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Description

Ensembl ID: ENSGALG00000010627 (Gene tree)
Gene ID: 771795
Gene Symbol: PRPF38A
Alias: -
Full Name: Gallus gallus pre-mRNA processing factor 38A (PRPF38A)%2C mRNA.
Gene Type: protein_coding
Species: Gallus_gallus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4312 bases
Position: chr8:24744263-24748574
Accession: NM_001277667
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGALP00000017271	PRP38	PF03371.15	1.8e-63	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGALT00000017291	-	1336	-	ENSGALP00000017271	312 (aa)	-	E1C6A8

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
gga03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	97.756	ENSG00000134748	PRPF38A	100	97.756	Homo_sapiens
ENSGALG00000010627	PRPF38A	71	90.045	ENSAPOG00000011652	prpf38a	100	82.748	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	97.756	ENSAMEG00000009319	PRPF38A	100	97.756	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGALG00000010627	PRPF38A	71	87.330	ENSACIG00000012292	prpf38a	100	75.962	Amphilophus_citrinellus
ENSGALG00000010627	PRPF38A	71	90.045	ENSAOCG00000018004	prpf38a	100	82.748	Amphiprion_ocellaris
ENSGALG00000010627	PRPF38A	71	90.045	ENSAPEG00000021414	prpf38a	100	82.748	Amphiprion_percula
ENSGALG00000010627	PRPF38A	71	89.140	ENSATEG00000004608	prpf38a	100	81.789	Anabas_testudineus
ENSGALG00000010627	PRPF38A	79	99.190	ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	99.190	Anas_platyrhynchos
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	96.154	ENSACAG00000008249	PRPF38A	100	96.154	Anolis_carolinensis
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	97.756	ENSANAG00000027839	PRPF38A	100	97.756	Aotus_nancymaae
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	67.089	ENSANAG00000029204	-	100	62.025	Aotus_nancymaae
ENSGALG00000010627	PRPF38A	71	87.783	ENSACLG00000021595	prpf38a	100	81.150	Astatotilapia_calliptera
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	82.109	ENSAMXG00000029274	prpf38a	100	82.109	Astyanax_mexicanus
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	97.756	ENSBTAG00000002720	PRPF38A	100	97.756	Bos_taurus
ENSGALG00000010627	PRPF38A	63	63.077	WBGene00008380	prp-38	59	64.894	Caenorhabditis_elegans
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	97.756	ENSCJAG00000021594	PRPF38A	100	97.756	Callithrix_jacchus
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	97.756	ENSCAFG00000003740	PRPF38A	100	97.756	Canis_familiaris
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	97.756	ENSCAFG00020010939	PRPF38A	100	97.756	Canis_lupus_dingo
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	97.756	ENSCHIG00000024730	PRPF38A	100	97.756	Capra_hircus
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	97.756	ENSTSYG00000009868	-	100	97.756	Carlito_syrichta
ENSGALG00000010627	PRPF38A	86	96.283	ENSTSYG00000031994	-	95	96.283	Carlito_syrichta
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	97.756	ENSCPOG00000005079	PRPF38A	100	97.756	Cavia_porcellus
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	97.436	ENSCCAG00000026502	PRPF38A	100	97.436	Cebus_capucinus
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	97.756	ENSCATG00000032296	PRPF38A	100	97.756	Cercocebus_atys
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	63.462	ENSCATG00000044190	-	100	62.179	Cercocebus_atys
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	97.756	ENSCLAG00000005816	PRPF38A	100	97.756	Chinchilla_lanigera
ENSGALG00000010627	PRPF38A	78	95.833	ENSCHOG00000008388	PRPF38A	77	95.833	Choloepus_hoffmanni
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	98.397	ENSCPBG00000014791	PRPF38A	100	98.397	Chrysemys_picta_bellii
ENSGALG00000010627	PRPF38A	70	71.889	ENSCSAVG00000009580	-	78	66.949	Ciona_savignyi
ENSGALG00000010627	PRPF38A	96	97.659	ENSCANG00000032608	PRPF38A	100	97.659	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	98.077	ENSCGRG00001018502	-	100	98.077	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGALG00000010627	PRPF38A	74	83.117	ENSCGRG00001002557	-	78	83.117	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	98.077	ENSCGRG00000014868	Prpf38a	100	98.077	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGALG00000010627	PRPF38A	71	88.688	ENSCSEG00000001269	prpf38a	79	87.879	Cynoglossus_semilaevis
ENSGALG00000010627	PRPF38A	71	90.045	ENSCVAG00000012305	prpf38a	100	82.109	Cyprinodon_variegatus
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	81.470	ENSDARG00000039213	prpf38a	100	81.470	Danio_rerio
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	97.756	ENSDNOG00000042326	PRPF38A	100	97.756	Dasypus_novemcinctus
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	84.295	ENSDORG00000023857	-	100	84.295	Dipodomys_ordii
ENSGALG00000010627	PRPF38A	84	81.749	ENSDORG00000023691	-	78	86.344	Dipodomys_ordii
ENSGALG00000010627	PRPF38A	84	81.749	ENSDORG00000025371	-	78	86.344	Dipodomys_ordii
ENSGALG00000010627	PRPF38A	63	74.619	FBgn0050342	Prp38	57	75.532	Drosophila_melanogaster
ENSGALG00000010627	PRPF38A	76	81.513	ENSEBUG00000012588	prpf38a	75	81.545	Eptatretus_burgeri
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	97.756	ENSEASG00005014427	PRPF38A	100	97.756	Equus_asinus_asinus
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	97.756	ENSECAG00000022628	PRPF38A	100	97.756	Equus_caballus
ENSGALG00000010627	PRPF38A	71	86.425	ENSELUG00000021094	prpf38a	100	80.192	Esox_lucius
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	97.756	ENSFCAG00000002518	PRPF38A	100	97.756	Felis_catus
ENSGALG00000010627	PRPF38A	99	86.174	ENSFALG00000003612	-	77	91.775	Ficedula_albicollis
ENSGALG00000010627	PRPF38A	87	98.524	ENSFALG00000005598	-	100	98.524	Ficedula_albicollis
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	97.436	ENSFDAG00000011287	PRPF38A	100	97.436	Fukomys_damarensis
ENSGALG00000010627	PRPF38A	84	79.545	ENSFHEG00000014317	prpf38a	78	88.312	Fundulus_heteroclitus
ENSGALG00000010627	PRPF38A	53	94.578	ENSGMOG00000011384	prpf38a	54	94.578	Gadus_morhua
ENSGALG00000010627	PRPF38A	71	90.950	ENSGAFG00000012422	prpf38a	100	82.748	Gambusia_affinis
ENSGALG00000010627	PRPF38A	71	87.444	ENSGACG00000005423	prpf38a	100	80.635	Gasterosteus_aculeatus
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	98.718	ENSGAGG00000020547	PRPF38A	100	98.718	Gopherus_agassizii
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	97.756	ENSGGOG00000003940	PRPF38A	100	97.756	Gorilla_gorilla
ENSGALG00000010627	PRPF38A	61	92.063	ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	92.021	Haplochromis_burtoni
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	97.756	ENSHGLG00000000475	PRPF38A	100	97.756	Heterocephalus_glaber_female
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	82.051	ENSHGLG00000007918	-	100	81.731	Heterocephalus_glaber_female
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	82.051	ENSHGLG00100003928	-	100	81.731	Heterocephalus_glaber_male
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	97.756	ENSHGLG00100008935	PRPF38A	100	97.756	Heterocephalus_glaber_male
ENSGALG00000010627	PRPF38A	87	69.742	ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	91.489	Hippocampus_comes
ENSGALG00000010627	PRPF38A	74	87.069	ENSIPUG00000005757	prpf38a	75	87.069	Ictalurus_punctatus
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	97.756	ENSSTOG00000015610	PRPF38A	100	97.756	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	97.756	ENSJJAG00000015811	Prpf38a	100	97.756	Jaculus_jaculus
ENSGALG00000010627	PRPF38A	71	89.593	ENSKMAG00000006588	prpf38a	100	81.789	Kryptolebias_marmoratus
ENSGALG00000010627	PRPF38A	96	79.530	ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	79.872	Labrus_bergylta
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	93.590	ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	93.590	Latimeria_chalumnae
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	80.192	ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	81.470	Lepisosteus_oculatus
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	97.756	ENSLAFG00000025862	PRPF38A	100	97.756	Loxodonta_africana
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	97.756	ENSMFAG00000039449	PRPF38A	100	97.756	Macaca_fascicularis
ENSGALG00000010627	PRPF38A	87	96.691	ENSMMUG00000014333	PRPF38A	98	96.691	Macaca_mulatta
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	63.782	ENSMNEG00000040242	-	100	62.821	Macaca_nemestrina
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	97.756	ENSMNEG00000031221	PRPF38A	100	97.756	Macaca_nemestrina
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	97.756	ENSMLEG00000041105	PRPF38A	100	97.756	Mandrillus_leucophaeus
ENSGALG00000010627	PRPF38A	71	89.593	ENSMAMG00000015431	prpf38a	100	82.428	Mastacembelus_armatus
ENSGALG00000010627	PRPF38A	71	87.783	ENSMZEG00005017838	prpf38a	100	81.150	Maylandia_zebra
ENSGALG00000010627	PRPF38A	96	100.000	ENSMGAG00000011176	PRPF38A	100	100.000	Meleagris_gallopavo
ENSGALG00000010627	PRPF38A	85	93.182	ENSMAUG00000018029	-	87	93.074	Mesocricetus_auratus
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	97.756	ENSMICG00000014193	PRPF38A	100	97.756	Microcebus_murinus
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	98.077	ENSMOCG00000013080	Prpf38a	100	98.077	Microtus_ochrogaster
ENSGALG00000010627	PRPF38A	83	81.008	ENSMMOG00000016972	prpf38a	100	74.522	Mola_mola
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	96.805	ENSMODG00000000644	PRPF38A	100	96.805	Monodelphis_domestica
ENSGALG00000010627	PRPF38A	71	88.688	ENSMALG00000019363	prpf38a	97	81.789	Monopterus_albus
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	97.756	MGP_CAROLIEiJ_G0026269	Prpf38a	100	97.756	Mus_caroli
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	97.756	ENSMUSG00000063800	Prpf38a	100	97.756	Mus_musculus
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ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	97.436	MGP_SPRETEiJ_G0027238	Prpf38a	100	98.030	Mus_spretus
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	97.756	ENSMPUG00000006896	PRPF38A	100	97.756	Mustela_putorius_furo
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	98.077	ENSNGAG00000011884	Prpf38a	100	98.077	Nannospalax_galili
ENSGALG00000010627	PRPF38A	71	86.425	ENSNBRG00000004013	prpf38a	98	75.321	Neolamprologus_brichardi
ENSGALG00000010627	PRPF38A	97	71.523	ENSNLEG00000012592	-	99	71.523	Nomascus_leucogenys
ENSGALG00000010627	PRPF38A	93	97.578	ENSNLEG00000017999	PRPF38A	93	97.578	Nomascus_leucogenys
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	65.705	ENSNLEG00000033398	-	94	65.705	Nomascus_leucogenys
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	93.910	ENSMEUG00000003860	PRPF38A	100	93.910	Notamacropus_eugenii
ENSGALG00000010627	PRPF38A	77	97.917	ENSOPRG00000008985	PRPF38A	100	97.917	Ochotona_princeps
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	97.756	ENSODEG00000005869	PRPF38A	100	97.756	Octodon_degus
ENSGALG00000010627	PRPF38A	71	86.878	ENSONIG00000007816	prpf38a	100	80.511	Oreochromis_niloticus
ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	64.650	ENSOANG00000009541	-	100	64.650	Ornithorhynchus_anatinus
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ENSGALG00000010627	PRPF38A	96	81.544	ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	81.470	Oryzias_melastigma
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