EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGALG00000013639 (Gene tree)
Gene ID: 419593
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|GCIPIP
Full Name: Gallus gallus SYF2 pre-mRNA splicing factor (SYF2)%2C mRNA.
Gene Type: protein_coding
Species: Gallus_gallus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2591 bases
Position: chr23:2556373-2558963
Accession: NM_001257294
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGALP00000001891	SYF2	PF08231.12	7e-56	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGALT00000001893	-	1078	-	ENSGALP00000001891	252 (aa)	-	F1P0B5

Gene Model

Click here to download ENSGALG00000013639's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
gga03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSGALG00000013639's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGALG00000013639	SYF2	99	82.000	ENSG00000117614	SYF2	92	88.393	Homo_sapiens
ENSGALG00000013639	SYF2	88	83.784	ENSAPOG00000001174	syf2	93	83.784	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGALG00000013639	SYF2	92	84.549	ENSAMEG00000010115	-	90	88.532	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGALG00000013639	SYF2	77	88.205	ENSAMEG00000010134	-	100	88.205	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGALG00000013639	SYF2	90	80.617	ENSACIG00000023688	syf2	91	80.617	Amphilophus_citrinellus
ENSGALG00000013639	SYF2	86	79.630	ENSAOCG00000010912	syf2	64	82.439	Amphiprion_ocellaris
ENSGALG00000013639	SYF2	94	80.085	ENSAOCG00000022046	syf2	94	83.784	Amphiprion_ocellaris
ENSGALG00000013639	SYF2	97	76.735	ENSAPEG00000018858	syf2	86	83.784	Amphiprion_percula
ENSGALG00000013639	SYF2	86	83.871	ENSATEG00000007745	syf2	93	82.883	Anabas_testudineus
ENSGALG00000013639	SYF2	79	99.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	99.000	Anas_platyrhynchos
ENSGALG00000013639	SYF2	81	87.745	ENSACAG00000013653	-	100	87.745	Anolis_carolinensis
ENSGALG00000013639	SYF2	66	77.246	ENSACAG00000026777	-	94	76.433	Anolis_carolinensis
ENSGALG00000013639	SYF2	99	82.800	ENSANAG00000032473	SYF2	93	87.665	Aotus_nancymaae
ENSGALG00000013639	SYF2	88	81.532	ENSACLG00000019916	syf2	95	80.176	Astatotilapia_calliptera
ENSGALG00000013639	SYF2	88	82.432	ENSAMXG00000004051	syf2	93	82.432	Astyanax_mexicanus
ENSGALG00000013639	SYF2	92	85.776	ENSBTAG00000001651	SYF2	95	87.556	Bos_taurus
ENSGALG00000013639	SYF2	83	52.381	WBGene00019402	syf-2	97	49.558	Caenorhabditis_elegans
ENSGALG00000013639	SYF2	99	82.400	ENSCJAG00000046570	SYF2	92	88.393	Callithrix_jacchus
ENSGALG00000013639	SYF2	89	79.111	ENSCAFG00000030331	-	96	79.111	Canis_familiaris
ENSGALG00000013639	SYF2	100	80.952	ENSCAFG00000012895	-	91	86.667	Canis_familiaris
ENSGALG00000013639	SYF2	72	79.670	ENSCAFG00020021094	-	83	87.179	Canis_lupus_dingo
ENSGALG00000013639	SYF2	100	80.952	ENSCAFG00020021091	-	91	86.667	Canis_lupus_dingo
ENSGALG00000013639	SYF2	92	86.207	ENSCHIG00000020874	SYF2	93	88.000	Capra_hircus
ENSGALG00000013639	SYF2	93	84.615	ENSTSYG00000005114	SYF2	92	86.607	Carlito_syrichta
ENSGALG00000013639	SYF2	79	88.889	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	88.889	Cavia_aperea
ENSGALG00000013639	SYF2	100	80.159	ENSCPOG00000005326	SYF2	92	87.500	Cavia_porcellus
ENSGALG00000013639	SYF2	99	82.800	ENSCCAG00000022459	SYF2	93	87.665	Cebus_capucinus
ENSGALG00000013639	SYF2	99	80.800	ENSCATG00000026917	SYF2	92	86.607	Cercocebus_atys
ENSGALG00000013639	SYF2	100	81.349	ENSCLAG00000008474	SYF2	92	88.839	Chinchilla_lanigera
ENSGALG00000013639	SYF2	99	81.200	ENSCSAG00000000948	SYF2	92	87.054	Chlorocebus_sabaeus
ENSGALG00000013639	SYF2	70	65.909	ENSCHOG00000005273	-	94	66.667	Choloepus_hoffmanni
ENSGALG00000013639	SYF2	94	86.066	ENSCPBG00000025073	SYF2	91	91.111	Chrysemys_picta_bellii
ENSGALG00000013639	SYF2	84	53.738	ENSCING00000003017	-	89	53.271	Ciona_intestinalis
ENSGALG00000013639	SYF2	84	51.869	ENSCSAVG00000006627	-	98	51.869	Ciona_savignyi
ENSGALG00000013639	SYF2	99	72.000	ENSCANG00000037322	SYF2	91	76.786	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGALG00000013639	SYF2	100	81.746	ENSCGRG00001020733	Syf2	93	87.556	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGALG00000013639	SYF2	78	87.755	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	87.437	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGALG00000013639	SYF2	87	78.440	ENSCSEG00000000117	syf2	93	77.477	Cynoglossus_semilaevis
ENSGALG00000013639	SYF2	88	82.805	ENSCVAG00000019543	syf2	95	81.057	Cyprinodon_variegatus
ENSGALG00000013639	SYF2	92	80.169	ENSDARG00000004706	syf2	94	83.408	Danio_rerio
ENSGALG00000013639	SYF2	100	81.028	ENSDNOG00000047605	SYF2	93	87.225	Dasypus_novemcinctus
ENSGALG00000013639	SYF2	100	81.349	ENSDORG00000001274	Syf2	92	88.393	Dipodomys_ordii
ENSGALG00000013639	SYF2	87	58.371	FBgn0033556	CG12343	98	58.371	Drosophila_melanogaster
ENSGALG00000013639	SYF2	86	73.148	ENSETEG00000015729	SYF2	92	74.286	Echinops_telfairi
ENSGALG00000013639	SYF2	78	59.391	ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.391	Eptatretus_burgeri
ENSGALG00000013639	SYF2	97	83.265	ENSEASG00005004224	-	91	88.839	Equus_asinus_asinus
ENSGALG00000013639	SYF2	92	78.017	ENSEASG00005004232	-	94	78.855	Equus_asinus_asinus
ENSGALG00000013639	SYF2	100	82.937	ENSECAG00000012023	-	93	88.546	Equus_caballus
ENSGALG00000013639	SYF2	95	84.937	ENSECAG00000010440	-	95	88.546	Equus_caballus
ENSGALG00000013639	SYF2	68	73.410	ENSEEUG00000015084	SYF2	91	75.904	Erinaceus_europaeus
ENSGALG00000013639	SYF2	88	85.068	ENSELUG00000003465	syf2	93	85.068	Esox_lucius
ENSGALG00000013639	SYF2	92	86.695	ENSFCAG00000010324	-	78	88.889	Felis_catus
ENSGALG00000013639	SYF2	100	81.102	ENSFCAG00000043095	-	92	87.281	Felis_catus
ENSGALG00000013639	SYF2	81	94.118	ENSFALG00000000460	SYF2	92	91.189	Ficedula_albicollis
ENSGALG00000013639	SYF2	100	81.349	ENSFDAG00000008310	SYF2	92	88.393	Fukomys_damarensis
ENSGALG00000013639	SYF2	88	68.304	ENSFHEG00000007238	syf2	99	68.304	Fundulus_heteroclitus
ENSGALG00000013639	SYF2	87	80.365	ENSGMOG00000019138	syf2	98	80.365	Gadus_morhua
ENSGALG00000013639	SYF2	88	81.081	ENSGAFG00000019435	syf2	93	81.081	Gambusia_affinis
ENSGALG00000013639	SYF2	88	81.532	ENSGACG00000007305	syf2	93	81.532	Gasterosteus_aculeatus
ENSGALG00000013639	SYF2	89	91.556	ENSGAGG00000010670	SYF2	91	91.556	Gopherus_agassizii
ENSGALG00000013639	SYF2	99	81.600	ENSGGOG00000012796	SYF2	92	87.946	Gorilla_gorilla
ENSGALG00000013639	SYF2	90	80.176	ENSHBUG00000020477	syf2	97	80.176	Haplochromis_burtoni
ENSGALG00000013639	SYF2	100	81.746	ENSHGLG00000014393	SYF2	92	88.839	Heterocephalus_glaber_female
ENSGALG00000013639	SYF2	89	76.786	ENSHGLG00000004304	-	94	75.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSGALG00000013639	SYF2	100	81.746	ENSHGLG00100014722	SYF2	92	88.839	Heterocephalus_glaber_male
ENSGALG00000013639	SYF2	100	73.333	ENSHCOG00000012904	syf2	73	81.081	Hippocampus_comes
ENSGALG00000013639	SYF2	87	83.562	ENSIPUG00000019859	syf2	92	83.562	Ictalurus_punctatus
ENSGALG00000013639	SYF2	58	84.932	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	84.932	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGALG00000013639	SYF2	79	88.945	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	88.945	Jaculus_jaculus
ENSGALG00000013639	SYF2	88	82.883	ENSKMAG00000013856	syf2	94	82.883	Kryptolebias_marmoratus
ENSGALG00000013639	SYF2	86	85.253	ENSLBEG00000014425	syf2	94	83.408	Labrus_bergylta
ENSGALG00000013639	SYF2	89	83.482	ENSLACG00000012064	SYF2	94	83.482	Latimeria_chalumnae
ENSGALG00000013639	SYF2	98	76.892	ENSLOCG00000002728	syf2	89	84.305	Lepisosteus_oculatus
ENSGALG00000013639	SYF2	73	62.567	ENSLAFG00000030814	-	100	62.567	Loxodonta_africana
ENSGALG00000013639	SYF2	100	80.632	ENSLAFG00000023150	-	93	86.784	Loxodonta_africana
ENSGALG00000013639	SYF2	99	81.200	ENSMFAG00000041831	SYF2	92	87.054	Macaca_fascicularis
ENSGALG00000013639	SYF2	99	81.600	ENSMMUG00000002968	SYF2	92	87.500	Macaca_mulatta
ENSGALG00000013639	SYF2	99	81.200	ENSMNEG00000030180	SYF2	92	87.054	Macaca_nemestrina
ENSGALG00000013639	SYF2	99	80.800	ENSMLEG00000030248	SYF2	92	86.607	Mandrillus_leucophaeus
ENSGALG00000013639	SYF2	86	82.028	ENSMAMG00000010403	syf2	92	81.081	Mastacembelus_armatus
ENSGALG00000013639	SYF2	93	79.060	ENSMZEG00005006429	syf2	95	80.176	Maylandia_zebra
ENSGALG00000013639	SYF2	79	100.000	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	100.000	Meleagris_gallopavo
ENSGALG00000013639	SYF2	99	82.400	ENSMAUG00000018974	Syf2	93	88.444	Mesocricetus_auratus
ENSGALG00000013639	SYF2	79	89.447	ENSMICG00000016191	SYF2	100	89.447	Microcebus_murinus
ENSGALG00000013639	SYF2	90	87.719	ENSMOCG00000022938	Syf2	93	88.444	Microtus_ochrogaster
ENSGALG00000013639	SYF2	88	79.730	ENSMMOG00000002396	syf2	93	79.730	Mola_mola
ENSGALG00000013639	SYF2	89	85.841	ENSMODG00000013951	-	99	85.841	Monodelphis_domestica
ENSGALG00000013639	SYF2	93	76.667	ENSMALG00000010706	syf2	93	80.717	Monopterus_albus
ENSGALG00000013639	SYF2	90	87.281	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	94	87.225	Mus_caroli
ENSGALG00000013639	SYF2	90	87.281	ENSMUSG00000028821	Syf2	94	87.225	Mus_musculus
ENSGALG00000013639	SYF2	90	87.281	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	94	87.225	Mus_pahari
ENSGALG00000013639	SYF2	90	87.281	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	94	87.225	Mus_spretus
ENSGALG00000013639	SYF2	100	80.952	ENSMPUG00000015802	-	92	86.784	Mustela_putorius_furo
ENSGALG00000013639	SYF2	93	85.043	ENSMPUG00000015801	-	91	87.500	Mustela_putorius_furo
ENSGALG00000013639	SYF2	92	85.897	ENSMLUG00000001885	SYF2	93	87.225	Myotis_lucifugus
ENSGALG00000013639	SYF2	93	85.169	ENSNGAG00000007912	Syf2	91	88.789	Nannospalax_galili
ENSGALG00000013639	SYF2	93	71.130	ENSNBRG00000010720	syf2	95	71.983	Neolamprologus_brichardi
ENSGALG00000013639	SYF2	99	82.000	ENSNLEG00000035185	SYF2	92	87.946	Nomascus_leucogenys
ENSGALG00000013639	SYF2	92	85.281	ENSOPRG00000012870	SYF2	93	86.667	Ochotona_princeps
ENSGALG00000013639	SYF2	100	72.619	ENSODEG00000014338	-	93	78.571	Octodon_degus
ENSGALG00000013639	SYF2	95	82.917	ENSODEG00000017664	-	94	87.054	Octodon_degus
ENSGALG00000013639	SYF2	88	81.532	ENSONIG00000008213	syf2	95	80.176	Oreochromis_niloticus
ENSGALG00000013639	SYF2	80	90.099	ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.099	Ornithorhynchus_anatinus
ENSGALG00000013639	SYF2	86	89.815	ENSOCUG00000013050	SYF2	92	88.839	Oryctolagus_cuniculus
ENSGALG00000013639	SYF2	87	84.862	ENSORLG00000028820	syf2	94	84.862	Oryzias_latipes
ENSGALG00000013639	SYF2	87	84.862	ENSORLG00020018333	syf2	92	84.862	Oryzias_latipes_hni
ENSGALG00000013639	SYF2	90	82.743	ENSORLG00015014665	syf2	94	82.743	Oryzias_latipes_hsok
ENSGALG00000013639	SYF2	87	84.862	ENSOMEG00000013911	syf2	95	81.938	Oryzias_melastigma
ENSGALG00000013639	SYF2	100	81.349	ENSOGAG00000009962	SYF2	92	87.946	Otolemur_garnettii
ENSGALG00000013639	SYF2	92	85.106	ENSOARG00000006348	-	92	87.225	Ovis_aries
ENSGALG00000013639	SYF2	77	62.051	ENSOARG00000006269	-	100	62.051	Ovis_aries
ENSGALG00000013639	SYF2	99	81.600	ENSPPAG00000036579	SYF2	92	87.946	Pan_paniscus
ENSGALG00000013639	SYF2	100	81.102	ENSPPRG00000001651	-	92	87.281	Panthera_pardus
ENSGALG00000013639	SYF2	92	86.695	ENSPPRG00000001638	-	91	88.889	Panthera_pardus
ENSGALG00000013639	SYF2	100	80.952	ENSPTIG00000007036	-	92	87.225	Panthera_tigris_altaica
ENSGALG00000013639	SYF2	86	90.278	ENSPTIG00000005711	-	81	89.238	Panthera_tigris_altaica
ENSGALG00000013639	SYF2	99	81.600	ENSPTRG00000000352	SYF2	92	87.946	Pan_troglodytes
ENSGALG00000013639	SYF2	99	81.200	ENSPANG00000008139	SYF2	92	87.054	Papio_anubis
ENSGALG00000013639	SYF2	93	80.426	ENSPKIG00000008130	syf2	94	83.710	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGALG00000013639	SYF2	94	87.712	ENSPSIG00000011816	SYF2	88	90.667	Pelodiscus_sinensis
ENSGALG00000013639	SYF2	94	77.311	ENSPMGG00000008755	syf2	89	79.295	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGALG00000013639	SYF2	93	85.897	ENSPEMG00000008283	Syf2	93	88.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGALG00000013639	SYF2	89	90.625	ENSPCIG00000014235	SYF2	90	90.625	Phascolarctos_cinereus
ENSGALG00000013639	SYF2	88	81.532	ENSPFOG00000004116	syf2	92	81.532	Poecilia_formosa
ENSGALG00000013639	SYF2	96	75.403	ENSPLAG00000006691	syf2	95	81.532	Poecilia_latipinna
ENSGALG00000013639	SYF2	92	76.395	ENSPMEG00000011684	syf2	95	78.829	Poecilia_mexicana
ENSGALG00000013639	SYF2	86	82.870	ENSPREG00000003009	syf2	94	81.166	Poecilia_reticulata
ENSGALG00000013639	SYF2	99	82.400	ENSPPYG00000001713	SYF2	92	88.393	Pongo_abelii
ENSGALG00000013639	SYF2	100	56.746	ENSPCOG00000027011	SYF2	89	59.821	Propithecus_coquereli
ENSGALG00000013639	SYF2	92	75.862	ENSPVAG00000005841	SYF2	91	77.679	Pteropus_vampyrus
ENSGALG00000013639	SYF2	88	81.532	ENSPNYG00000004979	syf2	95	80.176	Pundamilia_nyererei
ENSGALG00000013639	SYF2	88	84.234	ENSPNAG00000015570	syf2	93	84.234	Pygocentrus_nattereri
ENSGALG00000013639	SYF2	90	87.281	ENSRNOG00000060597	Syf2	94	87.225	Rattus_norvegicus
ENSGALG00000013639	SYF2	99	78.800	ENSRBIG00000042970	SYF2	92	84.375	Rhinopithecus_bieti
ENSGALG00000013639	SYF2	99	81.200	ENSRROG00000001347	SYF2	92	87.054	Rhinopithecus_roxellana
ENSGALG00000013639	SYF2	99	82.400	ENSSBOG00000020184	SYF2	93	87.225	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSGALG00000013639	SYF2	81	90.291	ENSSHAG00000007152	-	100	90.291	Sarcophilus_harrisii
ENSGALG00000013639	SYF2	93	83.065	ENSSHAG00000015630	-	90	89.732	Sarcophilus_harrisii
ENSGALG00000013639	SYF2	90	81.498	ENSSFOG00015023647	syf2	96	81.498	Scleropages_formosus
ENSGALG00000013639	SYF2	96	74.793	ENSSMAG00000009867	syf2	93	80.631	Scophthalmus_maximus
ENSGALG00000013639	SYF2	87	83.486	ENSSDUG00000013072	syf2	94	81.614	Seriola_dumerili
ENSGALG00000013639	SYF2	87	83.486	ENSSLDG00000012677	syf2	94	81.614	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSGALG00000013639	SYF2	96	66.390	ENSSARG00000012889	SYF2	92	69.778	Sorex_araneus
ENSGALG00000013639	SYF2	95	84.937	ENSSPUG00000005251	SYF2	89	88.839	Sphenodon_punctatus
ENSGALG00000013639	SYF2	93	78.059	ENSSPAG00000009626	syf2	93	81.532	Stegastes_partitus
ENSGALG00000013639	SYF2	93	85.043	ENSSSCG00000037481	SYF2	92	87.556	Sus_scrofa
ENSGALG00000013639	SYF2	78	63.366	ENSTGUG00000001126	SYF2	86	66.860	Taeniopygia_guttata
ENSGALG00000013639	SYF2	96	75.207	ENSTRUG00000001499	syf2	89	81.081	Takifugu_rubripes
ENSGALG00000013639	SYF2	88	79.821	ENSTNIG00000016912	syf2	100	79.821	Tetraodon_nigroviridis
ENSGALG00000013639	SYF2	100	61.905	ENSTBEG00000017370	SYF2	90	65.179	Tupaia_belangeri
ENSGALG00000013639	SYF2	100	81.746	ENSTTRG00000003550	SYF2	92	88.444	Tursiops_truncatus
ENSGALG00000013639	SYF2	100	79.842	ENSUAMG00000002897	SYF2	92	85.903	Ursus_americanus
ENSGALG00000013639	SYF2	100	80.159	ENSUMAG00000013108	SYF2	92	86.344	Ursus_maritimus
ENSGALG00000013639	SYF2	95	84.167	ENSVPAG00000005705	SYF2	93	87.225	Vicugna_pacos
ENSGALG00000013639	SYF2	100	80.952	ENSVVUG00000027175	-	91	86.667	Vulpes_vulpes
ENSGALG00000013639	SYF2	81	88.293	ENSVVUG00000027181	-	91	86.222	Vulpes_vulpes
ENSGALG00000013639	SYF2	96	80.408	ENSXETG00000022797	syf2	90	85.333	Xenopus_tropicalis
ENSGALG00000013639	SYF2	85	82.791	ENSXMAG00000022698	syf2	93	80.631	Xiphophorus_maculatus