EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGMOG00000001006 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: MSI1
Alias: -
Full Name: musashi RNA binding protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Gadus_morhua
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 20149 bases
Position: chrGeneScaffold_2101:30733-50881
Accession: 7330
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGMOP00000001058	RRM_1	PF00076.22	1.3e-32	1	2
ENSGMOP00000001058	RRM_1	PF00076.22	1.3e-32	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGMOT00000001096	MSI1-201	1041	-	ENSGMOP00000001058	347 (aa)	-	UPI00023EF85F

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSGMOG00000001006	MSI1	51	31.319	ENSGMOG00000009633	rbm14b	69	31.319
ENSGMOG00000001006	MSI1	52	75.000	ENSGMOG00000007596	-	100	75.000
ENSGMOG00000001006	MSI1	54	42.289	ENSGMOG00000000847	hnrnpaba	80	36.678
ENSGMOG00000001006	MSI1	54	44.920	ENSGMOG00000018481	hnrnpd	77	39.442
ENSGMOG00000001006	MSI1	54	30.070	ENSGMOG00000005612	tial1	76	30.070
ENSGMOG00000001006	MSI1	52	35.870	ENSGMOG00000016232	HNRNPA0	78	33.333
ENSGMOG00000001006	MSI1	66	33.663	ENSGMOG00000019323	tra2b	56	37.333
ENSGMOG00000001006	MSI1	55	37.824	ENSGMOG00000004230	HNRNPA3	97	30.816
ENSGMOG00000001006	MSI1	50	42.703	ENSGMOG00000001142	dazap1	53	42.703
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	83.003	ENSGMOG00000017838	-	100	83.003
ENSGMOG00000001006	MSI1	54	44.086	ENSGMOG00000009355	-	54	42.211
ENSGMOG00000001006	MSI1	53	40.761	ENSGMOG00000017950	hnrnpa1a	50	40.541

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	82.320	ENSG00000135097	MSI1	100	82.597	Homo_sapiens
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	91.117	ENSAPOG00000003191	MSI1	100	91.404	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	94.556	ENSAPOG00000023458	-	100	94.842	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	62.730	ENSAMEG00000013302	MSI1	100	62.992	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGMOG00000001006	MSI1	86	87.333	ENSACIG00000017754	-	72	89.655	Amphilophus_citrinellus
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	91.117	ENSAOCG00000003804	MSI1	100	91.404	Amphiprion_ocellaris
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	87.423	ENSAOCG00000009031	-	95	87.423	Amphiprion_ocellaris
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	94.556	ENSAPEG00000006857	-	84	94.842	Amphiprion_percula
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	91.117	ENSAPEG00000003245	MSI1	100	91.404	Amphiprion_percula
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	83.003	ENSATEG00000023779	-	100	83.286	Anabas_testudineus
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	90.986	ENSATEG00000017059	MSI1	100	91.268	Anabas_testudineus
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	83.102	ENSACAG00000002762	MSI1	100	83.380	Anolis_carolinensis
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	82.320	ENSANAG00000027151	MSI1	100	82.597	Aotus_nancymaae
ENSGMOG00000001006	MSI1	79	84.249	ENSANAG00000027901	-	84	84.249	Aotus_nancymaae
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	90.028	ENSACLG00000011230	MSI1	100	90.313	Astatotilapia_calliptera
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	95.977	ENSACLG00000000117	-	100	96.330	Astatotilapia_calliptera
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	90.282	ENSAMXG00000038960	msi1	76	90.596	Astyanax_mexicanus
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	82.320	ENSBTAG00000009800	MSI1	100	83.578	Bos_taurus
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	82.320	ENSCJAG00000008578	MSI1	100	82.597	Callithrix_jacchus
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	82.044	ENSCAFG00000010283	MSI1	100	82.320	Canis_familiaris
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	83.280	ENSCAFG00020020585	MSI1	100	83.601	Canis_lupus_dingo
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	80.109	ENSCHIG00000024304	MSI1	100	80.381	Capra_hircus
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	82.569	ENSTSYG00000033949	MSI1	95	82.875	Carlito_syrichta
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	74.121	ENSCAPG00000003919	MSI1	78	82.418	Cavia_aperea
ENSGMOG00000001006	MSI1	95	83.140	ENSCPOG00000012361	MSI1	100	83.626	Cavia_porcellus
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	82.320	ENSCCAG00000035567	MSI1	100	82.597	Cebus_capucinus
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	82.320	ENSCATG00000030019	MSI1	100	82.597	Cercocebus_atys
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	83.333	ENSCLAG00000011329	MSI1	100	83.626	Chinchilla_lanigera
ENSGMOG00000001006	MSI1	82	81.034	ENSCSAG00000002265	MSI1	96	84.116	Chlorocebus_sabaeus
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	86.040	ENSCPBG00000011349	MSI1	100	86.040	Chrysemys_picta_bellii
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	82.622	ENSCANG00000040651	MSI1	100	82.927	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	82.320	ENSCGRG00001018883	Msi1	100	82.597	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	82.675	ENSCGRG00000002191	Msi1	72	82.979	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	90.286	ENSCSEG00000005834	-	100	90.571	Cynoglossus_semilaevis
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	86.810	ENSCSEG00000011032	MSI1	100	87.117	Cynoglossus_semilaevis
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	94.828	ENSCSEG00000008352	-	100	95.115	Cynoglossus_semilaevis
ENSGMOG00000001006	MSI1	62	73.148	ENSCVAG00000017463	-	89	73.611	Cyprinodon_variegatus
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	95.977	ENSCVAG00000009100	MSI1	100	95.977	Cyprinodon_variegatus
ENSGMOG00000001006	MSI1	51	65.672	ENSCVAG00000017430	zgc:110796	94	65.672	Cyprinodon_variegatus
ENSGMOG00000001006	MSI1	79	91.163	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	98	91.628	Danio_rerio
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	85.714	ENSDARG00000010710	msi1	100	92.991	Danio_rerio
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	80.063	ENSDNOG00000005713	MSI1	91	80.380	Dasypus_novemcinctus
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	82.036	ENSDORG00000005610	Msi1	94	82.335	Dipodomys_ordii
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	81.402	ENSETEG00000004756	MSI1	100	81.098	Echinops_telfairi
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	82.320	ENSEASG00005004736	MSI1	100	82.597	Equus_asinus_asinus
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	82.320	ENSECAG00000017526	MSI1	100	82.597	Equus_caballus
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	88.252	ENSELUG00000023219	MSI1	92	88.539	Esox_lucius
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	88.037	ENSELUG00000023280	-	100	88.344	Esox_lucius
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	82.320	ENSFCAG00000011007	MSI1	100	82.597	Felis_catus
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	87.333	ENSFALG00000007574	MSI1	100	87.333	Ficedula_albicollis
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	82.317	ENSFDAG00000019586	MSI1	100	82.622	Fukomys_damarensis
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	94.556	ENSFHEG00000022446	MSI1	100	94.842	Fundulus_heteroclitus
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	90.000	ENSFHEG00000003560	-	100	90.286	Fundulus_heteroclitus
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	86.641	ENSGALG00000007227	MSI1	98	74.680	Gallus_gallus
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	91.718	ENSGAFG00000021522	MSI1	94	91.718	Gambusia_affinis
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	72.934	ENSGAFG00000005860	-	100	73.219	Gambusia_affinis
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	83.934	ENSGACG00000008674	-	100	83.934	Gasterosteus_aculeatus
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	93.696	ENSGACG00000012679	MSI1	100	93.983	Gasterosteus_aculeatus
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	85.755	ENSGAGG00000016037	MSI1	100	85.755	Gopherus_agassizii
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	83.121	ENSGGOG00000010328	MSI1	100	83.439	Gorilla_gorilla
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	90.028	ENSHBUG00000021921	MSI1	100	90.313	Haplochromis_burtoni
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	95.977	ENSHBUG00000011841	-	100	95.977	Haplochromis_burtoni
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	82.044	ENSHGLG00000012782	MSI1	100	82.320	Heterocephalus_glaber_female
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	82.317	ENSHGLG00100016848	MSI1	100	82.622	Heterocephalus_glaber_male
ENSGMOG00000001006	MSI1	90	89.776	ENSHCOG00000012019	MSI1	95	90.096	Hippocampus_comes
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	89.489	ENSHCOG00000012067	-	100	89.773	Hippocampus_comes
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	88.825	ENSIPUG00000001976	msi1	100	89.112	Ictalurus_punctatus
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	83.280	ENSSTOG00000009799	MSI1	100	83.601	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	74.566	ENSJJAG00000010643	-	100	74.566	Jaculus_jaculus
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	82.320	ENSJJAG00000010463	Msi1	100	82.597	Jaculus_jaculus
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	95.101	ENSKMAG00000011251	MSI1	100	95.389	Kryptolebias_marmoratus
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	85.890	ENSKMAG00000019877	-	100	86.196	Kryptolebias_marmoratus
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	95.702	ENSLBEG00000008789	MSI1	100	95.702	Labrus_bergylta
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	90.571	ENSLBEG00000001375	-	100	90.857	Labrus_bergylta
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	80.702	ENSLACG00000018287	MSI1	100	82.164	Latimeria_chalumnae
ENSGMOG00000001006	MSI1	52	79.091	ENSLOCG00000008618	zgc:110796	71	79.091	Lepisosteus_oculatus
ENSGMOG00000001006	MSI1	90	73.716	ENSLAFG00000009412	MSI1	100	74.018	Loxodonta_africana
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	83.333	ENSMFAG00000001798	MSI1	100	83.626	Macaca_fascicularis
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	83.626	ENSMMUG00000031527	MSI1	97	82.759	Macaca_mulatta
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	82.320	ENSMNEG00000040034	MSI1	100	82.597	Macaca_nemestrina
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	82.622	ENSMLEG00000003921	MSI1	100	82.927	Mandrillus_leucophaeus
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	95.389	ENSMAMG00000002279	MSI1	100	95.677	Mastacembelus_armatus
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	90.805	ENSMAMG00000018426	-	100	91.092	Mastacembelus_armatus
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	95.977	ENSMZEG00005000340	-	100	95.977	Maylandia_zebra
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	90.028	ENSMZEG00005026892	MSI1	100	90.313	Maylandia_zebra
ENSGMOG00000001006	MSI1	63	93.491	ENSMGAG00000016518	-	100	93.491	Meleagris_gallopavo
ENSGMOG00000001006	MSI1	70	88.889	ENSMAUG00000016820	Msi1	100	88.889	Mesocricetus_auratus
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	82.320	ENSMICG00000033181	MSI1	100	82.597	Microcebus_murinus
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	82.320	ENSMOCG00000002286	Msi1	100	82.597	Microtus_ochrogaster
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	85.276	ENSMMOG00000010492	MSI1	96	85.276	Mola_mola
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	80.692	ENSMMOG00000012265	-	100	80.980	Mola_mola
ENSGMOG00000001006	MSI1	90	57.530	ENSMODG00000003189	-	100	57.229	Monodelphis_domestica
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	95.402	ENSMALG00000017889	MSI1	100	95.690	Monopterus_albus
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	92.000	ENSMALG00000001426	-	100	92.000	Monopterus_albus
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	81.768	MGP_CAROLIEiJ_G0027626	Msi1	100	82.044	Mus_caroli
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	81.768	ENSMUSG00000054256	Msi1	99	85.494	Mus_musculus
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	84.857	MGP_PahariEiJ_G0024206	Msi1	100	84.857	Mus_pahari
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	81.768	MGP_SPRETEiJ_G0028624	Msi1	100	82.044	Mus_spretus
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	83.280	ENSMPUG00000003168	MSI1	100	83.601	Mustela_putorius_furo
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	74.107	ENSMLUG00000010313	MSI1	100	74.405	Myotis_lucifugus
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	82.675	ENSNGAG00000014508	Msi1	91	82.979	Nannospalax_galili
ENSGMOG00000001006	MSI1	88	81.967	ENSNBRG00000018012	MSI1	99	82.377	Neolamprologus_brichardi
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	95.977	ENSNBRG00000000841	-	100	95.977	Neolamprologus_brichardi
ENSGMOG00000001006	MSI1	90	73.171	ENSNLEG00000015636	MSI1	100	73.476	Nomascus_leucogenys
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	62.500	ENSMEUG00000015759	MSI1	100	63.110	Notamacropus_eugenii
ENSGMOG00000001006	MSI1	90	75.556	ENSOPRG00000016879	MSI1	100	75.873	Ochotona_princeps
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	82.622	ENSODEG00000006328	MSI1	100	82.927	Octodon_degus
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	95.977	ENSONIG00000011182	MSI1	100	95.977	Oreochromis_niloticus
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	86.813	ENSONIG00000019452	-	100	87.088	Oreochromis_niloticus
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	83.280	ENSOCUG00000027716	MSI1	100	83.601	Oryctolagus_cuniculus
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	95.702	ENSORLG00000019978	-	100	95.702	Oryzias_latipes
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	89.971	ENSORLG00000029593	MSI1	100	90.258	Oryzias_latipes
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ENSGMOG00000001006	MSI1	99	89.971	ENSORLG00020008266	MSI1	99	86.239	Oryzias_latipes_hni
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ENSGMOG00000001006	MSI1	99	89.971	ENSORLG00015003916	MSI1	100	90.258	Oryzias_latipes_hsok
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ENSGMOG00000001006	MSI1	99	79.670	ENSOGAG00000003847	MSI1	99	79.945	Otolemur_garnettii
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ENSGMOG00000001006	MSI1	99	82.320	ENSPTRG00000005531	MSI1	100	82.597	Pan_troglodytes
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	82.044	ENSPANG00000006335	MSI1	100	82.320	Papio_anubis
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	92.241	ENSPKIG00000016497	MSI1	100	92.529	Paramormyrops_kingsleyae
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ENSGMOG00000001006	MSI1	94	85.890	ENSPSIG00000011608	-	93	85.890	Pelodiscus_sinensis
ENSGMOG00000001006	MSI1	79	78.509	ENSPSIG00000009621	-	100	78.509	Pelodiscus_sinensis
ENSGMOG00000001006	MSI1	90	89.524	ENSPMGG00000000514	MSI1	97	89.841	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	74.695	ENSPMGG00000007743	-	92	72.586	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	81.306	ENSPEMG00000010491	Msi1	95	81.602	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSGMOG00000001006	MSI1	99	90.000	ENSPLAG00000012431	-	97	90.286	Poecilia_latipinna
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	95.129	ENSPMEG00000012796	MSI1	100	95.415	Poecilia_mexicana
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	90.517	ENSPMEG00000007025	-	86	90.517	Poecilia_mexicana
ENSGMOG00000001006	MSI1	95	82.530	ENSPREG00000021416	-	95	82.831	Poecilia_reticulata
ENSGMOG00000001006	MSI1	76	81.448	ENSPREG00000014574	-	100	81.900	Poecilia_reticulata
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	81.492	ENSPPYG00000005027	MSI1	100	81.768	Pongo_abelii
ENSGMOG00000001006	MSI1	73	89.674	ENSPCAG00000002300	MSI1	67	89.674	Procavia_capensis
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ENSGMOG00000001006	MSI1	94	67.073	ENSPVAG00000002225	MSI1	100	67.378	Pteropus_vampyrus
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ENSGMOG00000001006	MSI1	99	89.971	ENSPNAG00000019337	msi1	100	90.258	Pygocentrus_nattereri
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ENSGMOG00000001006	MSI1	94	83.280	ENSRBIG00000036889	MSI1	100	83.601	Rhinopithecus_bieti
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	82.424	ENSRROG00000041076	MSI1	93	82.727	Rhinopithecus_roxellana
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	83.333	ENSSBOG00000030259	MSI1	99	83.626	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	72.876	ENSSHAG00000006834	MSI1	100	73.529	Sarcophilus_harrisii
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ENSGMOG00000001006	MSI1	94	89.241	ENSSMAG00000018824	MSI1	97	89.557	Scophthalmus_maximus
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	90.805	ENSSMAG00000009156	-	73	89.604	Scophthalmus_maximus
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ENSGMOG00000001006	MSI1	99	90.857	ENSSDUG00000022697	-	100	91.143	Seriola_dumerili
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ENSGMOG00000001006	MSI1	99	85.755	ENSSPUG00000015741	MSI1	100	85.755	Sphenodon_punctatus
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ENSGMOG00000001006	MSI1	54	83.125	ENSSPAG00000015573	zgc:110796	82	83.125	Stegastes_partitus
ENSGMOG00000001006	MSI1	76	78.365	ENSSPAG00000014085	-	100	78.365	Stegastes_partitus
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	82.044	ENSSSCG00000029365	MSI1	100	83.280	Sus_scrofa
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ENSGMOG00000001006	MSI1	80	93.488	ENSTRUG00000016249	MSI1	100	83.794	Takifugu_rubripes
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ENSGMOG00000001006	MSI1	94	75.092	ENSTBEG00000007182	MSI1	100	73.665	Tupaia_belangeri
ENSGMOG00000001006	MSI1	73	88.933	ENSTTRG00000005663	MSI1	74	88.933	Tursiops_truncatus
ENSGMOG00000001006	MSI1	71	87.500	ENSUAMG00000015514	MSI1	94	87.500	Ursus_americanus
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ENSGMOG00000001006	MSI1	94	82.675	ENSVVUG00000020993	MSI1	100	82.282	Vulpes_vulpes
ENSGMOG00000001006	MSI1	99	84.971	ENSXETG00000012216	msi1	100	85.303	Xenopus_tropicalis
ENSGMOG00000001006	MSI1	94	74.847	ENSXCOG00000017605	MSI1	89	74.847	Xiphophorus_couchianus
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ENSGMOG00000001006	MSI1	99	95.115	ENSXMAG00000027103	MSI1	100	82.535	Xiphophorus_maculatus