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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSGAFG00000020084 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: caprin2
Alias: c1qdc1|wu:fj80b02
Full Name: caprin family member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Gambusia_affinis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 16369 bases
Position: chrNHOQ01002007.1:1773940-1790308
Accession: ZDB-GENE-040812-2
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGAFP00000029789	Caprin-1_C	PF12287.8	1.7e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGAFT00000030093	-	3695	-	ENSGAFP00000029789	892 (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGAFG00000020084	caprin2	94	42.222	ENSG00000110888	CAPRIN2	69	73.171	Homo_sapiens
ENSGAFG00000020084	caprin2	100	65.114	ENSAPOG00000019808	caprin2	100	66.631	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAFG00000020084	caprin2	94	42.761	ENSAMEG00000009118	CAPRIN2	79	42.761	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGAFG00000020084	caprin2	100	59.046	ENSACIG00000005589	caprin2	99	59.046	Amphilophus_citrinellus
ENSGAFG00000020084	caprin2	100	70.399	ENSAOCG00000013014	caprin2	100	70.399	Amphiprion_ocellaris
ENSGAFG00000020084	caprin2	86	43.836	ENSAPLG00000006703	CAPRIN2	82	43.836	Anas_platyrhynchos
ENSGAFG00000020084	caprin2	80	50.481	ENSACAG00000012953	CAPRIN2	71	45.594	Anolis_carolinensis
ENSGAFG00000020084	caprin2	90	43.210	ENSANAG00000035460	CAPRIN2	83	43.003	Aotus_nancymaae
ENSGAFG00000020084	caprin2	100	67.370	ENSACLG00000015175	-	100	67.370	Astatotilapia_calliptera
ENSGAFG00000020084	caprin2	100	48.673	ENSAMXG00000007266	caprin2	97	48.265	Astyanax_mexicanus
ENSGAFG00000020084	caprin2	94	40.944	ENSBTAG00000019373	CAPRIN2	86	53.254	Bos_taurus
ENSGAFG00000020084	caprin2	90	42.414	ENSCJAG00000001080	CAPRIN2	80	42.123	Callithrix_jacchus
ENSGAFG00000020084	caprin2	94	42.761	ENSCAFG00000010713	CAPRIN2	83	42.761	Canis_familiaris
ENSGAFG00000020084	caprin2	93	45.935	ENSCAFG00020018961	-	79	45.935	Canis_lupus_dingo
ENSGAFG00000020084	caprin2	94	41.085	ENSCHIG00000026352	CAPRIN2	90	41.085	Capra_hircus
ENSGAFG00000020084	caprin2	87	42.669	ENSTSYG00000008590	CAPRIN2	63	50.133	Carlito_syrichta
ENSGAFG00000020084	caprin2	86	42.549	ENSCPOG00000006625	CAPRIN2	96	34.340	Cavia_porcellus
ENSGAFG00000020084	caprin2	90	43.003	ENSCCAG00000027709	CAPRIN2	100	41.959	Cebus_capucinus
ENSGAFG00000020084	caprin2	91	43.478	ENSCATG00000031463	CAPRIN2	100	42.144	Cercocebus_atys
ENSGAFG00000020084	caprin2	93	41.438	ENSCLAG00000001513	CAPRIN2	85	41.438	Chinchilla_lanigera
ENSGAFG00000020084	caprin2	94	43.478	ENSCSAG00000007446	CAPRIN2	91	43.478	Chlorocebus_sabaeus
ENSGAFG00000020084	caprin2	94	41.149	ENSCHOG00000008931	CAPRIN2	83	41.149	Choloepus_hoffmanni
ENSGAFG00000020084	caprin2	100	39.943	ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	81	39.943	Chrysemys_picta_bellii
ENSGAFG00000020084	caprin2	73	50.133	ENSCANG00000035343	CAPRIN2	78	40.556	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGAFG00000020084	caprin2	79	51.256	ENSCGRG00001002901	Caprin2	99	33.590	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGAFG00000020084	caprin2	83	51.256	ENSCGRG00000001249	Caprin2	99	31.180	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGAFG00000020084	caprin2	100	48.577	ENSDARG00000020749	caprin2	99	48.577	Danio_rerio
ENSGAFG00000020084	caprin2	59	52.802	ENSDNOG00000009793	CAPRIN2	87	38.794	Dasypus_novemcinctus
ENSGAFG00000020084	caprin2	56	40.794	ENSDORG00000012639	Caprin2	100	33.333	Dipodomys_ordii
ENSGAFG00000020084	caprin2	94	41.030	ENSEASG00005005997	CAPRIN2	90	40.282	Equus_asinus_asinus
ENSGAFG00000020084	caprin2	94	40.864	ENSECAG00000000608	CAPRIN2	88	40.689	Equus_caballus
ENSGAFG00000020084	caprin2	100	50.363	ENSELUG00000019776	caprin2	100	50.675	Esox_lucius
ENSGAFG00000020084	caprin2	94	43.051	ENSFCAG00000007004	CAPRIN2	77	42.761	Felis_catus
ENSGAFG00000020084	caprin2	93	43.643	ENSFALG00000009038	CAPRIN2	77	43.643	Ficedula_albicollis
ENSGAFG00000020084	caprin2	100	81.264	ENSFHEG00000004435	caprin2	100	81.264	Fundulus_heteroclitus
ENSGAFG00000020084	caprin2	98	42.047	ENSGALG00000012947	CAPRIN2	79	43.448	Gallus_gallus
ENSGAFG00000020084	caprin2	100	57.417	ENSGACG00000019233	caprin2	99	57.417	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAFG00000020084	caprin2	94	42.193	ENSGAGG00000015057	CAPRIN2	74	42.193	Gopherus_agassizii
ENSGAFG00000020084	caprin2	94	42.222	ENSGGOG00000006182	CAPRIN2	71	43.478	Gorilla_gorilla
ENSGAFG00000020084	caprin2	100	65.689	ENSHBUG00000012107	-	100	65.689	Haplochromis_burtoni
ENSGAFG00000020084	caprin2	94	34.295	ENSHGLG00000007117	CAPRIN2	96	34.441	Heterocephalus_glaber_female
ENSGAFG00000020084	caprin2	100	45.659	ENSIPUG00000016517	caprin2	100	45.659	Ictalurus_punctatus
ENSGAFG00000020084	caprin2	88	50.711	ENSSTOG00000004672	CAPRIN2	75	50.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGAFG00000020084	caprin2	94	34.738	ENSJJAG00000018136	Caprin2	98	34.225	Jaculus_jaculus
ENSGAFG00000020084	caprin2	100	62.473	ENSKMAG00000011810	caprin2	100	62.473	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAFG00000020084	caprin2	100	67.810	ENSLBEG00000028194	caprin2	100	67.810	Labrus_bergylta
ENSGAFG00000020084	caprin2	94	38.374	ENSLACG00000006297	CAPRIN2	97	38.786	Latimeria_chalumnae
ENSGAFG00000020084	caprin2	85	53.890	ENSLOCG00000015099	caprin2	99	41.468	Lepisosteus_oculatus
ENSGAFG00000020084	caprin2	94	42.177	ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	84	42.177	Loxodonta_africana
ENSGAFG00000020084	caprin2	94	43.478	ENSMFAG00000025167	CAPRIN2	86	43.478	Macaca_fascicularis
ENSGAFG00000020084	caprin2	67	50.000	ENSMMUG00000001359	CAPRIN2	80	47.711	Macaca_mulatta
ENSGAFG00000020084	caprin2	91	43.478	ENSMNEG00000029750	CAPRIN2	100	42.007	Macaca_nemestrina
ENSGAFG00000020084	caprin2	67	50.133	ENSMLEG00000034760	CAPRIN2	72	43.478	Mandrillus_leucophaeus
ENSGAFG00000020084	caprin2	100	67.061	ENSMAMG00000023305	caprin2	100	67.061	Mastacembelus_armatus
ENSGAFG00000020084	caprin2	100	67.370	ENSMZEG00005008191	-	100	67.370	Maylandia_zebra
ENSGAFG00000020084	caprin2	86	43.448	ENSMGAG00000013350	CAPRIN2	77	43.448	Meleagris_gallopavo
ENSGAFG00000020084	caprin2	79	50.251	ENSMAUG00000008195	Caprin2	71	50.251	Mesocricetus_auratus
ENSGAFG00000020084	caprin2	94	43.243	ENSMICG00000010650	CAPRIN2	100	42.173	Microcebus_murinus
ENSGAFG00000020084	caprin2	66	58.271	ENSMOCG00000001842	Caprin2	82	42.857	Microtus_ochrogaster
ENSGAFG00000020084	caprin2	67	47.656	ENSMODG00000012642	-	69	47.656	Monodelphis_domestica
ENSGAFG00000020084	caprin2	100	63.221	ENSMALG00000020970	caprin2	100	63.221	Monopterus_albus
ENSGAFG00000020084	caprin2	88	40.891	MGP_CAROLIEiJ_G0029073	Caprin2	96	40.891	Mus_caroli
ENSGAFG00000020084	caprin2	84	46.774	ENSMUSG00000030309	Caprin2	94	46.774	Mus_musculus
ENSGAFG00000020084	caprin2	68	60.150	MGP_PahariEiJ_G0022834	Caprin2	67	60.150	Mus_pahari
ENSGAFG00000020084	caprin2	84	46.371	MGP_SPRETEiJ_G0030128	Caprin2	94	46.371	Mus_spretus
ENSGAFG00000020084	caprin2	94	43.051	ENSMPUG00000011164	CAPRIN2	80	42.761	Mustela_putorius_furo
ENSGAFG00000020084	caprin2	94	42.414	ENSMLUG00000008734	CAPRIN2	81	42.414	Myotis_lucifugus
ENSGAFG00000020084	caprin2	94	43.144	ENSNLEG00000005730	CAPRIN2	78	43.144	Nomascus_leucogenys
ENSGAFG00000020084	caprin2	73	50.000	ENSMEUG00000009176	CAPRIN2	64	50.000	Notamacropus_eugenii
ENSGAFG00000020084	caprin2	56	70.000	ENSOPRG00000011491	CAPRIN2	82	70.000	Ochotona_princeps
ENSGAFG00000020084	caprin2	88	42.321	ENSODEG00000005454	CAPRIN2	80	42.679	Octodon_degus
ENSGAFG00000020084	caprin2	100	65.801	ENSONIG00000012027	caprin2	100	65.801	Oreochromis_niloticus
ENSGAFG00000020084	caprin2	96	40.823	ENSOCUG00000017805	CAPRIN2	85	40.823	Oryctolagus_cuniculus
ENSGAFG00000020084	caprin2	95	66.705	ENSORLG00000012576	orla-b2m	96	66.705	Oryzias_latipes
ENSGAFG00000020084	caprin2	94	40.280	ENSOGAG00000010071	CAPRIN2	80	40.280	Otolemur_garnettii
ENSGAFG00000020084	caprin2	94	41.041	ENSOARG00000019503	CAPRIN2	84	41.348	Ovis_aries
ENSGAFG00000020084	caprin2	94	42.222	ENSPPAG00000041410	CAPRIN2	90	42.222	Pan_paniscus
ENSGAFG00000020084	caprin2	94	43.051	ENSPPRG00000013738	CAPRIN2	74	42.761	Panthera_pardus
ENSGAFG00000020084	caprin2	94	43.051	ENSPTIG00000013003	CAPRIN2	74	42.761	Panthera_tigris_altaica
ENSGAFG00000020084	caprin2	94	42.222	ENSPTRG00000004802	CAPRIN2	94	42.222	Pan_troglodytes
ENSGAFG00000020084	caprin2	91	43.478	ENSPANG00000005858	CAPRIN2	78	43.478	Papio_anubis
ENSGAFG00000020084	caprin2	96	45.424	ENSPKIG00000017980	caprin2	100	44.762	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGAFG00000020084	caprin2	100	39.714	ENSPSIG00000016188	CAPRIN2	91	40.456	Pelodiscus_sinensis
ENSGAFG00000020084	caprin2	79	51.707	ENSPEMG00000006778	Caprin2	89	51.707	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGAFG00000020084	caprin2	93	40.064	ENSPCIG00000015197	CAPRIN2	82	40.064	Phascolarctos_cinereus
ENSGAFG00000020084	caprin2	80	90.756	ENSPFOG00000009034	caprin2	99	90.756	Poecilia_formosa
ENSGAFG00000020084	caprin2	100	93.065	ENSPMEG00000020786	caprin2	100	93.065	Poecilia_mexicana
ENSGAFG00000020084	caprin2	93	42.222	ENSPPYG00000004394	CAPRIN2	78	43.478	Pongo_abelii
ENSGAFG00000020084	caprin2	92	41.071	ENSPCAG00000015746	CAPRIN2	78	41.071	Procavia_capensis
ENSGAFG00000020084	caprin2	87	43.738	ENSPCOG00000024022	CAPRIN2	72	43.738	Propithecus_coquereli
ENSGAFG00000020084	caprin2	86	58.667	ENSPVAG00000006083	CAPRIN2	73	58.667	Pteropus_vampyrus
ENSGAFG00000020084	caprin2	97	46.470	ENSPNAG00000017781	caprin2	96	46.414	Pygocentrus_nattereri
ENSGAFG00000020084	caprin2	84	46.122	ENSRNOG00000047319	Caprin2	93	46.122	Rattus_norvegicus
ENSGAFG00000020084	caprin2	91	41.830	ENSRBIG00000033178	CAPRIN2	100	42.329	Rhinopithecus_bieti
ENSGAFG00000020084	caprin2	81	41.762	ENSRROG00000033123	CAPRIN2	85	41.762	Rhinopithecus_roxellana
ENSGAFG00000020084	caprin2	90	43.345	ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	81	43.345	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSGAFG00000020084	caprin2	93	40.453	ENSSHAG00000004287	CAPRIN2	82	40.453	Sarcophilus_harrisii
ENSGAFG00000020084	caprin2	100	64.047	ENSSMAG00000016174	caprin2	100	64.263	Scophthalmus_maximus
ENSGAFG00000020084	caprin2	91	70.392	ENSSDUG00000019919	caprin2	96	70.392	Seriola_dumerili
ENSGAFG00000020084	caprin2	94	42.714	ENSSSCG00000022611	CAPRIN2	87	42.714	Sus_scrofa
ENSGAFG00000020084	caprin2	94	43.793	ENSTGUG00000011456	-	83	43.793	Taeniopygia_guttata
ENSGAFG00000020084	caprin2	76	48.441	ENSTTRG00000008463	CAPRIN2	66	48.441	Tursiops_truncatus
ENSGAFG00000020084	caprin2	54	41.683	ENSUAMG00000012343	-	100	41.683	Ursus_americanus
ENSGAFG00000020084	caprin2	94	43.098	ENSUMAG00000002576	CAPRIN2	83	42.809	Ursus_maritimus
ENSGAFG00000020084	caprin2	93	43.292	ENSVPAG00000007238	CAPRIN2	84	43.292	Vicugna_pacos
ENSGAFG00000020084	caprin2	94	42.761	ENSVVUG00000007217	CAPRIN2	71	42.761	Vulpes_vulpes
ENSGAFG00000020084	caprin2	77	55.642	ENSXETG00000007516	caprin2	73	55.642	Xenopus_tropicalis