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Description

Ensembl ID: ENSGAGG00000001065 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SBNO1
Alias: FLJ10701|FLJ10833|MOP3|Sno
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Gopherus_agassizii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 33355 bases
Position: chrPPEB01003950.1:45706-79060
Accession: 22973
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGAGP00000009883	ResIII	PF04851.15	1.5e-06	1	1
ENSGAGP00000009921	ResIII	PF04851.15	4e-06	1	1
ENSGAGP00000009813	ResIII	PF04851.15	1.5e-05	1	1
ENSGAGP00000009907	ResIII	PF04851.15	1.5e-05	1	1
ENSGAGP00000009809	ResIII	PF04851.15	1.8e-05	1	1
ENSGAGP00000009778	ResIII	PF04851.15	1.8e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGAGT00000011353	SBNO1-204	3792	-	ENSGAGP00000009883	1263 (aa)	-	-
ENSGAGT00000011266	SBNO1-202	4140	-	ENSGAGP00000009809	1379 (aa)	-	-
ENSGAGT00000011271	SBNO1-203	4020	-	ENSGAGP00000009813	1339 (aa)	-	-
ENSGAGT00000011379	SBNO1-205	4014	-	ENSGAGP00000009907	1337 (aa)	-	-
ENSGAGT00000011394	SBNO1-206	3672	-	ENSGAGP00000009921	1223 (aa)	-	-
ENSGAGT00000011230	SBNO1-201	4176	-	ENSGAGP00000009778	1391 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSGAGG00000001065	SBNO1	82	55.483	ENSGAGG00000008348	SBNO2	69	65.986

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGAGG00000001065	SBNO1	100	91.314	ENSG00000139697	SBNO1	97	94.840	Homo_sapiens
ENSGAGG00000001065	SBNO1	83	83.871	ENSAPOG00000003196	sbno1	96	80.708	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	95.118	ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	91.195	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	82.149	ENSACIG00000008088	sbno1	95	83.764	Amphilophus_citrinellus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	82.716	ENSAOCG00000014859	sbno1	97	74.746	Amphiprion_ocellaris
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	82.716	ENSAPEG00000006069	sbno1	97	74.746	Amphiprion_percula
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	85.172	ENSATEG00000006667	sbno1	95	86.338	Anabas_testudineus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	97.649	ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	95.111	Anas_platyrhynchos
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	96.085	ENSACAG00000015441	SBNO1	88	92.471	Anolis_carolinensis
ENSGAGG00000001065	SBNO1	100	95.118	ENSANAG00000029958	-	100	94.200	Aotus_nancymaae
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	75.258	ENSACLG00000024913	sbno1	98	76.105	Astatotilapia_calliptera
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	86.667	ENSAMXG00000019473	sbno1	95	87.146	Astyanax_mexicanus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	94.384	ENSBTAG00000020505	SBNO1	98	91.661	Bos_taurus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	100	90.961	ENSCJAG00000016599	SBNO1	97	94.662	Callithrix_jacchus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	94.775	ENSCAFG00000007503	SBNO1	100	91.332	Canis_familiaris
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	92.948	ENSCAFG00020015363	SBNO1	100	92.473	Canis_lupus_dingo
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	94.384	ENSCHIG00000008382	SBNO1	98	95.292	Capra_hircus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	95.479	ENSTSYG00000012749	SBNO1	97	94.662	Carlito_syrichta
ENSGAGG00000001065	SBNO1	96	95.118	ENSCAPG00000000384	SBNO1	99	95.144	Cavia_aperea
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	95.118	ENSCPOG00000008109	SBNO1	100	94.803	Cavia_porcellus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	100	86.810	ENSCCAG00000035316	SBNO1	100	86.882	Cebus_capucinus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	98	91.224	ENSCATG00000008239	SBNO1	98	95.324	Cercocebus_atys
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	95.298	ENSCLAG00000008995	SBNO1	100	94.982	Chinchilla_lanigera
ENSGAGG00000001065	SBNO1	84	95.298	ENSCSAG00000002064	SBNO1	100	93.270	Chlorocebus_sabaeus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	95	96.154	ENSCHOG00000008814	SBNO1	93	96.154	Choloepus_hoffmanni
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	99.466	ENSCPBG00000025968	SBNO1	99	98.344	Chrysemys_picta_bellii
ENSGAGG00000001065	SBNO1	100	86.165	ENSCANG00000042688	-	100	86.237	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	100	90.739	ENSCGRG00001017470	Sbno1	100	93.548	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGAGG00000001065	SBNO1	100	90.739	ENSCGRG00000004756	Sbno1	100	93.548	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	83.692	ENSCSEG00000011919	sbno1	94	84.962	Cynoglossus_semilaevis
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	83.513	ENSCVAG00000007038	sbno1	96	83.333	Cyprinodon_variegatus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	85.461	ENSDARG00000099080	sbno1	95	85.767	Danio_rerio
ENSGAGG00000001065	SBNO1	100	88.328	ENSDNOG00000017147	SBNO1	98	90.862	Dasypus_novemcinctus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	94.484	ENSDORG00000015261	Sbno1	99	91.712	Dipodomys_ordii
ENSGAGG00000001065	SBNO1	91	97.826	ENSETEG00000005620	SBNO1	93	84.953	Echinops_telfairi
ENSGAGG00000001065	SBNO1	71	86.207	ENSEBUG00000013823	sbno1	85	86.207	Eptatretus_burgeri
ENSGAGG00000001065	SBNO1	57	85.836	ENSEASG00005012595	-	92	90.653	Equus_asinus_asinus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	94.756	ENSECAG00000006127	SBNO1	100	91.679	Equus_caballus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	76	96.996	ENSEEUG00000003793	SBNO1	79	92.996	Erinaceus_europaeus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	86.871	ENSELUG00000002886	sbno1	96	87.713	Esox_lucius
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	95.109	ENSFCAG00000015331	SBNO1	99	91.529	Felis_catus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	97.468	ENSFALG00000009273	SBNO1	100	94.824	Ficedula_albicollis
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	89.585	ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	89.898	Fukomys_damarensis
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	82.862	ENSFHEG00000007360	sbno1	96	83.704	Fundulus_heteroclitus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	97	77.930	ENSGMOG00000018229	sbno1	93	83.551	Gadus_morhua
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	94.108	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	95.110	Gallus_gallus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	83.216	ENSGAFG00000003960	sbno1	96	84.074	Gambusia_affinis
ENSGAGG00000001065	SBNO1	96	83.244	ENSGACG00000015633	sbno1	98	77.649	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	100	91.373	ENSGGOG00000015000	SBNO1	99	95.161	Gorilla_gorilla
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	69.639	ENSHBUG00000011910	sbno1	98	70.404	Haplochromis_burtoni
ENSGAGG00000001065	SBNO1	100	94.937	ENSHGLG00000014165	-	99	93.972	Heterocephalus_glaber_female
ENSGAGG00000001065	SBNO1	92	87.863	ENSHCOG00000003246	sbno1	95	85.573	Hippocampus_comes
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	87.004	ENSIPUG00000015830	Sbno1	95	91.176	Ictalurus_punctatus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	95.118	ENSSTOG00000023221	SBNO1	100	94.624	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	94.306	ENSJJAG00000001741	Sbno1	100	91.176	Jaculus_jaculus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	76.596	ENSKMAG00000009696	sbno1	98	76.716	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	84.821	ENSLBEG00000007623	sbno1	96	85.185	Labrus_bergylta
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	84.019	ENSLACG00000017227	SBNO1	99	91.710	Latimeria_chalumnae
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	88.889	ENSLOCG00000005725	sbno1	97	82.123	Lepisosteus_oculatus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	94.575	ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	90.459	Loxodonta_africana
ENSGAGG00000001065	SBNO1	100	91.463	ENSMFAG00000031429	SBNO1	100	91.463	Macaca_fascicularis
ENSGAGG00000001065	SBNO1	100	91.529	ENSMMUG00000011496	SBNO1	100	91.529	Macaca_mulatta
ENSGAGG00000001065	SBNO1	95	95.324	ENSMLEG00000033260	SBNO1	100	94.982	Mandrillus_leucophaeus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	83.746	ENSMAMG00000005473	sbno1	95	83.647	Mastacembelus_armatus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	98.011	ENSMGAG00000003274	SBNO1	100	95.392	Meleagris_gallopavo
ENSGAGG00000001065	SBNO1	56	85.776	ENSMAUG00000004834	-	100	90.196	Mesocricetus_auratus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	92.043	ENSMICG00000006573	-	100	91.388	Microcebus_murinus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	100	90.980	ENSMOCG00000009390	Sbno1	100	94.444	Microtus_ochrogaster
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	85.118	ENSMMOG00000008691	sbno1	97	73.333	Mola_mola
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	92.279	ENSMODG00000012470	SBNO1	98	92.595	Monodelphis_domestica
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	83.513	ENSMALG00000001056	sbno1	98	74.320	Monopterus_albus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	91.017	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	97	95.009	Mus_caroli
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	91.240	ENSMUSG00000038095	Sbno1	97	95.009	Mus_musculus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	91.301	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	97	94.812	Mus_pahari
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	91.091	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	97	95.009	Mus_spretus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	95.118	ENSMPUG00000001658	SBNO1	100	91.607	Mustela_putorius_furo
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	94.213	ENSMLUG00000017159	SBNO1	100	91.248	Myotis_lucifugus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	95.298	ENSNGAG00000012620	Sbno1	98	95.136	Nannospalax_galili
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	75.000	ENSNBRG00000019189	sbno1	98	75.841	Neolamprologus_brichardi
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	88.716	ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	89.126	Nomascus_leucogenys
ENSGAGG00000001065	SBNO1	59	95.699	ENSMEUG00000008768	-	93	88.608	Notamacropus_eugenii
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	93.321	ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	88.387	Ochotona_princeps
ENSGAGG00000001065	SBNO1	100	94.937	ENSODEG00000009997	SBNO1	100	94.624	Octodon_degus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	74.179	ENSONIG00000015348	sbno1	98	74.768	Oreochromis_niloticus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	97	93.032	ENSOCUG00000002441	SBNO1	93	91.091	Oryctolagus_cuniculus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	82.155	ENSORLG00000001593	sbno1	96	82.252	Oryzias_latipes
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	74.726	ENSORLG00020015216	sbno1	94	82.963	Oryzias_latipes_hni
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	82.332	ENSORLG00015002726	sbno1	95	83.148	Oryzias_latipes_hsok
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	82.060	ENSOMEG00000019313	sbno1	98	74.709	Oryzias_melastigma
ENSGAGG00000001065	SBNO1	56	82.759	ENSOGAG00000010781	-	100	87.500	Otolemur_garnettii
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	94.384	ENSOARG00000004404	SBNO1	96	94.953	Ovis_aries
ENSGAGG00000001065	SBNO1	100	91.458	ENSPPAG00000024635	SBNO1	99	95.341	Pan_paniscus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	95.109	ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	91.529	Panthera_pardus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	95.118	ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	91.379	Panthera_tigris_altaica
ENSGAGG00000001065	SBNO1	100	91.379	ENSPTRG00000005597	SBNO1	99	95.161	Pan_troglodytes
ENSGAGG00000001065	SBNO1	100	91.385	ENSPANG00000011640	SBNO1	100	94.982	Papio_anubis
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	87.184	ENSPKIG00000001441	sbno1	93	87.713	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGAGG00000001065	SBNO1	100	98.404	ENSPSIG00000009572	-	100	97.063	Pelodiscus_sinensis
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	94.508	ENSPSIG00000009256	-	100	93.843	Pelodiscus_sinensis
ENSGAGG00000001065	SBNO1	100	90.524	ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	93.728	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	92.056	ENSPCIG00000010985	SBNO1	99	92.478	Phascolarctos_cinereus
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	83.039	ENSPFOG00000005069	sbno1	98	75.629	Poecilia_formosa
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	83.039	ENSPLAG00000015015	sbno1	98	75.557	Poecilia_latipinna
ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	83.039	ENSPMEG00000021212	sbno1	98	75.681	Poecilia_mexicana
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