EuRBPDB

Description

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGMOG00000001801 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ipo4
Alias: si:ch211-196f5.1
Full Name: importin 4
Gene Type: protein_coding
Species: Gadus_morhua
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 14861 bases
Position: chrGeneScaffold_1975:29514-44374
Accession: ZDB-GENE-041014-307
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGMOP00000001940	IBN_N	PF03810.19	7.2e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGMOT00000002003	-	3264	-	ENSGMOP00000001940	1088 (aa)	-	UPI00023EFE58

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	45.767	ENSG00000196497	IPO4	99	45.780	Homo_sapiens
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	76.888	ENSAPOG00000019018	ipo4	100	76.888	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	45.069	ENSAMEG00000016271	IPO4	85	45.069	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	74.521	ENSACIG00000004246	ipo4	100	74.771	Amphilophus_citrinellus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	79.193	ENSAOCG00000004773	ipo4	100	79.193	Amphiprion_ocellaris
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	79.468	ENSAPEG00000002112	ipo4	100	79.468	Amphiprion_percula
ENSGMOG00000001801	ipo4	92	81.256	ENSATEG00000017082	ipo4	99	81.256	Anabas_testudineus
ENSGMOG00000001801	ipo4	84	47.522	ENSACAG00000003973	-	97	47.629	Anolis_carolinensis
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	45.860	ENSANAG00000037973	IPO4	99	45.998	Aotus_nancymaae
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	76.909	ENSACLG00000019742	ipo4	100	76.909	Astatotilapia_calliptera
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	74.678	ENSAMXG00000037878	ipo4	100	74.472	Astyanax_mexicanus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	45.530	ENSBTAG00000002707	IPO4	99	45.530	Bos_taurus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	46.140	ENSCJAG00000006937	IPO4	99	46.182	Callithrix_jacchus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	46.605	ENSCAFG00000012049	IPO4	99	46.636	Canis_familiaris
ENSGMOG00000001801	ipo4	98	46.197	ENSCAFG00020002873	IPO4	99	45.455	Canis_lupus_dingo
ENSGMOG00000001801	ipo4	98	45.996	ENSCHIG00000009413	IPO4	96	46.033	Capra_hircus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	45.767	ENSTSYG00000002643	IPO4	99	45.722	Carlito_syrichta
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	46.359	ENSCPOG00000014783	IPO4	99	46.366	Cavia_porcellus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	45.860	ENSCCAG00000037929	IPO4	99	45.998	Cebus_capucinus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	46.140	ENSCATG00000040395	IPO4	99	46.182	Cercocebus_atys
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	46.359	ENSCLAG00000012817	IPO4	99	46.366	Chinchilla_lanigera
ENSGMOG00000001801	ipo4	90	46.389	ENSCPBG00000025757	IPO4	99	44.373	Chrysemys_picta_bellii
ENSGMOG00000001801	ipo4	92	37.098	ENSCING00000008639	-	99	37.585	Ciona_intestinalis
ENSGMOG00000001801	ipo4	92	37.598	ENSCSAVG00000011482	-	98	37.894	Ciona_savignyi
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	45.953	ENSCANG00000029513	IPO4	99	45.998	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	44.843	ENSCGRG00001001217	Ipo4	99	44.617	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	44.843	ENSCGRG00000014404	Ipo4	99	44.617	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	73.425	ENSCSEG00000009606	ipo4	100	73.486	Cynoglossus_semilaevis
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	70.018	ENSCVAG00000002281	ipo4	100	70.219	Cyprinodon_variegatus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	78.721	ENSDARG00000041493	ipo4	100	79.155	Danio_rerio
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	45.899	ENSDNOG00000000366	IPO4	99	45.899	Dasypus_novemcinctus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	46.419	ENSDORG00000009274	Ipo4	99	46.458	Dipodomys_ordii
ENSGMOG00000001801	ipo4	96	30.175	FBgn0042177	CG32164	97	30.175	Drosophila_melanogaster
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	44.894	ENSETEG00000018381	IPO4	99	44.862	Echinops_telfairi
ENSGMOG00000001801	ipo4	90	47.614	ENSEASG00005011954	IPO4	96	47.614	Equus_asinus_asinus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	46.175	ENSECAG00000009909	IPO4	99	46.175	Equus_caballus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	78.565	ENSELUG00000020628	ipo4	100	78.943	Esox_lucius
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	46.912	ENSFCAG00000005587	IPO4	99	46.912	Felis_catus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	43.080	ENSFDAG00000000725	IPO4	99	43.092	Fukomys_damarensis
ENSGMOG00000001801	ipo4	89	77.582	ENSFHEG00000009351	ipo4	97	78.426	Fundulus_heteroclitus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	74.176	ENSGAFG00000005601	ipo4	100	74.176	Gambusia_affinis
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	76.304	ENSGACG00000002276	ipo4	99	77.022	Gasterosteus_aculeatus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	45.860	ENSGGOG00000016062	IPO4	99	45.906	Gorilla_gorilla
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	77.553	ENSHBUG00000023269	ipo4	100	77.553	Haplochromis_burtoni
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	45.956	ENSHGLG00000002923	IPO4	99	46.055	Heterocephalus_glaber_female
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	45.680	ENSHGLG00100003725	IPO4	99	45.780	Heterocephalus_glaber_male
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	70.927	ENSHCOG00000016854	ipo4	99	71.429	Hippocampus_comes
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	76.265	ENSIPUG00000001185	ipo4	100	75.365	Ictalurus_punctatus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	46.912	ENSSTOG00000002288	IPO4	99	46.918	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	46.654	ENSJJAG00000019002	Ipo4	99	46.691	Jaculus_jaculus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	76.147	ENSKMAG00000004627	ipo4	100	76.147	Kryptolebias_marmoratus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	77.768	ENSLBEG00000024952	ipo4	100	77.859	Labrus_bergylta
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	51.518	ENSLACG00000001428	IPO4	100	52.111	Latimeria_chalumnae
ENSGMOG00000001801	ipo4	78	72.010	ENSLOCG00000001149	ipo4	85	72.010	Lepisosteus_oculatus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	44.434	ENSLAFG00000015852	IPO4	99	44.986	Loxodonta_africana
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	46.140	ENSMFAG00000000743	IPO4	99	46.182	Macaca_fascicularis
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	46.140	ENSMMUG00000012481	IPO4	99	46.182	Macaca_mulatta
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	46.047	ENSMNEG00000043531	IPO4	99	46.090	Macaca_nemestrina
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	46.140	ENSMLEG00000042067	IPO4	99	46.182	Mandrillus_leucophaeus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	77.624	ENSMAMG00000021976	ipo4	100	77.624	Mastacembelus_armatus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	77.461	ENSMZEG00005017273	ipo4	100	77.461	Maylandia_zebra
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	45.396	ENSMAUG00000017565	Ipo4	99	45.396	Mesocricetus_auratus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	46.512	ENSMICG00000001719	IPO4	99	46.550	Microcebus_murinus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	45.302	ENSMOCG00000020462	Ipo4	99	45.396	Microtus_ochrogaster
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	76.390	ENSMMOG00000005264	ipo4	100	76.169	Mola_mola
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	44.137	ENSMODG00000003337	IPO4	96	44.044	Monodelphis_domestica
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	76.535	ENSMALG00000001587	ipo4	100	76.535	Monopterus_albus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	45.304	MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	47.719	Mus_caroli
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	45.120	ENSMUSG00000002319	Ipo4	99	47.472	Mus_musculus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	45.069	MGP_PahariEiJ_G0030322	Ipo4	98	47.578	Mus_pahari
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	45.304	MGP_SPRETEiJ_G0020194	Ipo4	99	47.666	Mus_spretus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	47.281	ENSMPUG00000005916	IPO4	99	47.281	Mustela_putorius_furo
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	45.756	ENSMLUG00000025277	IPO4	86	46.033	Myotis_lucifugus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	45.891	ENSNGAG00000019340	Ipo4	99	45.899	Nannospalax_galili
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	80.110	ENSNBRG00000005870	ipo4	100	80.129	Neolamprologus_brichardi
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	46.366	ENSOPRG00000016615	IPO4	99	46.458	Ochotona_princeps
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	46.359	ENSODEG00000002609	IPO4	99	46.366	Octodon_degus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	79.117	ENSONIG00000014574	ipo4	100	79.117	Oreochromis_niloticus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	45.856	ENSOCUG00000002881	IPO4	99	45.956	Oryctolagus_cuniculus
ENSGMOG00000001801	ipo4	98	74.416	ENSORLG00000006457	ipo4	99	75.096	Oryzias_latipes
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	74.816	ENSORLG00020004286	ipo4	100	74.108	Oryzias_latipes_hni
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	75.092	ENSORLG00015021856	ipo4	100	74.382	Oryzias_latipes_hsok
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	73.073	ENSOMEG00000016203	ipo4	100	73.095	Oryzias_melastigma
ENSGMOG00000001801	ipo4	98	44.921	ENSOGAG00000010642	IPO4	99	45.152	Otolemur_garnettii
ENSGMOG00000001801	ipo4	98	45.191	ENSOARG00000019188	IPO4	99	45.191	Ovis_aries
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	45.581	ENSPPAG00000035476	IPO4	99	45.438	Pan_paniscus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	47.097	ENSPPRG00000023607	IPO4	99	47.097	Panthera_pardus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	47.005	ENSPTIG00000008720	IPO4	99	47.005	Panthera_tigris_altaica
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	45.767	ENSPTRG00000006200	IPO4	99	45.722	Pan_troglodytes
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	46.233	ENSPANG00000026278	IPO4	99	46.274	Papio_anubis
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	69.633	ENSPKIG00000007830	ipo4	100	70.228	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	70.756	ENSPKIG00000007683	-	99	70.691	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	70.009	ENSPMGG00000020871	ipo4	99	70.046	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	44.567	ENSPEMG00000016160	Ipo4	99	44.659	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGMOG00000001801	ipo4	96	46.881	ENSPCIG00000010718	IPO4	99	46.931	Phascolarctos_cinereus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	74.610	ENSPFOG00000009255	ipo4	100	74.610	Poecilia_formosa
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ENSGMOG00000001801	ipo4	98	46.555	ENSPCAG00000015669	IPO4	99	46.679	Procavia_capensis
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	45.581	ENSPCOG00000015319	IPO4	99	45.814	Propithecus_coquereli
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	45.488	ENSPVAG00000010755	IPO4	99	46.083	Pteropus_vampyrus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	78.565	ENSPNYG00000021414	ipo4	100	78.565	Pundamilia_nyererei
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	77.808	ENSPNAG00000027964	ipo4	100	77.849	Pygocentrus_nattereri
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	45.161	ENSRNOG00000019553	Ipo4	99	45.438	Rattus_norvegicus
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ENSGMOG00000001801	ipo4	99	47.238	ENSXETG00000014621	ipo4	99	47.610	Xenopus_tropicalis
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	73.665	ENSXCOG00000005208	ipo4	100	72.694	Xiphophorus_couchianus
ENSGMOG00000001801	ipo4	99	74.361	ENSXMAG00000006041	ipo4	100	74.519	Xiphophorus_maculatus