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Description

Ensembl ID: ENSGALG00000010164 (Gene tree)
Gene ID: 396040
Gene Symbol: SMARCA2
Alias: BRM
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Gallus_gallus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 109626 bases
Position: chrZ:26326425-26436050
Accession: 396040
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGALP00000043568	ResIII	PF04851.15	2e-08	1	1
ENSGALP00000050285	ResIII	PF04851.15	2e-08	1	1
ENSGALP00000016509	ResIII	PF04851.15	2e-08	1	1
ENSGALP00000043568	BRK	PF07533.16	1.4e-17	1	1
ENSGALP00000050285	BRK	PF07533.16	1.4e-17	1	1
ENSGALP00000016509	BRK	PF07533.16	1.4e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGALT00000016528	SMARCA2-202	6151	-	ENSGALP00000016509	1594 (aa)	-	E1C2F7
ENSGALT00000057965	SMARCA2-203	5077	-	ENSGALP00000043568	1548 (aa)	-	A0A1D5NTB4
ENSGALT00000055751	SMARCA2-201	5647	XM_025144681	ENSGALP00000050285	1568 (aa)	XP_025000449	A0A1D5PC01

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	91.863	ENSG00000080503	SMARCA2	100	98.500	Homo_sapiens
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	80.502	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	80.257	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	81	95.622	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	95.622	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	79.737	ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	79.330	Amphilophus_citrinellus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	80.401	ENSAOCG00000009647	-	97	80.411	Amphiprion_ocellaris
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	80.502	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	97	80.450	Amphiprion_percula
ENSGALG00000010164	SMARCA2	99	81.119	ENSATEG00000006916	SMARCA2	95	81.018	Anabas_testudineus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	89	94.180	ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	93.967	Anas_platyrhynchos
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	92.930	ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	92.803	Anolis_carolinensis
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	91.858	ENSANAG00000026498	SMARCA2	100	92.748	Aotus_nancymaae
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	80.543	ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	79.744	Astatotilapia_calliptera
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	82.726	ENSAMXG00000012404	smarca2	97	82.896	Astyanax_mexicanus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	92.112	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	100	93.003	Bos_taurus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	91.825	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	100	92.712	Callithrix_jacchus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	92.366	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	100	93.130	Canis_familiaris
ENSGALG00000010164	SMARCA2	77	94.574	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	97	94.574	Canis_lupus_dingo
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	92.430	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	100	93.003	Capra_hircus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	88.740	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	92.263	Carlito_syrichta
ENSGALG00000010164	SMARCA2	99	88.796	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	99	88.660	Cavia_aperea
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	91.608	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	100	92.254	Cavia_porcellus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	91.985	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	100	92.875	Cebus_capucinus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	91.741	ENSCATG00000031470	SMARCA2	100	91.736	Cercocebus_atys
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	91.550	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	92.186	Chinchilla_lanigera
ENSGALG00000010164	SMARCA2	93	92.245	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	99	92.537	Chlorocebus_sabaeus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	85	87.821	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	86	87.821	Choloepus_hoffmanni
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	96.051	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	100	96.051	Chrysemys_picta_bellii
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	91.921	ENSCANG00000039597	SMARCA2	100	92.812	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	99	76.662	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	96	75.373	Cynoglossus_semilaevis
ENSGALG00000010164	SMARCA2	84	78.164	ENSCVAG00000016571	SMARCA2	95	77.599	Cyprinodon_variegatus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	82.807	ENSDARG00000008904	smarca2	97	82.521	Danio_rerio
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	91.499	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	100	91.877	Dasypus_novemcinctus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	91.481	ENSDORG00000014832	Smarca2	100	92.386	Dipodomys_ordii
ENSGALG00000010164	SMARCA2	80	60.962	FBgn0000212	brm	85	55.112	Drosophila_melanogaster
ENSGALG00000010164	SMARCA2	91	61.859	ENSEBUG00000002449	-	95	64.637	Eptatretus_burgeri
ENSGALG00000010164	SMARCA2	94	70.936	ENSEBUG00000011442	-	93	70.014	Eptatretus_burgeri
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	92.058	ENSEASG00005010312	SMARCA2	100	93.130	Equus_asinus_asinus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	68	94.444	ENSEEUG00000015540	-	67	94.444	Erinaceus_europaeus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	92	82.041	ENSELUG00000010318	smarca2	95	80.663	Esox_lucius
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	91.858	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	100	92.557	Felis_catus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	98.214	ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	98.354	Ficedula_albicollis
ENSGALG00000010164	SMARCA2	99	90.425	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	99	90.425	Fukomys_damarensis
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	80.248	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	80.013	Fundulus_heteroclitus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	98	77.627	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	78.529	Gadus_morhua
ENSGALG00000010164	SMARCA2	89	96.667	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	89	96.667	Gambusia_affinis
ENSGALG00000010164	SMARCA2	99	79.429	ENSGACG00000014488	SMARCA2	97	78.916	Gasterosteus_aculeatus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	95.987	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	100	95.987	Gopherus_agassizii
ENSGALG00000010164	SMARCA2	78	96.490	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	93	95.687	Gorilla_gorilla
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	80.100	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	97	80.680	Haplochromis_burtoni
ENSGALG00000010164	SMARCA2	99	90.494	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	98	90.577	Heterocephalus_glaber_female
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	91.255	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	100	91.128	Heterocephalus_glaber_male
ENSGALG00000010164	SMARCA2	78	85.955	ENSHCOG00000015348	-	88	86.166	Hippocampus_comes
ENSGALG00000010164	SMARCA2	99	82.484	ENSIPUG00000011060	smarca2	96	82.549	Ictalurus_punctatus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	91.556	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	100	92.381	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	91.349	ENSJJAG00000010867	Smarca2	100	92.020	Jaculus_jaculus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	79.280	ENSKMAG00000015844	-	98	79.580	Kryptolebias_marmoratus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	98	83.873	ENSLOCG00000011499	smarca2	100	84.414	Lepisosteus_oculatus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	90.467	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	91.414	Loxodonta_africana
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	90.239	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	100	89.700	Macaca_fascicularis
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	91.921	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	100	92.812	Macaca_mulatta
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	91.360	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	100	92.503	Macaca_nemestrina
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	89.936	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	100	90.446	Mandrillus_leucophaeus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	80.509	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	98	80.458	Mastacembelus_armatus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	80.251	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	97	80.836	Maylandia_zebra
ENSGALG00000010164	SMARCA2	77	85.622	ENSMGAG00000005160	-	100	79.947	Meleagris_gallopavo
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	91.858	ENSMICG00000005162	SMARCA2	100	92.875	Microcebus_murinus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	91.481	ENSMOCG00000001611	Smarca2	100	91.990	Microtus_ochrogaster
ENSGALG00000010164	SMARCA2	99	78.384	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	96	78.033	Mola_mola
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	94.971	ENSMODG00000003578	SMARCA2	100	95.099	Monodelphis_domestica
ENSGALG00000010164	SMARCA2	99	80.295	ENSMALG00000009611	SMARCA2	96	78.385	Monopterus_albus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	90.852	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	100	90.915	Mus_caroli
ENSGALG00000010164	SMARCA2	84	95.038	ENSMUSG00000024921	Smarca2	99	98.324	Mus_musculus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	91.203	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	100	91.456	Mus_pahari
ENSGALG00000010164	SMARCA2	84	94.885	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	97	100.000	Mus_spretus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	82	95.476	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	94	95.476	Mustela_putorius_furo
ENSGALG00000010164	SMARCA2	99	87.257	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	99	87.967	Myotis_lucifugus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	99	89.638	ENSNGAG00000000108	Smarca2	99	89.245	Nannospalax_galili
ENSGALG00000010164	SMARCA2	96	68.655	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	89	91.209	Neolamprologus_brichardi
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	89.809	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	96	96.656	Nomascus_leucogenys
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	85.337	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	100	85.651	Notamacropus_eugenii
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	86.367	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	86.641	Ochotona_princeps
ENSGALG00000010164	SMARCA2	83	94.892	ENSODEG00000005452	SMARCA2	98	90.874	Octodon_degus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	99	80.302	ENSONIG00000014163	SMARCA2	96	80.568	Oreochromis_niloticus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	50	93.462	ENSOANG00000008299	-	95	97.976	Ornithorhynchus_anatinus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	91.128	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	100	91.546	Oryctolagus_cuniculus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	79.511	ENSORLG00000020820	SMARCA2	100	79.825	Oryzias_latipes
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	79.687	ENSORLG00015006289	SMARCA2	100	79.229	Oryzias_latipes_hsok
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	80.189	ENSOMEG00000009736	-	100	80.177	Oryzias_melastigma
ENSGALG00000010164	SMARCA2	82	96.288	ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	88.279	Otolemur_garnettii
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	91.285	ENSOARG00000013265	SMARCA2	100	89.470	Ovis_aries
ENSGALG00000010164	SMARCA2	93	96.554	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	90	95.893	Pan_paniscus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	91.921	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	100	92.621	Panthera_pardus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	92.503	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	100	92.259	Pan_troglodytes
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	86.358	ENSPANG00000025121	SMARCA2	100	84.433	Papio_anubis
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	84.150	ENSPKIG00000018469	-	100	83.450	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	95.613	ENSPSIG00000006284	SMARCA2	100	95.613	Pelodiscus_sinensis
ENSGALG00000010164	SMARCA2	98	74.202	ENSPMGG00000013696	-	96	74.239	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	90.546	ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	91.175	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGALG00000010164	SMARCA2	94	73.454	ENSPMAG00000005337	-	94	73.105	Petromyzon_marinus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	94.717	ENSPCIG00000015658	SMARCA2	100	95.035	Phascolarctos_cinereus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	80.337	ENSPFOG00000001856	SMARCA2	98	79.860	Poecilia_formosa
ENSGALG00000010164	SMARCA2	99	79.849	ENSPLAG00000017829	SMARCA2	94	79.961	Poecilia_latipinna
ENSGALG00000010164	SMARCA2	99	79.774	ENSPMEG00000001815	-	97	79.733	Poecilia_mexicana
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	79.703	ENSPREG00000013800	SMARCA2	98	79.810	Poecilia_reticulata
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	91.603	ENSPPYG00000019258	SMARCA2	100	92.430	Pongo_abelii
ENSGALG00000010164	SMARCA2	79	79.298	ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	79.298	Procavia_capensis
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	89.828	ENSPCOG00000025709	SMARCA2	100	90.776	Propithecus_coquereli
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ENSGALG00000010164	SMARCA2	89	78.929	ENSXCOG00000011073	SMARCA2	97	78.665	Xiphophorus_couchianus
ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	79.555	ENSXMAG00000015611	SMARCA2	99	80.208	Xiphophorus_maculatus