EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGMOG00000013244 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: srpra
Alias: id:ibd1064|srpr|wu:fd12f02
Full Name: SRP receptor subunit alpha
Gene Type: protein_coding
Species: Gadus_morhua
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8499 bases
Position: chrGeneScaffold_3150:126147-134645
Accession: ZDB-GENE-030219-11
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGMOP00000014172	SRP54	PF00448.22	1.1e-47	1	1
ENSGMOP00000014172	SRP54_N	PF02881.19	8.1e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGMOT00000014537	-	1860	-	ENSGMOP00000014172	620 (aa)	-	UPI00023F3091

Gene Model

Click here to download ENSGMOG00000013244's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSGMOG00000013244's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.682	ENSG00000182934	SRPRA	100	67.857	Homo_sapiens
ENSGMOG00000013244	srpra	100	82.923	ENSAPOG00000017588	srpra	100	83.129	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.478	ENSAMEG00000000117	SRPRA	100	67.857	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGMOG00000013244	srpra	100	77.301	ENSACIG00000021588	srpra	100	78.528	Amphilophus_citrinellus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	83.231	ENSAOCG00000018884	srpra	100	83.436	Amphiprion_ocellaris
ENSGMOG00000013244	srpra	100	83.231	ENSAPEG00000022286	srpra	100	79.360	Amphiprion_percula
ENSGMOG00000013244	srpra	100	79.570	ENSATEG00000023578	srpra	100	80.887	Anabas_testudineus
ENSGMOG00000013244	srpra	94	67.980	ENSAPLG00000016079	SRPRA	99	69.016	Anas_platyrhynchos
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.913	ENSACAG00000000108	SRPRA	100	68.259	Anolis_carolinensis
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.527	ENSANAG00000020346	SRPRA	100	67.702	Aotus_nancymaae
ENSGMOG00000013244	srpra	100	81.442	ENSACLG00000000518	srpra	100	80.982	Astatotilapia_calliptera
ENSGMOG00000013244	srpra	100	75.806	ENSAMXG00000009975	srpra	100	75.323	Astyanax_mexicanus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	67.846	ENSBTAG00000014105	SRPRA	100	67.957	Bos_taurus
ENSGMOG00000013244	srpra	99	49.155	WBGene00009521	F38A1.8	99	48.694	Caenorhabditis_elegans
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.274	ENSCJAG00000008752	SRPRA	100	67.445	Callithrix_jacchus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	66.822	ENSCAFG00000010474	SRPRA	100	65.994	Canis_familiaris
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.527	ENSCAFG00020010608	SRPRA	100	67.702	Canis_lupus_dingo
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.769	ENSCHIG00000012423	SRPRA	100	67.702	Capra_hircus
ENSGMOG00000013244	srpra	79	85.410	ENSTSYG00000005187	SRPRA	90	86.349	Carlito_syrichta
ENSGMOG00000013244	srpra	95	65.347	ENSCAPG00000007098	SRPRA	91	87.970	Cavia_aperea
ENSGMOG00000013244	srpra	100	67.178	ENSCPOG00000014976	SRPRA	91	87.970	Cavia_porcellus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.478	ENSCCAG00000025602	SRPRA	100	67.236	Cebus_capucinus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.372	ENSCATG00000039354	SRPRA	100	67.857	Cercocebus_atys
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.682	ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	67.081	Chinchilla_lanigera
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.527	ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	67.702	Chlorocebus_sabaeus
ENSGMOG00000013244	srpra	56	86.224	ENSCHOG00000010015	-	72	86.224	Choloepus_hoffmanni
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.817	ENSCPBG00000011128	SRPRA	100	68.865	Chrysemys_picta_bellii
ENSGMOG00000013244	srpra	99	56.535	ENSCING00000008954	-	100	55.927	Ciona_intestinalis
ENSGMOG00000013244	srpra	99	59.906	ENSCSAVG00000005602	-	100	59.119	Ciona_savignyi
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.527	ENSCANG00000032337	SRPRA	100	68.012	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.634	ENSCGRG00001017670	Srpr	100	67.857	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.634	ENSCGRG00000009892	Srpr	90	88.148	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGMOG00000013244	srpra	100	80.799	ENSCSEG00000002374	srpra	100	80.799	Cynoglossus_semilaevis
ENSGMOG00000013244	srpra	100	80.710	ENSCVAG00000019881	srpra	100	80.710	Cyprinodon_variegatus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	76.220	ENSDARG00000061124	srpra	100	75.643	Danio_rerio
ENSGMOG00000013244	srpra	100	67.890	ENSDNOG00000010821	SRPRA	100	66.718	Dasypus_novemcinctus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.682	ENSDORG00000016719	Srpr	100	67.391	Dipodomys_ordii
ENSGMOG00000013244	srpra	99	52.167	FBgn0010391	Gtp-bp	100	51.840	Drosophila_melanogaster
ENSGMOG00000013244	srpra	100	67.287	ENSETEG00000013956	SRPRA	100	66.512	Echinops_telfairi
ENSGMOG00000013244	srpra	60	73.280	ENSEBUG00000002602	srpra	92	72.292	Eptatretus_burgeri
ENSGMOG00000013244	srpra	100	69.099	ENSEASG00005022980	SRPRA	100	67.857	Equus_asinus_asinus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	69.099	ENSECAG00000014692	SRPRA	100	67.857	Equus_caballus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	64.341	ENSEEUG00000007920	SRPRA	100	62.986	Erinaceus_europaeus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	82.722	ENSELUG00000017643	srpra	100	82.569	Esox_lucius
ENSGMOG00000013244	srpra	100	69.040	ENSFCAG00000011274	-	100	67.752	Felis_catus
ENSGMOG00000013244	srpra	79	63.320	ENSFCAG00000030894	-	99	61.702	Felis_catus
ENSGMOG00000013244	srpra	99	66.149	ENSFALG00000005048	SRPRA	99	66.512	Ficedula_albicollis
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.682	ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.217	Fukomys_damarensis
ENSGMOG00000013244	srpra	100	80.492	ENSFHEG00000016959	srpra	100	80.704	Fundulus_heteroclitus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.259	ENSGALG00000030759	SRPRA	100	69.077	Gallus_gallus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	81.298	ENSGAFG00000000453	srpra	100	80.982	Gambusia_affinis
ENSGMOG00000013244	srpra	100	81.620	ENSGACG00000006550	srpra	100	81.620	Gasterosteus_aculeatus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.971	ENSGAGG00000021157	SRPRA	100	68.817	Gopherus_agassizii
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.682	ENSGGOG00000012962	SRPRA	100	67.857	Gorilla_gorilla
ENSGMOG00000013244	srpra	100	81.288	ENSHBUG00000000119	srpra	100	80.828	Haplochromis_burtoni
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.323	ENSHGLG00000001597	SRPR	94	88.636	Heterocephalus_glaber_female
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.323	ENSHGLG00100006449	SRPR	94	88.636	Heterocephalus_glaber_male
ENSGMOG00000013244	srpra	100	79.908	ENSHCOG00000010749	srpra	100	79.969	Hippocampus_comes
ENSGMOG00000013244	srpra	94	73.083	ENSIPUG00000000867	srpra	99	73.246	Ictalurus_punctatus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.372	ENSSTOG00000009897	SRPRA	100	67.702	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.217	ENSJJAG00000020272	Srpr	100	67.863	Jaculus_jaculus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	81.106	ENSKMAG00000002280	srpra	100	81.317	Kryptolebias_marmoratus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	82.488	ENSLBEG00000009608	srpra	100	82.848	Labrus_bergylta
ENSGMOG00000013244	srpra	100	69.678	ENSLACG00000017781	SRPRA	100	70.444	Latimeria_chalumnae
ENSGMOG00000013244	srpra	100	73.668	ENSLOCG00000002733	srpra	100	72.644	Lepisosteus_oculatus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.062	ENSLAFG00000010252	SRPRA	100	67.752	Loxodonta_africana
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.682	ENSMFAG00000032606	SRPRA	100	67.857	Macaca_fascicularis
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.682	ENSMMUG00000007938	SRPRA	100	67.857	Macaca_mulatta
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.527	ENSMNEG00000030709	SRPRA	100	67.702	Macaca_nemestrina
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.372	ENSMLEG00000043404	SRPRA	100	67.857	Mandrillus_leucophaeus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	81.595	ENSMAMG00000000473	srpra	100	81.902	Mastacembelus_armatus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	81.442	ENSMZEG00005013432	srpra	100	80.982	Maylandia_zebra
ENSGMOG00000013244	srpra	93	68.369	ENSMGAG00000000732	SRPRA	100	68.586	Meleagris_gallopavo
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.944	ENSMAUG00000015648	Srpr	100	67.857	Mesocricetus_auratus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.527	ENSMICG00000015981	SRPRA	100	66.925	Microcebus_murinus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.478	ENSMOCG00000008311	Srpr	100	67.702	Microtus_ochrogaster
ENSGMOG00000013244	srpra	100	78.537	ENSMMOG00000005019	srpra	100	76.827	Mola_mola
ENSGMOG00000013244	srpra	100	67.688	ENSMODG00000004576	-	100	67.026	Monodelphis_domestica
ENSGMOG00000013244	srpra	100	81.231	ENSMALG00000011343	srpra	100	81.846	Monopterus_albus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.896	MGP_CAROLIEiJ_G0031951	Srpr	86	89.394	Mus_caroli
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.944	ENSMUSG00000032042	Srpr	86	88.636	Mus_musculus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.740	MGP_PahariEiJ_G0014816	Srpr	86	88.636	Mus_pahari
ENSGMOG00000013244	srpra	100	65.134	MGP_SPRETEiJ_G0033075	Srpr	100	64.148	Mus_spretus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.837	ENSMPUG00000006626	SRPRA	100	67.857	Mustela_putorius_furo
ENSGMOG00000013244	srpra	100	67.597	ENSMLUG00000017334	SRPRA	100	67.132	Myotis_lucifugus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.217	ENSNGAG00000015686	Srpr	100	67.547	Nannospalax_galili
ENSGMOG00000013244	srpra	100	81.077	ENSNBRG00000017311	srpra	100	81.298	Neolamprologus_brichardi
ENSGMOG00000013244	srpra	99	65.211	ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	67.374	Nomascus_leucogenys
ENSGMOG00000013244	srpra	93	66.998	ENSMEUG00000004956	SRPRA	100	65.672	Notamacropus_eugenii
ENSGMOG00000013244	srpra	100	64.551	ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	64.031	Ochotona_princeps
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.111	ENSODEG00000004730	SRPRA	100	67.702	Octodon_degus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	81.385	ENSONIG00000005324	srpra	100	81.135	Oreochromis_niloticus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.837	ENSOCUG00000017057	SRPRA	100	68.012	Oryctolagus_cuniculus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	79.225	ENSORLG00000014676	srpra	100	79.690	Oryzias_latipes
ENSGMOG00000013244	srpra	100	79.070	ENSORLG00020009240	srpra	100	79.598	Oryzias_latipes_hni
ENSGMOG00000013244	srpra	100	79.968	ENSORLG00015015405	srpra	100	79.968	Oryzias_latipes_hsok
ENSGMOG00000013244	srpra	100	79.535	ENSOMEG00000005872	srpra	100	80.449	Oryzias_melastigma
ENSGMOG00000013244	srpra	100	69.195	ENSOGAG00000008926	SRPRA	100	68.175	Otolemur_garnettii
ENSGMOG00000013244	srpra	100	65.432	ENSOARG00000012397	SRPRA	100	65.789	Ovis_aries
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.682	ENSPPAG00000030813	SRPRA	100	67.857	Pan_paniscus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	69.040	ENSPPRG00000001542	SRPRA	100	67.752	Panthera_pardus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.885	ENSPTIG00000006989	SRPRA	100	67.597	Panthera_tigris_altaica
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.682	ENSPTRG00000028360	SRPRA	100	67.857	Pan_troglodytes
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.682	ENSPANG00000010858	SRPRA	100	67.857	Papio_anubis
ENSGMOG00000013244	srpra	100	75.157	ENSPKIG00000016106	srpra	100	74.808	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGMOG00000013244	srpra	93	69.508	ENSPSIG00000012009	SRPRA	100	69.180	Pelodiscus_sinensis
ENSGMOG00000013244	srpra	100	78.915	ENSPMGG00000001393	srpra	100	79.380	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.478	ENSPEMG00000018279	Srpr	100	67.702	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGMOG00000013244	srpra	99	60.401	ENSPMAG00000009559	srpra	99	61.171	Petromyzon_marinus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	66.413	ENSPCIG00000010207	SRPRA	100	67.130	Phascolarctos_cinereus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	81.135	ENSPFOG00000003114	srpra	100	81.135	Poecilia_formosa
ENSGMOG00000013244	srpra	100	81.135	ENSPLAG00000007323	srpra	100	81.288	Poecilia_latipinna
ENSGMOG00000013244	srpra	100	80.982	ENSPMEG00000015658	srpra	100	80.982	Poecilia_mexicana
ENSGMOG00000013244	srpra	100	81.442	ENSPREG00000004937	srpra	100	81.595	Poecilia_reticulata
ENSGMOG00000013244	srpra	88	86.842	ENSPPYG00000004045	SRPRA	100	86.842	Pongo_abelii
ENSGMOG00000013244	srpra	64	90.698	ENSPCAG00000003801	-	62	90.698	Procavia_capensis
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.682	ENSPCOG00000025726	SRPRA	100	67.081	Propithecus_coquereli
ENSGMOG00000013244	srpra	100	67.797	ENSPVAG00000000993	SRPRA	100	68.019	Pteropus_vampyrus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	81.442	ENSPNYG00000012371	srpra	100	80.982	Pundamilia_nyererei
ENSGMOG00000013244	srpra	100	75.269	ENSPNAG00000013476	srpra	100	75.038	Pygocentrus_nattereri
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.478	ENSRNOG00000010543	Srpra	100	67.702	Rattus_norvegicus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	69.040	ENSRBIG00000008702	SRPRA	100	67.857	Rhinopithecus_bieti
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.731	ENSRROG00000029494	SRPRA	100	67.907	Rhinopithecus_roxellana
ENSGMOG00000013244	srpra	51	41.916	YDR292C	-	52	41.641	Saccharomyces_cerevisiae
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.372	ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	67.547	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSGMOG00000013244	srpra	94	66.612	ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	66.833	Sarcophilus_harrisii
ENSGMOG00000013244	srpra	100	73.482	ENSSFOG00015008837	srpra	100	73.428	Scleropages_formosus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	77.107	ENSSMAG00000002783	srpra	100	75.355	Scophthalmus_maximus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	81.930	ENSSDUG00000013920	srpra	100	78.880	Seriola_dumerili
ENSGMOG00000013244	srpra	100	81.776	ENSSLDG00000008601	srpra	93	81.776	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSGMOG00000013244	srpra	81	80.488	ENSSARG00000012434	SRPRA	86	80.488	Sorex_araneus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	66.256	ENSSPUG00000018221	SRPRA	100	67.231	Sphenodon_punctatus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	81.902	ENSSPAG00000005103	srpra	100	82.110	Stegastes_partitus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	69.302	ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	68.634	Sus_scrofa
ENSGMOG00000013244	srpra	94	66.010	ENSTGUG00000000815	SRPRA	100	66.230	Taeniopygia_guttata
ENSGMOG00000013244	srpra	100	80.556	ENSTRUG00000006856	srpra	100	80.556	Takifugu_rubripes
ENSGMOG00000013244	srpra	100	77.064	ENSTNIG00000010316	srpra	100	75.841	Tetraodon_nigroviridis
ENSGMOG00000013244	srpra	100	69.077	ENSTTRG00000001558	SRPRA	100	67.957	Tursiops_truncatus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.527	ENSUAMG00000005510	SRPRA	100	67.907	Ursus_americanus
ENSGMOG00000013244	srpra	96	63.768	ENSUMAG00000002269	SRPRA	100	62.400	Ursus_maritimus
ENSGMOG00000013244	srpra	68	90.698	ENSVPAG00000001077	SRPRA	75	90.698	Vicugna_pacos
ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.527	ENSVVUG00000020094	SRPRA	100	67.857	Vulpes_vulpes
ENSGMOG00000013244	srpra	100	60.030	ENSXETG00000003920	srpra	100	61.094	Xenopus_tropicalis
ENSGMOG00000013244	srpra	100	72.742	ENSXCOG00000001286	srpra	100	72.419	Xiphophorus_couchianus
ENSGMOG00000013244	srpra	100	81.077	ENSXMAG00000028401	srpra	100	81.077	Xiphophorus_maculatus