EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSGMOG00000000347 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: tnpo1
Alias: Kapbeta2|karyopherin beta 2
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Gadus_morhua
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 21524 bases
Position: chrGeneScaffold_1141:172243-193766
Accession: ZDB-GENE-080819-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGMOP00000000350	IBN_N	PF03810.19	2.4e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGMOT00000000371	-	2694	-	ENSGMOP00000000350	898 (aa)	-	UPI00023EF54F

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSGMOG00000000347	tnpo1	80	84.112	ENSGMOG00000014237	-	90	84.112
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	77.318	ENSGMOG00000009021	tnpo2	99	77.318

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	90.034	ENSG00000083312	TNPO1	100	90.034	Homo_sapiens
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	93.281	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.281	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	100	89.073	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	89.183	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGMOG00000000347	tnpo1	87	92.535	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.535	Amphilophus_citrinellus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	93.281	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	93.281	Amphiprion_ocellaris
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	93.281	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.281	Amphiprion_percula
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	92.833	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	92.833	Anabas_testudineus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	98	87.064	ENSAPLG00000009619	-	99	87.050	Anas_platyrhynchos
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	90.482	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	90.482	Anolis_carolinensis
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	58.921	ENSANAG00000027118	-	99	59.471	Aotus_nancymaae
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	80.915	ENSANAG00000025351	-	99	80.915	Aotus_nancymaae
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.521	ENSANAG00000022453	-	99	89.521	Aotus_nancymaae
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	91.265	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.265	Astatotilapia_calliptera
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	92.953	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.617	Astyanax_mexicanus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.744	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	89.744	Bos_taurus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.632	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	89.632	Callithrix_jacchus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	96	90.000	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	90.000	Canis_familiaris
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	87.794	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	87.794	Canis_lupus_dingo
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.744	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	89.744	Capra_hircus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	86.486	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	88.811	Carlito_syrichta
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.698	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	89.698	Cebus_capucinus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	90.034	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	90.034	Cercocebus_atys
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.698	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	89.698	Chinchilla_lanigera
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.855	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	89.855	Chlorocebus_sabaeus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	94	78.605	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	78.605	Choloepus_hoffmanni
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	90.828	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	90.716	Chrysemys_picta_bellii
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	74.273	ENSCSAVG00000010981	-	99	73.503	Ciona_savignyi
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.855	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	89.855	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.967	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	89.967	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGMOG00000000347	tnpo1	96	90.326	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	90.326	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	92.282	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.273	Cynoglossus_semilaevis
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	92.945	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	92.945	Cyprinodon_variegatus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	92.609	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.609	Danio_rerio
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	84.538	ENSDNOG00000006647	TNPO1	100	84.538	Dasypus_novemcinctus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	93	89.916	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	89.904	Dipodomys_ordii
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	57.528	FBgn0035693	CG8219	99	57.303	Drosophila_melanogaster
ENSGMOG00000000347	tnpo1	86	91.760	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	91.760	Echinops_telfairi
ENSGMOG00000000347	tnpo1	94	84.460	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	84.460	Eptatretus_burgeri
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	90.034	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	90.034	Equus_asinus_asinus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.855	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	89.855	Equus_caballus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	86.398	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.241	Esox_lucius
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	90.034	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	90.034	Felis_catus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	90.817	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	90.817	Ficedula_albicollis
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.521	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	89.521	Fukomys_damarensis
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	92.945	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	92.945	Fundulus_heteroclitus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	90.157	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	90.146	Gallus_gallus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	93.057	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	93.057	Gambusia_affinis
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	92.506	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.506	Gasterosteus_aculeatus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	90.594	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	90.594	Gopherus_agassizii
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	90.034	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	90.034	Gorilla_gorilla
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	75.558	ENSGGOG00000022535	-	99	75.446	Gorilla_gorilla
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	92.833	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	92.833	Haplochromis_burtoni
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.509	ENSHGLG00000000970	-	99	89.509	Heterocephalus_glaber_female
ENSGMOG00000000347	tnpo1	96	70.684	ENSHGLG00100000963	-	99	70.452	Heterocephalus_glaber_male
ENSGMOG00000000347	tnpo1	96	89.639	ENSHGLG00100017090	-	99	89.639	Heterocephalus_glaber_male
ENSGMOG00000000347	tnpo1	100	90.089	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	90.089	Jaculus_jaculus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	92.609	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	92.945	Kryptolebias_marmoratus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	90	90.529	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.529	Labrus_bergylta
ENSGMOG00000000347	tnpo1	96	85.284	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	85.284	Latimeria_chalumnae
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	91.639	ENSLOCG00000011092	tnpo1	98	91.639	Lepisosteus_oculatus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	97	89.413	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	89.413	Loxodonta_africana
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.855	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	89.855	Macaca_fascicularis
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.989	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	89.989	Macaca_mulatta
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.855	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	89.855	Macaca_nemestrina
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.855	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	89.855	Mandrillus_leucophaeus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	93.169	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.169	Mastacembelus_armatus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	92.609	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.609	Maylandia_zebra
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	90.067	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	92.135	Mesocricetus_auratus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	86.384	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	86.384	Microcebus_murinus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	100	89.978	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	89.978	Microtus_ochrogaster
ENSGMOG00000000347	tnpo1	87	92.535	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.535	Mola_mola
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	91.064	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	91.064	Monodelphis_domestica
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	91.825	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	91.825	Monopterus_albus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.922	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	92.135	Mus_caroli
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	90.146	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	92.135	Mus_musculus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.855	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	92.135	Mus_pahari
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.967	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	92.135	Mus_spretus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.855	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	89.855	Mustela_putorius_furo
ENSGMOG00000000347	tnpo1	96	89.675	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	89.675	Myotis_lucifugus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	90.179	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	90.179	Nannospalax_galili
ENSGMOG00000000347	tnpo1	87	92.921	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.921	Neolamprologus_brichardi
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	90.034	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	90.034	Nomascus_leucogenys
ENSGMOG00000000347	tnpo1	90	85.481	ENSOPRG00000012390	TNPO1	90	85.331	Ochotona_princeps
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.509	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	89.509	Octodon_degus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	92.111	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.111	Oreochromis_niloticus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	92	91.252	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	91.252	Ornithorhynchus_anatinus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	96	84.517	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	84.517	Oryctolagus_cuniculus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	86	92.506	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.506	Oryzias_latipes
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	92.584	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.584	Oryzias_latipes_hni
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	92.697	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	92.697	Oryzias_latipes_hsok
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	92.472	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.472	Oryzias_melastigma
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.855	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	89.855	Otolemur_garnettii
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.744	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	89.744	Ovis_aries
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.855	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	89.855	Pan_paniscus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	90.034	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	90.034	Panthera_pardus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	90.034	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	90.034	Panthera_tigris_altaica
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.855	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	89.855	Pan_troglodytes
ENSGMOG00000000347	tnpo1	94	80.276	ENSPTRG00000047731	-	100	80.276	Pan_troglodytes
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.855	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	89.855	Papio_anubis
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	88.354	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	88.354	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	90.940	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	90.940	Pelodiscus_sinensis
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.933	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.045	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	96	90.326	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	90.326	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	90.482	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	90.482	Phascolarctos_cinereus
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	93.057	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	93.057	Poecilia_formosa
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	93.057	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.057	Poecilia_latipinna
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	92.833	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	92.833	Poecilia_mexicana
ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	93.281	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.281	Poecilia_reticulata
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ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.855	ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	89.855	Propithecus_coquereli
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