EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGALG00000016610 (Gene tree)
Gene ID: 422015
Gene Symbol: PTRHD1
Alias: C2orf79|LOC391356
Full Name: peptidyl-tRNA hydrolase domain containing 1
Gene Type: protein_coding
Species: Gallus_gallus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7374 bases
Position: chr3:105463857-105471230
Accession: 422015
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGALP00000026758	PTH2	PF01981.16	8.8e-21	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
					(aa)

Gene Model

Click here to download ENSGALG00000016610's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSGALG00000016610's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	59.200	ENSG00000184924	PTRHD1	83	61.207	Homo_sapiens
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	55.645	ENSAPOG00000024433	ptrhd1	91	56.522	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	82	59.483	ENSAMEG00000002651	PTRHD1	83	59.483	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	54.839	ENSACIG00000002596	ptrhd1	91	56.522	Amphilophus_citrinellus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	55.645	ENSAOCG00000007632	ptrhd1	91	56.522	Amphiprion_ocellaris
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	55.645	ENSAPEG00000011491	ptrhd1	91	56.522	Amphiprion_percula
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	54.839	ENSATEG00000019199	ptrhd1	91	56.522	Anabas_testudineus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	59.200	ENSANAG00000019089	PTRHD1	83	61.207	Aotus_nancymaae
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	55.645	ENSACLG00000000814	ptrhd1	91	57.391	Astatotilapia_calliptera
ENSGALG00000016610	PTRHD1	93	53.846	ENSAMXG00000034266	ptrhd1	80	55.652	Astyanax_mexicanus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	59.200	ENSBTAG00000015012	PTRHD1	83	62.069	Bos_taurus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	83	41.026	WBGene00050885	Y94H6A.12	100	38.710	Caenorhabditis_elegans
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	60.000	ENSCJAG00000008012	PTRHD1	83	62.069	Callithrix_jacchus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	91	56.589	ENSCAFG00000024865	PTRHD1	83	59.483	Canis_familiaris
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	58.400	ENSCHIG00000014757	PTRHD1	83	61.207	Capra_hircus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	57.600	ENSTSYG00000009995	PTRHD1	83	59.483	Carlito_syrichta
ENSGALG00000016610	PTRHD1	93	59.848	ENSCPOG00000005561	PTRHD1	83	63.793	Cavia_porcellus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	59.200	ENSCCAG00000033856	PTRHD1	83	61.207	Cebus_capucinus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	59.677	ENSCATG00000033690	PTRHD1	83	61.739	Cercocebus_atys
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	57.600	ENSCLAG00000006505	PTRHD1	80	60.345	Chinchilla_lanigera
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	59.200	ENSCSAG00000008490	PTRHD1	83	61.207	Chlorocebus_sabaeus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	72	54.000	ENSCHOG00000001920	PTRHD1	73	54.000	Choloepus_hoffmanni
ENSGALG00000016610	PTRHD1	96	65.926	ENSCPBG00000022276	PTRHD1	82	69.828	Chrysemys_picta_bellii
ENSGALG00000016610	PTRHD1	83	45.299	ENSCING00000019647	-	97	45.217	Ciona_intestinalis
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	59.200	ENSCANG00000034444	PTRHD1	83	61.207	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	56.800	ENSCGRG00001003289	Ptrhd1	55	59.483	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	56.800	ENSCGRG00000011834	Ptrhd1	83	59.483	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	56.000	ENSCSEG00000006943	ptrhd1	91	56.034	Cynoglossus_semilaevis
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	55.645	ENSCVAG00000016345	ptrhd1	91	57.391	Cyprinodon_variegatus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	93	53.846	ENSDARG00000016122	ptrhd1	91	57.391	Danio_rerio
ENSGALG00000016610	PTRHD1	93	55.725	ENSDNOG00000043646	PTRHD1	77	60.345	Dasypus_novemcinctus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	95	55.072	ENSDORG00000026776	Ptrhd1	83	60.345	Dipodomys_ordii
ENSGALG00000016610	PTRHD1	83	52.137	FBgn0038446	CG14903	97	53.043	Drosophila_melanogaster
ENSGALG00000016610	PTRHD1	57	56.098	ENSETEG00000001615	-	71	61.667	Echinops_telfairi
ENSGALG00000016610	PTRHD1	83	46.957	ENSETEG00000009379	-	85	47.368	Echinops_telfairi
ENSGALG00000016610	PTRHD1	84	55.085	ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	55.652	Eptatretus_burgeri
ENSGALG00000016610	PTRHD1	89	41.270	ENSEASG00005001302	-	82	42.241	Equus_asinus_asinus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	93	58.333	ENSECAG00000017730	PTRHD1	83	61.207	Equus_caballus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	89	42.063	ENSECAG00000005314	-	79	43.103	Equus_caballus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	56.000	ENSEEUG00000004263	PTRHD1	83	57.759	Erinaceus_europaeus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	54.839	ENSELUG00000003837	ptrhd1	91	57.391	Esox_lucius
ENSGALG00000016610	PTRHD1	91	56.589	ENSFCAG00000003648	PTRHD1	83	59.483	Felis_catus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	58.400	ENSFDAG00000004017	PTRHD1	83	60.345	Fukomys_damarensis
ENSGALG00000016610	PTRHD1	93	56.923	ENSFHEG00000009135	ptrhd1	91	59.130	Fundulus_heteroclitus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	93	57.692	ENSGAFG00000005717	ptrhd1	91	60.000	Gambusia_affinis
ENSGALG00000016610	PTRHD1	87	54.918	ENSGACG00000006743	ptrhd1	91	56.522	Gasterosteus_aculeatus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	93	68.702	ENSGAGG00000023951	PTRHD1	91	71.552	Gopherus_agassizii
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	58.400	ENSGGOG00000043870	PTRHD1	92	60.345	Gorilla_gorilla
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	55.645	ENSHBUG00000014289	ptrhd1	91	57.391	Haplochromis_burtoni
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	57.600	ENSHGLG00000008203	PTRHD1	83	59.483	Heterocephalus_glaber_female
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	58.400	ENSHGLG00100012553	PTRHD1	83	60.345	Heterocephalus_glaber_male
ENSGALG00000016610	PTRHD1	94	53.383	ENSHGLG00100004341	-	85	56.897	Heterocephalus_glaber_male
ENSGALG00000016610	PTRHD1	82	56.522	ENSHCOG00000013504	ptrhd1	91	56.522	Hippocampus_comes
ENSGALG00000016610	PTRHD1	82	57.391	ENSIPUG00000004885	ptrhd1	97	57.391	Ictalurus_punctatus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	58.400	ENSSTOG00000006030	PTRHD1	83	61.207	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	99	56.835	ENSJJAG00000024180	Ptrhd1	84	61.207	Jaculus_jaculus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	80	55.357	ENSKMAG00000016961	ptrhd1	99	55.357	Kryptolebias_marmoratus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	55.645	ENSLBEG00000024406	ptrhd1	91	56.522	Labrus_bergylta
ENSGALG00000016610	PTRHD1	85	55.462	ENSLACG00000018052	PTRHD1	91	60.000	Latimeria_chalumnae
ENSGALG00000016610	PTRHD1	93	54.615	ENSLOCG00000015890	ptrhd1	90	57.391	Lepisosteus_oculatus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	59.200	ENSLAFG00000014453	PTRHD1	83	61.207	Loxodonta_africana
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	58.400	ENSMFAG00000040267	PTRHD1	83	60.345	Macaca_fascicularis
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	58.400	ENSMMUG00000009598	PTRHD1	83	60.345	Macaca_mulatta
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	58.400	ENSMNEG00000035044	PTRHD1	83	60.345	Macaca_nemestrina
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	58.065	ENSMLEG00000030314	PTRHD1	83	60.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	54.839	ENSMAMG00000021201	ptrhd1	91	56.522	Mastacembelus_armatus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	55.645	ENSMZEG00005021808	ptrhd1	91	57.391	Maylandia_zebra
ENSGALG00000016610	PTRHD1	90	58.594	ENSMAUG00000019251	Ptrhd1	83	61.207	Mesocricetus_auratus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	60.800	ENSMICG00000001578	PTRHD1	83	62.931	Microcebus_murinus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	57.600	ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	83	60.345	Microtus_ochrogaster
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	55.645	ENSMMOG00000015284	ptrhd1	91	57.391	Mola_mola
ENSGALG00000016610	PTRHD1	96	62.963	ENSMODG00000015895	PTRHD1	85	68.966	Monodelphis_domestica
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	53.226	ENSMALG00000003471	ptrhd1	91	54.783	Monopterus_albus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	56.800	MGP_CAROLIEiJ_G0017582	Ptrhd1	83	60.345	Mus_caroli
ENSGALG00000016610	PTRHD1	100	53.191	ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	83	60.345	Mus_musculus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	100	53.191	MGP_SPRETEiJ_G0018426	Ptrhd1	83	60.345	Mus_spretus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	91	55.039	ENSMPUG00000014016	PTRHD1	83	59.483	Mustela_putorius_furo
ENSGALG00000016610	PTRHD1	93	58.333	ENSMLUG00000014127	PTRHD1	83	61.207	Myotis_lucifugus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	56.800	ENSNGAG00000016335	Ptrhd1	83	58.621	Nannospalax_galili
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	55.645	ENSNBRG00000009690	ptrhd1	91	57.391	Neolamprologus_brichardi
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	59.200	ENSNLEG00000000990	PTRHD1	83	61.207	Nomascus_leucogenys
ENSGALG00000016610	PTRHD1	55	62.025	ENSMEUG00000010482	-	72	71.667	Notamacropus_eugenii
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	60.800	ENSOPRG00000008600	PTRHD1	83	62.931	Ochotona_princeps
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	56.800	ENSODEG00000007805	PTRHD1	80	59.483	Octodon_degus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	55.645	ENSONIG00000015722	ptrhd1	85	57.391	Oreochromis_niloticus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	57.600	ENSOCUG00000015432	PTRHD1	83	60.345	Oryctolagus_cuniculus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	82	56.034	ENSORLG00000028768	ptrhd1	98	56.034	Oryzias_latipes
ENSGALG00000016610	PTRHD1	82	56.034	ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	56.034	Oryzias_latipes_hni
ENSGALG00000016610	PTRHD1	82	56.034	ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	56.034	Oryzias_latipes_hsok
ENSGALG00000016610	PTRHD1	89	53.968	ENSOMEG00000017594	ptrhd1	91	56.522	Oryzias_melastigma
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	56.800	ENSOGAG00000000756	PTRHD1	83	58.621	Otolemur_garnettii
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	59.200	ENSOARG00000018052	PTRHD1	83	62.069	Ovis_aries
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	59.200	ENSPPAG00000035395	PTRHD1	83	61.207	Pan_paniscus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	91	56.589	ENSPPRG00000022961	PTRHD1	83	59.483	Panthera_pardus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	91	56.589	ENSPTIG00000012136	PTRHD1	83	59.483	Panthera_tigris_altaica
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	59.200	ENSPTRG00000011716	PTRHD1	83	61.207	Pan_troglodytes
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	58.400	ENSPANG00000006781	PTRHD1	83	60.345	Papio_anubis
ENSGALG00000016610	PTRHD1	93	53.435	ENSPKIG00000015207	ptrhd1	78	57.391	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGALG00000016610	PTRHD1	82	61.739	ENSPMGG00000020297	ptrhd1	91	61.739	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	75	55.238	ENSPMAG00000007352	ptrhd1	91	56.522	Petromyzon_marinus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	64.000	ENSPCIG00000025242	PTRHD1	92	67.241	Phascolarctos_cinereus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	93	56.489	ENSPFOG00000004468	ptrhd1	82	59.130	Poecilia_formosa
ENSGALG00000016610	PTRHD1	93	56.923	ENSPLAG00000018019	ptrhd1	91	59.130	Poecilia_latipinna
ENSGALG00000016610	PTRHD1	93	57.692	ENSPMEG00000001321	ptrhd1	91	60.000	Poecilia_mexicana
ENSGALG00000016610	PTRHD1	93	57.692	ENSPREG00000017624	ptrhd1	91	60.000	Poecilia_reticulata
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	57.600	ENSPPYG00000012597	PTRHD1	83	59.483	Pongo_abelii
ENSGALG00000016610	PTRHD1	93	53.435	ENSPCAG00000007535	PTRHD1	83	57.759	Procavia_capensis
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	60.000	ENSPCOG00000003110	PTRHD1	83	62.069	Propithecus_coquereli
ENSGALG00000016610	PTRHD1	93	56.818	ENSPVAG00000017514	PTRHD1	83	60.345	Pteropus_vampyrus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	55.645	ENSPNYG00000016755	ptrhd1	91	57.391	Pundamilia_nyererei
ENSGALG00000016610	PTRHD1	93	54.615	ENSPNAG00000028214	ptrhd1	91	57.391	Pygocentrus_nattereri
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	56.000	ENSRNOG00000004059	Ptrhd1	83	59.483	Rattus_norvegicus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	59.200	ENSRBIG00000032190	PTRHD1	83	61.207	Rhinopithecus_bieti
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	59.200	ENSRROG00000029627	PTRHD1	83	61.207	Rhinopithecus_roxellana
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	59.200	ENSSBOG00000031751	PTRHD1	83	61.207	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSGALG00000016610	PTRHD1	96	60.000	ENSSHAG00000005774	PTRHD1	75	64.655	Sarcophilus_harrisii
ENSGALG00000016610	PTRHD1	86	55.372	ENSSFOG00015000526	ptrhd1	94	57.391	Scleropages_formosus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	82	57.391	ENSSMAG00000004450	ptrhd1	91	57.391	Scophthalmus_maximus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	93	54.962	ENSSDUG00000004610	ptrhd1	77	57.391	Seriola_dumerili
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	55.645	ENSSLDG00000006231	ptrhd1	91	57.391	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSGALG00000016610	PTRHD1	82	75.862	ENSSPUG00000002905	PTRHD1	87	75.862	Sphenodon_punctatus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	55.645	ENSSPAG00000000997	ptrhd1	91	56.522	Stegastes_partitus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	70	52.083	ENSSSCG00000040441	-	77	52.083	Sus_scrofa
ENSGALG00000016610	PTRHD1	97	62.044	ENSTGUG00000015169	-	85	68.103	Taeniopygia_guttata
ENSGALG00000016610	PTRHD1	93	53.077	ENSTRUG00000007201	ptrhd1	91	54.783	Takifugu_rubripes
ENSGALG00000016610	PTRHD1	93	55.385	ENSTNIG00000019143	ptrhd1	91	56.522	Tetraodon_nigroviridis
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	55.200	ENSTTRG00000015128	PTRHD1	71	61.000	Tursiops_truncatus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	91	55.814	ENSUAMG00000007305	PTRHD1	83	60.345	Ursus_americanus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	88	57.600	ENSVPAG00000005556	PTRHD1	83	60.345	Vicugna_pacos
ENSGALG00000016610	PTRHD1	79	60.360	ENSXETG00000021176	ptrhd1	83	62.609	Xenopus_tropicalis
ENSGALG00000016610	PTRHD1	93	57.692	ENSXCOG00000019083	ptrhd1	91	60.000	Xiphophorus_couchianus
ENSGALG00000016610	PTRHD1	93	57.692	ENSXMAG00000024458	ptrhd1	91	60.000	Xiphophorus_maculatus