EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGAGG00000004018 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: PELO
Alias: -
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Gopherus_agassizii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3697 bases
Position: chrPPEB01001297.1:97796-101492
Accession: 8829
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGAGP00000004900	eRF1_2	PF03464.15	2.5e-36	1	1
ENSGAGP00000004900	eRF1_3	PF03465.15	6.4e-26	1	1
ENSGAGP00000004900	eRF1_1	PF03463.15	2.1e-52	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGAGT00000005725	PELO-201	2093	-	ENSGAGP00000004900	385 (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.247	ENSG00000152684	PELO	98	93.617	Homo_sapiens
ENSGAGG00000004018	PELO	64	79.352	ENSAPOG00000023700	-	90	79.352	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAGG00000004018	PELO	64	79.352	ENSAPOG00000000616	pelo	90	79.352	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAGG00000004018	PELO	100	79.481	ENSAPOG00000023072	pelo	97	80.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.766	ENSAMEG00000007734	PELO	98	94.149	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGAGG00000004018	PELO	97	75.603	ENSACIG00000014386	pelo	97	79.882	Amphilophus_citrinellus
ENSGAGG00000004018	PELO	100	79.740	ENSAOCG00000023717	pelo	97	80.267	Amphiprion_ocellaris
ENSGAGG00000004018	PELO	100	79.740	ENSAPEG00000011235	pelo	97	80.267	Amphiprion_percula
ENSGAGG00000004018	PELO	100	80.519	ENSATEG00000019550	pelo	97	80.800	Anabas_testudineus
ENSGAGG00000004018	PELO	77	87.584	ENSAPLG00000013265	PELO	97	87.543	Anas_platyrhynchos
ENSGAGG00000004018	PELO	98	91.223	ENSACAG00000004352	PELO	98	91.223	Anolis_carolinensis
ENSGAGG00000004018	PELO	100	94.026	ENSANAG00000014096	PELO	98	94.415	Aotus_nancymaae
ENSGAGG00000004018	PELO	100	79.481	ENSACLG00000010305	pelo	97	80.000	Astatotilapia_calliptera
ENSGAGG00000004018	PELO	97	80.965	ENSAMXG00000020299	pelo	97	80.800	Astyanax_mexicanus
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.506	ENSBTAG00000003268	PELO	97	93.883	Bos_taurus
ENSGAGG00000004018	PELO	98	58.777	WBGene00011280	pelo-1	99	58.777	Caenorhabditis_elegans
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.766	ENSCJAG00000035190	PELO	98	94.149	Callithrix_jacchus
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.766	ENSCAFG00020023234	PELO	98	94.149	Canis_lupus_dingo
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.247	ENSCHIG00000016410	PELO	97	93.617	Capra_hircus
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.247	ENSTSYG00000005203	PELO	98	93.617	Carlito_syrichta
ENSGAGG00000004018	PELO	100	94.026	ENSCPOG00000027406	PELO	98	94.415	Cavia_porcellus
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.766	ENSCCAG00000035600	PELO	98	94.149	Cebus_capucinus
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.506	ENSCATG00000011829	PELO	98	93.883	Cercocebus_atys
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.506	ENSCLAG00000005043	PELO	98	93.883	Chinchilla_lanigera
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.506	ENSCSAG00000016692	PELO	98	93.883	Chlorocebus_sabaeus
ENSGAGG00000004018	PELO	100	92.987	ENSCHOG00000000523	PELO	98	93.351	Choloepus_hoffmanni
ENSGAGG00000004018	PELO	100	99.481	ENSCPBG00000007544	PELO	100	99.481	Chrysemys_picta_bellii
ENSGAGG00000004018	PELO	97	68.097	ENSCING00000001979	-	98	68.267	Ciona_intestinalis
ENSGAGG00000004018	PELO	100	69.351	ENSCSAVG00000006158	-	98	69.600	Ciona_savignyi
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.506	ENSCANG00000023382	PELO	98	93.883	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGAGG00000004018	PELO	97	91.957	ENSCGRG00001024665	Pelo	98	92.021	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGAGG00000004018	PELO	97	93.298	ENSCGRG00000004570	Pelo	98	93.351	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGAGG00000004018	PELO	100	78.961	ENSCSEG00000008807	pelo	97	79.200	Cynoglossus_semilaevis
ENSGAGG00000004018	PELO	100	81.299	ENSCVAG00000016082	pelo	97	81.867	Cyprinodon_variegatus
ENSGAGG00000004018	PELO	100	81.818	ENSDARG00000055477	pelo	97	82.133	Danio_rerio
ENSGAGG00000004018	PELO	100	90.155	ENSDNOG00000036721	PELO	98	90.451	Dasypus_novemcinctus
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.247	ENSDORG00000016689	Pelo	98	93.617	Dipodomys_ordii
ENSGAGG00000004018	PELO	96	66.757	FBgn0011207	pelo	95	66.667	Drosophila_melanogaster
ENSGAGG00000004018	PELO	71	77.193	ENSEBUG00000004955	pelo	95	77.193	Eptatretus_burgeri
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.247	ENSEASG00005013348	PELO	98	93.617	Equus_asinus_asinus
ENSGAGG00000004018	PELO	100	80.260	ENSELUG00000023229	pelo	98	81.408	Esox_lucius
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.247	ENSFCAG00000032341	PELO	98	93.617	Felis_catus
ENSGAGG00000004018	PELO	100	96.883	ENSFALG00000004559	PELO	100	96.883	Ficedula_albicollis
ENSGAGG00000004018	PELO	74	93.662	ENSFDAG00000002076	PELO	88	93.662	Fukomys_damarensis
ENSGAGG00000004018	PELO	100	80.000	ENSFHEG00000009769	pelo	97	80.533	Fundulus_heteroclitus
ENSGAGG00000004018	PELO	98	79.045	ENSGMOG00000005849	pelo	97	79.200	Gadus_morhua
ENSGAGG00000004018	PELO	100	80.260	ENSGAFG00000019350	pelo	97	81.067	Gambusia_affinis
ENSGAGG00000004018	PELO	100	79.740	ENSGACG00000007245	pelo	97	81.319	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.506	ENSGGOG00000012635	PELO	98	93.883	Gorilla_gorilla
ENSGAGG00000004018	PELO	100	79.481	ENSHBUG00000005866	pelo	97	80.000	Haplochromis_burtoni
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.247	ENSHGLG00000005932	PELO	98	93.617	Heterocephalus_glaber_female
ENSGAGG00000004018	PELO	100	90.909	ENSHGLG00100017627	PELO	98	91.223	Heterocephalus_glaber_male
ENSGAGG00000004018	PELO	100	77.143	ENSHCOG00000016782	pelo	97	77.600	Hippocampus_comes
ENSGAGG00000004018	PELO	100	79.481	ENSIPUG00000020627	pelo	97	79.733	Ictalurus_punctatus
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.766	ENSSTOG00000027378	PELO	98	94.149	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGAGG00000004018	PELO	100	90.649	ENSJJAG00000015032	Pelo	98	90.957	Jaculus_jaculus
ENSGAGG00000004018	PELO	100	80.779	ENSKMAG00000021305	pelo	97	81.333	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAGG00000004018	PELO	99	79.948	ENSLBEG00000022399	pelo	98	80.800	Labrus_bergylta
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.506	ENSLAFG00000020551	PELO	98	93.883	Loxodonta_africana
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.506	ENSMFAG00000000651	PELO	98	93.883	Macaca_fascicularis
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.506	ENSMMUG00000039101	PELO	98	93.883	Macaca_mulatta
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.506	ENSMNEG00000035538	PELO	98	93.883	Macaca_nemestrina
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.506	ENSMLEG00000039113	PELO	98	93.883	Mandrillus_leucophaeus
ENSGAGG00000004018	PELO	97	82.038	ENSMAMG00000013260	pelo	97	81.867	Mastacembelus_armatus
ENSGAGG00000004018	PELO	100	79.481	ENSMZEG00005014258	pelo	97	80.000	Maylandia_zebra
ENSGAGG00000004018	PELO	100	92.727	ENSMAUG00000009770	Pelo	98	93.085	Mesocricetus_auratus
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.766	ENSMICG00000044040	PELO	98	94.149	Microcebus_murinus
ENSGAGG00000004018	PELO	100	92.987	ENSMOCG00000017554	Pelo	98	93.351	Microtus_ochrogaster
ENSGAGG00000004018	PELO	100	78.442	ENSMMOG00000001324	pelo	97	79.467	Mola_mola
ENSGAGG00000004018	PELO	100	80.000	ENSMALG00000008194	pelo	97	80.800	Monopterus_albus
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.506	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	98	93.883	Mus_caroli
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.506	ENSMUSG00000042275	Pelo	98	93.883	Mus_musculus
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.766	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	98	94.149	Mus_pahari
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.506	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	98	93.883	Mus_spretus
ENSGAGG00000004018	PELO	100	90.649	ENSMLUG00000024132	PELO	98	90.957	Myotis_lucifugus
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.506	ENSNGAG00000019331	Pelo	98	93.617	Nannospalax_galili
ENSGAGG00000004018	PELO	100	79.481	ENSNBRG00000011799	pelo	97	80.000	Neolamprologus_brichardi
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.506	ENSNLEG00000035970	PELO	98	93.883	Nomascus_leucogenys
ENSGAGG00000004018	PELO	100	92.208	ENSMEUG00000005468	PELO	98	92.553	Notamacropus_eugenii
ENSGAGG00000004018	PELO	98	92.084	ENSOPRG00000018793	PELO	99	92.553	Ochotona_princeps
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.506	ENSODEG00000017579	PELO	98	93.883	Octodon_degus
ENSGAGG00000004018	PELO	96	79.784	ENSONIG00000011511	pelo	97	79.733	Oreochromis_niloticus
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.506	ENSOCUG00000023902	PELO	98	93.883	Oryctolagus_cuniculus
ENSGAGG00000004018	PELO	100	80.779	ENSORLG00000005827	pelo	97	81.333	Oryzias_latipes
ENSGAGG00000004018	PELO	100	81.039	ENSORLG00020016456	pelo	97	81.600	Oryzias_latipes_hni
ENSGAGG00000004018	PELO	100	81.299	ENSORLG00015014447	pelo	97	81.867	Oryzias_latipes_hsok
ENSGAGG00000004018	PELO	100	82.597	ENSOMEG00000021567	pelo	97	82.933	Oryzias_melastigma
ENSGAGG00000004018	PELO	100	94.545	ENSOGAG00000027940	PELO	98	94.947	Otolemur_garnettii
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.506	ENSOARG00000008324	PELO	97	93.883	Ovis_aries
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.506	ENSPPAG00000038951	PELO	98	93.883	Pan_paniscus
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.247	ENSPPRG00000018800	PELO	98	93.617	Panthera_pardus
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.247	ENSPTIG00000019988	PELO	98	93.617	Panthera_tigris_altaica
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.506	ENSPTRG00000034409	PELO	98	93.883	Pan_troglodytes
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.506	ENSPANG00000010902	PELO	98	93.883	Papio_anubis
ENSGAGG00000004018	PELO	100	82.078	ENSPKIG00000015190	pelo	97	82.933	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGAGG00000004018	PELO	100	98.182	ENSPSIG00000004971	PELO	100	98.182	Pelodiscus_sinensis
ENSGAGG00000004018	PELO	67	75.969	ENSPMGG00000014561	pelo	95	75.969	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGAGG00000004018	PELO	100	92.727	ENSPEMG00000015584	Pelo	98	93.085	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGAGG00000004018	PELO	100	92.208	ENSPCIG00000004880	PELO	98	92.819	Phascolarctos_cinereus
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ENSGAGG00000004018	PELO	100	81.039	ENSPMEG00000016964	pelo	97	81.600	Poecilia_mexicana
ENSGAGG00000004018	PELO	100	81.039	ENSPREG00000023071	pelo	97	81.600	Poecilia_reticulata
ENSGAGG00000004018	PELO	97	93.566	ENSPPYG00000015451	PELO	94	93.617	Pongo_abelii
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.766	ENSPCOG00000021178	PELO	98	94.149	Propithecus_coquereli
ENSGAGG00000004018	PELO	100	79.481	ENSPNYG00000017325	pelo	97	80.000	Pundamilia_nyererei
ENSGAGG00000004018	PELO	97	81.769	ENSPNAG00000012458	pelo	97	81.600	Pygocentrus_nattereri
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.247	ENSRNOG00000061128	Pelo	98	93.617	Rattus_norvegicus
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.506	ENSRBIG00000007299	PELO	98	93.883	Rhinopithecus_bieti
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.506	ENSRROG00000035507	PELO	98	93.883	Rhinopithecus_roxellana
ENSGAGG00000004018	PELO	98	34.115	YNL001W	-	97	34.211	Saccharomyces_cerevisiae
ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.506	ENSSBOG00000036140	PELO	98	93.883	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSGAGG00000004018	PELO	63	92.213	ENSSHAG00000010770	PELO	96	92.766	Sarcophilus_harrisii
ENSGAGG00000004018	PELO	98	82.759	ENSSFOG00015013399	pelo	97	82.933	Scleropages_formosus
ENSGAGG00000004018	PELO	100	80.000	ENSSMAG00000017171	pelo	98	80.319	Scophthalmus_maximus
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