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Description

Ensembl ID: ENSGAGG00000023315 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ACO1
Alias: IREB1|IREBP|IRP1
Full Name: aconitase 1
Gene Type: protein_coding
Species: Gopherus_agassizii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 47620 bases
Position: chrPPEB01002022.1:231186-278805
Accession: 117
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGAGP00000032616	Aconitase	PF00330.20	2.2e-180	1	1
ENSGAGP00000032612	Aconitase	PF00330.20	2.2e-180	1	1
ENSGAGP00000032614	Aconitase	PF00330.20	2.2e-180	1	1
ENSGAGP00000032615	Aconitase	PF00330.20	2.2e-180	1	1
ENSGAGP00000032616	Aconitase_C	PF00694.19	6.4e-46	1	1
ENSGAGP00000032612	Aconitase_C	PF00694.19	6.4e-46	1	1
ENSGAGP00000032614	Aconitase_C	PF00694.19	6.4e-46	1	1
ENSGAGP00000032615	Aconitase_C	PF00694.19	6.4e-46	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGAGT00000036963	ACO1-201	3879	-	ENSGAGP00000032612	889 (aa)	-	-
ENSGAGT00000036968	ACO1-204	3641	-	ENSGAGP00000032616	889 (aa)	-	-
ENSGAGT00000036966	ACO1-203	4376	-	ENSGAGP00000032615	889 (aa)	-	-
ENSGAGT00000036965	ACO1-202	3843	-	ENSGAGP00000032614	889 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	55.324	ENSGAGG00000006117	IREB2	95	55.324

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	88.063	ENSG00000122729	ACO1	99	88.063	Homo_sapiens
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	82.095	ENSAPOG00000008670	aco1	99	82.095	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	87.402	ENSAMEG00000003746	ACO1	99	87.402	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	82.207	ENSACIG00000014377	aco1	99	82.207	Amphilophus_citrinellus
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	82.207	ENSAOCG00000007699	aco1	99	82.207	Amphiprion_ocellaris
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	82.320	ENSAPEG00000014370	aco1	99	82.320	Amphiprion_percula
ENSGAGG00000023315	ACO1	100	82.002	ENSATEG00000000560	aco1	99	82.002	Anabas_testudineus
ENSGAGG00000023315	ACO1	100	88.189	ENSAPLG00000015490	ACO1	100	88.189	Anas_platyrhynchos
ENSGAGG00000023315	ACO1	97	86.163	ENSACAG00000001541	ACO1	99	86.163	Anolis_carolinensis
ENSGAGG00000023315	ACO1	100	87.177	ENSANAG00000003359	ACO1	100	87.177	Aotus_nancymaae
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	81.644	ENSACLG00000007755	aco1	99	81.644	Astatotilapia_calliptera
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	82.300	ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.300	Astyanax_mexicanus
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	88.613	ENSBTAG00000000555	ACO1	99	88.613	Bos_taurus
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	87.725	ENSCJAG00000007687	ACO1	99	87.725	Callithrix_jacchus
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	87.343	ENSCAFG00000001786	ACO1	99	87.289	Canis_familiaris
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	87.387	ENSCAFG00020014553	ACO1	99	87.387	Canis_lupus_dingo
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	88.613	ENSCHIG00000007667	ACO1	99	88.613	Capra_hircus
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	88.851	ENSTSYG00000004179	ACO1	99	88.851	Carlito_syrichta
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	70.483	ENSCAPG00000007254	ACO1	99	70.370	Cavia_aperea
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	87.275	ENSCPOG00000003768	ACO1	99	87.275	Cavia_porcellus
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	87.613	ENSCCAG00000022465	ACO1	99	87.613	Cebus_capucinus
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	87.725	ENSCATG00000045333	ACO1	99	87.725	Cercocebus_atys
ENSGAGG00000023315	ACO1	100	86.502	ENSCLAG00000002487	ACO1	99	86.599	Chinchilla_lanigera
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	87.725	ENSCSAG00000009824	ACO1	99	87.725	Chlorocebus_sabaeus
ENSGAGG00000023315	ACO1	90	70.165	ENSCHOG00000008996	ACO1	90	70.030	Choloepus_hoffmanni
ENSGAGG00000023315	ACO1	100	97.863	ENSCPBG00000008077	ACO1	100	97.863	Chrysemys_picta_bellii
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	87.838	ENSCANG00000014847	ACO1	99	87.838	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	88.851	ENSCGRG00001024337	Aco1	99	88.851	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	87.950	ENSCGRG00000004877	-	99	87.950	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	77.678	ENSCSEG00000018262	aco1	99	77.678	Cynoglossus_semilaevis
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	75.648	ENSCVAG00000020264	aco1	99	75.648	Cyprinodon_variegatus
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	82.658	ENSDARG00000026376	aco1	99	82.658	Danio_rerio
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	87.613	ENSDNOG00000003951	ACO1	99	87.613	Dasypus_novemcinctus
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	87.838	ENSDORG00000014246	Aco1	99	87.838	Dipodomys_ordii
ENSGAGG00000023315	ACO1	86	67.553	ENSETEG00000012415	-	85	67.553	Echinops_telfairi
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	57.264	ENSEBUG00000015441	aco1	97	57.264	Eptatretus_burgeri
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	88.626	ENSEASG00005004602	ACO1	99	88.626	Equus_asinus_asinus
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	88.514	ENSECAG00000014846	ACO1	99	88.514	Equus_caballus
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	76.239	ENSEEUG00000015174	ACO1	99	76.239	Erinaceus_europaeus
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	80.518	ENSELUG00000016812	aco1	97	80.518	Esox_lucius
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	87.500	ENSFCAG00000001293	ACO1	99	87.500	Felis_catus
ENSGAGG00000023315	ACO1	100	87.852	ENSFALG00000001167	ACO1	100	87.852	Ficedula_albicollis
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	87.050	ENSFDAG00000016058	ACO1	99	87.050	Fukomys_damarensis
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	81.398	ENSFHEG00000005619	aco1	99	81.398	Fundulus_heteroclitus
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	78.129	ENSGMOG00000005514	aco1	99	78.129	Gadus_morhua
ENSGAGG00000023315	ACO1	100	88.076	ENSGALG00000002162	ACO1	100	88.076	Gallus_gallus
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	81.038	ENSGACG00000001637	aco1	99	81.038	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	88.063	ENSGGOG00000016306	ACO1	99	88.063	Gorilla_gorilla
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	81.532	ENSHBUG00000008952	aco1	99	81.532	Haplochromis_burtoni
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	87.613	ENSHGLG00000018922	Aco1	99	87.613	Heterocephalus_glaber_female
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	87.613	ENSHGLG00100000149	Aco1	99	87.613	Heterocephalus_glaber_male
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	77.678	ENSHCOG00000015881	aco1	99	77.678	Hippocampus_comes
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	82.525	ENSIPUG00000020088	ACO1	99	82.525	Ictalurus_punctatus
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	88.514	ENSSTOG00000006942	ACO1	99	88.514	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	88.739	ENSJJAG00000013824	Aco1	99	88.739	Jaculus_jaculus
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	81.038	ENSKMAG00000015759	aco1	99	81.038	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	77.503	ENSLBEG00000013866	aco1	99	77.503	Labrus_bergylta
ENSGAGG00000023315	ACO1	75	72.741	ENSLACG00000000936	ACO1	99	72.727	Latimeria_chalumnae
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	82.300	ENSLOCG00000011082	aco1	99	82.300	Lepisosteus_oculatus
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	86.486	ENSLAFG00000013470	ACO1	99	86.486	Loxodonta_africana
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	87.838	ENSMFAG00000001702	ACO1	99	87.838	Macaca_fascicularis
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	87.950	ENSMMUG00000008196	ACO1	99	87.950	Macaca_mulatta
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	87.838	ENSMNEG00000045040	ACO1	99	87.838	Macaca_nemestrina
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	87.950	ENSMLEG00000005636	ACO1	99	87.950	Mandrillus_leucophaeus
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	82.658	ENSMAMG00000002915	aco1	99	82.658	Mastacembelus_armatus
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	78.052	ENSMZEG00005012733	aco1	99	77.716	Maylandia_zebra
ENSGAGG00000023315	ACO1	100	72.241	ENSMGAG00000008851	ACO1	100	72.241	Meleagris_gallopavo
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	88.288	ENSMAUG00000021408	Aco1	99	88.288	Mesocricetus_auratus
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	88.739	ENSMICG00000006540	ACO1	99	88.739	Microcebus_murinus
ENSGAGG00000023315	ACO1	100	88.414	ENSMOCG00000015393	Aco1	99	88.514	Microtus_ochrogaster
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	80.631	ENSMMOG00000020282	aco1	99	80.631	Mola_mola
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	86.599	ENSMODG00000004463	ACO1	99	86.599	Monodelphis_domestica
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	82.207	ENSMALG00000019764	aco1	99	82.207	Monopterus_albus
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	89.077	MGP_CAROLIEiJ_G0025892	Aco1	99	89.077	Mus_caroli
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	88.739	ENSMUSG00000028405	Aco1	99	88.739	Mus_musculus
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	88.626	MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	99	88.626	Mus_pahari
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	88.739	MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	88.739	Mus_spretus
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	88.176	ENSMPUG00000004340	ACO1	99	88.176	Mustela_putorius_furo
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	86.937	ENSMLUG00000003029	ACO1	99	86.937	Myotis_lucifugus
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	88.514	ENSNGAG00000005703	Aco1	99	88.514	Nannospalax_galili
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	64.278	ENSNBRG00000008973	aco1	99	64.054	Neolamprologus_brichardi
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	88.176	ENSNLEG00000003409	ACO1	99	88.176	Nomascus_leucogenys
ENSGAGG00000023315	ACO1	89	80.092	ENSMEUG00000014756	ACO1	89	80.092	Notamacropus_eugenii
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	84.234	ENSOPRG00000016791	ACO1	99	84.234	Ochotona_princeps
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	82.432	ENSODEG00000015432	-	99	81.982	Octodon_degus
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	85.135	ENSODEG00000001240	-	99	85.135	Octodon_degus
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	81.306	ENSONIG00000019869	aco1	99	81.306	Oreochromis_niloticus
ENSGAGG00000023315	ACO1	81	88.504	ENSOANG00000012132	ACO1	99	88.504	Ornithorhynchus_anatinus
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	86.971	ENSOCUG00000015960	ACO1	99	86.748	Oryctolagus_cuniculus
ENSGAGG00000023315	ACO1	100	81.102	ENSORLG00000020656	aco1	99	81.102	Oryzias_latipes
ENSGAGG00000023315	ACO1	100	80.652	ENSORLG00020010991	aco1	99	80.652	Oryzias_latipes_hni
ENSGAGG00000023315	ACO1	100	80.877	ENSORLG00015011785	aco1	99	80.877	Oryzias_latipes_hsok
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	80.226	ENSOMEG00000000660	aco1	99	80.226	Oryzias_melastigma
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	88.851	ENSOGAG00000010522	ACO1	99	88.851	Otolemur_garnettii
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	88.613	ENSOARG00000014707	ACO1	98	88.613	Ovis_aries
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	87.950	ENSPPAG00000033498	ACO1	99	87.950	Pan_paniscus
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	87.387	ENSPPRG00000009875	ACO1	99	87.387	Panthera_pardus
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	87.275	ENSPTIG00000016606	ACO1	98	87.275	Panthera_tigris_altaica
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	87.950	ENSPTRG00000020843	ACO1	99	87.950	Pan_troglodytes
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	87.950	ENSPANG00000025270	ACO1	99	87.950	Papio_anubis
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	80.405	ENSPKIG00000023168	aco1	99	80.405	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGAGG00000023315	ACO1	100	94.263	ENSPSIG00000008030	ACO1	100	94.263	Pelodiscus_sinensis
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	81.962	ENSPMGG00000020708	aco1	99	81.962	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	88.626	ENSPEMG00000018464	Aco1	99	88.626	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	86.697	ENSPCIG00000029321	ACO1	99	87.302	Phascolarctos_cinereus
ENSGAGG00000023315	ACO1	99	80.361	ENSPFOG00000013405	aco1	98	80.464	Poecilia_formosa
ENSGAGG00000023315	ACO1	90	81.955	ENSPLAG00000023422	aco1	97	81.955	Poecilia_latipinna
ENSGAGG00000023315	ACO1	90	82.080	ENSPMEG00000011800	aco1	97	82.080	Poecilia_mexicana
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ENSGAGG00000023315	ACO1	99	87.725	ENSPPYG00000019150	ACO1	95	87.725	Pongo_abelii
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