EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGALG00000006410 (Gene tree)
Gene ID: 422245
Gene Symbol: HTATSF1
Alias: TAT-SF1
Full Name: HIV-1 Tat specific factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Gallus_gallus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 13154 bases
Position: chr4:4332282-4345435
Accession: 422245
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGALP00000010334	RRM_1	PF00076.22	5.8e-15	1	2
ENSGALP00000010334	RRM_1	PF00076.22	5.8e-15	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGALT00000010348	HTATSF1-201	4082	-	ENSGALP00000010334	450 (aa)	XP_001233032	F1P1G7

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGALG00000006410	HTATSF1	90	65.707	ENSG00000102241	HTATSF1	100	63.830	Homo_sapiens
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	59.430	ENSAPOG00000009823	htatsf1	99	59.430	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	60.954	ENSACIG00000020459	htatsf1	99	60.954	Amphilophus_citrinellus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	58.225	ENSAOCG00000020994	htatsf1	99	58.225	Amphiprion_ocellaris
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	59.041	ENSAPEG00000016432	htatsf1	99	59.259	Amphiprion_percula
ENSGALG00000006410	HTATSF1	89	62.560	ENSATEG00000008903	htatsf1	88	65.228	Anabas_testudineus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	92	94.673	ENSAPLG00000012401	HTATSF1	100	94.673	Anas_platyrhynchos
ENSGALG00000006410	HTATSF1	85	70.649	ENSACAG00000009346	HTATSF1	98	70.558	Anolis_carolinensis
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	60.475	ENSACLG00000008096	htatsf1	99	60.606	Astatotilapia_calliptera
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	61.752	ENSAMXG00000008387	htatsf1	100	62.527	Astyanax_mexicanus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	90	64.976	ENSBTAG00000054942	HTATSF1	52	65.468	Bos_taurus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	90	64.976	ENSBTAG00000055212	HTATSF1	52	65.468	Bos_taurus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	70	36.170	WBGene00022025	Y65B4A.1	75	36.782	Caenorhabditis_elegans
ENSGALG00000006410	HTATSF1	87	67.839	ENSCJAG00000003676	HTATSF1	50	69.271	Callithrix_jacchus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	90	65.942	ENSCAFG00000023294	HTATSF1	50	68.992	Canis_familiaris
ENSGALG00000006410	HTATSF1	90	65.217	ENSCHIG00000000312	HTATSF1	53	65.707	Capra_hircus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	78	67.680	ENSCCAG00000025329	-	54	67.895	Cebus_capucinus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	87	67.588	ENSCCAG00000022701	-	50	69.010	Cebus_capucinus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	87	67.246	ENSCATG00000029963	HTATSF1	50	68.462	Cercocebus_atys
ENSGALG00000006410	HTATSF1	87	67.246	ENSCSAG00000007505	HTATSF1	50	68.462	Chlorocebus_sabaeus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	80.357	ENSCPBG00000026092	HTATSF1	99	80.357	Chrysemys_picta_bellii
ENSGALG00000006410	HTATSF1	87	44.186	ENSCING00000005914	-	70	45.879	Ciona_intestinalis
ENSGALG00000006410	HTATSF1	82	40.406	ENSCSAVG00000000371	-	80	43.396	Ciona_savignyi
ENSGALG00000006410	HTATSF1	87	67.494	ENSCANG00000028495	HTATSF1	50	68.718	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	61.572	ENSCVAG00000014070	htatsf1	98	61.354	Cyprinodon_variegatus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	60.832	ENSDARG00000056649	htatsf1	99	61.438	Danio_rerio
ENSGALG00000006410	HTATSF1	76	46.000	FBgn0037081	barc	62	47.143	Drosophila_melanogaster
ENSGALG00000006410	HTATSF1	86	52.567	ENSEBUG00000001534	htatsf1	75	55.172	Eptatretus_burgeri
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	59.170	ENSELUG00000005486	htatsf1	75	67.105	Esox_lucius
ENSGALG00000006410	HTATSF1	90	65.700	ENSFCAG00000031924	HTATSF1	50	68.475	Felis_catus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	100	89.404	ENSFALG00000003728	HTATSF1	100	89.404	Ficedula_albicollis
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	60.304	ENSFHEG00000020286	htatsf1	99	60.652	Fundulus_heteroclitus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	79	64.326	ENSGMOG00000016444	htatsf1	99	64.326	Gadus_morhua
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	61.354	ENSGAFG00000003041	htatsf1	98	60.480	Gambusia_affinis
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	60.573	ENSGACG00000020459	htatsf1	99	60.352	Gasterosteus_aculeatus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	87	67.246	ENSGGOG00000026072	HTATSF1	50	68.462	Gorilla_gorilla
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	61.039	ENSHBUG00000004392	htatsf1	99	61.039	Haplochromis_burtoni
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	57.359	ENSHCOG00000009056	htatsf1	100	59.091	Hippocampus_comes
ENSGALG00000006410	HTATSF1	86	67.617	ENSIPUG00000017828	htatsf1	100	60.515	Ictalurus_punctatus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	90	65.217	ENSSTOG00000012505	HTATSF1	52	68.217	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	62.445	ENSKMAG00000007622	htatsf1	99	61.572	Kryptolebias_marmoratus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	60.394	ENSLBEG00000001154	htatsf1	99	60.394	Labrus_bergylta
ENSGALG00000006410	HTATSF1	100	65.929	ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	65.487	Latimeria_chalumnae
ENSGALG00000006410	HTATSF1	98	45.629	ENSLOCG00000015118	htatsf1	99	44.421	Lepisosteus_oculatus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	84	69.072	ENSLAFG00000014307	HTATSF1	56	68.041	Loxodonta_africana
ENSGALG00000006410	HTATSF1	87	67.494	ENSMFAG00000044705	HTATSF1	50	68.718	Macaca_fascicularis
ENSGALG00000006410	HTATSF1	87	67.246	ENSMMUG00000006450	HTATSF1	50	68.462	Macaca_mulatta
ENSGALG00000006410	HTATSF1	90	65.707	ENSMNEG00000024084	HTATSF1	55	68.462	Macaca_nemestrina
ENSGALG00000006410	HTATSF1	87	67.246	ENSMLEG00000035511	HTATSF1	50	68.462	Mandrillus_leucophaeus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	90	62.892	ENSMAMG00000021225	htatsf1	100	59.565	Mastacembelus_armatus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	60.475	ENSMZEG00005000485	htatsf1	99	60.606	Maylandia_zebra
ENSGALG00000006410	HTATSF1	95	98.131	ENSMGAG00000003558	HTATSF1	99	98.131	Meleagris_gallopavo
ENSGALG00000006410	HTATSF1	90	65.860	ENSMAUG00000007235	Htatsf1	51	68.653	Mesocricetus_auratus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	90	64.748	ENSMICG00000009348	HTATSF1	51	67.008	Microcebus_murinus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	84	68.653	ENSMOCG00000023007	-	50	68.653	Microtus_ochrogaster
ENSGALG00000006410	HTATSF1	87	64.750	ENSMOCG00000022370	-	50	66.150	Microtus_ochrogaster
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	59.477	ENSMMOG00000011013	htatsf1	99	59.170	Mola_mola
ENSGALG00000006410	HTATSF1	54	73.200	ENSMODG00000000199	-	80	76.585	Monodelphis_domestica
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	69.933	ENSMODG00000014087	-	97	69.488	Monodelphis_domestica
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	60.349	ENSMALG00000019977	htatsf1	99	60.349	Monopterus_albus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	84	67.183	MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	51	67.183	Mus_caroli
ENSGALG00000006410	HTATSF1	84	67.183	ENSMUSG00000067873	Htatsf1	50	67.183	Mus_musculus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	84	67.442	MGP_SPRETEiJ_G0034249	Htatsf1	50	67.442	Mus_spretus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	90	65.700	ENSNGAG00000017831	Htatsf1	51	68.475	Nannospalax_galili
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	60.475	ENSNBRG00000003818	htatsf1	99	60.907	Neolamprologus_brichardi
ENSGALG00000006410	HTATSF1	87	67.246	ENSNLEG00000002746	HTATSF1	50	68.462	Nomascus_leucogenys
ENSGALG00000006410	HTATSF1	87	73.804	ENSMEUG00000004133	-	91	75.584	Notamacropus_eugenii
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	60.691	ENSONIG00000008638	htatsf1	99	60.823	Oreochromis_niloticus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	91	77.859	ENSOANG00000011674	-	99	77.859	Ornithorhynchus_anatinus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	90	65.860	ENSOCUG00000012570	HTATSF1	50	68.394	Oryctolagus_cuniculus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	62.445	ENSORLG00000002356	htatsf1	99	62.445	Oryzias_latipes
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	62.745	ENSORLG00020017818	htatsf1	96	63.181	Oryzias_latipes_hni
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	61.874	ENSORLG00015002268	htatsf1	99	62.151	Oryzias_latipes_hsok
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	61.957	ENSOMEG00000007564	htatsf1	99	61.957	Oryzias_melastigma
ENSGALG00000006410	HTATSF1	90	64.976	ENSOARG00000011215	-	52	65.468	Ovis_aries
ENSGALG00000006410	HTATSF1	90	65.707	ENSPPAG00000024268	HTATSF1	50	68.462	Pan_paniscus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	90	65.700	ENSPPRG00000014209	HTATSF1	50	68.734	Panthera_pardus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	90	65.707	ENSPTRG00000044591	HTATSF1	50	68.462	Pan_troglodytes
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	61.111	ENSPKIG00000024852	htatsf1	99	61.111	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGALG00000006410	HTATSF1	78	82.153	ENSPSIG00000010192	HTATSF1	99	82.153	Pelodiscus_sinensis
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	61.304	ENSPMGG00000006172	htatsf1	99	60.870	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	84	68.135	ENSPEMG00000022397	Htatsf1	50	68.135	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGALG00000006410	HTATSF1	98	65.772	ENSPCIG00000018896	-	98	65.772	Phascolarctos_cinereus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	88	73.632	ENSPCIG00000030173	-	86	76.579	Phascolarctos_cinereus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	61.354	ENSPFOG00000007871	htatsf1	96	61.220	Poecilia_formosa
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	60.917	ENSPLAG00000007532	htatsf1	99	60.566	Poecilia_latipinna
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	61.790	ENSPMEG00000000352	htatsf1	99	61.656	Poecilia_mexicana
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	62.527	ENSPREG00000007811	htatsf1	99	61.522	Poecilia_reticulata
ENSGALG00000006410	HTATSF1	87	67.494	ENSPPYG00000020765	HTATSF1	50	68.718	Pongo_abelii
ENSGALG00000006410	HTATSF1	86	60.459	ENSPCAG00000010576	HTATSF1	52	62.005	Procavia_capensis
ENSGALG00000006410	HTATSF1	90	65.459	ENSPCOG00000021823	HTATSF1	50	67.959	Propithecus_coquereli
ENSGALG00000006410	HTATSF1	90	64.619	ENSPVAG00000010281	HTATSF1	54	67.895	Pteropus_vampyrus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	60.475	ENSPNYG00000016693	htatsf1	99	60.606	Pundamilia_nyererei
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	61.277	ENSPNAG00000006166	htatsf1	100	62.361	Pygocentrus_nattereri
ENSGALG00000006410	HTATSF1	90	65.707	ENSRROG00000021939	HTATSF1	50	68.462	Rhinopithecus_roxellana
ENSGALG00000006410	HTATSF1	51	32.099	YNL286W	-	80	31.799	Saccharomyces_cerevisiae
ENSGALG00000006410	HTATSF1	87	67.250	ENSSBOG00000027186	-	50	69.010	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSGALG00000006410	HTATSF1	98	69.799	ENSSHAG00000018908	-	90	71.734	Sarcophilus_harrisii
ENSGALG00000006410	HTATSF1	86	73.469	ENSSHAG00000006440	-	91	77.159	Sarcophilus_harrisii
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	59.698	ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	59.657	Scleropages_formosus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	59.868	ENSSMAG00000002970	htatsf1	99	59.957	Scophthalmus_maximus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	80	64.785	ENSSDUG00000020002	htatsf1	87	64.402	Seriola_dumerili
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	58.952	ENSSLDG00000016880	htatsf1	99	59.170	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSGALG00000006410	HTATSF1	89	62.899	ENSSARG00000005193	HTATSF1	52	64.948	Sorex_araneus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	74.777	ENSSPUG00000014767	HTATSF1	98	74.777	Sphenodon_punctatus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	58.297	ENSSPAG00000000732	htatsf1	99	58.297	Stegastes_partitus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	60.297	ENSSSCG00000023062	HTATSF1	67	60.421	Sus_scrofa
ENSGALG00000006410	HTATSF1	100	90.687	ENSTGUG00000002099	HTATSF1	100	90.687	Taeniopygia_guttata
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	61.404	ENSTRUG00000013383	htatsf1	99	61.404	Takifugu_rubripes
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	60.394	ENSTNIG00000016140	htatsf1	98	60.784	Tetraodon_nigroviridis
ENSGALG00000006410	HTATSF1	76	69.231	ENSTTRG00000002269	HTATSF1	55	71.429	Tursiops_truncatus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	90	66.184	ENSUAMG00000012048	HTATSF1	50	68.992	Ursus_americanus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	98	64.574	ENSXETG00000019749	htatsf1	84	64.574	Xenopus_tropicalis
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	58.299	ENSXCOG00000006912	htatsf1	89	67.532	Xiphophorus_couchianus
ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	64.000	ENSXMAG00000000490	htatsf1	99	63.111	Xiphophorus_maculatus