EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGMOG00000003264 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: srp19
Alias: zgc:63961
Full Name: signal recognition particle 19
Gene Type: protein_coding
Species: Gadus_morhua
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1017 bases
Position: chrGeneScaffold_271:16957-17973
Accession: ZDB-GENE-040426-2657
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGMOP00000003447	SRP19	PF01922.17	8.7e-29	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGMOT00000003549	-	387	-	ENSGMOP00000003447	128 (aa)	-	UPI00023F04AA

Gene Model

Click here to download ENSGMOG00000003264's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSGMOG00000003264's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGMOG00000003264	srp19	93	71.667	ENSG00000153037	SRP19	87	72.222	Homo_sapiens
ENSGMOG00000003264	srp19	94	82.500	ENSAPOG00000002199	srp19	85	82.500	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGMOG00000003264	srp19	93	72.500	ENSAMEG00000012623	SRP19	82	72.500	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGMOG00000003264	srp19	94	80.833	ENSACIG00000005082	srp19	85	80.833	Amphilophus_citrinellus
ENSGMOG00000003264	srp19	94	81.667	ENSAOCG00000002718	srp19	85	81.667	Amphiprion_ocellaris
ENSGMOG00000003264	srp19	94	81.667	ENSAPEG00000022170	srp19	85	81.667	Amphiprion_percula
ENSGMOG00000003264	srp19	94	85.000	ENSATEG00000012472	srp19	85	85.000	Anabas_testudineus
ENSGMOG00000003264	srp19	87	66.071	ENSAPLG00000002624	SRP19	93	66.087	Anas_platyrhynchos
ENSGMOG00000003264	srp19	92	68.067	ENSACAG00000007550	SRP19	83	68.595	Anolis_carolinensis
ENSGMOG00000003264	srp19	92	59.167	ENSANAG00000029862	-	88	64.583	Aotus_nancymaae
ENSGMOG00000003264	srp19	93	72.500	ENSANAG00000032576	-	83	72.500	Aotus_nancymaae
ENSGMOG00000003264	srp19	95	54.472	ENSANAG00000030287	-	85	53.390	Aotus_nancymaae
ENSGMOG00000003264	srp19	94	79.167	ENSACLG00000006259	srp19	86	78.947	Astatotilapia_calliptera
ENSGMOG00000003264	srp19	92	77.966	ENSAMXG00000043011	srp19	85	78.333	Astyanax_mexicanus
ENSGMOG00000003264	srp19	93	71.667	ENSBTAG00000012803	SRP19	83	71.667	Bos_taurus
ENSGMOG00000003264	srp19	80	50.962	WBGene00018159	F37F2.2	73	50.962	Caenorhabditis_elegans
ENSGMOG00000003264	srp19	93	72.500	ENSCJAG00000038676	-	78	72.093	Callithrix_jacchus
ENSGMOG00000003264	srp19	91	52.991	ENSCJAG00000045531	-	76	52.066	Callithrix_jacchus
ENSGMOG00000003264	srp19	93	72.500	ENSCAFG00000031549	SRP19	83	72.500	Canis_familiaris
ENSGMOG00000003264	srp19	93	72.500	ENSCAFG00020014267	-	83	72.500	Canis_lupus_dingo
ENSGMOG00000003264	srp19	91	73.504	ENSCAFG00020022437	-	90	72.500	Canis_lupus_dingo
ENSGMOG00000003264	srp19	71	71.739	ENSCAFG00020004285	-	85	70.526	Canis_lupus_dingo
ENSGMOG00000003264	srp19	93	71.667	ENSCHIG00000017551	SRP19	83	71.667	Capra_hircus
ENSGMOG00000003264	srp19	93	72.500	ENSTSYG00000007875	SRP19	83	72.500	Carlito_syrichta
ENSGMOG00000003264	srp19	84	60.909	ENSCPOG00000036806	SRP19	83	60.909	Cavia_porcellus
ENSGMOG00000003264	srp19	91	52.991	ENSCCAG00000029821	-	58	53.846	Cebus_capucinus
ENSGMOG00000003264	srp19	91	55.932	ENSCCAG00000023426	-	76	55.932	Cebus_capucinus
ENSGMOG00000003264	srp19	93	72.500	ENSCCAG00000035651	-	83	72.500	Cebus_capucinus
ENSGMOG00000003264	srp19	91	63.248	ENSCATG00000040513	-	73	62.185	Cercocebus_atys
ENSGMOG00000003264	srp19	93	67.500	ENSCATG00000039250	-	83	67.500	Cercocebus_atys
ENSGMOG00000003264	srp19	93	70.833	ENSCLAG00000004791	-	83	70.833	Chinchilla_lanigera
ENSGMOG00000003264	srp19	93	66.667	ENSCLAG00000016055	-	83	66.667	Chinchilla_lanigera
ENSGMOG00000003264	srp19	93	71.667	ENSCHOG00000013452	SRP19	83	71.667	Choloepus_hoffmanni
ENSGMOG00000003264	srp19	92	65.546	ENSCPBG00000013903	SRP19	85	66.116	Chrysemys_picta_bellii
ENSGMOG00000003264	srp19	93	70.000	ENSCGRG00001020510	Srp19	83	70.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGMOG00000003264	srp19	92	63.025	ENSCGRG00000008542	-	91	63.025	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGMOG00000003264	srp19	74	66.000	ENSCGRG00000010716	-	88	66.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGMOG00000003264	srp19	94	82.500	ENSCSEG00000010039	srp19	85	82.500	Cynoglossus_semilaevis
ENSGMOG00000003264	srp19	94	87.500	ENSCVAG00000017621	srp19	85	87.500	Cyprinodon_variegatus
ENSGMOG00000003264	srp19	92	77.966	ENSDARG00000035699	srp19	85	78.333	Danio_rerio
ENSGMOG00000003264	srp19	93	71.667	ENSDNOG00000013856	SRP19	83	71.667	Dasypus_novemcinctus
ENSGMOG00000003264	srp19	74	71.875	ENSDORG00000004746	Srp19	76	71.875	Dipodomys_ordii
ENSGMOG00000003264	srp19	91	50.427	FBgn0015298	Srp19	72	50.427	Drosophila_melanogaster
ENSGMOG00000003264	srp19	93	73.333	ENSETEG00000017132	SRP19	83	73.333	Echinops_telfairi
ENSGMOG00000003264	srp19	89	66.667	ENSEBUG00000006613	srp19	85	65.000	Eptatretus_burgeri
ENSGMOG00000003264	srp19	93	74.167	ENSEASG00005015182	SRP19	83	74.167	Equus_asinus_asinus
ENSGMOG00000003264	srp19	93	73.333	ENSEEUG00000007298	SRP19	83	73.333	Erinaceus_europaeus
ENSGMOG00000003264	srp19	92	76.271	ENSELUG00000007958	srp19	85	76.667	Esox_lucius
ENSGMOG00000003264	srp19	94	76.667	ENSELUG00000004594	srp19	85	76.667	Esox_lucius
ENSGMOG00000003264	srp19	93	72.500	ENSFCAG00000025895	SRP19	83	72.500	Felis_catus
ENSGMOG00000003264	srp19	93	72.500	ENSFDAG00000013543	SRP19	83	72.500	Fukomys_damarensis
ENSGMOG00000003264	srp19	94	84.167	ENSFHEG00000000493	srp19	85	84.167	Fundulus_heteroclitus
ENSGMOG00000003264	srp19	92	66.387	ENSGALG00000000218	SRP19	84	66.942	Gallus_gallus
ENSGMOG00000003264	srp19	94	84.167	ENSGAFG00000015815	srp19	58	84.167	Gambusia_affinis
ENSGMOG00000003264	srp19	94	82.500	ENSGACG00000001093	srp19	81	82.500	Gasterosteus_aculeatus
ENSGMOG00000003264	srp19	92	64.706	ENSGAGG00000025305	SRP19	85	65.289	Gopherus_agassizii
ENSGMOG00000003264	srp19	94	78.333	ENSHBUG00000006131	srp19	84	78.333	Haplochromis_burtoni
ENSGMOG00000003264	srp19	93	72.500	ENSHGLG00000006075	SRP19	83	72.500	Heterocephalus_glaber_female
ENSGMOG00000003264	srp19	93	72.500	ENSHGLG00100015859	SRP19	83	72.500	Heterocephalus_glaber_male
ENSGMOG00000003264	srp19	93	80.000	ENSHCOG00000013231	srp19	85	80.000	Hippocampus_comes
ENSGMOG00000003264	srp19	92	77.966	ENSIPUG00000025084	srp19	85	78.333	Ictalurus_punctatus
ENSGMOG00000003264	srp19	93	70.833	ENSSTOG00000000348	SRP19	83	70.833	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGMOG00000003264	srp19	93	71.667	ENSJJAG00000017185	Srp19	83	71.667	Jaculus_jaculus
ENSGMOG00000003264	srp19	94	85.833	ENSKMAG00000011155	srp19	85	85.833	Kryptolebias_marmoratus
ENSGMOG00000003264	srp19	94	85.000	ENSLBEG00000026727	srp19	85	85.000	Labrus_bergylta
ENSGMOG00000003264	srp19	92	72.269	ENSLACG00000004459	SRP19	79	72.727	Latimeria_chalumnae
ENSGMOG00000003264	srp19	92	75.424	ENSLOCG00000010302	srp19	85	75.833	Lepisosteus_oculatus
ENSGMOG00000003264	srp19	93	70.000	ENSLAFG00000002564	SRP19	83	70.000	Loxodonta_africana
ENSGMOG00000003264	srp19	91	53.846	ENSMFAG00000040055	-	88	52.941	Macaca_fascicularis
ENSGMOG00000003264	srp19	87	69.643	ENSMFAG00000000554	-	84	67.742	Macaca_fascicularis
ENSGMOG00000003264	srp19	87	70.536	ENSMMUG00000049186	-	79	70.536	Macaca_mulatta
ENSGMOG00000003264	srp19	91	61.538	ENSMMUG00000032515	-	87	60.504	Macaca_mulatta
ENSGMOG00000003264	srp19	91	52.991	ENSMNEG00000040117	-	88	52.101	Macaca_nemestrina
ENSGMOG00000003264	srp19	93	71.667	ENSMNEG00000038714	SRP19	83	71.667	Macaca_nemestrina
ENSGMOG00000003264	srp19	94	85.833	ENSMAMG00000018346	srp19	85	85.833	Mastacembelus_armatus
ENSGMOG00000003264	srp19	94	79.167	ENSMZEG00005001765	srp19	85	79.167	Maylandia_zebra
ENSGMOG00000003264	srp19	92	66.387	ENSMGAG00000006762	SRP19	92	66.942	Meleagris_gallopavo
ENSGMOG00000003264	srp19	75	65.979	ENSMICG00000049202	-	86	66.667	Microcebus_murinus
ENSGMOG00000003264	srp19	93	71.667	ENSMICG00000000399	SRP19	83	71.667	Microcebus_murinus
ENSGMOG00000003264	srp19	93	71.667	ENSMOCG00000006534	Srp19	83	71.667	Microtus_ochrogaster
ENSGMOG00000003264	srp19	74	70.833	ENSMOCG00000010532	-	88	70.833	Microtus_ochrogaster
ENSGMOG00000003264	srp19	94	85.833	ENSMMOG00000010417	srp19	78	85.833	Mola_mola
ENSGMOG00000003264	srp19	92	70.588	ENSMODG00000013278	SRP19	85	71.074	Monodelphis_domestica
ENSGMOG00000003264	srp19	94	85.000	ENSMALG00000003858	srp19	85	85.000	Monopterus_albus
ENSGMOG00000003264	srp19	93	73.333	MGP_CAROLIEiJ_G0022086	Srp19	83	73.333	Mus_caroli
ENSGMOG00000003264	srp19	93	73.333	ENSMUSG00000014504	Srp19	83	73.333	Mus_musculus
ENSGMOG00000003264	srp19	93	72.500	MGP_PahariEiJ_G0018820	Srp19	83	72.500	Mus_pahari
ENSGMOG00000003264	srp19	93	73.333	MGP_SPRETEiJ_G0022998	Srp19	83	73.333	Mus_spretus
ENSGMOG00000003264	srp19	93	73.333	ENSMPUG00000012695	SRP19	82	73.333	Mustela_putorius_furo
ENSGMOG00000003264	srp19	93	71.667	ENSMLUG00000014793	-	83	71.667	Myotis_lucifugus
ENSGMOG00000003264	srp19	91	70.085	ENSMLUG00000024549	-	87	69.421	Myotis_lucifugus
ENSGMOG00000003264	srp19	90	64.655	ENSNGAG00000014524	-	89	64.655	Nannospalax_galili
ENSGMOG00000003264	srp19	93	69.167	ENSNGAG00000003440	-	83	69.167	Nannospalax_galili
ENSGMOG00000003264	srp19	93	64.167	ENSNLEG00000035364	-	88	66.667	Nomascus_leucogenys
ENSGMOG00000003264	srp19	92	70.588	ENSMEUG00000012529	SRP19	93	71.074	Notamacropus_eugenii
ENSGMOG00000003264	srp19	91	72.650	ENSOPRG00000010549	SRP19	93	72.727	Ochotona_princeps
ENSGMOG00000003264	srp19	74	71.875	ENSODEG00000005538	-	84	71.875	Octodon_degus
ENSGMOG00000003264	srp19	80	65.385	ENSODEG00000013862	-	81	65.421	Octodon_degus
ENSGMOG00000003264	srp19	91	70.085	ENSODEG00000019119	-	83	69.167	Octodon_degus
ENSGMOG00000003264	srp19	94	80.000	ENSONIG00000000542	srp19	85	80.000	Oreochromis_niloticus
ENSGMOG00000003264	srp19	92	70.588	ENSOANG00000011139	SRP19	70	71.074	Ornithorhynchus_anatinus
ENSGMOG00000003264	srp19	93	73.333	ENSOCUG00000015639	SRP19	83	73.333	Oryctolagus_cuniculus
ENSGMOG00000003264	srp19	94	83.333	ENSORLG00000028267	srp19	87	84.211	Oryzias_latipes
ENSGMOG00000003264	srp19	94	83.333	ENSORLG00020015201	srp19	87	84.211	Oryzias_latipes_hni
ENSGMOG00000003264	srp19	94	83.333	ENSORLG00015007525	srp19	87	84.211	Oryzias_latipes_hsok
ENSGMOG00000003264	srp19	94	83.333	ENSOMEG00000009178	srp19	86	83.333	Oryzias_melastigma
ENSGMOG00000003264	srp19	93	70.833	ENSOGAG00000008579	SRP19	83	70.833	Otolemur_garnettii
ENSGMOG00000003264	srp19	93	70.833	ENSOARG00000016066	SRP19	83	70.833	Ovis_aries
ENSGMOG00000003264	srp19	93	71.667	ENSPPAG00000037062	SRP19	83	71.667	Pan_paniscus
ENSGMOG00000003264	srp19	93	72.500	ENSPPRG00000015591	SRP19	83	72.500	Panthera_pardus
ENSGMOG00000003264	srp19	93	72.500	ENSPTIG00000021474	SRP19	83	72.500	Panthera_tigris_altaica
ENSGMOG00000003264	srp19	93	71.667	ENSPTRG00000017136	SRP19	83	71.667	Pan_troglodytes
ENSGMOG00000003264	srp19	93	66.667	ENSPANG00000034740	-	83	66.667	Papio_anubis
ENSGMOG00000003264	srp19	93	71.667	ENSPANG00000004370	-	83	71.667	Papio_anubis
ENSGMOG00000003264	srp19	94	70.833	ENSPKIG00000018671	srp19	85	70.833	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGMOG00000003264	srp19	92	65.546	ENSPSIG00000013811	SRP19	92	66.116	Pelodiscus_sinensis
ENSGMOG00000003264	srp19	94	82.500	ENSPMGG00000015313	srp19	85	82.500	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGMOG00000003264	srp19	93	71.667	ENSPEMG00000004412	-	88	71.667	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGMOG00000003264	srp19	95	60.331	ENSPMAG00000002685	srp19	84	61.864	Petromyzon_marinus
ENSGMOG00000003264	srp19	92	70.588	ENSPCIG00000010250	SRP19	84	71.074	Phascolarctos_cinereus
ENSGMOG00000003264	srp19	94	85.833	ENSPFOG00000015887	srp19	85	85.833	Poecilia_formosa
ENSGMOG00000003264	srp19	94	85.833	ENSPLAG00000007784	srp19	88	85.263	Poecilia_latipinna
ENSGMOG00000003264	srp19	94	85.000	ENSPMEG00000003056	srp19	88	85.263	Poecilia_mexicana
ENSGMOG00000003264	srp19	94	85.833	ENSPREG00000017307	srp19	85	85.833	Poecilia_reticulata
ENSGMOG00000003264	srp19	93	71.667	ENSPPYG00000029584	SRP19	82	71.667	Pongo_abelii
ENSGMOG00000003264	srp19	73	68.421	ENSPCAG00000000228	SRP19	66	68.421	Procavia_capensis
ENSGMOG00000003264	srp19	93	71.667	ENSPCOG00000023239	SRP19	83	71.667	Propithecus_coquereli
ENSGMOG00000003264	srp19	93	70.833	ENSPVAG00000004895	SRP19	83	70.833	Pteropus_vampyrus
ENSGMOG00000003264	srp19	92	79.832	ENSPNAG00000009392	srp19	88	80.165	Pygocentrus_nattereri
ENSGMOG00000003264	srp19	93	72.500	ENSRNOG00000020204	Srp19	83	72.500	Rattus_norvegicus
ENSGMOG00000003264	srp19	93	71.667	ENSRBIG00000015627	-	83	71.667	Rhinopithecus_bieti
ENSGMOG00000003264	srp19	56	65.753	ENSRBIG00000031651	-	81	65.753	Rhinopithecus_bieti
ENSGMOG00000003264	srp19	92	63.559	ENSRBIG00000040440	-	88	59.406	Rhinopithecus_bieti
ENSGMOG00000003264	srp19	92	63.559	ENSRROG00000037054	-	89	59.406	Rhinopithecus_roxellana
ENSGMOG00000003264	srp19	95	54.918	ENSRROG00000037316	-	90	55.833	Rhinopithecus_roxellana
ENSGMOG00000003264	srp19	93	72.500	ENSSBOG00000028071	-	83	72.500	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSGMOG00000003264	srp19	92	55.462	ENSSBOG00000032685	-	85	62.105	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSGMOG00000003264	srp19	94	77.500	ENSSFOG00015022139	srp19	85	77.500	Scleropages_formosus
ENSGMOG00000003264	srp19	94	79.167	ENSSMAG00000016803	srp19	85	79.167	Scophthalmus_maximus
ENSGMOG00000003264	srp19	94	72.519	ENSSDUG00000012930	srp19	86	72.519	Seriola_dumerili
ENSGMOG00000003264	srp19	95	52.846	ENSSLDG00000021916	-	57	64.368	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSGMOG00000003264	srp19	93	71.667	ENSSARG00000000615	SRP19	83	71.667	Sorex_araneus
ENSGMOG00000003264	srp19	92	71.429	ENSSPUG00000015769	SRP19	83	71.901	Sphenodon_punctatus
ENSGMOG00000003264	srp19	93	72.500	ENSSSCG00000026230	SRP19	83	72.500	Sus_scrofa
ENSGMOG00000003264	srp19	92	66.387	ENSTGUG00000001019	SRP19	83	66.942	Taeniopygia_guttata
ENSGMOG00000003264	srp19	94	83.871	ENSTRUG00000023119	srp19	86	83.871	Takifugu_rubripes
ENSGMOG00000003264	srp19	94	85.833	ENSTNIG00000018880	srp19	85	85.833	Tetraodon_nigroviridis
ENSGMOG00000003264	srp19	93	71.667	ENSTTRG00000001690	SRP19	83	71.667	Tursiops_truncatus
ENSGMOG00000003264	srp19	91	74.359	ENSUAMG00000000111	SRP19	83	73.333	Ursus_americanus
ENSGMOG00000003264	srp19	93	73.333	ENSUMAG00000016997	SRP19	83	73.333	Ursus_maritimus
ENSGMOG00000003264	srp19	93	73.333	ENSVPAG00000006001	SRP19	83	73.333	Vicugna_pacos
ENSGMOG00000003264	srp19	74	71.875	ENSVVUG00000012423	SRP19	87	75.000	Vulpes_vulpes
ENSGMOG00000003264	srp19	94	68.595	ENSXETG00000011993	srp19	85	68.595	Xenopus_tropicalis
ENSGMOG00000003264	srp19	96	65.041	ENSXCOG00000012530	srp19	74	73.585	Xiphophorus_couchianus
ENSGMOG00000003264	srp19	94	84.167	ENSXMAG00000029788	srp19	85	84.167	Xiphophorus_maculatus