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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGALG00000015014 (Gene tree)
Gene ID: 427218
Gene Symbol: TNPO1
Alias: IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Gallus_gallus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 75925 bases
Position: chrZ:25036411-25112335
Accession: 427218
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGALP00000024167	IBN_N	PF03810.19	3.2e-16	1	1
ENSGALP00000068918	IBN_N	PF03810.19	3.3e-16	1	1
ENSGALP00000058329	IBN_N	PF03810.19	3.9e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGALT00000098591	TNPO1-202	3265	-	ENSGALP00000068918	896 (aa)	XP_424806	UPI0003505C19
ENSGALT00000024213	TNPO1-201	3440	XM_025144810	ENSGALP00000024167	890 (aa)	XP_025000578	F1NSW3
ENSGALT00000076076	TNPO1-203	2762	-	ENSGALP00000058329	868 (aa)	-	A0A1D5PZB8

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.742	ENSG00000083312	TNPO1	100	97.409	Homo_sapiens
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	93.371	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.371	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	95.880	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	95.880	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGALG00000015014	TNPO1	89	92.894	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.894	Amphilophus_citrinellus
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	93.483	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	93.483	Amphiprion_ocellaris
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	93.483	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.483	Amphiprion_percula
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	93.146	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.146	Anabas_testudineus
ENSGALG00000015014	TNPO1	99	93.799	ENSAPLG00000009619	-	99	93.799	Anas_platyrhynchos
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	97.640	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	97.640	Anolis_carolinensis
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	86.180	ENSANAG00000025351	-	100	85.938	Aotus_nancymaae
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.292	ENSANAG00000022453	-	100	95.880	Aotus_nancymaae
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	62.584	ENSANAG00000027118	-	99	62.918	Aotus_nancymaae
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	91.236	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.236	Astatotilapia_calliptera
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	92.152	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	91.704	Astyanax_mexicanus
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.629	ENSBTAG00000007979	TNPO1	100	96.214	Bos_taurus
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.404	ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	95.991	Callithrix_jacchus
ENSGALG00000015014	TNPO1	96	96.616	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	96.616	Canis_familiaris
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	94.045	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	94.045	Canis_lupus_dingo
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.517	ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	96.102	Capra_hircus
ENSGALG00000015014	TNPO1	99	92.768	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	95.205	Carlito_syrichta
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.292	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	96.292	Cebus_capucinus
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.742	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	96.742	Cercocebus_atys
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.517	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	96.517	Chinchilla_lanigera
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.742	ENSCSAG00000015616	TNPO1	100	96.325	Chlorocebus_sabaeus
ENSGALG00000015014	TNPO1	97	83.943	ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	83.943	Choloepus_hoffmanni
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	98.539	ENSCPBG00000000260	TNPO1	95	98.322	Chrysemys_picta_bellii
ENSGALG00000015014	TNPO1	99	75.421	ENSCSAVG00000010981	-	99	74.860	Ciona_savignyi
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.742	ENSCANG00000004353	TNPO1	100	96.325	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.629	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	96.214	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGALG00000015014	TNPO1	96	96.725	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	96.725	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	92.360	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.360	Cynoglossus_semilaevis
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	92.809	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	92.809	Cyprinodon_variegatus
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	92.144	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	91.470	Danio_rerio
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	90.594	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	90.594	Dasypus_novemcinctus
ENSGALG00000015014	TNPO1	93	96.627	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	96.622	Dipodomys_ordii
ENSGALG00000015014	TNPO1	99	57.788	FBgn0035693	CG8219	99	57.562	Drosophila_melanogaster
ENSGALG00000015014	TNPO1	89	98.502	ENSETEG00000017805	TNPO1	90	98.502	Echinops_telfairi
ENSGALG00000015014	TNPO1	94	84.881	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	84.643	Eptatretus_burgeri
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.742	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	96.742	Equus_asinus_asinus
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.629	ENSECAG00000024424	TNPO1	100	96.214	Equus_caballus
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	86.710	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.275	Esox_lucius
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.742	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	96.742	Felis_catus
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	98.427	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	98.427	Ficedula_albicollis
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.629	ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	96.214	Fukomys_damarensis
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	93.154	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	92.817	Fundulus_heteroclitus
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	90.146	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	90.157	Gadus_morhua
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	92.265	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.265	Gambusia_affinis
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	93.034	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.034	Gasterosteus_aculeatus
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	98.315	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	98.315	Gopherus_agassizii
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	80.717	ENSGGOG00000022535	-	99	80.649	Gorilla_gorilla
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.742	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	96.742	Gorilla_gorilla
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	92.921	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	92.921	Haplochromis_burtoni
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.292	ENSHGLG00000000970	-	100	95.880	Heterocephalus_glaber_female
ENSGALG00000015014	TNPO1	96	96.262	ENSHGLG00100017090	-	99	96.262	Heterocephalus_glaber_male
ENSGALG00000015014	TNPO1	97	75.465	ENSHGLG00100000963	-	99	75.465	Heterocephalus_glaber_male
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.742	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	96.742	Jaculus_jaculus
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	93.258	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.258	Kryptolebias_marmoratus
ENSGALG00000015014	TNPO1	93	90.259	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.012	Labrus_bergylta
ENSGALG00000015014	TNPO1	96	88.837	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	88.837	Latimeria_chalumnae
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	95.506	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	95.506	Lepisosteus_oculatus
ENSGALG00000015014	TNPO1	97	96.305	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	96.305	Loxodonta_africana
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.742	ENSMFAG00000003636	TNPO1	100	96.325	Macaca_fascicularis
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.629	ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	96.214	Macaca_mulatta
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.742	ENSMNEG00000044581	TNPO1	100	96.325	Macaca_nemestrina
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.742	ENSMLEG00000030740	TNPO1	100	96.325	Mandrillus_leucophaeus
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	93.146	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.146	Mastacembelus_armatus
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	92.584	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.584	Maylandia_zebra
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.629	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	97.753	Mesocricetus_auratus
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	92.921	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	92.921	Microcebus_murinus
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.629	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	96.629	Microtus_ochrogaster
ENSGALG00000015014	TNPO1	89	92.526	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	Mola_mola
ENSGALG00000015014	TNPO1	99	97.447	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.447	Monodelphis_domestica
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	91.910	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	91.910	Monopterus_albus
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.404	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	97.753	Mus_caroli
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.629	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	97.753	Mus_musculus
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.517	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	97.753	Mus_pahari
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.404	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	97.753	Mus_spretus
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.742	ENSMPUG00000014387	TNPO1	100	96.325	Mustela_putorius_furo
ENSGALG00000015014	TNPO1	96	96.391	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	96.391	Myotis_lucifugus
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.629	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	96.214	Nannospalax_galili
ENSGALG00000015014	TNPO1	89	92.765	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.765	Neolamprologus_brichardi
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.742	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	96.742	Nomascus_leucogenys
ENSGALG00000015014	TNPO1	91	90.184	ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	90.184	Ochotona_princeps
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.292	ENSODEG00000001771	TNPO1	100	95.880	Octodon_degus
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	92.188	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.188	Oreochromis_niloticus
ENSGALG00000015014	TNPO1	94	97.683	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.683	Ornithorhynchus_anatinus
ENSGALG00000015014	TNPO1	96	90.187	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	89.953	Oryctolagus_cuniculus
ENSGALG00000015014	TNPO1	89	92.737	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.737	Oryzias_latipes
ENSGALG00000015014	TNPO1	99	92.672	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.672	Oryzias_latipes_hni
ENSGALG00000015014	TNPO1	99	92.897	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	92.897	Oryzias_latipes_hsok
ENSGALG00000015014	TNPO1	99	93.010	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.010	Oryzias_melastigma
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.742	ENSOGAG00000000808	TNPO1	100	96.325	Otolemur_garnettii
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.629	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	96.629	Ovis_aries
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.742	ENSPPAG00000042518	TNPO1	100	96.325	Pan_paniscus
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.742	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	96.742	Panthera_pardus
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.742	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	96.742	Panthera_tigris_altaica
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.742	ENSPTRG00000016972	TNPO1	100	96.325	Pan_troglodytes
ENSGALG00000015014	TNPO1	94	84.530	ENSPTRG00000047731	-	100	84.530	Pan_troglodytes
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.742	ENSPANG00000006074	TNPO1	100	96.325	Papio_anubis
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	89.663	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	89.663	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	98.315	ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	98.103	Pelodiscus_sinensis
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	90.460	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.236	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGALG00000015014	TNPO1	96	96.725	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	96.725	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	97.640	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	97.640	Phascolarctos_cinereus
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	93.057	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	93.057	Poecilia_formosa
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	93.057	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.057	Poecilia_latipinna
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	93.258	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.258	Poecilia_mexicana
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	93.161	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.161	Poecilia_reticulata
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.629	ENSPPYG00000015545	TNPO1	100	96.214	Pongo_abelii
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.629	ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	96.214	Propithecus_coquereli
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.517	ENSPVAG00000013051	TNPO1	100	96.102	Pteropus_vampyrus
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	92.705	ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	92.368	Pundamilia_nyererei
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	91.928	ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	92.265	Pygocentrus_nattereri
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.742	ENSRNOG00000014999	Tnpo1	100	96.742	Rattus_norvegicus
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.742	ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	96.742	Rhinopithecus_bieti
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.742	ENSRROG00000035271	TNPO1	100	96.325	Rhinopithecus_roxellana
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.404	ENSSBOG00000029256	TNPO1	100	96.404	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSGALG00000015014	TNPO1	97	96.875	ENSSHAG00000007120	TNPO1	100	96.875	Sarcophilus_harrisii
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	93.939	ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	93.603	Scleropages_formosus
ENSGALG00000015014	TNPO1	96	92.991	ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	92.991	Scophthalmus_maximus
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	93.371	ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	93.371	Seriola_dumerili
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	93.371	ENSSLDG00000014578	tnpo1	100	93.371	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	97.865	ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	97.865	Sphenodon_punctatus
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	93.483	ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	93.483	Stegastes_partitus
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.742	ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	96.742	Sus_scrofa
ENSGALG00000015014	TNPO1	99	96.205	ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	96.205	Taeniopygia_guttata
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	92.697	ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.697	Takifugu_rubripes
ENSGALG00000015014	TNPO1	71	88.474	ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	88.474	Tetraodon_nigroviridis
ENSGALG00000015014	TNPO1	87	98.667	ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	98.667	Tupaia_belangeri
ENSGALG00000015014	TNPO1	96	93.216	ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	93.216	Tursiops_truncatus
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.742	ENSUMAG00000007635	TNPO1	100	96.742	Ursus_maritimus
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	92.809	ENSVPAG00000009601	TNPO1	100	92.428	Vicugna_pacos
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.742	ENSVVUG00000007338	TNPO1	100	96.742	Vulpes_vulpes
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	94.719	ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.494	Xenopus_tropicalis
ENSGALG00000015014	TNPO1	100	92.929	ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	92.593	Xiphophorus_maculatus