EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGMOG00000018229 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: sbno1
Alias: -
Full Name: strawberry notch homolog 1 (Drosophila)
Gene Type: protein_coding
Species: Gadus_morhua
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 14422 bases
Position: chrGeneScaffold_58:178756-193177
Accession: ZDB-GENE-080522-2
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGMOP00000019645	ResIII	PF04851.15	2.7e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGMOT00000020124	-	3888	-	ENSGMOP00000019645	1296 (aa)	-	UPI00023F424D

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSGMOG00000018229	sbno1	72	62.358	ENSGMOG00000007542	si:ch73-63e15.2	79	62.358

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	78.659	ENSG00000139697	SBNO1	94	78.075	Homo_sapiens
ENSGMOG00000018229	sbno1	88	88.056	ENSAPOG00000003196	sbno1	98	88.317	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	78.636	ENSAMEG00000015151	SBNO1	94	78.056	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	83.033	ENSACIG00000008088	sbno1	96	83.333	Amphilophus_citrinellus
ENSGMOG00000018229	sbno1	100	84.708	ENSAOCG00000014859	sbno1	94	85.221	Amphiprion_ocellaris
ENSGMOG00000018229	sbno1	100	84.633	ENSAPEG00000006069	sbno1	94	85.146	Amphiprion_percula
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	86.090	ENSATEG00000006667	sbno1	94	86.241	Anabas_testudineus
ENSGMOG00000018229	sbno1	98	79.163	ENSAPLG00000015674	SBNO1	94	79.084	Anas_platyrhynchos
ENSGMOG00000018229	sbno1	98	77.846	ENSACAG00000015441	SBNO1	85	77.744	Anolis_carolinensis
ENSGMOG00000018229	sbno1	94	84.587	ENSANAG00000029958	-	96	82.447	Aotus_nancymaae
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	83.744	ENSACLG00000024913	sbno1	97	83.372	Astatotilapia_calliptera
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	83.763	ENSAMXG00000019473	sbno1	95	83.763	Astyanax_mexicanus
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	78.992	ENSBTAG00000020505	SBNO1	97	78.191	Bos_taurus
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	78.436	ENSCJAG00000016599	SBNO1	94	78.082	Callithrix_jacchus
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	78.696	ENSCAFG00000007503	SBNO1	97	84.921	Canis_familiaris
ENSGMOG00000018229	sbno1	100	77.568	ENSCAFG00020015363	SBNO1	96	82.385	Canis_lupus_dingo
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	78.855	ENSCHIG00000008382	SBNO1	96	84.587	Capra_hircus
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	78.795	ENSTSYG00000012749	SBNO1	96	79.777	Carlito_syrichta
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	78.479	ENSCAPG00000000384	SBNO1	98	84.404	Cavia_aperea
ENSGMOG00000018229	sbno1	94	84.404	ENSCPOG00000008109	SBNO1	96	84.404	Cavia_porcellus
ENSGMOG00000018229	sbno1	100	74.071	ENSCCAG00000035316	SBNO1	96	74.891	Cebus_capucinus
ENSGMOG00000018229	sbno1	95	83.696	ENSCATG00000008239	SBNO1	98	83.696	Cercocebus_atys
ENSGMOG00000018229	sbno1	94	84.404	ENSCLAG00000008995	SBNO1	96	84.404	Chinchilla_lanigera
ENSGMOG00000018229	sbno1	88	82.699	ENSCSAG00000002064	SBNO1	99	82.165	Chlorocebus_sabaeus
ENSGMOG00000018229	sbno1	95	77.720	ENSCHOG00000008814	SBNO1	90	76.715	Choloepus_hoffmanni
ENSGMOG00000018229	sbno1	98	78.682	ENSCPBG00000025968	SBNO1	95	78.343	Chrysemys_picta_bellii
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	74.905	ENSCANG00000042688	-	94	74.088	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGMOG00000018229	sbno1	94	83.486	ENSCGRG00001017470	Sbno1	96	83.486	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGMOG00000018229	sbno1	94	83.486	ENSCGRG00000004756	Sbno1	96	83.486	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	85.090	ENSCSEG00000011919	sbno1	95	84.789	Cynoglossus_semilaevis
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	85.188	ENSCVAG00000007038	sbno1	97	82.824	Cyprinodon_variegatus
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	85.627	ENSDARG00000099080	sbno1	94	85.377	Danio_rerio
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	77.692	ENSDNOG00000017147	SBNO1	95	77.625	Dasypus_novemcinctus
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	72.290	ENSDORG00000015261	Sbno1	94	81.431	Dipodomys_ordii
ENSGMOG00000018229	sbno1	92	71.809	ENSETEG00000005620	SBNO1	87	71.635	Echinops_telfairi
ENSGMOG00000018229	sbno1	74	64.206	ENSEBUG00000013823	sbno1	83	67.814	Eptatretus_burgeri
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	78.664	ENSECAG00000006127	SBNO1	97	78.006	Equus_caballus
ENSGMOG00000018229	sbno1	82	79.096	ENSEEUG00000003793	SBNO1	76	79.096	Erinaceus_europaeus
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	83.859	ENSELUG00000002886	sbno1	95	83.772	Esox_lucius
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	78.891	ENSFCAG00000015331	SBNO1	94	78.234	Felis_catus
ENSGMOG00000018229	sbno1	98	79.396	ENSFALG00000009273	SBNO1	94	79.237	Ficedula_albicollis
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	77.786	ENSFDAG00000014232	SBNO1	94	77.082	Fukomys_damarensis
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	84.725	ENSFHEG00000007360	sbno1	97	82.756	Fundulus_heteroclitus
ENSGMOG00000018229	sbno1	88	79.498	ENSGALG00000003392	SBNO1	93	79.463	Gallus_gallus
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	85.053	ENSGAFG00000003960	sbno1	96	84.966	Gambusia_affinis
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	85.823	ENSGACG00000015633	sbno1	99	85.671	Gasterosteus_aculeatus
ENSGMOG00000018229	sbno1	93	83.551	ENSGAGG00000001065	SBNO1	97	77.930	Gopherus_agassizii
ENSGMOG00000018229	sbno1	94	84.587	ENSGGOG00000015000	SBNO1	96	84.587	Gorilla_gorilla
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	77.863	ENSHBUG00000011910	sbno1	96	77.481	Haplochromis_burtoni
ENSGMOG00000018229	sbno1	94	84.404	ENSHGLG00000014165	-	96	82.092	Heterocephalus_glaber_female
ENSGMOG00000018229	sbno1	92	88.294	ENSHCOG00000003246	sbno1	92	88.294	Hippocampus_comes
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	83.232	ENSIPUG00000015830	Sbno1	93	84.370	Ictalurus_punctatus
ENSGMOG00000018229	sbno1	100	78.848	ENSSTOG00000023221	SBNO1	96	84.587	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	78.815	ENSJJAG00000001741	Sbno1	96	81.468	Jaculus_jaculus
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	84.887	ENSKMAG00000009696	sbno1	97	84.271	Kryptolebias_marmoratus
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	84.771	ENSLBEG00000007623	sbno1	94	85.146	Labrus_bergylta
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	75.303	ENSLACG00000017227	SBNO1	93	77.163	Latimeria_chalumnae
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	83.410	ENSLOCG00000005725	sbno1	91	83.728	Lepisosteus_oculatus
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	77.508	ENSLAFG00000002135	SBNO1	94	77.702	Loxodonta_africana
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	78.512	ENSMFAG00000031429	SBNO1	96	81.125	Macaca_fascicularis
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	78.659	ENSMMUG00000011496	SBNO1	96	81.125	Macaca_mulatta
ENSGMOG00000018229	sbno1	94	84.587	ENSMLEG00000033260	SBNO1	96	84.587	Mandrillus_leucophaeus
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	85.102	ENSMAMG00000005473	sbno1	94	84.725	Mastacembelus_armatus
ENSGMOG00000018229	sbno1	98	79.396	ENSMGAG00000003274	SBNO1	94	79.313	Meleagris_gallopavo
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	77.252	ENSMICG00000006573	-	96	79.433	Microcebus_murinus
ENSGMOG00000018229	sbno1	94	84.220	ENSMOCG00000009390	Sbno1	96	84.220	Microtus_ochrogaster
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	81.637	ENSMMOG00000008691	sbno1	95	82.053	Mola_mola
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	78.615	ENSMODG00000012470	SBNO1	93	78.032	Monodelphis_domestica
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	85.243	ENSMALG00000001056	sbno1	97	84.158	Monopterus_albus
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	78.593	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	95	90.789	Mus_caroli
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	78.642	ENSMUSG00000038095	Sbno1	94	90.789	Mus_musculus
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	78.593	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	95	90.789	Mus_pahari
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	78.550	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	95	90.789	Mus_spretus
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	78.891	ENSMPUG00000001658	SBNO1	94	78.234	Mustela_putorius_furo
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	78.588	ENSMLUG00000017159	SBNO1	94	78.403	Myotis_lucifugus
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	79.011	ENSNGAG00000012620	Sbno1	94	85.347	Nannospalax_galili
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	84.012	ENSNBRG00000019189	sbno1	97	83.639	Neolamprologus_brichardi
ENSGMOG00000018229	sbno1	100	75.114	ENSNLEG00000001502	SBNO1	96	76.514	Nomascus_leucogenys
ENSGMOG00000018229	sbno1	60	75.472	ENSMEUG00000008768	-	84	74.214	Notamacropus_eugenii
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	77.591	ENSOPRG00000011054	SBNO1	94	77.744	Ochotona_princeps
ENSGMOG00000018229	sbno1	94	84.404	ENSODEG00000009997	SBNO1	96	84.404	Octodon_degus
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	84.523	ENSONIG00000015348	sbno1	94	84.222	Oreochromis_niloticus
ENSGMOG00000018229	sbno1	98	77.315	ENSOCUG00000002441	SBNO1	89	77.202	Oryctolagus_cuniculus
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	83.973	ENSORLG00000001593	sbno1	94	84.575	Oryzias_latipes
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	84.111	ENSORLG00020015216	sbno1	94	84.488	Oryzias_latipes_hni
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	84.036	ENSORLG00015002726	sbno1	94	84.563	Oryzias_latipes_hsok
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	83.961	ENSOMEG00000019313	sbno1	95	84.552	Oryzias_melastigma
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	78.659	ENSOARG00000004404	SBNO1	94	78.185	Ovis_aries
ENSGMOG00000018229	sbno1	94	84.587	ENSPPAG00000024635	SBNO1	96	84.587	Pan_paniscus
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	78.891	ENSPPRG00000022092	SBNO1	94	78.234	Panthera_pardus
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	78.891	ENSPTIG00000017803	SBNO1	94	78.234	Panthera_tigris_altaica
ENSGMOG00000018229	sbno1	94	84.587	ENSPTRG00000005597	SBNO1	96	84.587	Pan_troglodytes
ENSGMOG00000018229	sbno1	94	84.587	ENSPANG00000011640	SBNO1	95	84.587	Papio_anubis
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	83.295	ENSPKIG00000001441	sbno1	94	83.155	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGMOG00000018229	sbno1	98	79.045	ENSPSIG00000009572	-	97	78.343	Pelodiscus_sinensis
ENSGMOG00000018229	sbno1	91	75.165	ENSPSIG00000009256	-	94	74.607	Pelodiscus_sinensis
ENSGMOG00000018229	sbno1	98	84.037	ENSPEMG00000016087	Sbno1	96	84.037	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	78.610	ENSPCIG00000010985	SBNO1	97	77.702	Phascolarctos_cinereus
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	85.671	ENSPFOG00000005069	sbno1	94	85.736	Poecilia_formosa
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	85.521	ENSPLAG00000015015	sbno1	94	85.511	Poecilia_latipinna
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	85.746	ENSPMEG00000021212	sbno1	94	85.811	Poecilia_mexicana
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	85.071	ENSPREG00000017746	sbno1	94	85.135	Poecilia_reticulata
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	78.354	ENSPPYG00000005084	SBNO1	94	77.769	Pongo_abelii
ENSGMOG00000018229	sbno1	87	72.853	ENSPCAG00000008634	SBNO1	82	72.403	Procavia_capensis
ENSGMOG00000018229	sbno1	94	83.485	ENSPCOG00000024277	SBNO1	96	83.485	Propithecus_coquereli
ENSGMOG00000018229	sbno1	85	83.936	ENSPVAG00000015304	SBNO1	81	83.936	Pteropus_vampyrus
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	84.650	ENSPNYG00000004291	sbno1	94	84.048	Pundamilia_nyererei
ENSGMOG00000018229	sbno1	99	83.384	ENSPNAG00000015622	sbno1	94	83.308	Pygocentrus_nattereri
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