EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGAGG00000017558 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: XPO1
Alias: CRM1|emb
Full Name: exportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Gopherus_agassizii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 86752 bases
Position: chrPPEB01000309.1:11437-98188
Accession: 12825
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGAGP00000024002	CRM1_C	PF08767.11	3.4e-135	1	1
ENSGAGP00000024003	CRM1_C	PF08767.11	3.4e-135	1	1
ENSGAGP00000024006	CRM1_C	PF08767.11	3.4e-135	1	1
ENSGAGP00000024002	Xpo1	PF08389.12	6.6e-41	1	1
ENSGAGP00000024003	Xpo1	PF08389.12	6.6e-41	1	1
ENSGAGP00000024006	Xpo1	PF08389.12	6.6e-41	1	1
ENSGAGP00000024002	IBN_N	PF03810.19	2.9e-12	1	1
ENSGAGP00000024003	IBN_N	PF03810.19	2.9e-12	1	1
ENSGAGP00000024006	IBN_N	PF03810.19	2.9e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGAGT00000027336	XPO1-201	4913	-	ENSGAGP00000024002	1071 (aa)	-	-
ENSGAGT00000027337	XPO1-202	4913	-	ENSGAGP00000024003	1071 (aa)	-	-
ENSGAGT00000027340	XPO1-203	4249	-	ENSGAGP00000024006	1071 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	98.413	ENSG00000082898	XPO1	100	99.441	Homo_sapiens
ENSGAGG00000017558	XPO1	88	90.638	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	90.638	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	96.545	ENSAPOG00000004984	-	100	96.545	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	99.440	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	99.440	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGAGG00000017558	XPO1	88	96.809	ENSACIG00000010818	-	100	96.809	Amphilophus_citrinellus
ENSGAGG00000017558	XPO1	88	92.979	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.979	Amphilophus_citrinellus
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	92.157	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	92.157	Amphiprion_ocellaris
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	96.545	ENSAOCG00000010121	-	100	96.545	Amphiprion_ocellaris
ENSGAGG00000017558	XPO1	91	92.791	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	92.791	Amphiprion_percula
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	96.545	ENSAPEG00000007038	-	100	96.545	Amphiprion_percula
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	96.545	ENSATEG00000008816	-	100	96.545	Anabas_testudineus
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	91.783	ENSATEG00000020750	xpo1a	100	91.783	Anabas_testudineus
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	99.813	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	99.813	Anas_platyrhynchos
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	99.627	ENSACAG00000002501	XPO1	100	99.627	Anolis_carolinensis
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	98.413	ENSANAG00000020802	XPO1	100	98.413	Aotus_nancymaae
ENSGAGG00000017558	XPO1	88	93.298	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	93.298	Astatotilapia_calliptera
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	96.452	ENSACLG00000015192	-	100	96.452	Astatotilapia_calliptera
ENSGAGG00000017558	XPO1	88	94.068	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	94.068	Astyanax_mexicanus
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	97.012	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	97.012	Astyanax_mexicanus
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	99.533	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	99.533	Bos_taurus
ENSGAGG00000017558	XPO1	99	51.941	WBGene00002078	xpo-1	99	51.941	Caenorhabditis_elegans
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	98.413	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	98.413	Callithrix_jacchus
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	99.533	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	99.533	Canis_familiaris
ENSGAGG00000017558	XPO1	93	99.498	ENSCAFG00020026910	XPO1	99	99.498	Canis_lupus_dingo
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	99.533	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	99.533	Capra_hircus
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	99.533	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	99.533	Carlito_syrichta
ENSGAGG00000017558	XPO1	53	94.858	ENSCAPG00000006454	-	100	94.858	Cavia_aperea
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	98.039	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	98.039	Cavia_porcellus
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	79.499	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.685	Cebus_capucinus
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	96.648	ENSCATG00000032674	XPO1	100	98.298	Cercocebus_atys
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	99.253	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	99.253	Chinchilla_lanigera
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	98.413	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.413	Chlorocebus_sabaeus
ENSGAGG00000017558	XPO1	83	99.741	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	99.741	Choloepus_hoffmanni
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	99.907	ENSCPBG00000026239	XPO1	100	99.907	Chrysemys_picta_bellii
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	81.192	ENSCING00000024562	-	100	81.192	Ciona_intestinalis
ENSGAGG00000017558	XPO1	99	80.205	ENSCSAVG00000005965	-	99	80.205	Ciona_savignyi
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	94.211	ENSCANG00000028883	XPO1	100	98.050	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	98.226	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	98.226	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	98.226	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	98.226	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGAGG00000017558	XPO1	88	95.638	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.638	Cynoglossus_semilaevis
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	91.503	ENSCVAG00000016558	xpo1a	100	91.503	Cyprinodon_variegatus
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	96.452	ENSCVAG00000016788	-	100	96.452	Cyprinodon_variegatus
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	97.199	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	97.199	Danio_rerio
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	93.184	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	95.511	Danio_rerio
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	99.627	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	99.627	Dasypus_novemcinctus
ENSGAGG00000017558	XPO1	92	96.193	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	96.193	Dipodomys_ordii
ENSGAGG00000017558	XPO1	99	71.134	FBgn0020497	emb	99	71.134	Drosophila_melanogaster
ENSGAGG00000017558	XPO1	94	98.339	ENSETEG00000018045	XPO1	94	98.339	Echinops_telfairi
ENSGAGG00000017558	XPO1	90	79.876	ENSEBUG00000012580	-	100	88.402	Eptatretus_burgeri
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	99.533	ENSEASG00005007223	XPO1	100	99.533	Equus_asinus_asinus
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	99.533	ENSECAG00000024920	XPO1	100	99.533	Equus_caballus
ENSGAGG00000017558	XPO1	92	100.000	ENSEEUG00000009479	XPO1	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSGAGG00000017558	XPO1	87	93.148	ENSELUG00000014306	-	99	93.148	Esox_lucius
ENSGAGG00000017558	XPO1	88	95.426	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	95.426	Esox_lucius
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	99.533	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	99.533	Felis_catus
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	99.533	ENSFALG00000010989	XPO1	100	99.533	Ficedula_albicollis
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	97.666	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	97.666	Fukomys_damarensis
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	91.783	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	91.783	Fundulus_heteroclitus
ENSGAGG00000017558	XPO1	53	81.028	ENSFHEG00000018974	-	100	81.028	Fundulus_heteroclitus
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	93.091	ENSGMOG00000004441	xpo1a	100	93.091	Gadus_morhua
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	90.663	ENSGMOG00000019063	-	100	90.663	Gadus_morhua
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	99.813	ENSGALG00000029476	XPO1	100	99.813	Gallus_gallus
ENSGAGG00000017558	XPO1	91	96.498	ENSGAFG00000003355	-	98	96.498	Gambusia_affinis
ENSGAGG00000017558	XPO1	88	92.872	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.872	Gambusia_affinis
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	91.690	ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.690	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	96.359	ENSGACG00000002743	-	100	96.359	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	98.413	ENSGGOG00000034878	XPO1	100	98.413	Gorilla_gorilla
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	92.344	ENSHBUG00000007128	xpo1a	100	92.344	Haplochromis_burtoni
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	96.452	ENSHBUG00000020037	-	100	96.452	Haplochromis_burtoni
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	99.160	ENSHGLG00000003115	XPO1	100	99.160	Heterocephalus_glaber_female
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	99.160	ENSHGLG00100012227	XPO1	100	99.160	Heterocephalus_glaber_male
ENSGAGG00000017558	XPO1	88	95.851	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	95.851	Hippocampus_comes
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	94.118	ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.118	Ictalurus_punctatus
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	97.106	ENSIPUG00000012891	Xpo1	100	97.106	Ictalurus_punctatus
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	99.346	ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.346	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	99.253	ENSJJAG00000020468	Xpo1	100	99.253	Jaculus_jaculus
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	91.783	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	91.783	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	95.985	ENSKMAG00000016218	-	100	95.985	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAGG00000017558	XPO1	88	90.360	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	90.360	Labrus_bergylta
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	96.545	ENSLBEG00000005740	-	100	96.545	Labrus_bergylta
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	77.655	ENSLACG00000018213	XPO1	100	77.655	Latimeria_chalumnae
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	97.106	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	97.106	Lepisosteus_oculatus
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	99.346	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	99.346	Loxodonta_africana
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	98.413	ENSMFAG00000038679	XPO1	100	98.413	Macaca_fascicularis
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	98.413	ENSMMUG00000006941	XPO1	100	98.413	Macaca_mulatta
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	98.413	ENSMNEG00000030909	XPO1	100	98.413	Macaca_nemestrina
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	96.651	ENSMLEG00000032004	XPO1	100	96.651	Mandrillus_leucophaeus
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	96.452	ENSMAMG00000010568	-	100	96.452	Mastacembelus_armatus
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	92.250	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	92.250	Mastacembelus_armatus
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	92.344	ENSMZEG00005005105	xpo1a	100	92.344	Maylandia_zebra
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	96.452	ENSMZEG00005018158	-	98	96.601	Maylandia_zebra
ENSGAGG00000017558	XPO1	68	99.449	ENSMGAG00000001496	-	100	99.449	Meleagris_gallopavo
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	98.226	ENSMAUG00000006769	Xpo1	100	98.226	Mesocricetus_auratus
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	99.533	ENSMICG00000027770	XPO1	100	99.533	Microcebus_murinus
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	98.506	ENSMOCG00000012169	Xpo1	100	98.506	Microtus_ochrogaster
ENSGAGG00000017558	XPO1	87	96.478	ENSMMOG00000008001	-	99	96.478	Mola_mola
ENSGAGG00000017558	XPO1	88	92.979	ENSMMOG00000018767	xpo1a	100	92.979	Mola_mola
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	98.413	ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.413	Monodelphis_domestica
ENSGAGG00000017558	XPO1	88	92.030	ENSMALG00000008617	xpo1a	100	92.030	Monopterus_albus
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	96.078	ENSMALG00000007085	-	100	96.078	Monopterus_albus
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	98.599	MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	98.599	Mus_caroli
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ENSGAGG00000017558	XPO1	100	98.599	MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	98.599	Mus_pahari
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	98.693	MGP_SPRETEiJ_G0016979	Xpo1	100	98.693	Mus_spretus
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	99.533	ENSMPUG00000005560	XPO1	100	99.533	Mustela_putorius_furo
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	99.440	ENSMLUG00000010670	XPO1	100	99.440	Myotis_lucifugus
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	99.346	ENSNGAG00000022158	Xpo1	100	99.346	Nannospalax_galili
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ENSGAGG00000017558	XPO1	96	95.837	ENSNBRG00000012229	-	100	96.915	Neolamprologus_brichardi
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ENSGAGG00000017558	XPO1	100	96.359	ENSOMEG00000001384	-	100	96.702	Oryzias_melastigma
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	95.810	ENSOGAG00000000143	XPO1	100	95.810	Otolemur_garnettii
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ENSGAGG00000017558	XPO1	100	99.533	ENSPTIG00000012259	XPO1	100	99.533	Panthera_tigris_altaica
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ENSGAGG00000017558	XPO1	100	98.700	ENSPSIG00000014457	XPO1	100	99.779	Pelodiscus_sinensis
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	94.590	ENSPMGG00000010632	XPO1	100	94.590	Periophthalmus_magnuspinnatus
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ENSGAGG00000017558	XPO1	100	91.970	ENSPREG00000020796	xpo1a	100	91.970	Poecilia_reticulata
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ENSGAGG00000017558	XPO1	100	99.533	ENSPCOG00000023123	XPO1	100	99.533	Propithecus_coquereli
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ENSGAGG00000017558	XPO1	100	96.452	ENSSLDG00000019530	-	100	96.452	Seriola_lalandi_dorsalis
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ENSGAGG00000017558	XPO1	100	96.545	ENSTRUG00000005571	-	100	96.545	Takifugu_rubripes
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ENSGAGG00000017558	XPO1	100	98.319	ENSXETG00000002224	xpo1	100	98.319	Xenopus_tropicalis
ENSGAGG00000017558	XPO1	78	97.442	ENSXCOG00000006625	-	97	97.442	Xiphophorus_couchianus
ENSGAGG00000017558	XPO1	88	92.766	ENSXCOG00000011889	XPO1	100	92.766	Xiphophorus_couchianus
ENSGAGG00000017558	XPO1	100	96.265	ENSXMAG00000007353	-	100	96.265	Xiphophorus_maculatus
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