EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGAGG00000010347 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: APOBEC2
Alias: ARCD1|ARP1
Full Name: apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 2
Gene Type: protein_coding
Species: Gopherus_agassizii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9049 bases
Position: chrPPEB01005533.1:14732-23780
Accession: 605
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGAGP00000013543	APOBEC_N	PF08210.11	2.1e-50	1	1
ENSGAGP00000013543	APOBEC_C	PF05240.14	1.6e-25	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGAGT00000015504	APOBEC2-201	1597	-	ENSGAGP00000013543	221 (aa)	-	-

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	71	36.364	ENSGAGG00000011838	-	83	34.884
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	71	36.364	ENSGAGG00000011839	-	83	34.884

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	75.943	ENSG00000124701	APOBEC2	83	80.214	Homo_sapiens
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	96	55.189	ENSAPOG00000019390	apobec2b	67	57.838	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	80	73.743	ENSAMEG00000004467	APOBEC2	66	73.653	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	99	52.018	ENSACIG00000002472	APOBEC2	75	57.297	Amphilophus_citrinellus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	82	56.044	ENSACIG00000016370	apobec2a	63	56.970	Amphilophus_citrinellus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	96	55.189	ENSAOCG00000023355	apobec2b	67	57.838	Amphiprion_ocellaris
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	96	50.472	ENSAOCG00000003291	apobec2a	74	55.135	Amphiprion_ocellaris
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	96	55.189	ENSAPEG00000004591	apobec2b	67	57.838	Amphiprion_percula
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	96	50.472	ENSAPEG00000003630	apobec2a	74	55.135	Amphiprion_percula
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	85	56.684	ENSATEG00000000956	apobec2a	99	56.111	Anabas_testudineus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	98	50.885	ENSATEG00000023043	APOBEC2	67	56.216	Anabas_testudineus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	99	78.027	ENSAPLG00000002895	APOBEC2	97	77.578	Anas_platyrhynchos
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	85	74.603	ENSACAG00000016506	APOBEC2	89	77.246	Anolis_carolinensis
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	76.415	ENSANAG00000026993	APOBEC2	83	80.749	Aotus_nancymaae
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	80	50.847	ENSACLG00000026736	-	90	50.909	Astatotilapia_calliptera
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	91	55.224	ENSACLG00000007634	APOBEC2	67	57.297	Astatotilapia_calliptera
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	87	51.020	ENSAMXG00000042992	apobec2a	73	53.439	Astyanax_mexicanus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	99	52.252	ENSAMXG00000015966	apobec2b	66	58.511	Astyanax_mexicanus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	74.528	ENSBTAG00000005974	APOBEC2	60	77.540	Bos_taurus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	76.887	ENSCJAG00000004063	APOBEC2	83	80.749	Callithrix_jacchus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	74.528	ENSCAFG00000001575	APOBEC2	83	78.610	Canis_familiaris
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	75.000	ENSCAFG00020008306	APOBEC2	83	79.144	Canis_lupus_dingo
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	75.472	ENSCHIG00000026348	APOBEC2	83	79.144	Capra_hircus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	75.472	ENSTSYG00000008206	APOBEC2	82	80.214	Carlito_syrichta
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	73.113	ENSCAPG00000015084	APOBEC2	82	77.540	Cavia_aperea
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	73.113	ENSCPOG00000036103	APOBEC2	82	77.540	Cavia_porcellus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	76.415	ENSCCAG00000033987	APOBEC2	83	80.749	Cebus_capucinus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	93	76.329	ENSCATG00000010691	APOBEC2	83	79.679	Cercocebus_atys
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	74.057	ENSCLAG00000013817	APOBEC2	82	78.610	Chinchilla_lanigera
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	75.472	ENSCSAG00000011177	APOBEC2	83	79.679	Chlorocebus_sabaeus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	80	77.654	ENSCHOG00000008930	APOBEC2	93	77.844	Choloepus_hoffmanni
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	100	97.285	ENSCPBG00000017469	APOBEC2	100	97.285	Chrysemys_picta_bellii
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	75.000	ENSCANG00000035072	APOBEC2	83	79.144	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	99	71.749	ENSCGRG00001014983	Apobec2	83	79.144	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	99	71.749	ENSCGRG00000007835	Apobec2	83	79.144	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	85	57.219	ENSCSEG00000000690	-	68	56.989	Cynoglossus_semilaevis
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	87	58.031	ENSCSEG00000020201	apobec2a	73	58.602	Cynoglossus_semilaevis
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	97	54.884	ENSCVAG00000012342	apobec2b	68	60.541	Cyprinodon_variegatus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	87	58.031	ENSDARG00000018881	apobec2a	68	58.602	Danio_rerio
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	99	55.157	ENSDARG00000113992	apobec2b	67	58.824	Danio_rerio
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	87	53.000	ENSDNOG00000033914	APOBEC2	84	52.604	Dasypus_novemcinctus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	75.943	ENSDORG00000006447	Apobec2	82	80.214	Dipodomys_ordii
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	73.239	ENSETEG00000000624	APOBEC2	82	76.596	Echinops_telfairi
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	86	68.229	ENSEASG00005002937	APOBEC2	81	76.923	Equus_asinus_asinus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	99	70.404	ENSECAG00000006576	APOBEC2	83	78.075	Equus_caballus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	71.226	ENSEEUG00000006046	APOBEC2	83	75.936	Erinaceus_europaeus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	84	52.688	ENSELUG00000003736	apobec2a	64	52.432	Esox_lucius
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	99	69.955	ENSFCAG00000004108	APOBEC2	83	78.075	Felis_catus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	100	64.574	ENSFALG00000003910	APOBEC2	100	64.574	Ficedula_albicollis
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	73.585	ENSFDAG00000006015	APOBEC2	83	78.075	Fukomys_damarensis
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	84	59.140	ENSFHEG00000005492	apobec2b	77	58.919	Fundulus_heteroclitus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	81	57.865	ENSGMOG00000007028	apobec2a	93	57.831	Gadus_morhua
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	85	51.872	ENSGMOG00000006819	apobec2b	74	51.892	Gadus_morhua
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	100	78.125	ENSGALG00000003226	APOBEC2	100	77.232	Gallus_gallus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	84	59.677	ENSGAFG00000007634	apobec2b	59	59.459	Gambusia_affinis
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	89	55.330	ENSGACG00000009663	apobec2b	80	56.216	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	85	56.150	ENSGACG00000011671	apobec2a	97	55.914	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	75.943	ENSGGOG00000001099	APOBEC2	81	80.214	Gorilla_gorilla
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	91	54.229	ENSHBUG00000005993	apobec2b	67	56.757	Haplochromis_burtoni
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	84	56.452	ENSHBUG00000015890	apobec2a	73	56.216	Haplochromis_burtoni
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	74.057	ENSHGLG00000017169	APOBEC2	82	78.610	Heterocephalus_glaber_female
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	74.057	ENSHGLG00100019442	APOBEC2	82	78.610	Heterocephalus_glaber_male
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	84	57.527	ENSHCOG00000002712	APOBEC2	68	57.297	Hippocampus_comes
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	85	54.545	ENSHCOG00000020319	apobec2a	75	54.301	Hippocampus_comes
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	89	55.000	ENSIPUG00000017355	apobec2a	53	56.915	Ictalurus_punctatus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	85	57.143	ENSIPUG00000013784	Apobec2	69	56.915	Ictalurus_punctatus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	99	71.749	ENSSTOG00000023643	APOBEC2	83	80.214	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	72.170	ENSJJAG00000009733	Apobec2	83	75.401	Jaculus_jaculus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	99	51.818	ENSKMAG00000020631	apobec2b	69	56.989	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	99	52.511	ENSLBEG00000009422	-	64	57.838	Labrus_bergylta
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	96	52.093	ENSLBEG00000025214	apobec2a	76	55.914	Labrus_bergylta
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	99	63.274	ENSLACG00000015985	APOBEC2	79	68.649	Latimeria_chalumnae
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	91	60.891	ENSLOCG00000012415	apobec2b	66	62.366	Lepisosteus_oculatus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	75.000	ENSLAFG00000016563	APOBEC2	83	78.610	Loxodonta_africana
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	75.472	ENSMFAG00000044645	APOBEC2	83	79.679	Macaca_fascicularis
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	75.472	ENSMMUG00000021171	APOBEC2	83	79.679	Macaca_mulatta
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	75.472	ENSMNEG00000045497	APOBEC2	83	79.679	Macaca_nemestrina
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	75.472	ENSMLEG00000028328	APOBEC2	83	79.679	Mandrillus_leucophaeus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	97	53.211	ENSMAMG00000023685	apobec2a	72	56.989	Mastacembelus_armatus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	98	52.995	ENSMAMG00000007926	APOBEC2	66	57.297	Mastacembelus_armatus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	84	55.914	ENSMZEG00005005240	-	84	54.967	Maylandia_zebra
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	91	55.224	ENSMZEG00005027159	APOBEC2	67	57.838	Maylandia_zebra
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	100	77.679	ENSMGAG00000010173	APOBEC2	97	77.232	Meleagris_gallopavo
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	99	72.000	ENSMAUG00000011016	Apobec2	83	78.610	Mesocricetus_auratus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	99	69.507	ENSMICG00000043339	APOBEC2	83	77.540	Microcebus_murinus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	73.585	ENSMOCG00000001904	Apobec2	83	77.540	Microtus_ochrogaster
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	52.830	ENSMMOG00000008681	apobec2b	68	55.135	Mola_mola
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	100	72.646	ENSMODG00000013090	APOBEC2	100	72.197	Monodelphis_domestica
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	84	54.839	ENSMALG00000013779	APOBEC2	71	54.595	Monopterus_albus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	85	55.080	ENSMALG00000020523	apobec2a	74	54.839	Monopterus_albus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	74.057	MGP_CAROLIEiJ_G0021727	Apobec2	83	78.075	Mus_caroli
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	74.528	ENSMUSG00000040694	Apobec2	83	78.610	Mus_musculus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	74.528	MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	83	78.610	Mus_pahari
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	73.113	ENSMPUG00000013691	APOBEC2	80	77.005	Mustela_putorius_furo
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	74.057	ENSMLUG00000011327	APOBEC2	81	78.075	Myotis_lucifugus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	75.943	ENSNGAG00000013717	Apobec2	83	79.679	Nannospalax_galili
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	85	56.684	ENSNBRG00000021776	apobec2a	73	56.757	Neolamprologus_brichardi
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	91	55.721	ENSNBRG00000018806	apobec2b	60	58.378	Neolamprologus_brichardi
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	75.943	ENSNLEG00000005057	APOBEC2	83	80.214	Nomascus_leucogenys
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	100	71.300	ENSMEUG00000011623	APOBEC2	100	70.852	Notamacropus_eugenii
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	94	75.120	ENSOPRG00000014808	APOBEC2	82	79.144	Ochotona_princeps
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	72.642	ENSODEG00000016183	APOBEC2	82	77.005	Octodon_degus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	92	55.122	ENSONIG00000004644	-	73	57.297	Oreochromis_niloticus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	91	55.721	ENSONIG00000012289	apobec2b	67	58.378	Oreochromis_niloticus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	76	81.548	ENSOANG00000000824	APOBEC2	87	81.410	Ornithorhynchus_anatinus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	96	74.299	ENSOCUG00000028008	APOBEC2	82	79.679	Oryctolagus_cuniculus
ENSGAGG00000010347	APOBEC2	84	56.989	ENSORLG00000022372	APOBEC2	68	56.757	Oryzias_latipes
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ENSGAGG00000010347	APOBEC2	84	57.527	ENSORLG00020006164	APOBEC2	68	57.297	Oryzias_latipes_hni
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