EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGAGG00000012893 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Gopherus_agassizii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 26485 bases
Position: chrPPEB01000113.1:375187-401671
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGAGP00000017314	PAZ	PF02170.22	1.3e-28	1	1
ENSGAGP00000017314	Piwi	PF02171.17	1.2e-110	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGAGT00000019756	-	2604	-	ENSGAGP00000017314	782 (aa)	-	UPI0002C86C38

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSGAGG00000012893	-	100	84.694	ENSGAGG00000003914	AGO2	100	84.694
ENSGAGG00000012893	-	100	85.588	ENSGAGG00000012887	AGO3	92	85.588
ENSGAGG00000012893	-	100	84.131	ENSGAGG00000012897	AGO4	100	84.131

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSG00000092847	AGO1	100	99.872	Homo_sapiens
ENSGAGG00000012893	-	100	97.059	ENSAPOG00000024299	ago1	96	97.977	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSAMEG00000000504	AGO1	91	99.872	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGAGG00000012893	-	90	92.023	ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	Amphilophus_citrinellus
ENSGAGG00000012893	-	100	97.059	ENSAOCG00000017727	ago1	91	97.059	Amphiprion_ocellaris
ENSGAGG00000012893	-	100	97.059	ENSAPEG00000004458	ago1	92	97.059	Amphiprion_percula
ENSGAGG00000012893	-	100	97.059	ENSATEG00000008523	ago1	91	97.059	Anabas_testudineus
ENSGAGG00000012893	-	100	93.384	ENSAPLG00000010440	AGO1	90	93.384	Anas_platyrhynchos
ENSGAGG00000012893	-	100	100.000	ENSACAG00000029174	AGO1	100	100.000	Anolis_carolinensis
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSANAG00000037711	AGO1	91	99.872	Aotus_nancymaae
ENSGAGG00000012893	-	100	96.931	ENSACLG00000000890	ago1	100	92.092	Astatotilapia_calliptera
ENSGAGG00000012893	-	88	98.542	ENSAMXG00000001917	ago1	98	98.542	Astyanax_mexicanus
ENSGAGG00000012893	-	100	99.744	ENSBTAG00000012253	AGO1	91	99.744	Bos_taurus
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSCJAG00000032023	AGO1	91	99.872	Callithrix_jacchus
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSCAFG00000003443	AGO1	91	99.872	Canis_familiaris
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSCAFG00020009251	AGO1	92	99.872	Canis_lupus_dingo
ENSGAGG00000012893	-	100	99.361	ENSCHIG00000011848	-	92	98.475	Capra_hircus
ENSGAGG00000012893	-	100	78.645	ENSTSYG00000032426	-	99	79.429	Carlito_syrichta
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSTSYG00000009767	-	92	99.872	Carlito_syrichta
ENSGAGG00000012893	-	77	99.180	ENSCAPG00000010228	AGO1	84	98.387	Cavia_aperea
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSCPOG00000011568	AGO1	91	99.872	Cavia_porcellus
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSCCAG00000011823	AGO1	91	99.872	Cebus_capucinus
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSCATG00000031521	AGO1	100	99.872	Cercocebus_atys
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSCLAG00000011507	AGO1	92	99.872	Chinchilla_lanigera
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSCSAG00000001091	AGO1	91	99.872	Chlorocebus_sabaeus
ENSGAGG00000012893	-	85	94.574	ENSCHOG00000011591	AGO1	78	94.574	Choloepus_hoffmanni
ENSGAGG00000012893	-	100	100.000	ENSCPBG00000018594	AGO1	91	100.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSCANG00000039798	AGO1	91	99.872	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSCGRG00001022708	Ago1	91	99.872	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSCGRG00000010386	Ago1	92	99.872	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGAGG00000012893	-	100	95.232	ENSCSEG00000001051	ago1	92	95.232	Cynoglossus_semilaevis
ENSGAGG00000012893	-	100	97.059	ENSCVAG00000018173	ago1	91	97.059	Cyprinodon_variegatus
ENSGAGG00000012893	-	100	97.187	ENSDARG00000092644	ago1	91	97.187	Danio_rerio
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	99.872	Dasypus_novemcinctus
ENSGAGG00000012893	-	92	99.007	ENSDORG00000008494	Ago1	92	99.007	Dipodomys_ordii
ENSGAGG00000012893	-	83	92.415	ENSETEG00000007626	AGO1	90	92.415	Echinops_telfairi
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSEASG00005012086	AGO1	91	99.872	Equus_asinus_asinus
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSECAG00000024353	AGO1	91	99.872	Equus_caballus
ENSGAGG00000012893	-	100	91.432	ENSEEUG00000005349	AGO1	91	91.432	Erinaceus_europaeus
ENSGAGG00000012893	-	100	96.931	ENSELUG00000016803	ago1	100	96.931	Esox_lucius
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSFCAG00000000746	AGO1	91	99.872	Felis_catus
ENSGAGG00000012893	-	100	92.219	ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	Ficedula_albicollis
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSFDAG00000017210	AGO1	91	99.872	Fukomys_damarensis
ENSGAGG00000012893	-	96	97.326	ENSFHEG00000017927	ago1	90	97.326	Fundulus_heteroclitus
ENSGAGG00000012893	-	96	84.513	ENSGMOG00000019413	ago1	100	84.513	Gadus_morhua
ENSGAGG00000012893	-	100	100.000	ENSGALG00000002249	AGO1	91	100.000	Gallus_gallus
ENSGAGG00000012893	-	100	97.059	ENSGAFG00000009775	ago1	91	97.059	Gambusia_affinis
ENSGAGG00000012893	-	96	97.071	ENSGACG00000012443	ago1	100	97.071	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSGGOG00000003316	AGO1	91	99.872	Gorilla_gorilla
ENSGAGG00000012893	-	100	96.931	ENSHBUG00000010459	ago1	100	92.092	Haplochromis_burtoni
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSHGLG00000011540	AGO1	91	99.872	Heterocephalus_glaber_female
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSHGLG00100005568	AGO1	91	99.872	Heterocephalus_glaber_male
ENSGAGG00000012893	-	100	97.059	ENSHCOG00000005708	ago1	92	97.059	Hippocampus_comes
ENSGAGG00000012893	-	100	96.803	ENSIPUG00000023216	ago1	100	92.720	Ictalurus_punctatus
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSSTOG00000010857	AGO1	91	99.872	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSJJAG00000019449	Ago1	91	99.872	Jaculus_jaculus
ENSGAGG00000012893	-	100	97.059	ENSKMAG00000019464	ago1	91	97.059	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAGG00000012893	-	100	97.059	ENSLBEG00000007694	ago1	97	94.032	Labrus_bergylta
ENSGAGG00000012893	-	100	93.367	ENSLACG00000017009	AGO1	92	93.367	Latimeria_chalumnae
ENSGAGG00000012893	-	100	94.373	ENSLOCG00000000504	AGO1	91	94.373	Lepisosteus_oculatus
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSLAFG00000010835	AGO1	92	99.872	Loxodonta_africana
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSMFAG00000002846	AGO1	91	99.872	Macaca_fascicularis
ENSGAGG00000012893	-	100	94.885	ENSMMUG00000006251	AGO1	93	94.757	Macaca_mulatta
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	99.872	Macaca_nemestrina
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSMLEG00000038388	AGO1	91	99.872	Mandrillus_leucophaeus
ENSGAGG00000012893	-	100	97.059	ENSMAMG00000008381	ago1	99	95.349	Mastacembelus_armatus
ENSGAGG00000012893	-	100	96.931	ENSMZEG00005007996	ago1	100	92.092	Maylandia_zebra
ENSGAGG00000012893	-	100	94.170	ENSMGAG00000003822	AGO1	92	94.170	Meleagris_gallopavo
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSMAUG00000015189	Ago1	91	99.872	Mesocricetus_auratus
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSMICG00000016147	AGO1	91	99.872	Microcebus_murinus
ENSGAGG00000012893	-	100	99.744	ENSMOCG00000000537	Ago1	91	99.744	Microtus_ochrogaster
ENSGAGG00000012893	-	86	98.657	ENSMMOG00000018459	ago1	93	98.657	Mola_mola
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSMODG00000023335	AGO1	91	99.872	Monodelphis_domestica
ENSGAGG00000012893	-	100	96.931	ENSMALG00000011057	ago1	93	96.675	Monopterus_albus
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	99.458	Mus_caroli
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	99.458	Mus_musculus
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	99.458	Mus_pahari
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	99.458	Mus_spretus
ENSGAGG00000012893	-	92	100.000	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSGAGG00000012893	-	58	99.341	ENSMLUG00000009628	AGO1	87	99.341	Myotis_lucifugus
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSNGAG00000017448	Ago1	92	99.872	Nannospalax_galili
ENSGAGG00000012893	-	100	96.931	ENSNBRG00000010867	ago1	100	96.931	Neolamprologus_brichardi
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSNLEG00000011181	AGO1	91	99.872	Nomascus_leucogenys
ENSGAGG00000012893	-	91	100.000	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSGAGG00000012893	-	92	100.000	ENSOPRG00000012325	AGO1	84	100.000	Ochotona_princeps
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSODEG00000005321	AGO1	91	99.872	Octodon_degus
ENSGAGG00000012893	-	100	96.931	ENSONIG00000016345	ago1	92	96.931	Oreochromis_niloticus
ENSGAGG00000012893	-	100	90.404	ENSOANG00000002080	AGO1	91	91.465	Ornithorhynchus_anatinus
ENSGAGG00000012893	-	100	99.744	ENSOCUG00000023116	AGO1	91	99.744	Oryctolagus_cuniculus
ENSGAGG00000012893	-	100	97.059	ENSORLG00000014965	ago1	91	97.059	Oryzias_latipes
ENSGAGG00000012893	-	100	97.059	ENSORLG00020018253	ago1	91	97.059	Oryzias_latipes_hni
ENSGAGG00000012893	-	100	97.059	ENSORLG00015003287	ago1	91	97.059	Oryzias_latipes_hsok
ENSGAGG00000012893	-	100	97.059	ENSOMEG00000020528	ago1	91	97.059	Oryzias_melastigma
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSOGAG00000010279	AGO1	91	99.872	Otolemur_garnettii
ENSGAGG00000012893	-	100	99.744	ENSOARG00000019591	AGO1	91	99.744	Ovis_aries
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSPPAG00000034838	AGO1	91	99.872	Pan_paniscus
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSPPRG00000006475	AGO1	91	99.872	Panthera_pardus
ENSGAGG00000012893	-	100	99.616	ENSPTIG00000020991	AGO1	91	99.616	Panthera_tigris_altaica
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSPTRG00000000528	AGO1	91	99.872	Pan_troglodytes
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSPANG00000009060	AGO1	91	99.872	Papio_anubis
ENSGAGG00000012893	-	100	99.107	ENSPSIG00000017482	AGO1	93	99.107	Pelodiscus_sinensis
ENSGAGG00000012893	-	88	97.384	ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSPEMG00000023313	Ago1	91	99.872	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSPCIG00000000172	AGO1	91	99.872	Phascolarctos_cinereus
ENSGAGG00000012893	-	100	97.059	ENSPFOG00000005867	ago1	91	97.059	Poecilia_formosa
ENSGAGG00000012893	-	100	97.059	ENSPLAG00000002824	ago1	99	98.119	Poecilia_latipinna
ENSGAGG00000012893	-	100	97.059	ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	Poecilia_mexicana
ENSGAGG00000012893	-	100	97.059	ENSPREG00000006534	ago1	91	97.059	Poecilia_reticulata
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSPPYG00000001551	AGO1	91	99.872	Pongo_abelii
ENSGAGG00000012893	-	53	100.000	ENSPCAG00000005604	AGO1	55	100.000	Procavia_capensis
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSPCOG00000022061	AGO1	100	99.872	Propithecus_coquereli
ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	ENSPVAG00000005082	AGO1	91	99.872	Pteropus_vampyrus
ENSGAGG00000012893	-	100	92.092	ENSPNYG00000012586	ago1	100	92.092	Pundamilia_nyererei
ENSGAGG00000012893	-	95	92.112	ENSPNAG00000000597	ago1	93	92.112	Pygocentrus_nattereri
ENSGAGG00000012893	-	100	99.744	ENSRNOG00000055915	Ago1	91	99.744	Rattus_norvegicus
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ENSGAGG00000012893	-	100	97.059	ENSSLDG00000000386	ago1	91	97.059	Seriola_lalandi_dorsalis
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