EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSGMOG00000014229 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SMARCA2
Alias: wu:fa56c07|wu:fi27f11|zgc:66238
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Gadus_morhua
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 61777 bases
Position: chrGeneScaffold_3001:361718-423494
Accession: 11098
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGMOP00000015257	ResIII	PF04851.15	1.6e-07	1	1
ENSGMOP00000015257	BRK	PF07533.16	1.2e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGMOT00000015648	SMARCA2-201	4644	-	ENSGMOP00000015257	1548 (aa)	-	UPI00023F2B0F

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	76	72.663	ENSGMOG00000002649	smarca4a	88	72.716
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	83	71.845	ENSGMOG00000005756	-	87	70.765

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	77.461	ENSG00000080503	SMARCA2	99	96.000	Homo_sapiens
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	83.122	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	83.643	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	80	83.307	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	98	83.466	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	81.318	ENSACIG00000015607	SMARCA2	99	82.138	Amphilophus_citrinellus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	83.097	ENSAOCG00000009647	-	99	83.591	Amphiprion_ocellaris
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	82.931	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	99	83.843	Amphiprion_percula
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	83.027	ENSATEG00000006916	SMARCA2	98	83.407	Anabas_testudineus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	87	76.828	ENSAPLG00000013873	SMARCA2	92	75.777	Anas_platyrhynchos
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	77.917	ENSACAG00000002423	SMARCA2	98	77.117	Anolis_carolinensis
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	78.250	ENSANAG00000026498	SMARCA2	98	77.685	Aotus_nancymaae
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	83.376	ENSACLG00000004248	SMARCA2	99	83.959	Astatotilapia_calliptera
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	80.329	ENSAMXG00000012404	smarca2	99	80.594	Astyanax_mexicanus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	79.006	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	97	78.879	Bos_taurus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	77.828	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	98	77.548	Callithrix_jacchus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	79.263	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	98	77.835	Canis_familiaris
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	75	83.433	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	94	83.319	Canis_lupus_dingo
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	78.940	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	98	77.964	Capra_hircus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	76.335	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	98	77.707	Carlito_syrichta
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	75.567	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	98	75.405	Cavia_aperea
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	77.900	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	98	78.058	Cavia_porcellus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	77.886	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	98	77.763	Cebus_capucinus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	77.662	ENSCATG00000031470	SMARCA2	98	77.965	Cercocebus_atys
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	77.249	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	98	77.500	Chinchilla_lanigera
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	92	78.138	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	98	78.332	Chlorocebus_sabaeus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	84	78.117	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	85	78.018	Choloepus_hoffmanni
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	77.523	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	98	77.384	Chrysemys_picta_bellii
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	77.973	ENSCANG00000039597	SMARCA2	98	78.145	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	74.276	ENSCGRG00001002323	Smarca2	97	73.299	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	79.255	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	98	80.167	Cynoglossus_semilaevis
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	85	80.464	ENSCVAG00000016571	SMARCA2	98	81.091	Cyprinodon_variegatus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	80.063	ENSDARG00000008904	smarca2	99	80.266	Danio_rerio
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	78.066	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	98	77.799	Dasypus_novemcinctus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	81	84.353	ENSDORG00000014832	Smarca2	98	78.072	Dipodomys_ordii
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	79	60.746	FBgn0000212	brm	72	60.033	Drosophila_melanogaster
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	95	69.128	ENSEBUG00000011442	-	96	68.725	Eptatretus_burgeri
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	87	61.351	ENSEBUG00000002449	-	95	62.372	Eptatretus_burgeri
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	79.065	ENSEASG00005010312	SMARCA2	97	78.641	Equus_asinus_asinus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	62	88.235	ENSEEUG00000015540	-	68	71.945	Erinaceus_europaeus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	93	81.216	ENSELUG00000010318	smarca2	99	78.476	Esox_lucius
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	79.125	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	98	77.706	Felis_catus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	77.654	ENSFALG00000010416	SMARCA2	98	78.527	Ficedula_albicollis
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	77.267	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	97	76.928	Fukomys_damarensis
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	81.928	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	99	81.992	Fundulus_heteroclitus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	78.529	ENSGALG00000010164	SMARCA2	98	77.627	Gallus_gallus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	96	76.109	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	92	92.222	Gambusia_affinis
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	83.578	ENSGACG00000014488	SMARCA2	99	84.345	Gasterosteus_aculeatus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	77.654	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	98	77.320	Gopherus_agassizii
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	83.150	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	99	82.468	Haplochromis_burtoni
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	76.992	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	97	76.737	Heterocephalus_glaber_female
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	79.027	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	98	77.771	Heterocephalus_glaber_male
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	90	76.824	ENSHCOG00000015348	-	99	77.480	Hippocampus_comes
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	79.014	ENSIPUG00000011060	smarca2	98	79.481	Ictalurus_punctatus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	77.763	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	98	77.469	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	78.182	ENSJJAG00000010867	Smarca2	98	77.943	Jaculus_jaculus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	81.356	ENSKMAG00000015844	-	99	81.670	Kryptolebias_marmoratus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	79.652	ENSLOCG00000011499	smarca2	99	78.737	Lepisosteus_oculatus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	76.819	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	98	77.628	Loxodonta_africana
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	81	84.169	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	98	77.484	Macaca_fascicularis
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	77.857	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	98	78.030	Macaca_mulatta
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	78.060	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	98	78.159	Macaca_nemestrina
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	80	84.400	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	99	77.818	Mandrillus_leucophaeus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	81.881	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	81.953	Mastacembelus_armatus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	83.441	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	99	82.689	Maylandia_zebra
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	74	66.887	ENSMGAG00000005160	-	99	66.050	Meleagris_gallopavo
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	78.227	ENSMICG00000005162	SMARCA2	98	78.131	Microcebus_murinus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	78.030	ENSMOCG00000001611	Smarca2	98	77.899	Microtus_ochrogaster
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	79.288	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	99	79.860	Mola_mola
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	77.763	ENSMODG00000003578	SMARCA2	98	77.592	Monodelphis_domestica
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	82.224	ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	82.676	Monopterus_albus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	77.232	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	98	77.293	Mus_caroli
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	77.282	ENSMUSG00000024921	Smarca2	99	96.000	Mus_musculus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	77.612	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	98	77.492	Mus_pahari
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	77.102	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	98	77.165	Mus_spretus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	81	83.085	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	93	83.241	Mustela_putorius_furo
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	73.963	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	98	73.764	Myotis_lucifugus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	77.706	ENSNGAG00000000108	Smarca2	98	77.235	Nannospalax_galili
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	88	74.711	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	94	82.090	Neolamprologus_brichardi
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	77.836	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	97	77.908	Nomascus_leucogenys
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	70.976	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	97	71.217	Notamacropus_eugenii
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	84	77.531	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	98	73.843	Ochotona_princeps
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	83	82.154	ENSODEG00000005452	SMARCA2	97	77.081	Octodon_degus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	81.812	ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	82.190	Oreochromis_niloticus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	84	82.515	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	98	77.721	Oryctolagus_cuniculus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	82.129	ENSORLG00000020820	SMARCA2	100	81.384	Oryzias_latipes
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	82.245	ENSORLG00015006289	SMARCA2	99	82.435	Oryzias_latipes_hsok
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	83.754	ENSOMEG00000009736	-	99	83.754	Oryzias_melastigma
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	81	84.248	ENSOGAG00000017053	SMARCA2	98	76.673	Otolemur_garnettii
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	78.408	ENSOARG00000013265	SMARCA2	97	78.363	Ovis_aries
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	80	83.386	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	98	77.017	Pan_paniscus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	79.192	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	98	77.771	Panthera_pardus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	78.227	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	98	78.115	Pan_troglodytes
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	73.935	ENSPANG00000025121	SMARCA2	97	74.547	Papio_anubis
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	100	80.333	ENSPKIG00000018469	-	99	80.000	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	77.502	ENSPSIG00000006284	SMARCA2	98	77.170	Pelodiscus_sinensis
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	77.964	ENSPMGG00000013696	-	97	78.865	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	77.038	ENSPEMG00000019821	Smarca2	98	76.673	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	95	68.582	ENSPMAG00000005337	-	97	68.344	Petromyzon_marinus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	78.221	ENSPCIG00000015658	SMARCA2	98	77.656	Phascolarctos_cinereus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	81.416	ENSPFOG00000001856	SMARCA2	99	81.858	Poecilia_formosa
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	80.651	ENSPLAG00000017829	SMARCA2	98	81.097	Poecilia_latipinna
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	80.764	ENSPMEG00000001815	-	99	81.203	Poecilia_mexicana
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	80.401	ENSPREG00000013800	SMARCA2	99	80.964	Poecilia_reticulata
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	78.010	ENSPPYG00000019258	SMARCA2	98	77.670	Pongo_abelii
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	76	72.183	ENSPCAG00000016969	SMARCA2	75	72.183	Procavia_capensis
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	76.888	ENSPCOG00000025709	SMARCA2	99	75.054	Propithecus_coquereli
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	90	80.351	ENSPVAG00000000901	SMARCA2	92	80.884	Pteropus_vampyrus
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	80.153	ENSPNYG00000004533	SMARCA2	99	80.472	Pundamilia_nyererei
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	80.101	ENSPNAG00000014635	smarca2	98	80.721	Pygocentrus_nattereri
ENSGMOG00000014229	SMARCA2	83	82.020	ENSRNOG00000011931	Smarca2	98	76.718	Rattus_norvegicus
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