EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGAFG00000019546 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: nrde2
Alias: c14orf102
Full Name: NRDE-2%2C necessary for RNA interference%2C domain containing
Gene Type: protein_coding
Species: Gambusia_affinis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10209 bases
Position: chrNHOQ01002481.1:10971768-10981976
Accession: ZDB-GENE-111117-3
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGAFP00000028962	NRDE-2	PF08424.10	5.8e-98	1	1
ENSGAFP00000028963	NRDE-2	PF08424.10	5.6e-97	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGAFT00000029261	-	3114	-	ENSGAFP00000028963	1037 (aa)	-	-
ENSGAFT00000029260	-	2706	-	ENSGAFP00000028962	901 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSGAFG00000019546's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSGAFG00000019546's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGAFG00000019546	nrde2	97	50.725	ENSG00000119720	NRDE2	100	67.647	Homo_sapiens
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	75.586	ENSAPOG00000009202	nrde2	92	71.957	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAFG00000019546	nrde2	98	47.884	ENSAMEG00000001807	NRDE2	91	46.312	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	75.328	ENSACIG00000014783	nrde2	97	71.969	Amphilophus_citrinellus
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	76.502	ENSAOCG00000015576	nrde2	91	72.529	Amphiprion_ocellaris
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	77.081	ENSAPEG00000001711	nrde2	92	72.901	Amphiprion_percula
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	75.427	ENSATEG00000010247	nrde2	92	71.454	Anabas_testudineus
ENSGAFG00000019546	nrde2	98	50.601	ENSAPLG00000015870	NRDE2	93	48.842	Anas_platyrhynchos
ENSGAFG00000019546	nrde2	98	48.087	ENSACAG00000014571	NRDE2	89	46.711	Anolis_carolinensis
ENSGAFG00000019546	nrde2	97	47.170	ENSANAG00000025313	NRDE2	90	45.658	Aotus_nancymaae
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	75.702	ENSACLG00000025154	nrde2	92	72.182	Astatotilapia_calliptera
ENSGAFG00000019546	nrde2	91	72.093	ENSAMXG00000034642	nrde2	90	46.094	Astyanax_mexicanus
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	50.165	ENSBTAG00000005427	NRDE2	91	49.209	Bos_taurus
ENSGAFG00000019546	nrde2	97	50.613	ENSCJAG00000017711	NRDE2	90	48.735	Callithrix_jacchus
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	46.246	ENSCAFG00000017515	NRDE2	89	45.750	Canis_familiaris
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	48.584	ENSCAFG00020016346	NRDE2	88	47.939	Canis_lupus_dingo
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	49.558	ENSCHIG00000005876	NRDE2	91	48.641	Capra_hircus
ENSGAFG00000019546	nrde2	97	49.332	ENSTSYG00000000161	NRDE2	88	47.642	Carlito_syrichta
ENSGAFG00000019546	nrde2	97	49.833	ENSCAPG00000012039	NRDE2	92	47.802	Cavia_aperea
ENSGAFG00000019546	nrde2	97	49.721	ENSCPOG00000002428	NRDE2	90	47.708	Cavia_porcellus
ENSGAFG00000019546	nrde2	97	50.502	ENSCCAG00000024917	NRDE2	88	48.795	Cebus_capucinus
ENSGAFG00000019546	nrde2	97	49.387	ENSCLAG00000015185	NRDE2	90	47.570	Chinchilla_lanigera
ENSGAFG00000019546	nrde2	97	50.613	ENSCSAG00000011451	NRDE2	90	48.689	Chlorocebus_sabaeus
ENSGAFG00000019546	nrde2	76	47.633	ENSCHOG00000006165	NRDE2	66	47.511	Choloepus_hoffmanni
ENSGAFG00000019546	nrde2	98	49.283	ENSCPBG00000008537	NRDE2	85	48.464	Chrysemys_picta_bellii
ENSGAFG00000019546	nrde2	97	50.390	ENSCANG00000029067	NRDE2	88	48.940	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGAFG00000019546	nrde2	97	49.117	ENSCGRG00001015658	Nrde2	91	47.778	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGAFG00000019546	nrde2	97	49.721	ENSCGRG00000005062	Nrde2	90	48.273	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGAFG00000019546	nrde2	97	71.109	ENSCSEG00000000089	nrde2	98	69.053	Cynoglossus_semilaevis
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	83.135	ENSCVAG00000023105	nrde2	92	79.136	Cyprinodon_variegatus
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	58.434	ENSDARG00000074726	nrde2	92	56.198	Danio_rerio
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	48.637	ENSDNOG00000024057	NRDE2	90	47.712	Dasypus_novemcinctus
ENSGAFG00000019546	nrde2	98	48.053	ENSDORG00000003197	Nrde2	96	48.398	Dipodomys_ordii
ENSGAFG00000019546	nrde2	75	45.911	ENSETEG00000000198	NRDE2	60	46.544	Echinops_telfairi
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	41.693	ENSEBUG00000014552	nrde2	88	40.776	Eptatretus_burgeri
ENSGAFG00000019546	nrde2	97	50.557	ENSEASG00005020675	NRDE2	90	48.457	Equus_asinus_asinus
ENSGAFG00000019546	nrde2	98	50.610	ENSECAG00000003862	NRDE2	91	48.513	Equus_caballus
ENSGAFG00000019546	nrde2	59	59.398	ENSEEUG00000004026	-	59	59.398	Erinaceus_europaeus
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	60.879	ENSELUG00000005973	nrde2	93	58.737	Esox_lucius
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	50.055	ENSFCAG00000011312	NRDE2	91	47.619	Felis_catus
ENSGAFG00000019546	nrde2	98	50.440	ENSFALG00000012260	NRDE2	91	48.649	Ficedula_albicollis
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	48.681	ENSFDAG00000021350	NRDE2	90	47.334	Fukomys_damarensis
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	83.927	ENSFHEG00000021385	nrde2	94	80.588	Fundulus_heteroclitus
ENSGAFG00000019546	nrde2	83	70.260	ENSGMOG00000015815	nrde2	100	64.192	Gadus_morhua
ENSGAFG00000019546	nrde2	98	50.054	ENSGALG00000010677	NRDE2	91	48.276	Gallus_gallus
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	73.139	ENSGACG00000012619	nrde2	94	71.712	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAFG00000019546	nrde2	98	48.955	ENSGAGG00000003252	NRDE2	88	48.329	Gopherus_agassizii
ENSGAFG00000019546	nrde2	97	50.502	ENSGGOG00000008835	NRDE2	92	48.186	Gorilla_gorilla
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	76.026	ENSHBUG00000016736	nrde2	92	72.455	Haplochromis_burtoni
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	49.615	ENSHGLG00000006731	NRDE2	91	48.030	Heterocephalus_glaber_female
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	49.615	ENSHGLG00100017736	NRDE2	91	48.030	Heterocephalus_glaber_male
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	65.588	ENSHCOG00000009559	nrde2	98	62.987	Hippocampus_comes
ENSGAFG00000019546	nrde2	98	54.139	ENSIPUG00000016129	nrde2	92	51.410	Ictalurus_punctatus
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	49.505	ENSSTOG00000001678	NRDE2	90	48.127	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGAFG00000019546	nrde2	98	50.887	ENSJJAG00000000907	Nrde2	90	48.507	Jaculus_jaculus
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	75.506	ENSKMAG00000008647	nrde2	92	72.563	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	74.232	ENSLBEG00000021428	nrde2	99	71.650	Labrus_bergylta
ENSGAFG00000019546	nrde2	90	51.749	ENSLACG00000013921	NRDE2	99	51.749	Latimeria_chalumnae
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	56.861	ENSLOCG00000009037	nrde2	92	53.614	Lepisosteus_oculatus
ENSGAFG00000019546	nrde2	98	48.610	ENSLAFG00000004966	NRDE2	91	47.438	Loxodonta_africana
ENSGAFG00000019546	nrde2	97	50.390	ENSMMUG00000010442	NRDE2	100	67.157	Macaca_mulatta
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	73.439	ENSMAMG00000013452	nrde2	92	69.991	Mastacembelus_armatus
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	75.810	ENSMZEG00005008319	nrde2	92	72.273	Maylandia_zebra
ENSGAFG00000019546	nrde2	98	49.675	ENSMGAG00000013052	NRDE2	99	48.461	Meleagris_gallopavo
ENSGAFG00000019546	nrde2	97	49.833	ENSMAUG00000018578	Nrde2	90	47.850	Mesocricetus_auratus
ENSGAFG00000019546	nrde2	97	50.725	ENSMICG00000016741	NRDE2	91	48.651	Microcebus_murinus
ENSGAFG00000019546	nrde2	97	48.049	ENSMOCG00000014472	Nrde2	90	46.648	Microtus_ochrogaster
ENSGAFG00000019546	nrde2	92	67.995	ENSMMOG00000004703	nrde2	92	67.799	Mola_mola
ENSGAFG00000019546	nrde2	91	48.929	ENSMODG00000002711	NRDE2	85	48.083	Monodelphis_domestica
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	72.788	ENSMALG00000021869	nrde2	97	69.954	Monopterus_albus
ENSGAFG00000019546	nrde2	97	49.833	MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	91	47.672	Mus_caroli
ENSGAFG00000019546	nrde2	97	49.944	ENSMUSG00000021179	Nrde2	90	47.672	Mus_musculus
ENSGAFG00000019546	nrde2	97	49.833	MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	90	47.810	Mus_pahari
ENSGAFG00000019546	nrde2	97	49.498	MGP_SPRETEiJ_G0018865	Nrde2	94	57.812	Mus_spretus
ENSGAFG00000019546	nrde2	97	48.434	ENSMPUG00000008135	NRDE2	90	46.392	Mustela_putorius_furo
ENSGAFG00000019546	nrde2	97	49.109	ENSMLUG00000007484	NRDE2	87	48.309	Myotis_lucifugus
ENSGAFG00000019546	nrde2	97	49.498	ENSNGAG00000002993	Nrde2	91	46.960	Nannospalax_galili
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	75.791	ENSNBRG00000010184	nrde2	99	73.674	Neolamprologus_brichardi
ENSGAFG00000019546	nrde2	98	48.955	ENSNLEG00000017032	NRDE2	90	47.661	Nomascus_leucogenys
ENSGAFG00000019546	nrde2	93	47.600	ENSMEUG00000011097	NRDE2	74	48.193	Notamacropus_eugenii
ENSGAFG00000019546	nrde2	63	58.947	ENSOPRG00000001375	-	61	61.321	Ochotona_princeps
ENSGAFG00000019546	nrde2	97	48.272	ENSODEG00000012422	NRDE2	90	47.110	Octodon_degus
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	77.308	ENSONIG00000019512	nrde2	92	72.525	Oreochromis_niloticus
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	49.506	ENSOCUG00000010083	NRDE2	88	48.701	Oryctolagus_cuniculus
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	70.833	ENSORLG00000017730	nrde2	96	68.466	Oryzias_latipes
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	70.701	ENSORLG00020015965	nrde2	92	67.296	Oryzias_latipes_hni
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	71.550	ENSORLG00015012437	nrde2	96	67.655	Oryzias_latipes_hsok
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	72.281	ENSOMEG00000010890	nrde2	92	69.161	Oryzias_melastigma
ENSGAFG00000019546	nrde2	97	50.389	ENSOGAG00000006624	NRDE2	91	48.282	Otolemur_garnettii
ENSGAFG00000019546	nrde2	98	47.164	ENSOARG00000003475	NRDE2	92	46.908	Ovis_aries
ENSGAFG00000019546	nrde2	97	50.725	ENSPPAG00000034133	NRDE2	96	51.155	Pan_paniscus
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	50.165	ENSPPRG00000006422	NRDE2	91	47.712	Panthera_pardus
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	50.164	ENSPTIG00000009989	NRDE2	91	47.806	Panthera_tigris_altaica
ENSGAFG00000019546	nrde2	97	50.613	ENSPTRG00000023399	NRDE2	92	48.279	Pan_troglodytes
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	55.150	ENSPKIG00000009331	nrde2	92	52.279	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGAFG00000019546	nrde2	98	49.723	ENSPSIG00000005588	NRDE2	87	48.453	Pelodiscus_sinensis
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	68.287	ENSPMGG00000024089	nrde2	94	66.923	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGAFG00000019546	nrde2	97	49.889	ENSPEMG00000023707	Nrde2	96	48.169	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	50.000	ENSPCIG00000018567	NRDE2	94	49.467	Phascolarctos_cinereus
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	89.107	ENSPFOG00000013217	nrde2	94	84.960	Poecilia_formosa
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	90.032	ENSPLAG00000022350	nrde2	94	86.195	Poecilia_latipinna
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	90.247	ENSPMEG00000000778	nrde2	94	86.460	Poecilia_mexicana
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	90.558	ENSPREG00000009066	nrde2	94	86.625	Poecilia_reticulata
ENSGAFG00000019546	nrde2	97	49.329	ENSPPYG00000006245	NRDE2	100	47.273	Pongo_abelii
ENSGAFG00000019546	nrde2	76	69.231	ENSPCAG00000016399	NRDE2	72	69.231	Procavia_capensis
ENSGAFG00000019546	nrde2	91	49.645	ENSPCOG00000024684	NRDE2	91	46.832	Propithecus_coquereli
ENSGAFG00000019546	nrde2	94	45.968	ENSPVAG00000010023	NRDE2	91	44.294	Pteropus_vampyrus
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	75.682	ENSPNYG00000022833	nrde2	94	76.190	Pundamilia_nyererei
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	56.084	ENSPNAG00000015807	nrde2	97	54.213	Pygocentrus_nattereri
ENSGAFG00000019546	nrde2	86	49.437	ENSRNOG00000004004	Nrde2	90	46.846	Rattus_norvegicus
ENSGAFG00000019546	nrde2	97	50.502	ENSSBOG00000024346	NRDE2	90	48.454	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSGAFG00000019546	nrde2	98	50.498	ENSSHAG00000016736	NRDE2	85	49.422	Sarcophilus_harrisii
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	57.080	ENSSFOG00015011794	nrde2	92	53.426	Scleropages_formosus
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	73.411	ENSSMAG00000011671	nrde2	92	69.542	Scophthalmus_maximus
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	76.483	ENSSDUG00000017948	nrde2	92	72.491	Seriola_dumerili
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	78.603	ENSSLDG00000023798	nrde2	99	76.258	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSGAFG00000019546	nrde2	98	50.335	ENSSPUG00000006348	NRDE2	99	48.493	Sphenodon_punctatus
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	76.575	ENSSPAG00000000539	nrde2	99	74.807	Stegastes_partitus
ENSGAFG00000019546	nrde2	97	49.944	ENSSSCG00000002434	NRDE2	91	48.007	Sus_scrofa
ENSGAFG00000019546	nrde2	98	50.386	ENSTGUG00000012462	-	93	48.644	Taeniopygia_guttata
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	69.103	ENSTRUG00000002798	nrde2	97	69.103	Takifugu_rubripes
ENSGAFG00000019546	nrde2	90	59.298	ENSTBEG00000011834	NRDE2	86	49.669	Tupaia_belangeri
ENSGAFG00000019546	nrde2	97	49.557	ENSTTRG00000013583	NRDE2	91	48.056	Tursiops_truncatus
ENSGAFG00000019546	nrde2	98	47.725	ENSUAMG00000004159	NRDE2	95	46.767	Ursus_americanus
ENSGAFG00000019546	nrde2	98	46.987	ENSUMAG00000006393	NRDE2	93	45.966	Ursus_maritimus
ENSGAFG00000019546	nrde2	98	48.783	ENSVVUG00000018202	NRDE2	87	47.555	Vulpes_vulpes
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	47.788	ENSXETG00000015708	nrde2	92	46.002	Xenopus_tropicalis
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	92.817	ENSXCOG00000013298	nrde2	100	90.170	Xiphophorus_couchianus
ENSGAFG00000019546	nrde2	99	92.060	ENSXMAG00000009320	nrde2	94	87.268	Xiphophorus_maculatus