EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGALG00000035499 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SKIV2L
Alias: 170A|DDX13|HLP|SKI2W|SKIV2|SKIV2L1
Full Name: Ski2 like RNA helicase
Gene Type: protein_coding
Species: Gallus_gallus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9071 bases
Position: chr26:501760-510830
Accession: 10898
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGALP00000047745	rRNA_proc-arch	PF13234.6	3e-25	1	1
ENSGALP00000069971	rRNA_proc-arch	PF13234.6	3.7e-25	1	1
ENSGALP00000073389	rRNA_proc-arch	PF13234.6	4.2e-25	1	1
ENSGALP00000047745	DEAD	PF00270.29	1.4e-15	1	1
ENSGALP00000069971	DEAD	PF00270.29	1.7e-15	1	1
ENSGALP00000073389	DEAD	PF00270.29	1.8e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGALT00000094685	SKIV2L-201	3577	-	ENSGALP00000073389	1123 (aa)	-	-
ENSGALT00000098792	SKIV2L-204	894	-	ENSGALP00000073966	297 (aa)	-	-
ENSGALT00000078911	SKIV2L-202	3175	-	ENSGALP00000047745	989 (aa)	-	A0A1D5P4Y1
ENSGALT00000095443	SKIV2L-203	3222	-	ENSGALP00000069971	1073 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSGALG00000035499's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSGALG00000035499's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	60.550	ENSG00000204351	SKIV2L	99	55.249	Homo_sapiens
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	56.907	ENSAPOG00000008257	skiv2l	76	57.039	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.237	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	77	61.331	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	55.533	ENSACIG00000016719	skiv2l	77	55.683	Amphilophus_citrinellus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	56.701	ENSAOCG00000017352	skiv2l	76	56.830	Amphiprion_ocellaris
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	56.701	ENSAPEG00000001055	skiv2l	76	56.830	Amphiprion_percula
ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	56.953	ENSATEG00000007601	skiv2l	76	57.351	Anabas_testudineus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.602	ENSACAG00000011746	SKIV2L	77	60.667	Anolis_carolinensis
ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	60.550	ENSANAG00000037992	SKIV2L	87	60.550	Aotus_nancymaae
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	57.128	ENSACLG00000006886	skiv2l	78	57.188	Astatotilapia_calliptera
ENSGALG00000035499	SKIV2L	97	57.158	ENSAMXG00000011517	skiv2l	76	57.143	Astyanax_mexicanus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.531	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	79	60.529	Bos_taurus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	77	67.526	WBGene00008502	skih-2	78	41.461	Caenorhabditis_elegans
ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	60.652	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	78	60.550	Callithrix_jacchus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.134	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	77	60.915	Canis_familiaris
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.134	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	77	60.915	Canis_lupus_dingo
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.634	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	78	60.634	Capra_hircus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	60.408	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	77	60.811	Carlito_syrichta
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.048	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	79	60.631	Cavia_porcellus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	60.754	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	85	60.652	Cebus_capucinus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.220	ENSCATG00000036901	SKIV2L	85	58.291	Cercocebus_atys
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.174	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	77	61.019	Chinchilla_lanigera
ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	60.652	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	77	61.227	Chlorocebus_sabaeus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	84	62.539	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	76	61.702	Chrysemys_picta_bellii
ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	50.459	ENSCING00000005576	-	82	50.363	Ciona_intestinalis
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.220	ENSCANG00000039709	SKIV2L	85	60.634	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.270	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	77	61.475	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	56.408	ENSCSEG00000011326	skiv2l	76	57.321	Cynoglossus_semilaevis
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	56.907	ENSCVAG00000003072	skiv2l	80	56.920	Cyprinodon_variegatus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	56.495	ENSDARG00000062206	skiv2l	76	56.934	Danio_rerio
ENSGALG00000035499	SKIV2L	90	71.000	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	70	71.779	Dasypus_novemcinctus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	45.096	FBgn0039117	tst	80	44.923	Drosophila_melanogaster
ENSGALG00000035499	SKIV2L	86	60.811	ENSETEG00000009522	SKIV2L	68	69.841	Echinops_telfairi
ENSGALG00000035499	SKIV2L	88	56.050	ENSEBUG00000013680	-	72	56.272	Eptatretus_burgeri
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.737	ENSEASG00005015534	SKIV2L	84	61.043	Equus_asinus_asinus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	91	61.487	ENSECAG00000021823	SKIV2L	73	61.513	Equus_caballus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	66	67.059	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	57	67.059	Erinaceus_europaeus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	56.939	ENSELUG00000000181	skiv2l	81	57.351	Esox_lucius
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.134	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	77	60.811	Felis_catus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	60.393	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	77	60.187	Fukomys_damarensis
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	56.907	ENSFHEG00000008853	skiv2l	80	57.247	Fundulus_heteroclitus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	97	57.261	ENSGMOG00000005926	skiv2l	76	57.442	Gadus_morhua
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	56.302	ENSGAFG00000002382	skiv2l	76	56.517	Gambusia_affinis
ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	55.828	ENSGACG00000002927	skiv2l	77	56.309	Gasterosteus_aculeatus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	54	63.822	ENSGAGG00000015556	SKIV2L	71	64.218	Gopherus_agassizii
ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	60.652	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	85	60.550	Gorilla_gorilla
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	57.231	ENSHBUG00000000726	skiv2l	78	56.830	Haplochromis_burtoni
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	60.784	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	79	59.858	Heterocephalus_glaber_female
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	59.649	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	79	58.746	Heterocephalus_glaber_male
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	56.495	ENSHCOG00000007191	skiv2l	82	56.712	Hippocampus_comes
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	57.202	ENSIPUG00000016263	skiv2l	78	57.440	Ictalurus_punctatus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.427	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	79	60.588	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	60.958	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	78	60.856	Loxodonta_africana
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.220	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	85	60.634	Macaca_fascicularis
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.220	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	85	60.634	Macaca_mulatta
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.220	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	85	60.634	Macaca_nemestrina
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.220	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	85	58.291	Mandrillus_leucophaeus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	57.201	ENSMAMG00000002927	skiv2l	80	57.544	Mastacembelus_armatus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	57.128	ENSMZEG00005026415	skiv2l	78	57.083	Maylandia_zebra
ENSGALG00000035499	SKIV2L	66	96.341	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	73	96.341	Meleagris_gallopavo
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.066	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	77	61.267	Mesocricetus_auratus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.134	ENSMICG00000046331	SKIV2L	78	60.203	Microcebus_murinus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	59.959	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	79	59.858	Microtus_ochrogaster
ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	55.667	ENSMMOG00000014547	skiv2l	82	55.567	Mola_mola
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	62.126	ENSMODG00000015052	SKIV2L	79	60.988	Monodelphis_domestica
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	56.567	ENSMALG00000010535	skiv2l	78	56.517	Monopterus_albus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	60.772	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	100	39.928	Mus_caroli
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.364	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	100	39.928	Mus_musculus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.260	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	100	40.288	Mus_pahari
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.260	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	100	39.928	Mus_spretus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.483	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	77	61.123	Mustela_putorius_furo
ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	61.750	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	79	61.546	Myotis_lucifugus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	56.612	ENSNBRG00000018650	skiv2l	77	56.621	Neolamprologus_brichardi
ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	59.878	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	85	59.694	Nomascus_leucogenys
ENSGALG00000035499	SKIV2L	69	64.336	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	55	64.336	Notamacropus_eugenii
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.753	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	78	61.350	Ochotona_princeps
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	60.472	ENSODEG00000017516	SKIV2L	77	60.540	Octodon_degus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	57.026	ENSONIG00000013500	skiv2l	79	56.517	Oreochromis_niloticus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.531	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	79	60.689	Oryctolagus_cuniculus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	56.295	ENSORLG00000002021	skiv2l	76	56.517	Oryzias_latipes
ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	56.090	ENSORLG00020009462	skiv2l	68	74.586	Oryzias_latipes_hni
ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	55.988	ENSORLG00015016750	skiv2l	80	53.736	Oryzias_latipes_hsok
ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	56.718	ENSOMEG00000008531	skiv2l	78	56.513	Oryzias_melastigma
ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	60.887	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	79	60.484	Otolemur_garnettii
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	58.901	ENSOARG00000002411	-	65	77.901	Ovis_aries
ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	59.919	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	86	59.818	Pan_paniscus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.134	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	77	60.915	Panthera_pardus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	60.619	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	77	60.395	Panthera_tigris_altaica
ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	60.550	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	85	60.449	Pan_troglodytes
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	60.393	ENSPANG00000011501	SKIV2L	85	57.696	Papio_anubis
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	56.818	ENSPKIG00000011876	skiv2l	82	56.830	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	56.625	ENSPMGG00000019707	skiv2l	78	56.517	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.880	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	79	61.077	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.816	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	77	61.954	Phascolarctos_cinereus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	56.598	ENSPFOG00000002424	skiv2l	76	56.830	Poecilia_formosa
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	56.612	ENSPLAG00000018304	skiv2l	76	56.726	Poecilia_latipinna
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	56.598	ENSPMEG00000006997	skiv2l	76	56.934	Poecilia_mexicana
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	56.508	ENSPREG00000002277	skiv2l	79	56.726	Poecilia_reticulata
ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	60.203	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	79	60.081	Pongo_abelii
ENSGALG00000035499	SKIV2L	89	57.362	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	71	57.362	Procavia_capensis
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.427	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	78	60.489	Propithecus_coquereli
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.128	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	77	60.811	Pteropus_vampyrus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	56.760	ENSPNYG00000017853	skiv2l	81	56.771	Pundamilia_nyererei
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	57.453	ENSPNAG00000011823	skiv2l	76	57.440	Pygocentrus_nattereri
ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	60.834	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	77	61.163	Rattus_norvegicus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	60.246	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	85	59.676	Rhinopithecus_bieti
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.013	ENSRROG00000036429	SKIV2L	85	59.473	Rhinopithecus_roxellana
ENSGALG00000035499	SKIV2L	78	63.184	YLR398C	-	62	66.120	Saccharomyces_cerevisiae
ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	60.550	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	85	57.809	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.920	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	77	60.603	Sarcophilus_harrisii
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	57.775	ENSSFOG00015016930	skiv2l	80	57.856	Scleropages_formosus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	56.907	ENSSMAG00000020185	skiv2l	77	57.143	Scophthalmus_maximus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	57.423	ENSSDUG00000019977	skiv2l	79	57.664	Seriola_dumerili
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	56.598	ENSSLDG00000024382	skiv2l	79	56.535	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	55.900	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	77	55.203	Sphenodon_punctatus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	91	55.863	ENSSPAG00000012904	skiv2l	75	56.138	Stegastes_partitus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.737	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	81	61.247	Sus_scrofa
ENSGALG00000035499	SKIV2L	82	58.452	ENSTRUG00000000966	skiv2l	75	61.313	Takifugu_rubripes
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	56.625	ENSTNIG00000004382	skiv2l	76	56.726	Tetraodon_nigroviridis
ENSGALG00000035499	SKIV2L	90	67.532	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	66	69.444	Tupaia_belangeri
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	57.158	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	77	56.691	Tursiops_truncatus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.443	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	79	60.427	Ursus_americanus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.443	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	83	61.227	Ursus_maritimus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.237	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	83	61.123	Vulpes_vulpes
ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	57.026	ENSXETG00000010932	skiv2l	77	56.936	Xenopus_tropicalis
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	56.082	ENSXCOG00000019517	skiv2l	75	56.296	Xiphophorus_couchianus
ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	55.979	ENSXMAG00000014079	skiv2l	76	56.191	Xiphophorus_maculatus