EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGAGG00000010670 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Gopherus_agassizii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4724 bases
Position: chrPPEB01000477.1:402846-407569
Accession: 19824
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGAGP00000014011	SYF2	PF08231.12	3.7e-55	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGAGT00000016034	SYF2-201	1247	-	ENSGAGP00000014011	248 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSGAGG00000010670's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSGAGG00000010670's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGAGG00000010670	SYF2	94	87.554	ENSG00000117614	SYF2	92	89.732	Homo_sapiens
ENSGAGG00000010670	SYF2	91	85.333	ENSAPOG00000001174	syf2	94	85.333	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAGG00000010670	SYF2	79	89.231	ENSAMEG00000010134	-	100	89.231	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGAGG00000010670	SYF2	98	83.539	ENSAMEG00000010115	-	91	90.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGAGG00000010670	SYF2	94	80.342	ENSACIG00000023688	syf2	89	82.222	Amphilophus_citrinellus
ENSGAGG00000010670	SYF2	98	80.645	ENSAOCG00000022046	syf2	95	85.778	Amphiprion_ocellaris
ENSGAGG00000010670	SYF2	87	82.273	ENSAOCG00000010912	syf2	64	84.615	Amphiprion_ocellaris
ENSGAGG00000010670	SYF2	98	80.645	ENSAPEG00000018858	syf2	86	85.778	Amphiprion_percula
ENSGAGG00000010670	SYF2	88	85.253	ENSATEG00000007745	syf2	94	84.000	Anabas_testudineus
ENSGAGG00000010670	SYF2	81	92.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	92.000	Anas_platyrhynchos
ENSGAGG00000010670	SYF2	82	92.647	ENSACAG00000013653	-	100	92.647	Anolis_carolinensis
ENSGAGG00000010670	SYF2	67	79.641	ENSACAG00000026777	-	94	78.981	Anolis_carolinensis
ENSGAGG00000010670	SYF2	94	87.554	ENSANAG00000032473	SYF2	93	89.333	Aotus_nancymaae
ENSGAGG00000010670	SYF2	91	81.778	ENSACLG00000019916	syf2	94	81.778	Astatotilapia_calliptera
ENSGAGG00000010670	SYF2	94	79.747	ENSAMXG00000004051	syf2	93	82.883	Astyanax_mexicanus
ENSGAGG00000010670	SYF2	97	85.062	ENSBTAG00000001651	SYF2	95	88.889	Bos_taurus
ENSGAGG00000010670	SYF2	84	52.857	WBGene00019402	syf-2	90	52.607	Caenorhabditis_elegans
ENSGAGG00000010670	SYF2	87	90.278	ENSCJAG00000046570	SYF2	92	89.732	Callithrix_jacchus
ENSGAGG00000010670	SYF2	87	89.815	ENSCAFG00000012895	-	91	88.889	Canis_familiaris
ENSGAGG00000010670	SYF2	91	80.088	ENSCAFG00000030331	-	96	80.088	Canis_familiaris
ENSGAGG00000010670	SYF2	73	80.769	ENSCAFG00020021094	-	83	87.821	Canis_lupus_dingo
ENSGAGG00000010670	SYF2	87	89.815	ENSCAFG00020021091	-	91	88.889	Canis_lupus_dingo
ENSGAGG00000010670	SYF2	97	85.892	ENSCHIG00000020874	SYF2	98	85.477	Capra_hircus
ENSGAGG00000010670	SYF2	94	85.897	ENSTSYG00000005114	SYF2	92	88.341	Carlito_syrichta
ENSGAGG00000010670	SYF2	80	89.394	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	89.394	Cavia_aperea
ENSGAGG00000010670	SYF2	92	87.773	ENSCPOG00000005326	SYF2	92	88.839	Cavia_porcellus
ENSGAGG00000010670	SYF2	94	87.983	ENSCCAG00000022459	SYF2	93	89.778	Cebus_capucinus
ENSGAGG00000010670	SYF2	93	87.013	ENSCATG00000026917	SYF2	92	88.393	Cercocebus_atys
ENSGAGG00000010670	SYF2	92	89.520	ENSCLAG00000008474	SYF2	92	90.625	Chinchilla_lanigera
ENSGAGG00000010670	SYF2	92	87.719	ENSCSAG00000000948	SYF2	92	88.839	Chlorocebus_sabaeus
ENSGAGG00000010670	SYF2	71	70.621	ENSCHOG00000005273	-	93	72.189	Choloepus_hoffmanni
ENSGAGG00000010670	SYF2	100	98.790	ENSCPBG00000025073	SYF2	100	98.790	Chrysemys_picta_bellii
ENSGAGG00000010670	SYF2	85	54.673	ENSCING00000003017	-	89	54.206	Ciona_intestinalis
ENSGAGG00000010670	SYF2	85	51.869	ENSCSAVG00000006627	-	98	51.869	Ciona_savignyi
ENSGAGG00000010670	SYF2	93	77.489	ENSCANG00000037322	SYF2	91	78.571	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGAGG00000010670	SYF2	99	82.996	ENSCGRG00001020733	Syf2	99	82.591	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGAGG00000010670	SYF2	79	88.265	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	87.940	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGAGG00000010670	SYF2	88	79.358	ENSCSEG00000000117	syf2	96	76.957	Cynoglossus_semilaevis
ENSGAGG00000010670	SYF2	89	83.710	ENSCVAG00000019543	syf2	92	83.710	Cyprinodon_variegatus
ENSGAGG00000010670	SYF2	94	81.435	ENSDARG00000004706	syf2	97	82.174	Danio_rerio
ENSGAGG00000010670	SYF2	94	88.362	ENSDNOG00000047605	SYF2	91	90.179	Dasypus_novemcinctus
ENSGAGG00000010670	SYF2	94	86.752	ENSDORG00000001274	Syf2	92	89.732	Dipodomys_ordii
ENSGAGG00000010670	SYF2	92	58.261	FBgn0033556	CG12343	98	58.850	Drosophila_melanogaster
ENSGAGG00000010670	SYF2	88	73.516	ENSETEG00000015729	SYF2	92	75.238	Echinops_telfairi
ENSGAGG00000010670	SYF2	79	60.914	ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.914	Eptatretus_burgeri
ENSGAGG00000010670	SYF2	100	84.800	ENSEASG00005004224	-	100	84.000	Equus_asinus_asinus
ENSGAGG00000010670	SYF2	94	78.970	ENSEASG00005004232	-	93	80.804	Equus_asinus_asinus
ENSGAGG00000010670	SYF2	98	85.597	ENSECAG00000010440	-	93	90.583	Equus_caballus
ENSGAGG00000010670	SYF2	97	86.722	ENSECAG00000012023	-	91	90.625	Equus_caballus
ENSGAGG00000010670	SYF2	69	76.301	ENSEEUG00000015084	SYF2	89	78.395	Erinaceus_europaeus
ENSGAGG00000010670	SYF2	94	83.051	ENSELUG00000003465	syf2	93	86.425	Esox_lucius
ENSGAGG00000010670	SYF2	95	87.288	ENSFCAG00000043095	-	91	89.823	Felis_catus
ENSGAGG00000010670	SYF2	92	89.474	ENSFCAG00000010324	-	78	90.222	Felis_catus
ENSGAGG00000010670	SYF2	82	88.725	ENSFALG00000000460	SYF2	90	86.667	Ficedula_albicollis
ENSGAGG00000010670	SYF2	92	87.773	ENSFDAG00000008310	SYF2	92	88.839	Fukomys_damarensis
ENSGAGG00000010670	SYF2	90	69.196	ENSFHEG00000007238	syf2	99	69.196	Fundulus_heteroclitus
ENSGAGG00000010670	SYF2	87	84.651	ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.651	Gadus_morhua
ENSGAGG00000010670	SYF2	91	91.556	ENSGALG00000013639	SYF2	89	91.556	Gallus_gallus
ENSGAGG00000010670	SYF2	95	78.298	ENSGAFG00000019435	syf2	94	80.889	Gambusia_affinis
ENSGAGG00000010670	SYF2	87	83.721	ENSGACG00000007305	syf2	90	83.721	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAGG00000010670	SYF2	94	87.124	ENSGGOG00000012796	SYF2	92	89.286	Gorilla_gorilla
ENSGAGG00000010670	SYF2	94	79.915	ENSHBUG00000020477	syf2	96	81.778	Haplochromis_burtoni
ENSGAGG00000010670	SYF2	92	88.646	ENSHGLG00000014393	SYF2	92	89.732	Heterocephalus_glaber_female
ENSGAGG00000010670	SYF2	90	77.232	ENSHGLG00000004304	-	94	75.446	Heterocephalus_glaber_female
ENSGAGG00000010670	SYF2	92	88.646	ENSHGLG00100014722	SYF2	92	89.732	Heterocephalus_glaber_male
ENSGAGG00000010670	SYF2	94	78.903	ENSHCOG00000012904	syf2	73	82.432	Hippocampus_comes
ENSGAGG00000010670	SYF2	93	82.174	ENSIPUG00000019859	syf2	92	83.636	Ictalurus_punctatus
ENSGAGG00000010670	SYF2	59	86.986	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	86.986	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGAGG00000010670	SYF2	80	89.447	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	89.447	Jaculus_jaculus
ENSGAGG00000010670	SYF2	94	80.591	ENSKMAG00000013856	syf2	97	81.739	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAGG00000010670	SYF2	88	85.388	ENSLBEG00000014425	syf2	94	84.305	Labrus_bergylta
ENSGAGG00000010670	SYF2	95	82.203	ENSLACG00000012064	SYF2	92	87.615	Latimeria_chalumnae
ENSGAGG00000010670	SYF2	94	83.262	ENSLOCG00000002728	syf2	89	85.202	Lepisosteus_oculatus
ENSGAGG00000010670	SYF2	93	87.879	ENSLAFG00000023150	-	91	89.732	Loxodonta_africana
ENSGAGG00000010670	SYF2	74	63.784	ENSLAFG00000030814	-	100	63.784	Loxodonta_africana
ENSGAGG00000010670	SYF2	93	87.446	ENSMFAG00000041831	SYF2	92	88.839	Macaca_fascicularis
ENSGAGG00000010670	SYF2	94	86.266	ENSMMUG00000002968	SYF2	92	88.393	Macaca_mulatta
ENSGAGG00000010670	SYF2	93	87.446	ENSMNEG00000030180	SYF2	92	88.839	Macaca_nemestrina
ENSGAGG00000010670	SYF2	93	87.013	ENSMLEG00000030248	SYF2	92	88.393	Mandrillus_leucophaeus
ENSGAGG00000010670	SYF2	88	83.871	ENSMAMG00000010403	syf2	93	82.667	Mastacembelus_armatus
ENSGAGG00000010670	SYF2	94	79.747	ENSMZEG00005006429	syf2	94	81.778	Maylandia_zebra
ENSGAGG00000010670	SYF2	80	92.462	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	92.462	Meleagris_gallopavo
ENSGAGG00000010670	SYF2	92	87.719	ENSMAUG00000018974	Syf2	93	88.444	Mesocricetus_auratus
ENSGAGG00000010670	SYF2	80	89.447	ENSMICG00000016191	SYF2	100	89.447	Microcebus_murinus
ENSGAGG00000010670	SYF2	92	88.158	ENSMOCG00000022938	Syf2	93	88.889	Microtus_ochrogaster
ENSGAGG00000010670	SYF2	95	80.085	ENSMMOG00000002396	syf2	93	82.883	Mola_mola
ENSGAGG00000010670	SYF2	90	87.168	ENSMODG00000013951	-	99	87.168	Monodelphis_domestica
ENSGAGG00000010670	SYF2	96	81.092	ENSMALG00000010706	syf2	93	83.628	Monopterus_albus
ENSGAGG00000010670	SYF2	92	87.719	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	93	88.444	Mus_caroli
ENSGAGG00000010670	SYF2	92	87.719	ENSMUSG00000028821	Syf2	93	88.444	Mus_musculus
ENSGAGG00000010670	SYF2	92	87.719	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	93	88.444	Mus_pahari
ENSGAGG00000010670	SYF2	92	87.719	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	93	88.444	Mus_spretus
ENSGAGG00000010670	SYF2	87	89.815	ENSMPUG00000015802	-	91	89.286	Mustela_putorius_furo
ENSGAGG00000010670	SYF2	100	82.400	ENSMPUG00000015801	-	100	82.400	Mustela_putorius_furo
ENSGAGG00000010670	SYF2	97	85.477	ENSMLUG00000001885	SYF2	92	89.286	Myotis_lucifugus
ENSGAGG00000010670	SYF2	95	86.441	ENSNGAG00000007912	Syf2	91	90.135	Nannospalax_galili
ENSGAGG00000010670	SYF2	96	70.293	ENSNBRG00000010720	syf2	93	72.444	Neolamprologus_brichardi
ENSGAGG00000010670	SYF2	94	87.124	ENSNLEG00000035185	SYF2	92	89.286	Nomascus_leucogenys
ENSGAGG00000010670	SYF2	93	88.312	ENSOPRG00000012870	SYF2	93	88.938	Ochotona_princeps
ENSGAGG00000010670	SYF2	92	87.336	ENSODEG00000017664	-	94	88.839	Octodon_degus
ENSGAGG00000010670	SYF2	96	76.891	ENSODEG00000014338	-	93	80.357	Octodon_degus
ENSGAGG00000010670	SYF2	91	81.778	ENSONIG00000008213	syf2	94	81.778	Oreochromis_niloticus
ENSGAGG00000010670	SYF2	81	91.584	ENSOANG00000009552	SYF2	100	91.584	Ornithorhynchus_anatinus
ENSGAGG00000010670	SYF2	94	88.841	ENSOCUG00000013050	SYF2	92	91.071	Oryctolagus_cuniculus
ENSGAGG00000010670	SYF2	94	79.915	ENSORLG00000028820	syf2	95	82.883	Oryzias_latipes
ENSGAGG00000010670	SYF2	98	77.686	ENSORLG00020018333	syf2	94	82.883	Oryzias_latipes_hni
ENSGAGG00000010670	SYF2	98	78.099	ENSORLG00015014665	syf2	92	83.945	Oryzias_latipes_hsok
ENSGAGG00000010670	SYF2	94	81.857	ENSOMEG00000013911	syf2	93	84.234	Oryzias_melastigma
ENSGAGG00000010670	SYF2	99	83.806	ENSOGAG00000009962	SYF2	92	89.732	Otolemur_garnettii
ENSGAGG00000010670	SYF2	79	62.051	ENSOARG00000006269	-	100	62.051	Ovis_aries
ENSGAGG00000010670	SYF2	97	84.774	ENSOARG00000006348	-	92	88.546	Ovis_aries
ENSGAGG00000010670	SYF2	94	87.124	ENSPPAG00000036579	SYF2	92	89.286	Pan_paniscus
ENSGAGG00000010670	SYF2	95	87.288	ENSPPRG00000001651	-	91	89.823	Panthera_pardus
ENSGAGG00000010670	SYF2	92	89.474	ENSPPRG00000001638	-	91	90.222	Panthera_pardus
ENSGAGG00000010670	SYF2	87	90.741	ENSPTIG00000005711	-	81	89.686	Panthera_tigris_altaica
ENSGAGG00000010670	SYF2	95	86.864	ENSPTIG00000007036	-	91	89.732	Panthera_tigris_altaica
ENSGAGG00000010670	SYF2	94	87.124	ENSPTRG00000000352	SYF2	92	89.286	Pan_troglodytes
ENSGAGG00000010670	SYF2	93	87.446	ENSPANG00000008139	SYF2	92	88.839	Papio_anubis
ENSGAGG00000010670	SYF2	99	78.947	ENSPKIG00000008130	syf2	94	84.615	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGAGG00000010670	SYF2	98	90.234	ENSPSIG00000011816	SYF2	88	96.903	Pelodiscus_sinensis
ENSGAGG00000010670	SYF2	95	78.814	ENSPMGG00000008755	syf2	87	81.614	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGAGG00000010670	SYF2	92	87.719	ENSPEMG00000008283	Syf2	93	88.444	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGAGG00000010670	SYF2	90	91.964	ENSPCIG00000014235	SYF2	90	91.964	Phascolarctos_cinereus
ENSGAGG00000010670	SYF2	94	79.828	ENSPFOG00000004116	syf2	92	81.778	Poecilia_formosa
ENSGAGG00000010670	SYF2	94	79.828	ENSPLAG00000006691	syf2	96	81.778	Poecilia_latipinna
ENSGAGG00000010670	SYF2	95	76.596	ENSPMEG00000011684	syf2	96	78.667	Poecilia_mexicana
ENSGAGG00000010670	SYF2	87	83.333	ENSPREG00000003009	syf2	94	81.166	Poecilia_reticulata
ENSGAGG00000010670	SYF2	93	87.879	ENSPPYG00000001713	SYF2	92	89.286	Pongo_abelii
ENSGAGG00000010670	SYF2	94	60.515	ENSPCOG00000027011	SYF2	89	61.161	Propithecus_coquereli
ENSGAGG00000010670	SYF2	94	77.586	ENSPVAG00000005841	SYF2	91	79.464	Pteropus_vampyrus
ENSGAGG00000010670	SYF2	91	81.778	ENSPNYG00000004979	syf2	94	81.778	Pundamilia_nyererei
ENSGAGG00000010670	SYF2	94	82.278	ENSPNAG00000015570	syf2	93	85.135	Pygocentrus_nattereri
ENSGAGG00000010670	SYF2	92	87.719	ENSRNOG00000060597	Syf2	93	88.444	Rattus_norvegicus
ENSGAGG00000010670	SYF2	93	84.848	ENSRBIG00000042970	SYF2	92	86.161	Rhinopithecus_bieti
ENSGAGG00000010670	SYF2	93	87.446	ENSRROG00000001347	SYF2	92	88.839	Rhinopithecus_roxellana
ENSGAGG00000010670	SYF2	93	87.879	ENSSBOG00000020184	SYF2	93	89.333	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSGAGG00000010670	SYF2	83	90.777	ENSSHAG00000007152	-	100	90.777	Sarcophilus_harrisii
ENSGAGG00000010670	SYF2	90	91.518	ENSSHAG00000015630	-	90	91.518	Sarcophilus_harrisii
ENSGAGG00000010670	SYF2	90	83.929	ENSSFOG00015023647	syf2	95	83.929	Scleropages_formosus
ENSGAGG00000010670	SYF2	95	79.574	ENSSMAG00000009867	syf2	93	82.432	Scophthalmus_maximus
ENSGAGG00000010670	SYF2	88	83.945	ENSSDUG00000013072	syf2	92	83.945	Seriola_dumerili
ENSGAGG00000010670	SYF2	88	83.945	ENSSLDG00000012677	syf2	92	83.945	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSGAGG00000010670	SYF2	94	68.534	ENSSARG00000012889	SYF2	92	70.222	Sorex_araneus
ENSGAGG00000010670	SYF2	98	89.024	ENSSPUG00000005251	SYF2	97	88.618	Sphenodon_punctatus
ENSGAGG00000010670	SYF2	94	80.169	ENSSPAG00000009626	syf2	93	82.883	Stegastes_partitus
ENSGAGG00000010670	SYF2	97	84.647	ENSSSCG00000037481	SYF2	92	88.889	Sus_scrofa
ENSGAGG00000010670	SYF2	60	61.589	ENSTGUG00000001126	SYF2	85	61.765	Taeniopygia_guttata
ENSGAGG00000010670	SYF2	96	80.169	ENSTRUG00000001499	syf2	89	82.432	Takifugu_rubripes
ENSGAGG00000010670	SYF2	90	80.269	ENSTNIG00000016912	syf2	100	80.269	Tetraodon_nigroviridis
ENSGAGG00000010670	SYF2	92	67.686	ENSTBEG00000017370	SYF2	90	67.857	Tupaia_belangeri
ENSGAGG00000010670	SYF2	99	84.211	ENSTTRG00000003550	SYF2	92	89.778	Tursiops_truncatus
ENSGAGG00000010670	SYF2	94	86.266	ENSUAMG00000002897	SYF2	92	88.053	Ursus_americanus
ENSGAGG00000010670	SYF2	87	89.352	ENSUMAG00000013108	SYF2	92	88.496	Ursus_maritimus
ENSGAGG00000010670	SYF2	99	82.661	ENSVPAG00000005705	SYF2	91	88.739	Vicugna_pacos
ENSGAGG00000010670	SYF2	83	88.780	ENSVVUG00000027181	-	94	81.781	Vulpes_vulpes
ENSGAGG00000010670	SYF2	87	89.815	ENSVVUG00000027175	-	91	88.889	Vulpes_vulpes
ENSGAGG00000010670	SYF2	95	83.475	ENSXETG00000022797	syf2	90	85.778	Xenopus_tropicalis
ENSGAGG00000010670	SYF2	87	84.186	ENSXMAG00000022698	syf2	94	81.778	Xiphophorus_maculatus