EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Gene Ontology

Description

Ensembl ID: ENSGALG00000000988 (Gene tree)
Gene ID: 428281
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: -
Full Name: Gallus gallus elongation factor Tu GTP binding domain containing 2 (EFTUD2)%2C mRNA.
Gene Type: protein_coding
Species: Gallus_gallus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 17228 bases
Position: chr27:3673094-3690321
Accession: NM_001031501
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGALP00000063711	GTP_EFTU	PF00009.27	8.8e-46	1	1
ENSGALP00000001456	GTP_EFTU	PF00009.27	9.6e-46	1	1
ENSGALP00000064066	GTP_EFTU	PF00009.27	1.5e-45	1	1
ENSGALP00000063711	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.6e-12	1	1
ENSGALP00000001456	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.6e-12	1	1
ENSGALP00000064066	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	2.4e-12	1	1
ENSGALP00000063711	EFG_IV	PF03764.18	1.5e-23	1	1
ENSGALP00000001456	EFG_IV	PF03764.18	1.6e-23	1	1
ENSGALP00000064066	EFG_IV	PF03764.18	2.4e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGALT00000089928	-	3883	-	ENSGALP00000063711	928 (aa)	-	A0A1L1RXY9
ENSGALT00000088580	-	4599	-	ENSGALP00000064066	1222 (aa)	-	A0A1L1RYY6
ENSGALT00000001458	-	3468	-	ENSGALP00000001456	972 (aa)	-	Q5F3X4

Gene Model

Click here to download ENSGALG00000000988's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
gga03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSGALG00000000988's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.599	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.913	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	91.770	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.707	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	98.148	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	90.000	ENSACIG00000009096	eftud2	100	88.169	Amphilophus_citrinellus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	92	88.118	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	88.118	Amphiprion_ocellaris
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.913	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	91.770	Amphiprion_percula
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	94.130	ENSATEG00000000457	eftud2	100	92.078	Anabas_testudineus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	95.881	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	95.881	Anas_platyrhynchos
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.707	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	98.251	Anolis_carolinensis
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.599	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	98.045	Aotus_nancymaae
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.696	ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.667	Astatotilapia_calliptera
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	94.009	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.095	Astyanax_mexicanus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.707	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	97.942	Bos_taurus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	71.273	WBGene00001166	eftu-2	99	70.455	Caenorhabditis_elegans
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.599	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	98.045	Callithrix_jacchus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.707	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	98.148	Canis_familiaris
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.707	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	98.148	Canis_lupus_dingo
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.707	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	97.942	Capra_hircus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.491	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	97.840	Carlito_syrichta
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.060	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	97.428	Cavia_aperea
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.060	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	97.428	Cavia_porcellus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.599	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	98.045	Cebus_capucinus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.599	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	98.045	Cercocebus_atys
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.060	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	97.325	Chinchilla_lanigera
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.599	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	98.045	Chlorocebus_sabaeus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	96	85.698	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	85.698	Choloepus_hoffmanni
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	99.030	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.663	Chrysemys_picta_bellii
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	79.501	ENSCING00000009372	-	100	77.538	Ciona_intestinalis
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	80.652	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.835	Ciona_savignyi
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.599	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	98.045	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.384	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	97.634	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.384	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	97.634	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.261	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.255	Cynoglossus_semilaevis
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	94.239	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	91.975	Cyprinodon_variegatus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.137	ENSDARG00000012261	eftud2	100	90.545	Danio_rerio
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.060	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	97.531	Dasypus_novemcinctus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.384	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	97.737	Dipodomys_ordii
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	76.649	FBgn0039566	CG4849	100	75.179	Drosophila_melanogaster
ENSGALG00000000988	EFTUD2	92	98.913	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	98.913	Echinops_telfairi
ENSGALG00000000988	EFTUD2	77	93.532	ENSEBUG00000004047	-	96	87.065	Eptatretus_burgeri
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.707	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	98.148	Equus_asinus_asinus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.599	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	98.045	Equus_caballus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	87	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.261	ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	Esox_lucius
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.707	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	98.045	Felis_catus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	99.677	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	99.486	Ficedula_albicollis
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.491	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	97.737	Fukomys_damarensis
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	94.022	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	91.872	Fundulus_heteroclitus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.261	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	91.255	Gadus_morhua
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	94.130	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	91.872	Gambusia_affinis
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.261	ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.152	Gasterosteus_aculeatus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.599	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	98.045	Gorilla_gorilla
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.696	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.564	Haplochromis_burtoni
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.168	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	97.428	Heterocephalus_glaber_female
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.168	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	97.428	Heterocephalus_glaber_male
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.152	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	Hippocampus_comes
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.798	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.564	Ictalurus_punctatus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	96	98.311	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	95.956	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.491	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	98.077	Jaculus_jaculus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.478	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	91.461	Kryptolebias_marmoratus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	94	93.257	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	Labrus_bergylta
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	96.091	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.758	Latimeria_chalumnae
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	94.239	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	92.078	Lepisosteus_oculatus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.491	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	97.531	Loxodonta_africana
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.599	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	98.045	Macaca_fascicularis
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.599	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.599	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	98.045	Macaca_nemestrina
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.599	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	98.045	Mandrillus_leucophaeus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	94.130	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	92.284	Mastacembelus_armatus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.696	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	91.667	Maylandia_zebra
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	99.677	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	99.589	Meleagris_gallopavo
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.491	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	97.737	Mesocricetus_auratus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.599	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	98.045	Microcebus_murinus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.491	ENSMOCG00000009039	-	100	97.737	Microtus_ochrogaster
ENSGALG00000000988	EFTUD2	92	80.225	ENSMOCG00000017653	-	90	80.225	Microtus_ochrogaster
ENSGALG00000000988	EFTUD2	92	93.882	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	93.882	Mola_mola
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.707	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	98.148	Monodelphis_domestica
ENSGALG00000000988	EFTUD2	92	92.235	ENSMALG00000014501	eftud2	100	92.235	Monopterus_albus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.276	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	97.428	Mus_caroli
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.276	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	97.428	Mus_musculus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.276	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	97.428	Mus_pahari
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.276	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	97.428	Mus_spretus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	97	98.556	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	94	94.556	Mustela_putorius_furo
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.707	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	98.148	Myotis_lucifugus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.599	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	97.840	Nannospalax_galili
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.587	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.564	Neolamprologus_brichardi
ENSGALG00000000988	EFTUD2	97	96.656	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	96.174	Nomascus_leucogenys
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	94.342	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	94.342	Notamacropus_eugenii
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	89.712	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	89.712	Ochotona_princeps
ENSGALG00000000988	EFTUD2	93	79.023	ENSODEG00000003385	-	100	79.023	Octodon_degus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	98.058	ENSODEG00000018041	-	100	97.016	Octodon_degus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.696	ENSONIG00000000912	eftud2	100	91.667	Oreochromis_niloticus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.599	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	97.942	Oryctolagus_cuniculus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.478	ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.461	Oryzias_latipes
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.478	ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.358	Oryzias_latipes_hni
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.478	ENSORLG00015002611	eftud2	100	93.464	Oryzias_latipes_hsok
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	96.228	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	95.782	Otolemur_garnettii
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.707	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	97.942	Ovis_aries
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.599	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	98.045	Pan_paniscus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.707	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	98.148	Panthera_pardus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.707	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	98.148	Panthera_tigris_altaica
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.599	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	98.045	Pan_troglodytes
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.599	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	98.045	Papio_anubis
ENSGALG00000000988	EFTUD2	93	97.798	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.574	Pelodiscus_sinensis
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	85.978	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	84.259	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.491	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	97.634	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.599	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	98.045	Phascolarctos_cinereus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	94.130	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	91.872	Poecilia_formosa
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	94.130	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	91.872	Poecilia_latipinna
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	94.130	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	91.872	Poecilia_mexicana
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	97.091	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	96.605	Pongo_abelii
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	93.827	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	93.827	Procavia_capensis
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.599	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	98.045	Propithecus_coquereli
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	93.621	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	93.621	Pteropus_vampyrus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.587	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	91.564	Pundamilia_nyererei
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	94.015	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.078	Pygocentrus_nattereri
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.384	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	97.531	Rattus_norvegicus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.491	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	97.942	Rhinopithecus_bieti
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.491	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	97.942	Rhinopithecus_roxellana
ENSGALG00000000988	EFTUD2	97	34.091	YKL173W	SNU114	97	33.893	Saccharomyces_cerevisiae
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.599	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	98.045	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.599	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	98.294	Sarcophilus_harrisii
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.913	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.461	Scleropages_formosus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.261	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	91.461	Scophthalmus_maximus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.804	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	91.770	Seriola_dumerili
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.913	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	91.872	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	89.871	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	89.403	Sorex_araneus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.384	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.840	Sphenodon_punctatus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.804	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	91.872	Stegastes_partitus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.599	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	97.942	Sus_scrofa
ENSGALG00000000988	EFTUD2	87	99.261	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	99.148	Taeniopygia_guttata
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	92.935	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	90.947	Takifugu_rubripes
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	88.203	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.373	Tetraodon_nigroviridis
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	92.780	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	92.490	Tupaia_belangeri
ENSGALG00000000988	EFTUD2	95	95.119	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	89.403	Tursiops_truncatus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	97.737	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	97.023	Ursus_americanus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.707	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	98.148	Ursus_maritimus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.707	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	98.148	Vulpes_vulpes
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	95.685	ENSXETG00000003394	eftud2	99	95.685	Xenopus_tropicalis
ENSGALG00000000988	EFTUD2	84	93.750	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.750	Xiphophorus_couchianus
ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	94.130	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.872	Xiphophorus_maculatus

Gene Ontology

Go ID	Go_term	PubmedID	Evidence	Category
GO:0000398	mRNA splicing, via spliceosome	21873635.	IBA	Process
GO:0003924	GTPase activity	21873635.	IBA	Function
GO:0005525	GTP binding	-	IEA	Function
GO:0005829	cytosol	21873635.	IBA	Component
GO:0030623	U5 snRNA binding	21873635.	IBA	Function
GO:0046540	U4/U6 x U5 tri-snRNP complex	21873635.	IBA	Component
GO:0071007	U2-type catalytic step 2 spliceosome	21873635.	IBA	Component
GO:1990904	ribonucleoprotein complex	21873635.	IBA	Component