EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSGALG00000029476 (Gene tree)
Gene ID: 421192
Gene Symbol: XPO1
Alias: exportin-1
Full Name: Gallus gallus exportin 1 (XPO1)%2C mRNA.
Gene Type: protein_coding
Species: Gallus_gallus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 41938 bases
Position: chr3:2366625-2408562
Accession: NM_001290134
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGALP00000049025	CRM1_C	PF08767.11	3e-135	1	1
ENSGALP00000049025	Xpo1	PF08389.12	5.5e-41	1	1
ENSGALP00000049025	IBN_N	PF03810.19	2.4e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGALT00000068970	-	6523	-	ENSGALP00000049025	1071 (aa)	-	A0A1D5P8H7

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
gga03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG
gga03013	RNA transport	KEGG
gga05164	Influenza A	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGALG00000029476	XPO1	100	98.599	ENSG00000082898	XPO1	100	99.441	Homo_sapiens
ENSGALG00000029476	XPO1	88	90.745	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	90.745	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGALG00000029476	XPO1	100	96.639	ENSAPOG00000004984	-	100	96.639	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGALG00000029476	XPO1	100	99.627	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	99.627	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGALG00000029476	XPO1	88	96.915	ENSACIG00000010818	-	100	96.915	Amphilophus_citrinellus
ENSGALG00000029476	XPO1	88	93.085	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	93.085	Amphilophus_citrinellus
ENSGALG00000029476	XPO1	100	96.639	ENSAOCG00000010121	-	100	96.639	Amphiprion_ocellaris
ENSGALG00000029476	XPO1	100	92.250	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	92.250	Amphiprion_ocellaris
ENSGALG00000029476	XPO1	100	96.639	ENSAPEG00000007038	-	100	96.639	Amphiprion_percula
ENSGALG00000029476	XPO1	91	92.894	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	92.894	Amphiprion_percula
ENSGALG00000029476	XPO1	100	96.639	ENSATEG00000008816	-	100	96.639	Anabas_testudineus
ENSGALG00000029476	XPO1	100	91.877	ENSATEG00000020750	xpo1a	100	91.877	Anabas_testudineus
ENSGALG00000029476	XPO1	100	100.000	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	100.000	Anas_platyrhynchos
ENSGALG00000029476	XPO1	100	99.813	ENSACAG00000002501	XPO1	100	99.813	Anolis_carolinensis
ENSGALG00000029476	XPO1	100	98.599	ENSANAG00000020802	XPO1	100	98.599	Aotus_nancymaae
ENSGALG00000029476	XPO1	88	93.404	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	93.404	Astatotilapia_calliptera
ENSGALG00000029476	XPO1	100	96.452	ENSACLG00000015192	-	100	96.452	Astatotilapia_calliptera
ENSGALG00000029476	XPO1	100	97.012	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	97.012	Astyanax_mexicanus
ENSGALG00000029476	XPO1	88	94.280	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	94.280	Astyanax_mexicanus
ENSGALG00000029476	XPO1	100	99.720	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	99.720	Bos_taurus
ENSGALG00000029476	XPO1	99	51.941	WBGene00002078	xpo-1	99	51.941	Caenorhabditis_elegans
ENSGALG00000029476	XPO1	100	98.599	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	98.599	Callithrix_jacchus
ENSGALG00000029476	XPO1	100	99.720	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	99.720	Canis_familiaris
ENSGALG00000029476	XPO1	93	99.699	ENSCAFG00020026910	XPO1	99	99.699	Canis_lupus_dingo
ENSGALG00000029476	XPO1	100	99.720	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	99.720	Capra_hircus
ENSGALG00000029476	XPO1	100	99.720	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	99.720	Carlito_syrichta
ENSGALG00000029476	XPO1	53	95.213	ENSCAPG00000006454	-	100	95.213	Cavia_aperea
ENSGALG00000029476	XPO1	100	98.226	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	98.226	Cavia_porcellus
ENSGALG00000029476	XPO1	100	79.499	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.685	Cebus_capucinus
ENSGALG00000029476	XPO1	100	96.834	ENSCATG00000032674	XPO1	100	98.511	Cercocebus_atys
ENSGALG00000029476	XPO1	100	99.440	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	99.440	Chinchilla_lanigera
ENSGALG00000029476	XPO1	100	98.599	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.599	Chlorocebus_sabaeus
ENSGALG00000029476	XPO1	83	99.741	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	99.741	Choloepus_hoffmanni
ENSGALG00000029476	XPO1	100	99.907	ENSCPBG00000026239	XPO1	100	99.907	Chrysemys_picta_bellii
ENSGALG00000029476	XPO1	100	81.285	ENSCING00000024562	-	100	81.285	Ciona_intestinalis
ENSGALG00000029476	XPO1	99	80.299	ENSCSAVG00000005965	-	99	80.299	Ciona_savignyi
ENSGALG00000029476	XPO1	100	94.398	ENSCANG00000028883	XPO1	100	98.404	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGALG00000029476	XPO1	100	98.413	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	98.413	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGALG00000029476	XPO1	100	98.413	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	98.413	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGALG00000029476	XPO1	88	95.745	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.745	Cynoglossus_semilaevis
ENSGALG00000029476	XPO1	100	96.545	ENSCVAG00000016788	-	100	96.545	Cyprinodon_variegatus
ENSGALG00000029476	XPO1	100	91.597	ENSCVAG00000016558	xpo1a	100	91.597	Cyprinodon_variegatus
ENSGALG00000029476	XPO1	100	97.386	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	97.386	Danio_rerio
ENSGALG00000029476	XPO1	100	93.277	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	95.511	Danio_rerio
ENSGALG00000029476	XPO1	100	99.813	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	99.813	Dasypus_novemcinctus
ENSGALG00000029476	XPO1	92	96.193	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	96.193	Dipodomys_ordii
ENSGALG00000029476	XPO1	99	71.134	FBgn0020497	emb	99	71.134	Drosophila_melanogaster
ENSGALG00000029476	XPO1	94	98.339	ENSETEG00000018045	XPO1	94	98.339	Echinops_telfairi
ENSGALG00000029476	XPO1	90	79.979	ENSEBUG00000012580	-	100	88.531	Eptatretus_burgeri
ENSGALG00000029476	XPO1	100	99.720	ENSEASG00005007223	XPO1	100	99.720	Equus_asinus_asinus
ENSGALG00000029476	XPO1	100	99.720	ENSECAG00000024920	XPO1	100	99.720	Equus_caballus
ENSGALG00000029476	XPO1	92	100.000	ENSEEUG00000009479	XPO1	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSGALG00000029476	XPO1	88	95.532	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	95.532	Esox_lucius
ENSGALG00000029476	XPO1	87	93.362	ENSELUG00000014306	-	99	93.362	Esox_lucius
ENSGALG00000029476	XPO1	100	99.720	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	99.720	Felis_catus
ENSGALG00000029476	XPO1	100	99.720	ENSFALG00000010989	XPO1	100	99.720	Ficedula_albicollis
ENSGALG00000029476	XPO1	100	97.852	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	97.852	Fukomys_damarensis
ENSGALG00000029476	XPO1	100	91.877	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	91.877	Fundulus_heteroclitus
ENSGALG00000029476	XPO1	100	90.570	ENSGMOG00000019063	-	100	90.570	Gadus_morhua
ENSGALG00000029476	XPO1	100	93.091	ENSGMOG00000004441	xpo1a	100	93.091	Gadus_morhua
ENSGALG00000029476	XPO1	88	92.979	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.979	Gambusia_affinis
ENSGALG00000029476	XPO1	91	96.601	ENSGAFG00000003355	-	98	96.601	Gambusia_affinis
ENSGALG00000029476	XPO1	100	91.783	ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.783	Gasterosteus_aculeatus
ENSGALG00000029476	XPO1	100	96.359	ENSGACG00000002743	-	100	96.359	Gasterosteus_aculeatus
ENSGALG00000029476	XPO1	100	99.813	ENSGAGG00000017558	XPO1	100	99.813	Gopherus_agassizii
ENSGALG00000029476	XPO1	100	98.599	ENSGGOG00000034878	XPO1	100	98.599	Gorilla_gorilla
ENSGALG00000029476	XPO1	100	92.437	ENSHBUG00000007128	xpo1a	100	92.437	Haplochromis_burtoni
ENSGALG00000029476	XPO1	100	96.545	ENSHBUG00000020037	-	100	96.545	Haplochromis_burtoni
ENSGALG00000029476	XPO1	100	99.346	ENSHGLG00000003115	XPO1	100	99.346	Heterocephalus_glaber_female
ENSGALG00000029476	XPO1	100	99.346	ENSHGLG00100012227	XPO1	100	99.346	Heterocephalus_glaber_male
ENSGALG00000029476	XPO1	88	95.745	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	95.745	Hippocampus_comes
ENSGALG00000029476	XPO1	100	94.304	ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.304	Ictalurus_punctatus
ENSGALG00000029476	XPO1	100	97.012	ENSIPUG00000012891	Xpo1	100	97.012	Ictalurus_punctatus
ENSGALG00000029476	XPO1	100	99.533	ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.533	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGALG00000029476	XPO1	100	99.440	ENSJJAG00000020468	Xpo1	100	99.440	Jaculus_jaculus
ENSGALG00000029476	XPO1	100	96.078	ENSKMAG00000016218	-	100	96.078	Kryptolebias_marmoratus
ENSGALG00000029476	XPO1	100	91.877	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	91.877	Kryptolebias_marmoratus
ENSGALG00000029476	XPO1	88	90.466	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	90.466	Labrus_bergylta
ENSGALG00000029476	XPO1	100	96.639	ENSLBEG00000005740	-	100	96.639	Labrus_bergylta
ENSGALG00000029476	XPO1	100	77.839	ENSLACG00000018213	XPO1	100	77.839	Latimeria_chalumnae
ENSGALG00000029476	XPO1	100	97.292	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	97.292	Lepisosteus_oculatus
ENSGALG00000029476	XPO1	100	99.346	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	99.346	Loxodonta_africana
ENSGALG00000029476	XPO1	100	98.599	ENSMFAG00000038679	XPO1	100	98.599	Macaca_fascicularis
ENSGALG00000029476	XPO1	100	98.599	ENSMMUG00000006941	XPO1	100	98.599	Macaca_mulatta
ENSGALG00000029476	XPO1	100	98.599	ENSMNEG00000030909	XPO1	100	98.599	Macaca_nemestrina
ENSGALG00000029476	XPO1	100	96.837	ENSMLEG00000032004	XPO1	100	96.837	Mandrillus_leucophaeus
ENSGALG00000029476	XPO1	100	96.545	ENSMAMG00000010568	-	100	96.545	Mastacembelus_armatus
ENSGALG00000029476	XPO1	100	92.157	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	92.157	Mastacembelus_armatus
ENSGALG00000029476	XPO1	100	96.452	ENSMZEG00005018158	-	98	96.601	Maylandia_zebra
ENSGALG00000029476	XPO1	100	92.437	ENSMZEG00005005105	xpo1a	100	92.437	Maylandia_zebra
ENSGALG00000029476	XPO1	68	99.725	ENSMGAG00000001496	-	100	99.725	Meleagris_gallopavo
ENSGALG00000029476	XPO1	100	98.413	ENSMAUG00000006769	Xpo1	100	98.413	Mesocricetus_auratus
ENSGALG00000029476	XPO1	100	99.720	ENSMICG00000027770	XPO1	100	99.720	Microcebus_murinus
ENSGALG00000029476	XPO1	100	98.693	ENSMOCG00000012169	Xpo1	100	98.693	Microtus_ochrogaster
ENSGALG00000029476	XPO1	88	93.085	ENSMMOG00000018767	xpo1a	100	93.085	Mola_mola
ENSGALG00000029476	XPO1	87	96.585	ENSMMOG00000008001	-	99	96.585	Mola_mola
ENSGALG00000029476	XPO1	100	98.599	ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.599	Monodelphis_domestica
ENSGALG00000029476	XPO1	88	92.136	ENSMALG00000008617	xpo1a	100	92.136	Monopterus_albus
ENSGALG00000029476	XPO1	100	96.172	ENSMALG00000007085	-	100	96.172	Monopterus_albus
ENSGALG00000029476	XPO1	100	98.786	MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	98.786	Mus_caroli
ENSGALG00000029476	XPO1	100	98.880	ENSMUSG00000020290	Xpo1	100	98.880	Mus_musculus
ENSGALG00000029476	XPO1	100	98.786	MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	98.786	Mus_pahari
ENSGALG00000029476	XPO1	100	98.880	MGP_SPRETEiJ_G0016979	Xpo1	100	98.880	Mus_spretus
ENSGALG00000029476	XPO1	100	99.720	ENSMPUG00000005560	XPO1	100	99.720	Mustela_putorius_furo
ENSGALG00000029476	XPO1	100	99.627	ENSMLUG00000010670	XPO1	100	99.627	Myotis_lucifugus
ENSGALG00000029476	XPO1	100	99.533	ENSNGAG00000022158	Xpo1	100	99.533	Nannospalax_galili
ENSGALG00000029476	XPO1	100	92.437	ENSNBRG00000003776	xpo1a	100	92.437	Neolamprologus_brichardi
ENSGALG00000029476	XPO1	96	95.934	ENSNBRG00000012229	-	100	97.021	Neolamprologus_brichardi
ENSGALG00000029476	XPO1	100	94.722	ENSNLEG00000009680	XPO1	100	94.722	Nomascus_leucogenys
ENSGALG00000029476	XPO1	63	100.000	ENSMEUG00000013277	-	63	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSGALG00000029476	XPO1	100	94.024	ENSOPRG00000012615	XPO1	100	94.024	Ochotona_princeps
ENSGALG00000029476	XPO1	100	98.133	ENSODEG00000012632	XPO1	100	98.133	Octodon_degus
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ENSGALG00000029476	XPO1	93	96.586	ENSONIG00000002969	-	99	96.586	Oreochromis_niloticus
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ENSGALG00000029476	XPO1	100	97.479	ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	97.566	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGALG00000029476	XPO1	100	94.958	ENSPKIG00000005688	XPO1	100	94.958	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGALG00000029476	XPO1	100	98.886	ENSPSIG00000014457	XPO1	100	100.000	Pelodiscus_sinensis
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ENSGALG00000029476	XPO1	99	92.127	ENSTRUG00000001415	xpo1a	100	92.127	Takifugu_rubripes
ENSGALG00000029476	XPO1	100	96.639	ENSTRUG00000005571	-	100	96.639	Takifugu_rubripes
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ENSGALG00000029476	XPO1	100	99.720	ENSUAMG00000026512	XPO1	100	99.720	Ursus_americanus
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ENSGALG00000029476	XPO1	96	95.308	ENSVPAG00000011446	XPO1	100	95.308	Vicugna_pacos
ENSGALG00000029476	XPO1	100	99.720	ENSVVUG00000012009	XPO1	100	99.720	Vulpes_vulpes
ENSGALG00000029476	XPO1	100	98.133	ENSXETG00000002224	xpo1	100	98.133	Xenopus_tropicalis
ENSGALG00000029476	XPO1	88	92.872	ENSXCOG00000011889	XPO1	100	92.872	Xiphophorus_couchianus
ENSGALG00000029476	XPO1	78	97.442	ENSXCOG00000006625	-	97	97.442	Xiphophorus_couchianus
ENSGALG00000029476	XPO1	100	96.359	ENSXMAG00000007353	-	100	96.359	Xiphophorus_maculatus
ENSGALG00000029476	XPO1	100	92.063	ENSXMAG00000005790	xpo1a	100	92.063	Xiphophorus_maculatus