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PPI

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Gene Ontology

Description

Ensembl ID: ENSGALG00000003392 (Gene tree)
Gene ID: 427694
Gene Symbol: SBNO1
Alias: -
Full Name: Gallus gallus strawberry notch homolog 1 (SBNO1)%2C mRNA.
Gene Type: protein_coding
Species: Gallus_gallus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 29164 bases
Position: chr15:5299498-5328661
Accession: NM_001031469
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGALP00000058574	ResIII	PF04851.15	1.7e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGALT00000054517	-	5548	-	ENSGALP00000058574	1239 (aa)	-	Q5F371

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	92.283	ENSG00000139697	SBNO1	88	92.283	Homo_sapiens
ENSGALG00000003392	SBNO1	80	82.294	ENSAPOG00000003196	sbno1	85	81.718	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	91.984	ENSAMEG00000015151	SBNO1	88	92.227	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	75.100	ENSACIG00000008088	sbno1	88	75.000	Amphilophus_citrinellus
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	75.958	ENSAOCG00000014859	sbno1	87	75.457	Amphiprion_ocellaris
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	75.958	ENSAPEG00000006069	sbno1	87	75.457	Amphiprion_percula
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	76.990	ENSATEG00000006667	sbno1	88	76.145	Anabas_testudineus
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	98.698	ENSAPLG00000015674	SBNO1	88	98.698	Anas_platyrhynchos
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	90.660	ENSACAG00000015441	SBNO1	78	90.580	Anolis_carolinensis
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	91.883	ENSANAG00000029958	-	98	90.812	Aotus_nancymaae
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	75.061	ENSACLG00000024913	sbno1	88	74.597	Astatotilapia_calliptera
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	79.952	ENSAMXG00000019473	sbno1	88	80.338	Astyanax_mexicanus
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	92.451	ENSBTAG00000020505	SBNO1	88	92.614	Bos_taurus
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	91.883	ENSCJAG00000016599	SBNO1	97	87.402	Callithrix_jacchus
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	92.289	ENSCAFG00000007503	SBNO1	86	96.907	Canis_familiaris
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	91.315	ENSCAFG00020015363	SBNO1	87	93.401	Canis_lupus_dingo
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	92.608	ENSCHIG00000008382	SBNO1	87	96.954	Capra_hircus
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	92.370	ENSTSYG00000012749	SBNO1	88	96.515	Carlito_syrichta
ENSGALG00000003392	SBNO1	94	92.564	ENSCAPG00000000384	SBNO1	86	96.447	Cavia_aperea
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	91.870	ENSCPOG00000008109	SBNO1	87	96.447	Cavia_porcellus
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	87.024	ENSCCAG00000035316	SBNO1	88	87.024	Cebus_capucinus
ENSGALG00000003392	SBNO1	96	92.515	ENSCATG00000008239	SBNO1	85	96.701	Cercocebus_atys
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	91.964	ENSCLAG00000008995	SBNO1	87	96.954	Chinchilla_lanigera
ENSGALG00000003392	SBNO1	80	94.383	ENSCSAG00000002064	SBNO1	86	94.483	Chlorocebus_sabaeus
ENSGALG00000003392	SBNO1	94	94.697	ENSCHOG00000008814	SBNO1	84	94.697	Choloepus_hoffmanni
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	95.925	ENSCPBG00000025968	SBNO1	92	95.925	Chrysemys_picta_bellii
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	86.861	ENSCANG00000042688	-	88	86.780	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	91.714	ENSCGRG00001017470	Sbno1	87	95.178	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	91.714	ENSCGRG00000004756	Sbno1	87	95.178	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	75.020	ENSCSEG00000011919	sbno1	88	75.476	Cynoglossus_semilaevis
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	75.837	ENSCVAG00000007038	sbno1	88	76.077	Cyprinodon_variegatus
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	79.500	ENSDARG00000099080	sbno1	88	79.822	Danio_rerio
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	89.675	ENSDNOG00000017147	SBNO1	98	92.094	Dasypus_novemcinctus
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	80.860	ENSDORG00000015261	Sbno1	71	92.624	Dipodomys_ordii
ENSGALG00000003392	SBNO1	91	83.692	ENSETEG00000005620	SBNO1	81	84.221	Echinops_telfairi
ENSGALG00000003392	SBNO1	84	62.942	ENSEBUG00000013823	sbno1	93	62.360	Eptatretus_burgeri
ENSGALG00000003392	SBNO1	57	88.527	ENSEASG00005012595	-	92	89.124	Equus_asinus_asinus
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	92.532	ENSECAG00000006127	SBNO1	88	93.019	Equus_caballus
ENSGALG00000003392	SBNO1	78	87.416	ENSEEUG00000003793	SBNO1	70	87.753	Erinaceus_europaeus
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	78.025	ENSELUG00000002886	sbno1	89	77.147	Esox_lucius
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	92.451	ENSFCAG00000015331	SBNO1	88	92.614	Felis_catus
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	98.698	ENSFALG00000009273	SBNO1	88	98.698	Ficedula_albicollis
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	90.089	ENSFDAG00000014232	SBNO1	88	90.252	Fukomys_damarensis
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	76.400	ENSFHEG00000007360	sbno1	88	76.480	Fundulus_heteroclitus
ENSGALG00000003392	SBNO1	93	79.463	ENSGMOG00000018229	sbno1	88	79.498	Gadus_morhua
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	76.518	ENSGAFG00000003960	sbno1	88	76.653	Gambusia_affinis
ENSGALG00000003392	SBNO1	93	78.929	ENSGACG00000015633	sbno1	88	78.929	Gasterosteus_aculeatus
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	95.110	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	94.108	Gopherus_agassizii
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	92.201	ENSGGOG00000015000	SBNO1	87	96.954	Gorilla_gorilla
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	68.740	ENSHBUG00000011910	sbno1	87	68.302	Haplochromis_burtoni
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	91.883	ENSHGLG00000014165	-	87	95.025	Heterocephalus_glaber_female
ENSGALG00000003392	SBNO1	93	87.949	ENSHCOG00000003246	sbno1	86	87.949	Hippocampus_comes
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	79.694	ENSIPUG00000015830	Sbno1	98	79.350	Ictalurus_punctatus
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	92.283	ENSSTOG00000023221	SBNO1	87	96.701	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	92.289	ENSJJAG00000001741	Sbno1	88	92.289	Jaculus_jaculus
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	76.377	ENSKMAG00000009696	sbno1	88	76.433	Kryptolebias_marmoratus
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	76.274	ENSLBEG00000007623	sbno1	88	75.930	Labrus_bergylta
ENSGALG00000003392	SBNO1	98	85.179	ENSLACG00000017227	SBNO1	99	84.846	Latimeria_chalumnae
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	82.476	ENSLOCG00000005725	sbno1	86	83.199	Lepisosteus_oculatus
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	91.477	ENSLAFG00000002135	SBNO1	88	91.558	Loxodonta_africana
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	92.289	ENSMFAG00000031429	SBNO1	99	91.947	Macaca_fascicularis
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	92.364	ENSMMUG00000011496	SBNO1	87	96.701	Macaca_mulatta
ENSGALG00000003392	SBNO1	94	96.701	ENSMLEG00000033260	SBNO1	98	90.519	Mandrillus_leucophaeus
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	76.855	ENSMAMG00000005473	sbno1	89	76.935	Mastacembelus_armatus
ENSGALG00000003392	SBNO1	100	99.839	ENSMGAG00000003274	SBNO1	100	99.839	Meleagris_gallopavo
ENSGALG00000003392	SBNO1	56	87.931	ENSMAUG00000004834	-	100	88.522	Mesocricetus_auratus
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	91.153	ENSMICG00000006573	-	98	88.546	Microcebus_murinus
ENSGALG00000003392	SBNO1	94	96.193	ENSMOCG00000009390	Sbno1	87	96.193	Microtus_ochrogaster
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	71.930	ENSMMOG00000008691	sbno1	87	71.088	Mola_mola
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	93.252	ENSMODG00000012470	SBNO1	87	93.496	Monodelphis_domestica
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	75.876	ENSMALG00000001056	sbno1	88	75.218	Monopterus_albus
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	92.033	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	95	97.368	Mus_caroli
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	91.951	ENSMUSG00000038095	Sbno1	94	97.368	Mus_musculus
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	92.345	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	95	97.368	Mus_pahari
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	91.870	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	95	97.368	Mus_spretus
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	92.532	ENSMPUG00000001658	SBNO1	88	92.695	Mustela_putorius_furo
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	92.289	ENSMLUG00000017159	SBNO1	88	92.451	Myotis_lucifugus
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	92.289	ENSNGAG00000012620	Sbno1	89	96.701	Nannospalax_galili
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	74.919	ENSNBRG00000019189	sbno1	88	74.376	Neolamprologus_brichardi
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	89.846	ENSNLEG00000001502	SBNO1	90	89.854	Nomascus_leucogenys
ENSGALG00000003392	SBNO1	75	78.088	ENSMEUG00000008768	-	93	86.709	Notamacropus_eugenii
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	89.376	ENSOPRG00000011054	SBNO1	88	89.457	Ochotona_princeps
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	92.201	ENSODEG00000009997	SBNO1	87	96.701	Octodon_degus
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	76.452	ENSONIG00000015348	sbno1	88	76.070	Oreochromis_niloticus
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	92.364	ENSOCUG00000002441	SBNO1	85	92.445	Oryctolagus_cuniculus
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	75.796	ENSORLG00000001593	sbno1	91	75.398	Oryzias_latipes
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	75.777	ENSORLG00020015216	sbno1	88	75.378	Oryzias_latipes_hni
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	75.936	ENSORLG00015002726	sbno1	88	75.458	Oryzias_latipes_hsok
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	75.835	ENSOMEG00000019313	sbno1	88	75.278	Oryzias_melastigma
ENSGALG00000003392	SBNO1	56	85.201	ENSOGAG00000010781	-	100	85.817	Otolemur_garnettii
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	92.376	ENSOARG00000004404	SBNO1	88	92.539	Ovis_aries
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	92.127	ENSPPAG00000024635	SBNO1	87	96.954	Pan_paniscus
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	92.451	ENSPPRG00000022092	SBNO1	88	92.614	Panthera_pardus
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	92.195	ENSPTIG00000017803	SBNO1	88	92.439	Panthera_tigris_altaica
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	92.127	ENSPTRG00000005597	SBNO1	87	96.954	Pan_troglodytes
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	92.283	ENSPANG00000011640	SBNO1	98	92.162	Papio_anubis
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	81.811	ENSPKIG00000001441	sbno1	88	81.796	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	95.219	ENSPSIG00000009572	-	88	95.219	Pelodiscus_sinensis
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	92.220	ENSPSIG00000009256	-	96	92.464	Pelodiscus_sinensis
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	91.714	ENSPEMG00000016087	Sbno1	87	95.431	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	93.258	ENSPCIG00000010985	SBNO1	88	93.501	Phascolarctos_cinereus
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	76.856	ENSPFOG00000005069	sbno1	88	76.990	Poecilia_formosa
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	76.696	ENSPLAG00000015015	sbno1	88	76.911	Poecilia_latipinna
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ENSGALG00000003392	SBNO1	99	92.532	ENSPCOG00000024277	SBNO1	86	96.907	Propithecus_coquereli
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ENSGALG00000003392	SBNO1	99	76.653	ENSPNYG00000004291	sbno1	88	76.032	Pundamilia_nyererei
ENSGALG00000003392	SBNO1	99	79.227	ENSPNAG00000015622	sbno1	88	79.355	Pygocentrus_nattereri
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