EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGALG00000050082 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Gallus_gallus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1674 bases
Position: chr1:10877917-10879590
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGALP00000073985	RVT_1	PF00078.27	8e-36	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGALT00000091368	-	1674	-	ENSGALP00000073985	557 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGALG00000050082	-	71	53.367	ENSCPBG00000000668	-	94	53.367	Chrysemys_picta_bellii
ENSGALG00000050082	-	50	54.255	ENSCPBG00000000168	-	96	54.255	Chrysemys_picta_bellii
ENSGALG00000050082	-	50	54.122	ENSCPBG00000004754	-	68	54.122	Chrysemys_picta_bellii
ENSGALG00000050082	-	52	57.642	ENSCPBG00000018615	-	91	57.642	Chrysemys_picta_bellii
ENSGALG00000050082	-	50	55.914	ENSCPBG00000000783	-	89	55.914	Chrysemys_picta_bellii
ENSGALG00000050082	-	79	50.113	ENSCPBG00000013282	-	86	50.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSGALG00000050082	-	82	84.816	ENSGALG00000051731	-	90	84.816	Gallus_gallus
ENSGALG00000050082	-	96	87.290	ENSGALG00000049758	-	56	87.290	Gallus_gallus
ENSGALG00000050082	-	51	57.343	ENSGALG00000052695	-	80	57.343	Gallus_gallus
ENSGALG00000050082	-	89	88.153	ENSGALG00000054082	-	92	88.153	Gallus_gallus
ENSGALG00000050082	-	67	87.433	ENSGALG00000054614	-	63	87.433	Gallus_gallus
ENSGALG00000050082	-	68	50.524	ENSGALG00000052402	-	94	50.524	Gallus_gallus
ENSGALG00000050082	-	61	86.095	ENSGALG00000046064	-	99	86.095	Gallus_gallus
ENSGALG00000050082	-	78	85.057	ENSGALG00000054278	-	68	85.057	Gallus_gallus
ENSGALG00000050082	-	90	85.602	ENSGALG00000052317	-	95	85.602	Gallus_gallus
ENSGALG00000050082	-	70	84.143	ENSGALG00000054416	-	65	84.143	Gallus_gallus
ENSGALG00000050082	-	98	86.654	ENSGALG00000051139	-	99	86.654	Gallus_gallus
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ENSGALG00000050082	-	99	81.193	ENSGALG00000048743	-	93	81.193	Gallus_gallus
ENSGALG00000050082	-	51	71.777	ENSGALG00000050555	-	55	71.777	Gallus_gallus
ENSGALG00000050082	-	56	81.703	ENSGALG00000050399	-	61	81.703	Gallus_gallus
ENSGALG00000050082	-	59	83.533	ENSGALG00000054228	-	72	83.533	Gallus_gallus
ENSGALG00000050082	-	61	60.117	ENSGALG00000053417	-	77	60.117	Gallus_gallus
ENSGALG00000050082	-	70	83.376	ENSGALG00000051759	-	99	83.376	Gallus_gallus
ENSGALG00000050082	-	98	85.064	ENSGALG00000050649	-	67	85.064	Gallus_gallus
ENSGALG00000050082	-	99	83.032	ENSGALG00000051205	-	70	83.032	Gallus_gallus
ENSGALG00000050082	-	70	80.051	ENSGALG00000049152	-	75	80.051	Gallus_gallus
ENSGALG00000050082	-	99	85.714	ENSGALG00000048525	-	73	85.714	Gallus_gallus
ENSGALG00000050082	-	70	81.841	ENSGALG00000051097	-	65	81.841	Gallus_gallus
ENSGALG00000050082	-	74	87.561	ENSGALG00000045605	-	99	87.561	Gallus_gallus
ENSGALG00000050082	-	90	85.010	ENSGALG00000047518	-	71	85.010	Gallus_gallus
ENSGALG00000050082	-	70	81.586	ENSGALG00000052360	-	95	81.586	Gallus_gallus
ENSGALG00000050082	-	96	86.059	ENSGALG00000051783	-	79	86.059	Gallus_gallus
ENSGALG00000050082	-	81	49.234	ENSGALG00000049124	-	91	49.234	Gallus_gallus
ENSGALG00000050082	-	88	61.224	ENSGALG00000048170	-	98	61.224	Gallus_gallus
ENSGALG00000050082	-	74	86.683	ENSGALG00000054620	-	99	86.683	Gallus_gallus
ENSGALG00000050082	-	99	84.892	ENSGALG00000049210	-	67	84.892	Gallus_gallus
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ENSGALG00000050082	-	78	83.678	ENSGALG00000050302	-	88	83.678	Gallus_gallus
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ENSGALG00000050082	-	100	81.607	ENSGALG00000050225	-	100	81.607	Gallus_gallus
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ENSGALG00000050082	-	84	51.592	ENSGAGG00000025677	-	92	51.592	Gopherus_agassizii
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ENSGALG00000050082	-	96	52.897	ENSPSIG00000001726	-	78	52.897	Pelodiscus_sinensis
ENSGALG00000050082	-	84	50.531	ENSPSIG00000001967	-	75	50.531	Pelodiscus_sinensis
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ENSGALG00000050082	-	80	49.220	ENSPSIG00000001438	-	79	49.220	Pelodiscus_sinensis
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ENSGALG00000050082	-	62	48.415	ENSPSIG00000000869	-	96	48.415	Pelodiscus_sinensis
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