EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGAGG00000012897 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: AGO4
Alias: EIF2C4|FLJ20033|KIAA1567|hAGO4
Full Name: argonaute 4%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Gopherus_agassizii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 14401 bases
Position: chrPPEB01000113.1:433460-447860
Accession: 18424
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGAGP00000017318	PAZ	PF02170.22	7.6e-28	1	1
ENSGAGP00000017318	Piwi	PF02171.17	2.7e-105	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGAGT00000019761	AGO4-201	3498	-	ENSGAGP00000017318	794 (aa)	-	UPI0000443363

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	81.818	ENSGAGG00000012887	AGO3	92	81.818
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	79.874	ENSGAGG00000003914	AGO2	100	79.874
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	84.131	ENSGAGG00000012893	-	100	84.131

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	ENSG00000134698	AGO4	92	99.496	Homo_sapiens
ENSGAGG00000012897	AGO4	95	96.359	ENSAPOG00000023867	ago4	92	96.359	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	ENSAMEG00000000573	AGO4	92	99.496	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	97.733	ENSACIG00000014548	ago4	100	97.733	Amphilophus_citrinellus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	93.073	ENSAPEG00000022426	ago4	100	93.073	Amphiprion_percula
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	96.398	ENSATEG00000006717	ago4	100	96.398	Anabas_testudineus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	100.000	ENSAPLG00000010882	AGO4	94	100.000	Anas_platyrhynchos
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	98.615	ENSACAG00000017275	AGO4	92	98.615	Anolis_carolinensis
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.370	ENSANAG00000031428	AGO4	92	99.370	Aotus_nancymaae
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	96.398	ENSACLG00000005181	ago4	100	94.710	Astatotilapia_calliptera
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	96.646	ENSAMXG00000010318	ago4	100	96.474	Astyanax_mexicanus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	98.363	ENSBTAG00000015220	AGO4	92	98.363	Bos_taurus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	ENSCJAG00000001610	AGO4	92	99.496	Callithrix_jacchus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	ENSCAFG00000024306	AGO4	100	99.496	Canis_familiaris
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.370	ENSCHIG00000026564	AGO4	92	99.370	Capra_hircus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	ENSTSYG00000014007	AGO4	93	99.496	Carlito_syrichta
ENSGAGG00000012897	AGO4	93	98.939	ENSCAPG00000009369	AGO4	92	98.939	Cavia_aperea
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	97.481	ENSCPOG00000011557	AGO4	92	97.481	Cavia_porcellus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	ENSCCAG00000001397	AGO4	92	99.496	Cebus_capucinus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	ENSCATG00000043421	AGO4	100	99.483	Cercocebus_atys
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.370	ENSCLAG00000012097	AGO4	93	99.370	Chinchilla_lanigera
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	ENSCSAG00000001090	AGO4	92	99.496	Chlorocebus_sabaeus
ENSGAGG00000012897	AGO4	79	100.000	ENSCHOG00000006867	AGO4	74	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	100.000	ENSCPBG00000018602	AGO4	91	100.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	ENSCANG00000016914	AGO4	93	99.496	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	98.992	ENSCGRG00001002701	Ago4	92	98.992	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	98.992	ENSCGRG00000013335	Ago4	93	98.992	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	91.834	ENSCSEG00000010696	ago4	100	91.834	Cynoglossus_semilaevis
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	97.859	ENSDARG00000100854	ago4	92	97.859	Danio_rerio
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	ENSDNOG00000015674	AGO4	92	99.496	Dasypus_novemcinctus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	ENSDORG00000008933	Ago4	92	99.496	Dipodomys_ordii
ENSGAGG00000012897	AGO4	65	99.507	ENSETEG00000018390	AGO4	83	99.507	Echinops_telfairi
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	ENSEASG00005012079	AGO4	92	99.496	Equus_asinus_asinus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	ENSECAG00000024686	AGO4	92	99.496	Equus_caballus
ENSGAGG00000012897	AGO4	78	95.833	ENSEEUG00000000745	AGO4	72	95.833	Erinaceus_europaeus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	96.273	ENSELUG00000023873	ago4	92	96.273	Esox_lucius
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	ENSFCAG00000006218	AGO4	92	99.496	Felis_catus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	ENSFDAG00000021483	AGO4	93	99.496	Fukomys_damarensis
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	88.413	ENSFHEG00000019658	ago4	95	88.413	Fundulus_heteroclitus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	97.733	ENSGMOG00000009544	ago4	92	97.733	Gadus_morhua
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	100.000	ENSGALG00000039713	AGO4	100	100.000	Gallus_gallus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	96.398	ENSGAFG00000017239	ago4	92	96.398	Gambusia_affinis
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	97.733	ENSGACG00000002683	ago4	92	97.733	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	95.849	ENSGGOG00000036532	AGO4	93	95.849	Gorilla_gorilla
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	96.398	ENSHBUG00000001525	ago4	92	96.398	Haplochromis_burtoni
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	ENSHGLG00000010241	AGO4	92	99.496	Heterocephalus_glaber_female
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	ENSHGLG00100005233	AGO4	93	99.496	Heterocephalus_glaber_male
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	96.273	ENSHCOG00000003725	ago4	92	96.273	Hippocampus_comes
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	96.522	ENSIPUG00000015600	ago4	92	96.522	Ictalurus_punctatus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	ENSSTOG00000004725	AGO4	92	99.496	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	96.522	ENSKMAG00000018602	ago4	92	96.522	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	95.684	ENSLBEG00000010670	ago4	92	95.684	Labrus_bergylta
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	98.866	ENSLACG00000016888	AGO4	92	98.866	Latimeria_chalumnae
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	96.522	ENSLOCG00000000584	ago4	92	96.522	Lepisosteus_oculatus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	98.868	ENSLAFG00000010394	AGO4	99	98.868	Loxodonta_africana
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	ENSMFAG00000035543	AGO4	92	99.496	Macaca_fascicularis
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.371	ENSMMUG00000003343	AGO4	100	99.603	Macaca_mulatta
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	ENSMNEG00000037723	AGO4	100	99.603	Macaca_nemestrina
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	ENSMLEG00000039490	AGO4	93	99.496	Mandrillus_leucophaeus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	96.273	ENSMAMG00000003874	ago4	100	96.221	Mastacembelus_armatus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	96.398	ENSMZEG00005026346	ago4	92	96.398	Maylandia_zebra
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.622	ENSMGAG00000003851	AGO4	93	99.622	Meleagris_gallopavo
ENSGAGG00000012897	AGO4	81	100.000	ENSMAUG00000021743	Ago4	87	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.245	ENSMICG00000033507	AGO4	93	99.245	Microcebus_murinus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	98.992	ENSMOCG00000005772	Ago4	92	98.992	Microtus_ochrogaster
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	96.725	ENSMMOG00000013473	ago4	100	96.725	Mola_mola
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.874	ENSMODG00000017888	AGO4	92	99.874	Monodelphis_domestica
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	95.718	ENSMALG00000011797	ago4	92	95.718	Monopterus_albus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	98.489	MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	92	98.489	Mus_caroli
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	98.237	ENSMUSG00000042500	Ago4	92	98.237	Mus_musculus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	97.859	MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	92	97.859	Mus_pahari
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	97.985	MGP_SPRETEiJ_G0027458	Ago4	92	97.985	Mus_spretus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	ENSMPUG00000014876	AGO4	100	99.496	Mustela_putorius_furo
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	98.237	ENSMLUG00000017102	AGO4	91	98.237	Myotis_lucifugus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	ENSNGAG00000020544	Ago4	93	99.496	Nannospalax_galili
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	96.398	ENSNBRG00000013492	ago4	92	96.398	Neolamprologus_brichardi
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	ENSNLEG00000011125	AGO4	93	99.496	Nomascus_leucogenys
ENSGAGG00000012897	AGO4	90	98.868	ENSMEUG00000001023	AGO4	83	98.868	Notamacropus_eugenii
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	91.688	ENSOPRG00000012309	AGO4	93	91.688	Ochotona_princeps
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.370	ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.370	Octodon_degus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	97.229	ENSONIG00000013603	ago4	92	96.398	Oreochromis_niloticus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.874	ENSOANG00000002082	AGO4	100	99.874	Ornithorhynchus_anatinus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.370	ENSOCUG00000004076	AGO4	92	99.370	Oryctolagus_cuniculus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	96.398	ENSORLG00000009865	ago4	85	96.398	Oryzias_latipes
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	96.398	ENSORLG00020016978	ago4	85	96.398	Oryzias_latipes_hni
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	96.398	ENSORLG00015008800	ago4	85	96.398	Oryzias_latipes_hsok
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	96.398	ENSOMEG00000006399	ago4	92	96.398	Oryzias_melastigma
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	98.111	ENSOGAG00000004233	-	99	98.111	Otolemur_garnettii
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	92.065	ENSOGAG00000027107	-	92	92.065	Otolemur_garnettii
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	98.866	ENSOARG00000019568	AGO4	91	98.866	Ovis_aries
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	ENSPPAG00000031752	AGO4	93	99.496	Pan_paniscus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	ENSPPRG00000006520	AGO4	92	99.496	Panthera_pardus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	ENSPTIG00000020262	AGO4	93	99.496	Panthera_tigris_altaica
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	ENSPTRG00000000527	AGO4	92	99.496	Pan_troglodytes
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	ENSPANG00000007232	AGO4	100	99.496	Papio_anubis
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	96.398	ENSPKIG00000022598	ago4	92	96.398	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	100.000	ENSPSIG00000013832	AGO4	92	100.000	Pelodiscus_sinensis
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	97.607	ENSPMGG00000023325	ago4	100	97.607	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	87.940	ENSPEMG00000022651	-	88	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.874	ENSPCIG00000000092	AGO4	92	99.874	Phascolarctos_cinereus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	96.522	ENSPFOG00000001935	ago4	92	96.522	Poecilia_formosa
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	97.859	ENSPLAG00000011534	ago4	98	96.862	Poecilia_latipinna
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	96.522	ENSPMEG00000005049	ago4	92	96.522	Poecilia_mexicana
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	96.522	ENSPREG00000010315	ago4	92	96.522	Poecilia_reticulata
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	ENSPPYG00000001552	AGO4	93	99.496	Pongo_abelii
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.245	ENSPCOG00000015935	AGO4	93	99.245	Propithecus_coquereli
ENSGAGG00000012897	AGO4	87	100.000	ENSPVAG00000005079	AGO4	81	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	96.398	ENSPNYG00000002089	ago4	92	96.398	Pundamilia_nyererei
ENSGAGG00000012897	AGO4	100	97.733	ENSPNAG00000005191	ago4	92	97.733	Pygocentrus_nattereri
ENSGAGG00000012897	AGO4	75	97.990	ENSRNOG00000025596	Ago4	100	97.990	Rattus_norvegicus
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ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	ENSRROG00000035783	AGO4	100	99.496	Rhinopithecus_roxellana
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