000001499	syf2	91	85.903	Takifugu_rubripes
ENSGAFG00000019435	syf2	93	87.387	ENSTNIG00000016912	syf2	99	87.387	Tetraodon_nigroviridis
ENSGAFG00000019435	syf2	99	56.250	ENSTBEG00000017370	SYF2	98	56.250	Tupaia_belangeri
ENSGAFG00000019435	syf2	91	80.556	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	74.180	Tursiops_truncatus
ENSGAFG00000019435	syf2	94	78.924	ENSUAMG00000002897	SYF2	90	78.924	Ursus_americanus
ENSGAFG00000019435	syf2	91	79.630	ENSUMAG00000013108	SYF2	90	78.475	Ursus_maritimus
ENSGAFG00000019435	syf2	100	73.361	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	73.361	Vicugna_pacos
ENSGAFG00000019435	syf2	86	79.512	ENSVVUG00000027181	-	90	78.475	Vulpes_vulpes
ENSGAFG00000019435	syf2	91	79.630	ENSVVUG00000027175	-	90	78.475	Vulpes_vulpes
ENSGAFG00000019435	syf2	97	74.678	ENSXETG00000022797	syf2	94	74.678	Xenopus_tropicalis
ENSGAFG00000019435	syf2	100	95.798	ENSXMAG00000022698	syf2	100	95.798	Xiphophorus_maculatus