EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSGAGG00000010260 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: REXO4
Alias: XPMC2H|hPMC2
Full Name: REX4 homolog%2C 3'-5' exonuclease
Gene Type: protein_coding
Species: Gopherus_agassizii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6888 bases
Position: chrPPEB01005529.1:5793-12680
Accession: 12820
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGAGP00000013430	RNase_T	PF00929.24	3e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGAGT00000015366	REXO4-201	1336	-	ENSGAGP00000013430	403 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGAGG00000010260	REXO4	98	55.366	ENSG00000148300	REXO4	95	55.854	Homo_sapiens
ENSGAGG00000010260	REXO4	85	55.858	ENSAPOG00000019264	rexo4	83	55.707	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAGG00000010260	REXO4	90	57.600	ENSAMEG00000011649	REXO4	87	58.152	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGAGG00000010260	REXO4	85	57.345	ENSAOCG00000004087	rexo4	82	57.627	Amphiprion_ocellaris
ENSGAGG00000010260	REXO4	85	57.062	ENSAPEG00000009106	rexo4	82	57.345	Amphiprion_percula
ENSGAGG00000010260	REXO4	85	57.263	ENSATEG00000017662	rexo4	82	57.263	Anabas_testudineus
ENSGAGG00000010260	REXO4	83	67.463	ENSAPLG00000005865	REXO4	99	67.463	Anas_platyrhynchos
ENSGAGG00000010260	REXO4	100	54.306	ENSANAG00000028404	REXO4	87	57.105	Aotus_nancymaae
ENSGAGG00000010260	REXO4	85	55.707	ENSACLG00000006007	rexo4	82	55.163	Astatotilapia_calliptera
ENSGAGG00000010260	REXO4	86	55.402	ENSAMXG00000013291	rexo4	82	55.402	Astyanax_mexicanus
ENSGAGG00000010260	REXO4	86	55.495	ENSBTAG00000019721	REXO4	85	55.769	Bos_taurus
ENSGAGG00000010260	REXO4	99	54.106	ENSCJAG00000009774	REXO4	97	54.458	Callithrix_jacchus
ENSGAGG00000010260	REXO4	91	52.897	ENSCAFG00000019767	REXO4	86	55.228	Canis_familiaris
ENSGAGG00000010260	REXO4	91	53.149	ENSCAFG00020000983	-	83	55.228	Canis_lupus_dingo
ENSGAGG00000010260	REXO4	90	56.183	ENSCHIG00000009517	REXO4	85	57.939	Capra_hircus
ENSGAGG00000010260	REXO4	98	55.693	ENSTSYG00000027492	REXO4	95	55.693	Carlito_syrichta
ENSGAGG00000010260	REXO4	67	61.818	ENSCAPG00000014583	REXO4	80	62.182	Cavia_aperea
ENSGAGG00000010260	REXO4	84	53.846	ENSCPOG00000001386	REXO4	83	53.804	Cavia_porcellus
ENSGAGG00000010260	REXO4	98	50.000	ENSCCAG00000027049	REXO4	95	50.000	Cebus_capucinus
ENSGAGG00000010260	REXO4	98	54.390	ENSCATG00000028646	REXO4	95	54.878	Cercocebus_atys
ENSGAGG00000010260	REXO4	61	66.400	ENSCLAG00000006919	REXO4	74	66.800	Chinchilla_lanigera
ENSGAGG00000010260	REXO4	98	54.567	ENSCSAG00000015280	REXO4	95	54.878	Chlorocebus_sabaeus
ENSGAGG00000010260	REXO4	100	90.385	ENSCPBG00000021152	REXO4	100	90.144	Chrysemys_picta_bellii
ENSGAGG00000010260	REXO4	53	57.477	ENSCING00000010751	-	76	57.477	Ciona_intestinalis
ENSGAGG00000010260	REXO4	98	55.231	ENSCANG00000029855	REXO4	95	55.718	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGAGG00000010260	REXO4	85	55.899	ENSCGRG00001013126	Rexo4	81	55.899	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGAGG00000010260	REXO4	85	55.899	ENSCGRG00000009819	Rexo4	84	55.742	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGAGG00000010260	REXO4	85	55.241	ENSCSEG00000019343	rexo4	81	55.524	Cynoglossus_semilaevis
ENSGAGG00000010260	REXO4	85	52.161	ENSCVAG00000014963	rexo4	83	52.161	Cyprinodon_variegatus
ENSGAGG00000010260	REXO4	86	54.039	ENSDARG00000088619	rexo4	81	72.936	Danio_rerio
ENSGAGG00000010260	REXO4	98	49.785	ENSDNOG00000002429	REXO4	94	53.261	Dasypus_novemcinctus
ENSGAGG00000010260	REXO4	70	61.592	ENSDORG00000006190	Rexo4	82	61.592	Dipodomys_ordii
ENSGAGG00000010260	REXO4	85	57.062	ENSECAG00000007896	REXO4	77	57.022	Equus_caballus
ENSGAGG00000010260	REXO4	86	52.846	ENSELUG00000003539	rexo4	83	53.514	Esox_lucius
ENSGAGG00000010260	REXO4	86	56.546	ENSFCAG00000011652	REXO4	80	56.667	Felis_catus
ENSGAGG00000010260	REXO4	87	64.187	ENSFALG00000001520	REXO4	88	63.934	Ficedula_albicollis
ENSGAGG00000010260	REXO4	98	52.300	ENSFDAG00000016050	REXO4	84	55.525	Fukomys_damarensis
ENSGAGG00000010260	REXO4	85	55.523	ENSFHEG00000002413	rexo4	84	53.297	Fundulus_heteroclitus
ENSGAGG00000010260	REXO4	54	60.731	ENSGMOG00000012876	rexo4	66	60.731	Gadus_morhua
ENSGAGG00000010260	REXO4	67	48.921	ENSGAFG00000015404	-	83	49.281	Gambusia_affinis
ENSGAGG00000010260	REXO4	85	57.637	ENSGACG00000008065	rexo4	80	57.637	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAGG00000010260	REXO4	98	55.122	ENSGGOG00000014508	REXO4	95	55.610	Gorilla_gorilla
ENSGAGG00000010260	REXO4	85	55.163	ENSHBUG00000000542	rexo4	82	54.620	Haplochromis_burtoni
ENSGAGG00000010260	REXO4	98	50.962	ENSHGLG00000016901	REXO4	96	50.835	Heterocephalus_glaber_female
ENSGAGG00000010260	REXO4	98	50.962	ENSHGLG00100017444	REXO4	96	50.835	Heterocephalus_glaber_male
ENSGAGG00000010260	REXO4	55	63.636	ENSHCOG00000018196	rexo4	57	63.636	Hippocampus_comes
ENSGAGG00000010260	REXO4	85	54.830	ENSIPUG00000021084	rexo4	81	55.114	Ictalurus_punctatus
ENSGAGG00000010260	REXO4	97	54.321	ENSSTOG00000003754	REXO4	82	58.571	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGAGG00000010260	REXO4	84	56.303	ENSJJAG00000013002	Rexo4	79	57.143	Jaculus_jaculus
ENSGAGG00000010260	REXO4	85	56.131	ENSKMAG00000015039	rexo4	82	56.131	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAGG00000010260	REXO4	85	55.899	ENSLBEG00000025570	rexo4	81	55.899	Labrus_bergylta
ENSGAGG00000010260	REXO4	91	58.466	ENSLACG00000012399	REXO4	87	58.760	Latimeria_chalumnae
ENSGAGG00000010260	REXO4	95	55.584	ENSLOCG00000003577	rexo4	84	56.216	Lepisosteus_oculatus
ENSGAGG00000010260	REXO4	91	52.208	ENSLAFG00000011274	REXO4	92	52.344	Loxodonta_africana
ENSGAGG00000010260	REXO4	98	54.878	ENSMFAG00000042425	REXO4	95	55.366	Macaca_fascicularis
ENSGAGG00000010260	REXO4	98	54.722	ENSMMUG00000000935	REXO4	95	55.366	Macaca_mulatta
ENSGAGG00000010260	REXO4	98	56.145	ENSMNEG00000031604	REXO4	95	56.627	Macaca_nemestrina
ENSGAGG00000010260	REXO4	98	54.634	ENSMLEG00000037716	REXO4	95	55.122	Mandrillus_leucophaeus
ENSGAGG00000010260	REXO4	86	53.482	ENSMAMG00000011251	rexo4	86	52.703	Mastacembelus_armatus
ENSGAGG00000010260	REXO4	85	56.358	ENSMZEG00005012336	rexo4	82	55.435	Maylandia_zebra
ENSGAGG00000010260	REXO4	86	66.389	ENSMGAG00000006521	REXO4	99	66.389	Meleagris_gallopavo
ENSGAGG00000010260	REXO4	84	56.534	ENSMAUG00000015137	Rexo4	81	56.022	Mesocricetus_auratus
ENSGAGG00000010260	REXO4	85	55.096	ENSMICG00000008422	REXO4	83	55.096	Microcebus_murinus
ENSGAGG00000010260	REXO4	84	56.620	ENSMOCG00000020607	Rexo4	79	56.620	Microtus_ochrogaster
ENSGAGG00000010260	REXO4	88	59.838	ENSMODG00000012817	REXO4	86	59.838	Monodelphis_domestica
ENSGAGG00000010260	REXO4	85	54.696	ENSMALG00000019705	rexo4	81	54.696	Monopterus_albus
ENSGAGG00000010260	REXO4	84	57.020	MGP_CAROLIEiJ_G0023332	-	83	57.020	Mus_caroli
ENSGAGG00000010260	REXO4	84	56.322	ENSMUSG00000052406	Rexo4	84	55.807	Mus_musculus
ENSGAGG00000010260	REXO4	84	55.620	MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	83	55.966	Mus_pahari
ENSGAGG00000010260	REXO4	84	57.020	MGP_SPRETEiJ_G0024249	-	84	57.020	Mus_spretus
ENSGAGG00000010260	REXO4	80	56.342	ENSMPUG00000012315	REXO4	93	56.342	Mustela_putorius_furo
ENSGAGG00000010260	REXO4	97	53.117	ENSNGAG00000010700	Rexo4	85	56.742	Nannospalax_galili
ENSGAGG00000010260	REXO4	85	55.495	ENSNBRG00000011712	rexo4	82	55.495	Neolamprologus_brichardi
ENSGAGG00000010260	REXO4	85	58.640	ENSNLEG00000013130	-	96	55.231	Nomascus_leucogenys
ENSGAGG00000010260	REXO4	82	56.851	ENSNLEG00000007556	-	84	56.851	Nomascus_leucogenys
ENSGAGG00000010260	REXO4	85	47.472	ENSMEUG00000006513	-	85	46.761	Notamacropus_eugenii
ENSGAGG00000010260	REXO4	61	66.135	ENSODEG00000015721	REXO4	71	66.135	Octodon_degus
ENSGAGG00000010260	REXO4	88	53.562	ENSONIG00000020052	rexo4	82	54.496	Oreochromis_niloticus
ENSGAGG00000010260	REXO4	90	60.789	ENSOANG00000002453	REXO4	97	60.789	Ornithorhynchus_anatinus
ENSGAGG00000010260	REXO4	99	50.935	ENSORLG00000006904	rexo4	82	55.041	Oryzias_latipes
ENSGAGG00000010260	REXO4	99	52.195	ENSORLG00020013768	rexo4	82	56.215	Oryzias_latipes_hni
ENSGAGG00000010260	REXO4	99	52.439	ENSORLG00015012070	rexo4	82	56.215	Oryzias_latipes_hsok
ENSGAGG00000010260	REXO4	99	53.448	ENSOMEG00000018327	rexo4	84	56.164	Oryzias_melastigma
ENSGAGG00000010260	REXO4	93	53.927	ENSOGAG00000014040	REXO4	85	55.618	Otolemur_garnettii
ENSGAGG00000010260	REXO4	98	54.878	ENSPPAG00000027911	REXO4	95	55.366	Pan_paniscus
ENSGAGG00000010260	REXO4	96	53.750	ENSPPRG00000002894	REXO4	85	57.303	Panthera_pardus
ENSGAGG00000010260	REXO4	91	47.644	ENSPTIG00000012007	REXO4	82	49.171	Panthera_tigris_altaica
ENSGAGG00000010260	REXO4	98	54.878	ENSPTRG00000023363	REXO4	95	55.366	Pan_troglodytes
ENSGAGG00000010260	REXO4	98	54.634	ENSPANG00000026040	REXO4	95	55.122	Papio_anubis
ENSGAGG00000010260	REXO4	99	52.323	ENSPKIG00000024761	rexo4	83	56.657	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGAGG00000010260	REXO4	99	83.092	ENSPSIG00000016908	REXO4	99	82.850	Pelodiscus_sinensis
ENSGAGG00000010260	REXO4	86	53.134	ENSPMGG00000005312	rexo4	84	52.381	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGAGG00000010260	REXO4	96	51.621	ENSPEMG00000017982	Rexo4	85	55.307	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGAGG00000010260	REXO4	99	55.083	ENSPCIG00000017379	REXO4	87	58.245	Phascolarctos_cinereus
ENSGAGG00000010260	REXO4	85	54.391	ENSPFOG00000017751	rexo4	84	54.366	Poecilia_formosa
ENSGAGG00000010260	REXO4	85	54.674	ENSPLAG00000010487	rexo4	83	54.648	Poecilia_latipinna
ENSGAGG00000010260	REXO4	85	53.890	ENSPMEG00000020767	rexo4	84	54.802	Poecilia_mexicana
ENSGAGG00000010260	REXO4	85	52.909	ENSPREG00000021841	rexo4	82	55.429	Poecilia_reticulata
ENSGAGG00000010260	REXO4	98	54.878	ENSPPYG00000019735	REXO4	95	55.366	Pongo_abelii
ENSGAGG00000010260	REXO4	91	51.724	ENSPCAG00000010581	REXO4	86	52.762	Procavia_capensis
ENSGAGG00000010260	REXO4	85	55.586	ENSPCOG00000025466	REXO4	83	55.586	Propithecus_coquereli
ENSGAGG00000010260	REXO4	90	50.263	ENSPVAG00000001429	REXO4	86	51.630	Pteropus_vampyrus
ENSGAGG00000010260	REXO4	85	55.163	ENSPNYG00000013712	rexo4	82	54.620	Pundamilia_nyererei
ENSGAGG00000010260	REXO4	88	53.846	ENSPNAG00000019227	rexo4	82	53.743	Pygocentrus_nattereri
ENSGAGG00000010260	REXO4	85	55.966	ENSRNOG00000027867	Rexo4	85	55.966	Rattus_norvegicus
ENSGAGG00000010260	REXO4	98	54.878	ENSRBIG00000037515	REXO4	95	54.878	Rhinopithecus_bieti
ENSGAGG00000010260	REXO4	98	54.634	ENSRROG00000028864	REXO4	95	54.634	Rhinopithecus_roxellana
ENSGAGG00000010260	REXO4	98	45.700	ENSSBOG00000032587	REXO4	94	44.307	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSGAGG00000010260	REXO4	86	60.278	ENSSHAG00000005827	REXO4	90	60.278	Sarcophilus_harrisii
ENSGAGG00000010260	REXO4	55	74.208	ENSSFOG00015017394	rexo4	61	74.208	Scleropages_formosus
ENSGAGG00000010260	REXO4	99	52.555	ENSSMAG00000015441	rexo4	81	56.022	Scophthalmus_maximus
ENSGAGG00000010260	REXO4	85	54.972	ENSSDUG00000023346	rexo4	80	54.972	Seriola_dumerili
ENSGAGG00000010260	REXO4	85	57.507	ENSSLDG00000011085	rexo4	81	57.507	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSGAGG00000010260	REXO4	99	70.024	ENSSPUG00000015868	REXO4	98	69.784	Sphenodon_punctatus
ENSGAGG00000010260	REXO4	85	56.374	ENSSPAG00000007221	rexo4	82	56.374	Stegastes_partitus
ENSGAGG00000010260	REXO4	98	52.542	ENSSSCG00000023173	REXO4	84	55.372	Sus_scrofa
ENSGAGG00000010260	REXO4	86	65.833	ENSTGUG00000005537	REXO4	91	65.847	Taeniopygia_guttata
ENSGAGG00000010260	REXO4	86	56.354	ENSTRUG00000013225	rexo4	86	56.354	Takifugu_rubripes
ENSGAGG00000010260	REXO4	86	57.022	ENSTNIG00000005873	rexo4	96	56.780	Tetraodon_nigroviridis
ENSGAGG00000010260	REXO4	90	58.268	ENSUAMG00000018676	REXO4	85	58.824	Ursus_americanus
ENSGAGG00000010260	REXO4	84	54.062	ENSUMAG00000023164	REXO4	93	54.062	Ursus_maritimus
ENSGAGG00000010260	REXO4	91	53.401	ENSVVUG00000027337	REXO4	83	55.496	Vulpes_vulpes
ENSGAGG00000010260	REXO4	79	52.134	ENSXETG00000023096	rexo4	88	54.430	Xenopus_tropicalis
ENSGAGG00000010260	REXO4	85	53.258	ENSXMAG00000013686	rexo4	86	53.824	Xiphophorus_maculatus