EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGMOG00000002081 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: srprb
Alias: wu:fk57h10|zgc:111820|zgc:92746
Full Name: SRP receptor subunit beta
Gene Type: protein_coding
Species: Gadus_morhua
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4190 bases
Position: chrGeneScaffold_1881:9508-13697
Accession: ZDB-GENE-040718-311
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGMOP00000002221	MMR_HSR1	PF01926.23	1.1e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGMOT00000002293	-	813	-	ENSGMOP00000002221	270 (aa)	-	UPI00023EFDB7

Gene Model

Click here to download ENSGMOG00000002081's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSGMOG00000002081's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGMOG00000002081	srprb	100	80.220	ENSAPOG00000021219	srprb	99	80.220	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGMOG00000002081	srprb	94	82.745	ENSACIG00000014621	srprb	100	80.451	Amphilophus_citrinellus
ENSGMOG00000002081	srprb	100	79.853	ENSAOCG00000017265	srprb	99	79.853	Amphiprion_ocellaris
ENSGMOG00000002081	srprb	100	79.853	ENSAPEG00000024541	srprb	87	79.853	Amphiprion_percula
ENSGMOG00000002081	srprb	100	80.443	ENSATEG00000014016	srprb	99	80.443	Anabas_testudineus
ENSGMOG00000002081	srprb	100	80.147	ENSACLG00000016748	srprb	99	80.147	Astatotilapia_calliptera
ENSGMOG00000002081	srprb	98	67.293	ENSAMXG00000044118	srprb	100	67.293	Astyanax_mexicanus
ENSGMOG00000002081	srprb	100	77.860	ENSCSEG00000017194	srprb	99	77.860	Cynoglossus_semilaevis
ENSGMOG00000002081	srprb	98	81.203	ENSCVAG00000004221	srprb	100	81.203	Cyprinodon_variegatus
ENSGMOG00000002081	srprb	98	64.286	ENSDARG00000030949	srprb	100	64.286	Danio_rerio
ENSGMOG00000002081	srprb	93	82.072	ENSELUG00000009740	srprb	93	82.072	Esox_lucius
ENSGMOG00000002081	srprb	94	86.561	ENSFHEG00000006004	srprb	95	86.561	Fundulus_heteroclitus
ENSGMOG00000002081	srprb	97	82.197	ENSGAFG00000012593	srprb	99	82.197	Gambusia_affinis
ENSGMOG00000002081	srprb	100	80.443	ENSGACG00000009891	srprb	100	80.443	Gasterosteus_aculeatus
ENSGMOG00000002081	srprb	100	80.147	ENSHBUG00000002145	srprb	99	80.147	Haplochromis_burtoni
ENSGMOG00000002081	srprb	99	77.985	ENSHCOG00000007732	srprb	99	77.985	Hippocampus_comes
ENSGMOG00000002081	srprb	93	65.873	ENSIPUG00000004177	srprb	94	65.873	Ictalurus_punctatus
ENSGMOG00000002081	srprb	93	84.064	ENSKMAG00000020736	srprb	94	84.064	Kryptolebias_marmoratus
ENSGMOG00000002081	srprb	99	80.970	ENSLBEG00000021483	srprb	97	80.970	Labrus_bergylta
ENSGMOG00000002081	srprb	99	66.790	ENSLOCG00000009740	srprb	91	67.159	Lepisosteus_oculatus
ENSGMOG00000002081	srprb	100	79.705	ENSMAMG00000011876	srprb	99	79.705	Mastacembelus_armatus
ENSGMOG00000002081	srprb	94	82.812	ENSMZEG00005016621	srprb	99	82.812	Maylandia_zebra
ENSGMOG00000002081	srprb	100	78.598	ENSMMOG00000012550	srprb	100	78.598	Mola_mola
ENSGMOG00000002081	srprb	100	82.222	ENSMALG00000012595	srprb	99	82.222	Monopterus_albus
ENSGMOG00000002081	srprb	74	79.703	ENSNBRG00000004699	srprb	86	79.703	Neolamprologus_brichardi
ENSGMOG00000002081	srprb	100	81.181	ENSONIG00000003788	srprb	81	81.181	Oreochromis_niloticus
ENSGMOG00000002081	srprb	100	77.860	ENSORLG00000006430	srprb	99	77.860	Oryzias_latipes
ENSGMOG00000002081	srprb	100	77.860	ENSORLG00020003413	srprb	99	77.860	Oryzias_latipes_hni
ENSGMOG00000002081	srprb	100	78.229	ENSORLG00015000166	srprb	99	78.229	Oryzias_latipes_hsok
ENSGMOG00000002081	srprb	100	78.967	ENSOMEG00000012735	srprb	99	78.967	Oryzias_melastigma
ENSGMOG00000002081	srprb	93	71.713	ENSPKIG00000013147	srprb	95	71.713	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGMOG00000002081	srprb	98	76.894	ENSPMGG00000014061	srprb	96	76.894	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGMOG00000002081	srprb	97	82.197	ENSPFOG00000011347	srprb	96	82.197	Poecilia_formosa
ENSGMOG00000002081	srprb	94	84.980	ENSPLAG00000001156	srprb	98	84.980	Poecilia_latipinna
ENSGMOG00000002081	srprb	93	84.524	ENSPMEG00000012169	srprb	98	84.524	Poecilia_mexicana
ENSGMOG00000002081	srprb	94	83.399	ENSPREG00000001449	srprb	98	83.399	Poecilia_reticulata
ENSGMOG00000002081	srprb	100	80.147	ENSPNYG00000005911	srprb	99	80.147	Pundamilia_nyererei
ENSGMOG00000002081	srprb	98	68.421	ENSPNAG00000009983	srprb	100	68.421	Pygocentrus_nattereri
ENSGMOG00000002081	srprb	94	72.047	ENSSFOG00015019355	srprb	94	72.332	Scleropages_formosus
ENSGMOG00000002081	srprb	100	80.443	ENSSMAG00000013202	srprb	99	80.443	Scophthalmus_maximus
ENSGMOG00000002081	srprb	100	79.336	ENSSDUG00000018746	srprb	92	79.336	Seriola_dumerili
ENSGMOG00000002081	srprb	100	78.967	ENSSLDG00000020560	srprb	99	78.967	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSGMOG00000002081	srprb	99	81.550	ENSSPAG00000008898	srprb	98	81.550	Stegastes_partitus
ENSGMOG00000002081	srprb	100	78.598	ENSTRUG00000022463	srprb	99	78.598	Takifugu_rubripes
ENSGMOG00000002081	srprb	96	78.626	ENSTNIG00000007725	srprb	95	81.200	Tetraodon_nigroviridis
ENSGMOG00000002081	srprb	94	85.771	ENSXCOG00000012585	srprb	98	85.771	Xiphophorus_couchianus
ENSGMOG00000002081	srprb	94	85.375	ENSXMAG00000028725	srprb	98	85.375	Xiphophorus_maculatus