EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGALG00000053078 (Gene tree)
Gene ID: 100858926
Gene Symbol: APOBEC4
Alias: C1orf169|FLJ25691|MGC26594|RP1-127C7.4
Full Name: apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic polypeptide like 4
Gene Type: protein_coding
Species: Gallus_gallus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1029 bases
Position: chr8:8010718-8011746
Accession: 100858926
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGALP00000069310	APOBEC_N	PF08210.11	5.3e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGALT00000092828	APOBEC4-201	1029	-	ENSGALP00000069310	342 (aa)	XP_015145826	UPI00035040E5

Gene Model

Click here to download ENSGALG00000053078's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSGALG00000053078's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGALG00000053078	APOBEC4	94	49.091	ENSG00000173627	APOBEC4	89	49.390	Homo_sapiens
ENSGALG00000053078	APOBEC4	94	49.107	ENSAMEG00000002503	APOBEC4	86	50.151	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGALG00000053078	APOBEC4	99	51.594	ENSACAG00000015192	APOBEC4	97	51.594	Anolis_carolinensis
ENSGALG00000053078	APOBEC4	94	50.000	ENSBTAG00000047395	APOBEC4	90	50.000	Bos_taurus
ENSGALG00000053078	APOBEC4	95	48.071	ENSCJAG00000040026	APOBEC4	89	48.358	Callithrix_jacchus
ENSGALG00000053078	APOBEC4	94	47.892	ENSCAFG00000013349	APOBEC4	89	48.182	Canis_familiaris
ENSGALG00000053078	APOBEC4	94	47.892	ENSCAFG00020015526	APOBEC4	89	48.182	Canis_lupus_dingo
ENSGALG00000053078	APOBEC4	94	49.096	ENSCHIG00000011987	APOBEC4	85	49.394	Capra_hircus
ENSGALG00000053078	APOBEC4	97	48.378	ENSCSAG00000000243	APOBEC4	92	48.378	Chlorocebus_sabaeus
ENSGALG00000053078	APOBEC4	94	49.394	ENSCHOG00000012387	APOBEC4	89	49.394	Choloepus_hoffmanni
ENSGALG00000053078	APOBEC4	99	59.763	ENSCPBG00000015714	APOBEC4	91	59.763	Chrysemys_picta_bellii
ENSGALG00000053078	APOBEC4	92	48.580	ENSCGRG00001004553	Apobec4	90	48.580	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGALG00000053078	APOBEC4	94	48.214	ENSDNOG00000044664	APOBEC4	89	48.503	Dasypus_novemcinctus
ENSGALG00000053078	APOBEC4	97	46.386	ENSDORG00000007335	Apobec4	93	46.386	Dipodomys_ordii
ENSGALG00000053078	APOBEC4	94	49.550	ENSEASG00005006513	APOBEC4	89	49.849	Equus_asinus_asinus
ENSGALG00000053078	APOBEC4	94	49.550	ENSECAG00000019734	APOBEC4	89	49.849	Equus_caballus
ENSGALG00000053078	APOBEC4	94	48.949	ENSFCAG00000010909	APOBEC4	89	49.849	Felis_catus
ENSGALG00000053078	APOBEC4	86	53.020	ENSFDAG00000018185	APOBEC4	92	53.020	Fukomys_damarensis
ENSGALG00000053078	APOBEC4	94	49.394	ENSGGOG00000042217	APOBEC4	89	49.695	Gorilla_gorilla
ENSGALG00000053078	APOBEC4	94	46.933	ENSLACG00000014504	APOBEC4	88	46.933	Latimeria_chalumnae
ENSGALG00000053078	APOBEC4	62	35.648	ENSLOCG00000010326	-	79	37.089	Lepisosteus_oculatus
ENSGALG00000053078	APOBEC4	97	47.788	ENSMMUG00000031303	APOBEC4	92	47.788	Macaca_mulatta
ENSGALG00000053078	APOBEC4	98	87.425	ENSMGAG00000017190	APOBEC4	100	87.425	Meleagris_gallopavo
ENSGALG00000053078	APOBEC4	92	48.318	MGP_CAROLIEiJ_G0014701	Apobec4	83	48.318	Mus_caroli
ENSGALG00000053078	APOBEC4	92	48.012	ENSMUSG00000055547	Apobec4	83	48.012	Mus_musculus
ENSGALG00000053078	APOBEC4	92	49.379	MGP_PahariEiJ_G0027937	Apobec4	83	49.379	Mus_pahari
ENSGALG00000053078	APOBEC4	92	47.546	MGP_SPRETEiJ_G0015508	Apobec4	83	47.546	Mus_spretus
ENSGALG00000053078	APOBEC4	93	50.000	ENSMPUG00000011756	APOBEC4	85	50.155	Mustela_putorius_furo
ENSGALG00000053078	APOBEC4	93	48.955	ENSMLUG00000002458	APOBEC4	88	49.394	Myotis_lucifugus
ENSGALG00000053078	APOBEC4	92	41.486	ENSNGAG00000017599	Apobec4	85	41.486	Nannospalax_galili
ENSGALG00000053078	APOBEC4	94	48.503	ENSNLEG00000035610	APOBEC4	89	48.795	Nomascus_leucogenys
ENSGALG00000053078	APOBEC4	94	47.432	ENSODEG00000009778	APOBEC4	93	47.720	Octodon_degus
ENSGALG00000053078	APOBEC4	95	49.401	ENSOANG00000001000	APOBEC4	90	49.401	Ornithorhynchus_anatinus
ENSGALG00000053078	APOBEC4	95	49.699	ENSOGAG00000003118	APOBEC4	90	50.448	Otolemur_garnettii
ENSGALG00000053078	APOBEC4	94	48.673	ENSOARG00000005287	APOBEC4	89	48.961	Ovis_aries
ENSGALG00000053078	APOBEC4	94	48.930	ENSPPAG00000038272	APOBEC4	89	48.930	Pan_paniscus
ENSGALG00000053078	APOBEC4	94	47.619	ENSPPRG00000014706	APOBEC4	89	49.245	Panthera_pardus
ENSGALG00000053078	APOBEC4	94	47.321	ENSPTIG00000005518	APOBEC4	89	48.943	Panthera_tigris_altaica
ENSGALG00000053078	APOBEC4	94	48.485	ENSPTRG00000047181	APOBEC4	89	48.780	Pan_troglodytes
ENSGALG00000053078	APOBEC4	92	48.297	ENSPEMG00000019164	Apobec4	87	48.297	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGALG00000053078	APOBEC4	61	34.764	ENSPMAG00000006156	APOBEC4	63	34.764	Petromyzon_marinus
ENSGALG00000053078	APOBEC4	97	50.292	ENSPCIG00000003817	APOBEC4	89	50.292	Phascolarctos_cinereus
ENSGALG00000053078	APOBEC4	94	48.485	ENSPPYG00000000424	APOBEC4	89	48.780	Pongo_abelii
ENSGALG00000053078	APOBEC4	94	38.602	ENSPCAG00000015174	APOBEC4	89	38.602	Procavia_capensis
ENSGALG00000053078	APOBEC4	94	49.550	ENSPVAG00000001100	APOBEC4	90	50.150	Pteropus_vampyrus
ENSGALG00000053078	APOBEC4	91	49.688	ENSRNOG00000028089	Apobec4	80	49.688	Rattus_norvegicus
ENSGALG00000053078	APOBEC4	94	49.547	ENSSHAG00000013804	APOBEC4	89	49.547	Sarcophilus_harrisii
ENSGALG00000053078	APOBEC4	94	56.656	ENSSPUG00000010884	APOBEC4	87	56.656	Sphenodon_punctatus
ENSGALG00000053078	APOBEC4	94	48.048	ENSSSCG00000015561	APOBEC4	90	48.071	Sus_scrofa
ENSGALG00000053078	APOBEC4	94	48.810	ENSTBEG00000006476	APOBEC4	89	49.102	Tupaia_belangeri
ENSGALG00000053078	APOBEC4	95	48.961	ENSTTRG00000014784	APOBEC4	89	49.254	Tursiops_truncatus
ENSGALG00000053078	APOBEC4	94	48.810	ENSUAMG00000005088	APOBEC4	90	49.550	Ursus_americanus
ENSGALG00000053078	APOBEC4	94	48.494	ENSUMAG00000016285	APOBEC4	90	48.494	Ursus_maritimus
ENSGALG00000053078	APOBEC4	73	55.200	ENSVVUG00000009054	APOBEC4	89	47.879	Vulpes_vulpes
ENSGALG00000053078	APOBEC4	94	44.720	ENSXETG00000017441	apobec4	86	44.720	Xenopus_tropicalis