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Description

Ensembl ID: ENSGAGG00000013419 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: TNPO1
Alias: IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Gopherus_agassizii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 133219 bases
Position: chrPPEB01000118.1:612684-745902
Accession: 6401
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGAGP00000018114	IBN_N	PF03810.19	4.2e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGAGT00000020651	TNPO1-201	3389	-	ENSGAGP00000018114	890 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSGAGG00000013419	TNPO1	99	87.373	ENSGAGG00000010150	TNPO2	99	87.373

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.528	ENSG00000083312	TNPO1	100	97.927	Homo_sapiens
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	94.157	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	94.157	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	96.659	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	96.659	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGAGG00000013419	TNPO1	87	93.411	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	93.411	Amphilophus_citrinellus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	94.270	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	94.270	Amphiprion_ocellaris
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	94.270	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	94.270	Amphiprion_percula
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	94.045	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	94.045	Anabas_testudineus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	99	93.799	ENSAPLG00000009619	-	99	93.799	Anas_platyrhynchos
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	98.764	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	98.764	Anolis_carolinensis
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	63.193	ENSANAG00000027118	-	99	63.304	Aotus_nancymaae
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.079	ENSANAG00000022453	-	99	97.079	Aotus_nancymaae
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	86.742	ENSANAG00000025351	-	99	86.742	Aotus_nancymaae
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	91.798	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.798	Astatotilapia_calliptera
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	92.713	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.601	Astyanax_mexicanus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.416	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	97.416	Bos_taurus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.191	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	97.191	Callithrix_jacchus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	96	97.433	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	97.433	Canis_familiaris
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	94.831	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	94.831	Canis_lupus_dingo
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.303	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	97.303	Capra_hircus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	99	93.672	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	96.140	Carlito_syrichta
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.079	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	97.079	Cebus_capucinus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.528	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	97.528	Cercocebus_atys
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.303	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	97.303	Chinchilla_lanigera
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.528	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	97.528	Chlorocebus_sabaeus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	94	85.101	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	85.101	Choloepus_hoffmanni
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	99.775	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	99.775	Chrysemys_picta_bellii
ENSGAGG00000013419	TNPO1	99	75.533	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.421	Ciona_savignyi
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.528	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	97.528	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.416	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	97.416	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGAGG00000013419	TNPO1	96	97.544	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	97.544	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	93.146	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	93.146	Cynoglossus_semilaevis
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	93.820	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.820	Cyprinodon_variegatus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	93.266	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.593	Danio_rerio
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	91.489	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	91.489	Dasypus_novemcinctus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	93	97.470	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	97.467	Dipodomys_ordii
ENSGAGG00000013419	TNPO1	99	58.014	FBgn0035693	CG8219	99	57.901	Drosophila_melanogaster
ENSGAGG00000013419	TNPO1	86	98.876	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	98.876	Echinops_telfairi
ENSGAGG00000013419	TNPO1	94	85.238	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.357	Eptatretus_burgeri
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.528	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	97.528	Equus_asinus_asinus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.416	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	97.416	Equus_caballus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	87.146	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.492	Esox_lucius
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.528	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	97.528	Felis_catus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	99.438	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	99.438	Ficedula_albicollis
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.191	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	97.191	Fukomys_damarensis
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	94.164	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	94.164	Fundulus_heteroclitus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	90.594	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	90.594	Gadus_morhua
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	98.315	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	98.315	Gallus_gallus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	93.049	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	93.049	Gambusia_affinis
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	93.146	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.146	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.528	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	97.528	Gorilla_gorilla
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	81.278	ENSGGOG00000022535	-	98	81.278	Gorilla_gorilla
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	93.483	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.483	Haplochromis_burtoni
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.079	ENSHGLG00000000970	-	99	97.079	Heterocephalus_glaber_female
ENSGAGG00000013419	TNPO1	96	97.079	ENSHGLG00100017090	-	99	97.079	Heterocephalus_glaber_male
ENSGAGG00000013419	TNPO1	97	76.047	ENSHGLG00100000963	-	99	75.465	Heterocephalus_glaber_male
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.640	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	97.640	Jaculus_jaculus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	94.157	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	94.157	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	91	90.875	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.875	Labrus_bergylta
ENSGAGG00000013419	TNPO1	96	89.884	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.884	Latimeria_chalumnae
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	96.629	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	96.629	Lepisosteus_oculatus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	97	97.113	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	97.113	Loxodonta_africana
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.528	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	97.528	Macaca_fascicularis
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.416	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	97.416	Macaca_mulatta
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.528	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	97.528	Macaca_nemestrina
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.528	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	97.528	Mandrillus_leucophaeus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	94.045	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	94.045	Mastacembelus_armatus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	93.146	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	93.146	Maylandia_zebra
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.416	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	97.191	Mesocricetus_auratus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	93.483	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	93.483	Microcebus_murinus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.416	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	97.416	Microtus_ochrogaster
ENSGAGG00000013419	TNPO1	87	93.428	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	93.428	Mola_mola
ENSGAGG00000013419	TNPO1	99	98.085	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	98.085	Monodelphis_domestica
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	92.697	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.697	Monopterus_albus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.191	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	97.398	Mus_caroli
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.416	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	97.646	Mus_musculus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.303	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	97.522	Mus_pahari
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.191	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	97.398	Mus_spretus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.416	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	97.416	Mustela_putorius_furo
ENSGAGG00000013419	TNPO1	96	96.973	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	96.973	Myotis_lucifugus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.416	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	97.416	Nannospalax_galili
ENSGAGG00000013419	TNPO1	87	93.282	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	93.282	Neolamprologus_brichardi
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.528	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	97.528	Nomascus_leucogenys
ENSGAGG00000013419	TNPO1	90	90.798	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	90.798	Ochotona_princeps
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.079	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	97.079	Octodon_degus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	92.746	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.746	Oreochromis_niloticus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	92	98.659	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	98.659	Ornithorhynchus_anatinus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	96	91.121	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	91.121	Oryctolagus_cuniculus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	87	93.645	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	93.645	Oryzias_latipes
ENSGAGG00000013419	TNPO1	99	93.574	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.574	Oryzias_latipes_hni
ENSGAGG00000013419	TNPO1	99	93.799	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.799	Oryzias_latipes_hsok
ENSGAGG00000013419	TNPO1	99	93.687	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.687	Oryzias_melastigma
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.528	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	97.528	Otolemur_garnettii
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.416	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	97.416	Ovis_aries
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.528	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	97.528	Pan_paniscus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.528	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	97.528	Panthera_pardus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.528	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	97.528	Panthera_tigris_altaica
ENSGAGG00000013419	TNPO1	94	85.359	ENSPTRG00000047731	-	100	85.359	Pan_troglodytes
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.528	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	97.528	Pan_troglodytes
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.528	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	97.528	Papio_anubis
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	90.787	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.787	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	99.438	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	99.438	Pelodiscus_sinensis
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	90.797	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.797	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	96	97.544	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	97.544	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	98.652	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.652	Phascolarctos_cinereus
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	93.841	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	93.841	Poecilia_formosa
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	93.841	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.841	Poecilia_latipinna
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	94.045	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	94.045	Poecilia_mexicana
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ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.416	ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	97.416	Pongo_abelii
ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.528	ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	97.528	Propithecus_coquereli
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ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	93.266	ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	93.266	Pundamilia_nyererei
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