EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSGAGG00000003914 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: AGO2
Alias: CASC7|EIF2C2|LINC00980|Q10|hAGO2
Full Name: argonaute 2%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Gopherus_agassizii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 127719 bases
Position: chrPPEB01003742.1:35302-163020
Accession: 3263
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGAGP00000004780	PAZ	PF02170.22	1e-26	1	1
ENSGAGP00000004775	PAZ	PF02170.22	1e-26	1	1
ENSGAGP00000004761	PAZ	PF02170.22	1.1e-26	1	1
ENSGAGP00000004767	PAZ	PF02170.22	1.1e-26	1	1
ENSGAGP00000004775	Piwi	PF02171.17	6.1e-115	1	1
ENSGAGP00000004780	Piwi	PF02171.17	6.8e-115	1	1
ENSGAGP00000004761	Piwi	PF02171.17	7.5e-115	1	1
ENSGAGP00000004767	Piwi	PF02171.17	7.5e-115	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGAGT00000005598	AGO2-204	2707	-	ENSGAGP00000004780	853 (aa)	-	-
ENSGAGT00000005591	AGO2-203	2407	-	ENSGAGP00000004775	783 (aa)	-	UPI000388E57E
ENSGAGT00000005582	AGO2-202	2750	-	ENSGAGP00000004767	871 (aa)	-	-
ENSGAGT00000005575	AGO2-201	2750	-	ENSGAGP00000004761	871 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	81.566	ENSGAGG00000012887	AGO3	98	80.569
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	84.694	ENSGAGG00000012893	-	100	84.694
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	79.874	ENSGAGG00000012897	AGO4	100	79.874

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.489	ENSG00000123908	AGO2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	94.253	ENSAPOG00000017586	ago2	96	93.452	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.108	ENSAMEG00000005019	AGO2	99	98.950	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGAGG00000003914	AGO2	89	93.813	ENSACIG00000001179	ago2	96	93.813	Amphilophus_citrinellus
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	94.381	ENSAOCG00000015307	ago2	96	93.690	Amphiprion_ocellaris
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	94.381	ENSAPEG00000018425	ago2	96	93.690	Amphiprion_percula
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	94.381	ENSATEG00000000529	ago2	96	93.690	Anabas_testudineus
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.617	ENSAPLG00000010465	AGO2	99	99.415	Anas_platyrhynchos
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.617	ENSACAG00000000167	AGO2	99	98.387	Anolis_carolinensis
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.489	ENSANAG00000027399	AGO2	99	99.068	Aotus_nancymaae
ENSGAGG00000003914	AGO2	88	94.752	ENSACLG00000024684	ago2	98	94.752	Astatotilapia_calliptera
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	94.253	ENSAMXG00000014587	ago2	98	93.571	Astyanax_mexicanus
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.489	ENSBTAG00000001579	AGO2	99	99.065	Bos_taurus
ENSGAGG00000003914	AGO2	99	68.434	WBGene00000106	alg-2	96	66.706	Caenorhabditis_elegans
ENSGAGG00000003914	AGO2	99	68.480	WBGene00000105	alg-1	87	67.010	Caenorhabditis_elegans
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.489	ENSCJAG00000004132	AGO2	99	99.065	Callithrix_jacchus
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.361	ENSCAFG00000001196	AGO2	100	99.386	Canis_familiaris
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.361	ENSCAFG00020014198	AGO2	100	98.608	Canis_lupus_dingo
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.489	ENSCHIG00000010156	AGO2	99	99.171	Capra_hircus
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.361	ENSTSYG00000007281	AGO2	99	98.837	Carlito_syrichta
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	83.036	ENSCAPG00000013707	AGO2	98	84.242	Cavia_aperea
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.489	ENSCPOG00000010428	AGO2	99	99.297	Cavia_porcellus
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.489	ENSCCAG00000035031	AGO2	100	99.297	Cebus_capucinus
ENSGAGG00000003914	AGO2	99	96.811	ENSCATG00000038820	AGO2	100	95.935	Cercocebus_atys
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.489	ENSCLAG00000001381	AGO2	99	99.180	Chinchilla_lanigera
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.489	ENSCSAG00000009574	AGO2	94	99.181	Chlorocebus_sabaeus
ENSGAGG00000003914	AGO2	81	84.633	ENSCHOG00000008938	-	84	84.633	Choloepus_hoffmanni
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	100.000	ENSCPBG00000019183	AGO2	100	99.771	Chrysemys_picta_bellii
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	73.241	ENSCING00000007310	-	98	72.268	Ciona_intestinalis
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	74.055	ENSCSAVG00000005282	-	99	78.806	Ciona_savignyi
ENSGAGG00000003914	AGO2	96	99.599	ENSCANG00000030899	AGO2	99	95.545	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.361	ENSCGRG00001013557	Ago2	100	97.359	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.361	ENSCGRG00000002120	Ago2	100	98.593	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	94.253	ENSCSEG00000012273	ago2	96	93.452	Cynoglossus_semilaevis
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	93.614	ENSCVAG00000008763	ago2	100	92.308	Cyprinodon_variegatus
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	93.997	ENSDARG00000061268	ago2	96	93.349	Danio_rerio
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	97.070	ENSDNOG00000033433	AGO2	100	97.092	Dasypus_novemcinctus
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.361	ENSDORG00000011242	Ago2	100	98.712	Dipodomys_ordii
ENSGAGG00000003914	AGO2	99	76.005	FBgn0262739	AGO1	90	74.239	Drosophila_melanogaster
ENSGAGG00000003914	AGO2	89	88.761	ENSEBUG00000014654	ago2	100	88.761	Eptatretus_burgeri
ENSGAGG00000003914	AGO2	88	86.337	ENSEBUG00000006807	-	100	86.337	Eptatretus_burgeri
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	86.718	ENSEBUG00000011986	-	100	86.279	Eptatretus_burgeri
ENSGAGG00000003914	AGO2	88	86.317	ENSEBUG00000008202	-	99	86.317	Eptatretus_burgeri
ENSGAGG00000003914	AGO2	95	56.983	ENSEBUG00000014681	ago2	99	56.983	Eptatretus_burgeri
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.489	ENSEASG00005021922	AGO2	100	99.509	Equus_asinus_asinus
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.617	ENSECAG00000006078	AGO2	100	98.163	Equus_caballus
ENSGAGG00000003914	AGO2	73	98.592	ENSEEUG00000008564	-	74	98.592	Erinaceus_europaeus
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	93.495	ENSELUG00000019378	ago2	96	92.866	Esox_lucius
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.361	ENSFCAG00000002782	AGO2	100	99.063	Felis_catus
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.745	ENSFALG00000002838	AGO2	99	99.649	Ficedula_albicollis
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.489	ENSFDAG00000004759	AGO2	100	99.297	Fukomys_damarensis
ENSGAGG00000003914	AGO2	96	94.141	ENSFHEG00000016080	ago2	96	93.193	Fundulus_heteroclitus
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	93.487	ENSGMOG00000013651	ago2	98	92.527	Gadus_morhua
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.617	ENSGALG00000040957	AGO2	100	98.393	Gallus_gallus
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	94.253	ENSGAFG00000018026	ago2	97	93.452	Gambusia_affinis
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	93.997	ENSGACG00000006796	ago2	98	93.333	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.489	ENSGGOG00000011412	AGO2	100	99.297	Gorilla_gorilla
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	94.636	ENSHBUG00000018515	ago2	98	94.752	Haplochromis_burtoni
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.489	ENSHGLG00000005548	AGO2	99	99.297	Heterocephalus_glaber_female
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.234	ENSHGLG00100015994	-	99	99.063	Heterocephalus_glaber_male
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	87.995	ENSHGLG00100000694	-	98	88.612	Heterocephalus_glaber_male
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	94.381	ENSHCOG00000006200	ago2	98	93.690	Hippocampus_comes
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	93.870	ENSIPUG00000001018	ago2	98	93.112	Ictalurus_punctatus
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.489	ENSSTOG00000008113	AGO2	100	99.062	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.234	ENSJJAG00000018712	Ago2	99	98.946	Jaculus_jaculus
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	94.253	ENSKMAG00000019999	ago2	98	93.452	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	93.870	ENSLBEG00000005112	ago2	96	93.214	Labrus_bergylta
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	88.422	ENSLACG00000001277	-	98	88.284	Latimeria_chalumnae
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	93.997	ENSLOCG00000007766	ago2	97	93.333	Lepisosteus_oculatus
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.489	ENSLAFG00000012905	AGO2	100	98.946	Loxodonta_africana
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.489	ENSMFAG00000015384	AGO2	100	99.297	Macaca_fascicularis
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.489	ENSMMUG00000008045	AGO2	98	99.297	Macaca_mulatta
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.489	ENSMNEG00000019904	AGO2	99	99.297	Macaca_nemestrina
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.489	ENSMLEG00000038874	AGO2	99	99.297	Mandrillus_leucophaeus
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	94.253	ENSMAMG00000008662	ago2	99	91.320	Mastacembelus_armatus
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	94.636	ENSMZEG00005008998	ago2	98	94.752	Maylandia_zebra
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.489	ENSMGAG00000012942	AGO2	99	99.415	Meleagris_gallopavo
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	90.549	ENSMAUG00000007785	Ago2	99	90.515	Mesocricetus_auratus
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.489	ENSMICG00000004427	AGO2	99	99.182	Microcebus_murinus
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.489	ENSMOCG00000000300	Ago2	100	98.945	Microtus_ochrogaster
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	90.967	ENSMMOG00000020165	ago2	100	90.595	Mola_mola
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	100.000	ENSMODG00000000748	AGO2	100	97.592	Monodelphis_domestica
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	94.253	ENSMALG00000020610	ago2	98	93.452	Monopterus_albus
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.489	MGP_CAROLIEiJ_G0019861	Ago2	100	97.474	Mus_caroli
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.489	ENSMUSG00000036698	Ago2	100	97.474	Mus_musculus
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.234	MGP_PahariEiJ_G0019867	Ago2	100	97.245	Mus_pahari
ENSGAGG00000003914	AGO2	99	99.483	MGP_SPRETEiJ_G0020759	Ago2	99	100.000	Mus_spretus
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.361	ENSMPUG00000001930	AGO2	100	99.063	Mustela_putorius_furo
ENSGAGG00000003914	AGO2	72	87.170	ENSMLUG00000004552	-	100	87.170	Myotis_lucifugus
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.489	ENSNGAG00000014556	Ago2	99	98.944	Nannospalax_galili
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	94.636	ENSNBRG00000006100	ago2	96	93.929	Neolamprologus_brichardi
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	93.870	ENSNLEG00000001461	AGO2	97	94.035	Nomascus_leucogenys
ENSGAGG00000003914	AGO2	88	85.860	ENSMEUG00000001395	AGO2	86	98.039	Notamacropus_eugenii
ENSGAGG00000003914	AGO2	95	90.629	ENSOPRG00000008795	-	99	86.690	Ochotona_princeps
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.489	ENSODEG00000014145	AGO2	100	99.297	Octodon_degus
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	94.636	ENSONIG00000010747	ago2	96	93.929	Oreochromis_niloticus
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.745	ENSOANG00000007125	AGO2	99	99.302	Ornithorhynchus_anatinus
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	97.446	ENSOCUG00000006066	AGO2	100	97.427	Oryctolagus_cuniculus
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	93.997	ENSORLG00000004615	ago2	98	93.333	Oryzias_latipes
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	93.997	ENSORLG00020003449	ago2	98	93.333	Oryzias_latipes_hni
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	93.997	ENSORLG00015015319	ago2	98	93.333	Oryzias_latipes_hsok
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	94.125	ENSOMEG00000017751	ago2	98	93.452	Oryzias_melastigma
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.489	ENSOGAG00000007933	AGO2	100	99.298	Otolemur_garnettii
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	97.704	ENSOARG00000003763	AGO2	100	97.547	Ovis_aries
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.489	ENSPPAG00000037787	AGO2	100	99.297	Pan_paniscus
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.361	ENSPPRG00000002594	AGO2	99	99.181	Panthera_pardus
ENSGAGG00000003914	AGO2	100	97.957	ENSPTIG00000007438	AGO2	99	97.890	Panthera_tigris_altaica
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ENSGAGG00000003914	AGO2	100	94.381	ENSXMAG00000000787	ago2	97	93.452	Xiphophorus_maculatus